Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 T -2 -3 -2 -3 -3 -3 -3 -4 -4 -3 -4 -3 -3 -5 -3 3 7 -5 -4 -3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24 76 0 0 0 1.46 1.13 2 E 3 -2 -2 2 -5 2 3 -4 -4 -5 -5 0 -4 -6 4 -1 -2 -6 -5 -2 23 2 1 10 0 8 21 0 0 0 0 6 0 0 21 4 2 0 0 3 0.66 1.25 3 E 2 -3 -1 1 -5 1 6 -3 -3 -4 -4 -2 -4 -4 -4 1 0 -5 -5 -3 17 0 1 7 0 4 54 1 0 1 1 0 0 1 0 8 4 0 0 1 0.92 1.28 4 Q -1 -1 -3 2 -6 7 3 -4 0 -5 -3 0 -3 -6 -4 -2 -3 -5 -4 -5 4 2 0 9 0 56 18 0 2 0 2 3 0 0 0 1 1 0 0 0 1.21 1.29 5 K -3 4 -5 -4 -5 -3 -2 -6 -2 -1 5 0 1 -2 -5 -3 -4 -5 -1 -3 1 28 0 1 0 0 2 0 1 3 53 4 3 1 0 1 0 0 2 0 0.91 1.34 6 R 0 6 3 0 -5 -1 -2 -4 2 -3 -4 -1 -4 -4 -4 0 -1 -5 -2 -3 9 46 13 5 0 2 1 0 6 2 1 1 0 1 0 8 3 0 1 2 0.81 1.32 7 M -4 -3 -5 -2 -4 1 -2 -6 -4 0 5 -2 5 -1 -5 -4 -4 0 0 -2 0 1 0 2 0 7 3 0 0 3 57 2 15 2 0 0 0 1 4 1 0.90 1.35 8 L -2 -5 -5 -1 3 -2 -5 -6 -5 -2 4 -5 5 0 -6 -4 -4 8 -1 -3 3 0 0 5 7 2 0 0 0 0 39 0 19 4 0 1 0 20 1 0 1.16 1.38 9 L -4 -5 -6 -6 -4 -5 -6 -6 -5 -1 5 -5 6 3 -6 -5 -4 -4 -3 -1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 56 0 26 14 0 0 0 0 0 3 1.33 1.39 10 L -3 0 -5 -6 -4 -4 -5 -6 -5 -2 5 -4 7 -2 -5 -4 1 -4 -4 -2 1 6 0 0 0 0 0 0 0 0 53 0 31 1 0 1 8 0 0 0 1.23 1.41 11 P 2 0 -3 -4 -2 1 -3 -2 -4 -3 0 0 2 -4 3 1 2 -5 0 0 15 5 0 0 1 8 1 3 0 0 10 5 6 0 14 11 12 0 3 7 0.30 1.40 12 A 4 0 -3 -2 -2 1 -1 -1 2 -4 -3 -1 -1 -2 -1 3 0 -5 -4 -2 32 5 0 2 1 5 4 4 5 0 2 3 1 2 3 24 4 0 0 2 0.46 1.39 13 E -2 1 -2 0 -6 0 6 -3 -3 -4 -5 1 -4 -6 -4 -3 0 -6 -5 -3 2 8 1 4 0 1 66 1 0 1 0 9 0 0 0 0 5 0 0 1 1.22 1.41 14 A 3 1 -1 -2 -1 -1 0 0 -1 -1 -3 -2 -1 -5 1 1 1 -5 -4 0 29 7 2 1 2 2 5 6 2 4 2 2 1 0 8 11 10 0 0 6 0.31 1.40 15 V -1 3 -4 -4 0 1 -2 -3 -4 2 0 0 0 -3 -4 -3 1 -5 -4 4 3 18 0 0 2 6 2 2 0 10 6 6 2 1 0 0 8 0 0 32 0.50 1.35 16 N -2 4 -2 -2 -4 -2 -2 -4 -2 -3 -1 4 -1 -5 -4 -1 4 -5 -4 -2 3 23 1 2 0 1 1 0 1 1 5 25 2 0 0 4 30 0 0 2 0.73 1.38 17 V 1 -5 -5 -5 -2 -4 -4 -4 -5 3 1 -4 0 -3 1 -4 -2 -5 -1 5 10 0 0 0 1 0 0 1 0 16 10 0 2 0 6 0 1 0 2 50 0.85 1.36 18 S -1 2 1 2 -5 3 -1 0 3 -5 -5 2 -4 -1 -2 1 -1 -5 -2 -4 5 10 5 12 0 14 3 6 8 0 1 14 0 3 2 11 4 0 1 1 0.38 1.35 19 R -2 6 1 -1 -4 2 0 -2 -3 -4 -4 4 -3 -5 -1 -1 0 -4 -4 -4 2 39 5 3 0 8 4 2 0 1 1 22 0 0 3 4 5 0 0 1 0.81 1.29 20 K -3 2 4 3 -2 -1 -1 -1 3 -2 -3 1 -3 -4 -1 -1 -1 -4 -1 -1 1 11 19 18 1 2 3 5 8 3 3 7 0 1 3 4 4 0 2 4 0.39 1.23 21 G -1 -2 1 -1 -4 -2 -2 6 -3 -4 -4 -3 -4 -4 -3 -1 -3 -4 -4 -4 3 2 6 3 0 2 3 68 0 1 2 1 0 1 1 4 1 0 1 1 1.19 1.18 22 E 0 0 -1 -1 0 0 1 -1 -2 0 -1 -1 -1 -2 -1 0 2 0 -1 2 6 5 2 4 2 4 10 4 1 5 7 4 1 2 2 7 15 1 3 13 0.11 0.76 23 F -2 1 -2 -2 -2 -2 -2 -1 1 2 -1 -1 -1 5 -2 -2 -2 -1 0 2 3 9 2 2 1 2 3 5 3 12 4 4 1 24 2 3 3 1 3 13 0.33 0.82 24 T -1 1 -1 -1 -2 -1 1 -1 -2 0 0 0 0 -1 -2 -1 4 -2 0 0 4 9 3 3 1 3 9 5 1 5 7 5 2 2 2 4 24 1 3 6 0.18 0.87 25 L -2 0 -2 -1 -2 0 -1 -2 -1 0 3 -1 1 -2 -2 -2 -1 -2 -2 2 3 5 2 5 1 4 5 3 2 4 35 3 4 2 2 3 3 1 1 14 0.29 0.86 26 K -1 0 2 1 -2 1 0 -2 0 1 -2 4 -2 -2 -2 -1 0 -2 -2 -1 5 3 8 7 1 5 6 3 2 8 4 26 1 2 2 3 7 1 1 5 0.24 0.83 27 V 3 -1 -1 -2 1 0 -2 1 -2 0 -2 0 -1 -1 0 1 -1 0 -2 1 28 3 3 2 3 3 3 9 1 4 4 5 2 3 4 10 2 1 1 9 0.21 0.86 28 G 0 0 0 -1 -2 -1 -2 4 2 -2 -2 0 -2 -2 -2 0 1 -2 -2 -2 6 5 5 4 1 3 3 34 5 2 5 5 1 2 2 5 8 1 1 3 0.36 0.86 29 G -1 -1 -1 -1 -3 -2 0 5 -2 -3 -2 0 -3 -2 -2 -1 -2 -2 1 -2 3 3 3 3 1 1 6 49 1 2 4 6 1 1 2 3 3 0 6 3 0.66 1.02 30 S 0 0 -1 0 -3 -1 3 1 -2 -3 -3 2 -2 -3 -2 1 1 3 0 -1 7 5 3 5 1 2 17 9 1 1 2 13 1 1 1 10 9 4 3 5 0.23 1.10 31 L -4 -4 -5 -5 -4 -5 -5 -6 -5 6 2 -5 0 0 -3 -2 -2 -4 0 3 0 1 0 0 0 0 0 0 0 49 20 0 1 3 1 3 2 0 3 16 1.00 1.44 32 K -1 2 1 -1 -5 2 0 -2 5 -4 -2 2 -2 -1 -4 0 0 3 1 -3 6 11 6 3 0 10 4 3 14 0 4 13 1 2 0 7 6 4 4 2 0.38 1.43 33 G -3 -4 0 -3 -4 -1 -2 2 0 0 2 -2 -2 5 -5 -2 -4 -1 0 -1 1 0 4 1 0 3 2 19 3 5 21 2 1 28 0 3 0 1 2 4 0.55 1.39 34 A -1 2 0 -3 -5 3 1 -1 1 -3 1 -1 3 2 -4 -3 -4 -1 2 -3 6 12 5 1 0 12 10 5 4 1 16 3 7 8 0 1 0 1 8 1 0.30 1.42 35 K -2 0 1 1 -5 -1 -1 4 -3 -5 -5 3 -4 -5 -4 -1 0 -5 -2 -4 2 6 7 6 0 2 3 37 0 0 1 21 0 0 0 4 6 0 2 1 0.67 1.38 36 N -3 -1 7 -2 -4 0 -3 -1 -1 -2 0 -2 -3 -2 -4 -2 0 -5 0 -2 1 3 59 0 0 4 0 3 1 3 8 1 0 2 0 1 4 0 3 3 1.06 1.39 37 V -2 6 -1 0 -5 -1 -1 -4 0 -1 -2 -1 -3 -1 -4 -2 2 2 -2 0 2 44 2 5 0 2 4 0 2 4 3 2 0 3 0 2 12 3 1 7 0.68 1.37 38 Y -5 -5 -5 -6 -5 -4 -5 -6 -1 -4 -4 -5 -4 3 -6 -5 -5 -1 9 -4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9 0 0 0 0 91 0 2.59 1.44 39 Y -3 0 -3 -5 -2 -2 0 -3 2 0 -2 -4 -3 3 -5 -2 -1 9 4 -2 2 5 1 0 1 2 7 2 5 5 4 0 0 12 0 2 4 30 16 2 1.12 1.39 40 N 3 -3 3 1 2 -1 -3 -2 4 -4 -4 -3 -4 -5 -4 3 0 -5 -4 -4 30 0 12 8 5 2 0 2 10 0 0 0 0 0 0 23 5 0 0 0 0.67 1.37 41 M 0 0 -1 2 -5 0 4 -3 0 -5 -3 -1 0 -5 4 -1 -2 -5 -1 -3 7 4 2 13 0 4 31 1 2 0 2 2 2 0 21 3 2 0 2 2 0.65 1.37 42 A 2 -2 -2 2 -4 1 4 -3 -1 -3 -2 0 -4 0 -2 -1 0 3 -2 -1 18 1 1 10 0 5 26 2 1 1 3 6 0 5 1 4 7 4 1 4 0.37 1.37 43 L -4 -5 -6 -6 0 -4 -5 -6 -5 -1 6 -5 4 0 -5 -5 -4 -4 -3 -2 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0 83 0 9 3 0 0 0 0 0 0 1.45 1.39 44 M 2 -3 1 -3 -1 -1 0 -1 1 2 -1 -3 2 1 -3 -1 -1 3 2 -1 19 1 8 1 1 3 5 4 3 15 5 1 5 6 1 4 3 4 8 4 0.24 1.39 45 N 1 1 2 1 -5 1 2 2 1 -5 -3 -2 0 -2 0 0 -2 -5 -2 -5 13 9 8 9 0 6 14 18 3 0 2 1 2 2 4 5 1 0 2 0 0.33 1.44 46 A -3 -1 -4 -5 -2 -4 -2 -2 6 1 0 -3 1 2 -5 -2 -2 5 5 -1 2 3 0 0 1 0 3 3 22 7 10 1 3 7 0 3 3 7 21 4 0.76 1.44 47 G 1 2 -1 -1 -5 2 -2 -2 3 1 -1 1 1 -1 -5 -2 -2 -5 -4 2 14 11 3 4 0 10 1 2 7 9 6 9 3 3 0 2 2 0 0 14 0.25 1.44 48 V -2 -2 -2 0 -5 -2 -2 6 3 -5 -4 -1 -2 -5 -2 -2 -2 -5 -2 -2 1 2 2 5 0 1 2 62 7 0 2 4 1 0 2 1 3 0 2 3 1.06 1.42 49 K -3 3 0 0 -6 3 4 -2 1 -5 -5 4 -4 -5 -2 -2 -2 -5 -4 -5 0 13 3 5 0 15 26 2 3 0 0 25 0 0 2 2 1 0 0 0 0.79 1.40 50 K -2 3 -1 -2 -6 2 1 -5 -1 -5 -4 5 -1 -5 1 0 -1 -5 1 -5 3 13 3 2 0 8 8 0 1 0 1 39 2 0 8 5 3 0 4 0 0.70 1.44 51 V -2 -5 -6 -6 -1 -5 -5 -6 -6 1 1 -5 -2 -3 -5 -4 -2 -5 -1 7 2 0 0 0 1 0 0 0 0 4 9 0 0 0 0 0 1 0 2 81 1.39 1.27 52 V -2 0 -2 -2 -4 -1 -2 -5 0 2 0 0 1 -2 -4 -1 2 -4 3 3 2 4 1 2 0 3 2 0 3 11 6 5 4 1 1 3 14 0 12 26 0.38 1.27 53 V 0 -5 -6 -6 -4 -5 -5 -4 -6 4 1 -5 -2 -1 -5 -4 -3 -5 -2 6 9 0 0 0 0 0 0 1 0 23 10 0 0 2 0 0 0 0 1 54 1.05 1.27 54 R -1 7 -2 -4 -6 -2 -2 -2 -3 -5 -3 2 -4 -3 -5 -2 -4 -5 -4 -4 4 75 1 0 0 0 1 3 0 0 2 10 0 1 0 2 0 0 0 1 1.49 1.27 55 F -5 -3 -5 -6 -5 -5 -5 -6 -2 -2 -2 -5 -3 7 -6 -5 -4 2 8 -2 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 41 0 0 0 2 52 1 1.90 1.27 56 D -4 -4 2 8 -6 -3 -1 -4 -3 -6 -6 -3 -6 -6 -4 -1 -3 -7 -6 -6 0 0 10 87 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 0 0 0 2.00 1.27 57 P -2 -4 -4 -2 -4 -2 -1 -4 -4 -1 -2 -3 -4 -4 8 -3 -3 0 -3 -3 2 0 0 2 0 1 4 1 0 4 4 0 0 0 74 1 0 1 1 2 1.83 1.16 58 Q 0 1 1 4 -1 2 1 -4 2 -3 -2 -2 -3 0 -4 -1 -2 3 1 -3 8 9 6 23 2 11 10 1 6 1 3 0 0 4 0 3 2 4 5 1 0.41 1.16 59 Q -1 0 4 6 -5 -1 -1 -2 2 -4 -3 -1 -4 -2 -4 -2 -3 -5 -2 -4 4 5 19 48 0 2 1 2 6 0 3 3 0 2 0 1 0 0 1 1 0.94 1.16 60 L 0 -4 -3 -3 -4 -4 -5 -5 -5 2 5 -4 3 -2 -2 -2 -3 -4 -4 0 8 0 1 2 0 0 0 0 0 13 60 0 6 0 3 2 0 0 0 3 0.87 1.23 61 H -1 0 -1 -1 -3 2 -2 -2 8 -2 -1 -2 0 -2 0 -1 1 0 -1 -2 5 4 1 3 1 8 2 2 37 2 6 2 2 1 5 4 10 1 1 3 0.71 0.88 62 S 0 -2 0 3 -4 1 2 2 -3 -4 -2 0 -4 -3 -3 2 -2 -4 -1 -4 9 2 4 14 0 6 13 18 0 0 3 5 0 1 0 19 0 0 3 0 0.39 1.17 63 T 0 0 0 0 -1 -2 2 0 -3 -3 -4 1 -2 -4 2 2 1 -4 0 -2 8 6 4 5 1 0 15 7 0 1 0 9 1 0 11 14 10 0 4 3 0.27 1.20 64 V -2 -5 -6 -6 0 -5 -5 -6 -6 4 1 -5 1 -3 -5 -4 -2 -5 -4 6 3 0 0 0 2 0 0 0 0 28 9 0 2 0 0 0 1 0 0 55 1.17 1.27 65 Y -1 4 -4 -5 -1 -2 -2 -5 5 0 0 0 -3 -1 -5 -4 -2 6 5 -2 4 21 0 0 2 1 3 0 13 5 8 5 0 2 0 0 2 11 22 2 0.78 1.27 66 C -1 -5 -6 -6 3 -5 -5 -6 -6 3 -1 -5 -2 -3 -5 -3 -3 -5 -4 6 3 0 0 0 5 0 0 0 0 12 3 0 0 0 0 1 0 0 0 76 1.36 1.27 67 Y -4 0 -4 -4 -5 -4 -3 -5 0 -4 -2 -2 -3 4 -5 -4 -3 2 9 -4 0 5 0 1 0 0 2 0 1 0 2 2 0 13 0 0 1 2 72 0 1.83 1.25 68 T -1 1 0 6 -5 -1 -1 -3 2 -4 -2 -1 -4 -5 -4 0 3 -5 -3 -4 6 8 2 44 0 2 1 1 4 0 3 2 0 0 0 6 19 0 1 0 0.80 1.23 69 L 0 -2 -3 -1 -2 0 1 -1 0 -1 4 -1 1 -2 -1 -2 -1 -4 -2 -1 6 2 1 3 1 4 8 5 3 3 44 4 3 1 3 2 4 0 1 2 0.36 1.24 70 D -2 -1 3 6 -5 0 2 -4 -2 -4 -6 0 -3 -6 -4 0 0 -6 -5 -5 3 3 15 42 0 4 13 0 0 1 0 6 1 0 0 6 6 0 0 0 0.90 1.27 71 G -2 -4 1 2 -5 -3 -2 6 -2 -5 -5 -2 -3 -3 -4 -2 -3 -5 -5 -5 1 0 6 14 0 0 2 67 1 0 1 2 1 1 0 2 0 0 0 0 1.27 1.19 72 R -2 5 0 -1 -2 1 3 -2 -1 -4 -3 1 -4 -5 -4 0 0 -2 -4 0 3 35 4 2 1 5 18 2 1 0 2 9 0 0 0 6 6 1 0 7 0.61 1.27 73 F -4 -1 -5 -6 -5 -3 -4 -6 1 -3 0 -2 -3 7 -3 -5 -4 1 6 -3 1 4 0 0 0 1 1 0 3 0 10 2 0 51 2 0 0 1 25 1 1.35 1.27 74 I -4 -5 -6 -6 -1 -5 -6 -6 -3 6 4 -5 0 -2 -5 -5 -3 -5 -4 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 49 40 0 1 1 0 0 0 0 0 7 1.21 1.25 75 C 1 -5 -5 -5 10 -5 -5 1 -5 -2 -3 -5 -2 -5 -5 -3 -3 1 -5 -2 10 0 0 0 68 0 0 13 0 1 2 0 1 0 0 0 1 2 0 2 2.02 1.22 76 E -1 0 -2 1 -5 0 4 -4 1 -1 -3 1 0 -1 -3 -2 2 -5 -3 0 4 6 1 8 0 3 35 0 3 4 1 8 3 2 1 1 14 0 1 6 0.48 1.23 77 A 7 -4 -4 -4 -3 -3 -3 -2 -4 -4 -4 -3 -3 -4 -3 -1 -3 2 -4 -1 92 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 3 1.49 1.20 78 E 0 -3 -2 0 -5 1 5 -3 -1 0 -5 1 -4 -5 4 -1 -3 -5 -1 -3 6 0 1 5 0 7 40 1 1 6 0 8 0 0 18 5 1 0 2 1 0.72 1.13 79 C -2 -5 -5 -6 11 -5 -6 -5 -5 -3 -1 -5 0 -4 -5 -3 -3 -4 -4 0 2 0 0 0 87 0 0 0 0 0 4 0 2 0 0 0 0 0 0 5 2.43 0.88 80 L -3 -4 -5 -5 -3 -4 -5 -5 -5 5 3 -4 3 -1 -5 -4 -2 -4 -3 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46 27 0 7 2 0 0 0 0 0 19 0.87 0.69 K Lambda Standard Ungapped 0.1357 0.3211 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1778 0.3164 PSI Gapped 0.0544 0.2670