Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 A 5 -3 -3 -3 -3 -3 -3 2 -4 -4 -4 -3 -3 -5 -3 4 -2 -5 -4 -3 51 0 0 0 0 0 0 13 0 0 0 0 0 0 0 36 0 0 0 0 0.95 0.92 2 E -1 -3 1 3 -5 4 3 -4 1 -5 -5 -1 -4 -5 -4 2 0 -5 -4 -5 5 0 7 14 0 24 22 0 3 0 0 1 0 0 0 17 6 0 0 0 0.72 1.11 3 I -3 -3 -4 -4 -3 -1 -2 -3 -5 1 2 -2 7 0 -2 -3 2 -5 -4 0 1 0 0 1 0 3 2 2 0 7 19 2 37 4 2 1 13 0 0 6 0.79 1.30 4 K -1 0 0 -3 -5 6 0 -4 4 -4 -4 3 -1 -5 1 -2 0 -5 -4 -4 4 3 4 0 0 35 4 1 11 1 1 19 1 0 8 2 5 0 0 1 0.78 1.32 5 H -2 -2 0 -3 -4 3 -1 -4 2 -1 -3 2 -2 -5 -4 -1 5 -5 -4 0 1 2 3 0 0 14 2 0 5 4 1 12 1 0 0 2 47 0 0 6 0.78 1.33 6 Y -3 -4 -4 -5 -1 -2 -3 -6 5 1 -1 -3 1 0 -5 -4 0 3 6 3 1 0 0 0 1 2 1 0 13 6 3 1 3 3 0 0 5 3 30 26 0.85 1.32 7 Q -2 0 -2 -1 -4 1 6 -5 0 -3 -4 1 -4 -3 -4 -2 1 -5 -3 0 2 4 1 2 0 5 51 0 2 1 1 9 0 1 0 2 11 0 0 8 0.83 1.39 8 F -4 -4 -6 -6 -3 -4 -6 -6 -4 1 3 -5 1 7 -6 -5 -4 -2 2 -2 1 0 0 0 0 0 0 0 0 5 27 0 3 55 0 0 0 0 5 1 1.40 1.39 9 N 2 1 3 1 -5 0 0 -3 -1 -5 -4 4 2 -3 -4 1 -2 -6 -3 -4 17 6 13 7 0 3 4 1 1 0 1 30 5 1 0 9 1 0 0 1 0.53 1.40 10 V -2 -5 -6 -6 -4 -5 -5 -6 -6 2 -1 -5 1 -4 -5 -4 -2 -6 -4 7 1 0 0 0 0 0 0 0 0 8 1 0 3 0 0 0 2 0 0 85 1.58 1.39 11 V 0 1 2 2 -5 2 1 -1 2 -5 -5 0 -2 -6 1 2 0 -6 -3 -3 7 7 8 13 0 10 9 4 5 0 1 6 1 0 8 15 5 0 1 1 0.37 1.44 12 M -3 -5 -5 -6 -2 -4 -5 -6 -5 2 1 -4 10 -1 -6 -4 -3 -4 -4 -1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 9 7 0 79 1 0 0 1 0 0 2 2.07 1.46 13 T -2 -2 -1 2 2 -3 -2 -4 6 -5 -5 -1 -2 -5 -3 2 5 -6 -4 -3 3 2 2 10 4 0 2 1 17 0 0 3 1 0 1 18 37 0 0 1 0.86 1.49 14 C -3 -6 -5 -4 11 -6 -4 -4 -6 -4 -4 -6 -4 -5 -6 -2 -4 2 -5 -4 0 0 0 1 92 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 2 0 3 0 0 3.13 1.50 15 S 1 -2 0 2 -5 2 4 2 0 -4 -5 -1 -3 -5 -1 1 -1 -5 -3 -4 12 1 4 11 0 10 25 14 2 1 1 3 0 0 3 8 3 0 1 1 0.47 1.45 16 G 0 -2 -1 -2 -2 -4 -3 6 2 -5 -5 -1 -3 -5 -4 2 -3 -5 -5 -5 8 2 2 1 1 0 1 56 5 0 0 4 1 0 0 16 1 0 0 0 1.06 1.45 17 C -3 -6 -5 -6 11 -5 -6 -5 -5 -4 -4 -5 -4 -5 -5 -2 -4 -5 -5 -4 0 0 0 0 94 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 0 0 0 3.23 1.50 18 S 3 -3 -3 -4 -3 -1 2 -4 -3 -1 -3 0 -2 -4 -3 3 -2 -6 -3 4 21 1 1 0 0 3 15 1 0 2 0 6 1 0 1 20 1 0 0 28 0.54 1.56 19 G 0 3 3 0 -5 0 -1 2 0 -4 -4 3 -3 -6 0 0 -1 -6 -5 -4 7 14 13 6 0 4 3 16 2 1 2 15 1 0 4 8 3 0 0 1 0.41 1.53 20 A 4 2 -2 -1 -4 -2 -2 -3 -1 -2 -1 3 -4 -4 -4 1 -1 -5 -3 -2 35 13 1 4 0 1 1 1 1 2 5 21 0 1 0 8 3 0 1 3 0.55 1.51 21 V -2 -5 -6 -6 -1 -5 -5 -6 -6 5 -1 -5 -1 -3 -5 -4 -2 -5 -4 6 2 0 0 0 1 0 0 0 0 28 3 0 1 0 0 0 1 0 0 62 1.37 1.51 22 N -2 3 0 -2 -5 0 3 -4 2 -5 -5 4 -3 -6 0 0 2 -2 -3 -5 2 17 3 2 0 2 20 1 4 0 1 24 0 0 4 7 12 1 1 0 0.63 1.53 23 K -1 5 3 -1 -6 0 -1 -3 0 -4 -4 4 -4 -6 -3 -1 -2 -6 -5 -5 4 33 12 3 0 3 3 2 2 1 1 28 0 0 1 4 2 0 0 0 0.87 1.67 24 V 4 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 1 0 -2 0 -3 -5 -3 1 -1 -6 -4 3 33 1 1 1 1 2 2 1 3 6 3 6 0 0 1 10 4 0 0 24 0.51 1.67 25 L -3 -5 -6 -6 -1 -5 -5 -6 -5 2 5 -5 1 -1 -5 -5 -2 -5 -2 2 2 0 0 0 1 0 0 0 0 10 67 0 2 1 0 0 2 0 2 12 1.15 1.64 26 T 0 0 3 -2 -5 3 1 0 1 -3 -2 2 -2 -3 -4 2 0 -5 0 -3 6 4 12 2 0 14 9 6 3 1 4 14 1 1 0 13 6 0 3 1 0.32 1.61 27 K 1 2 -1 -1 -1 0 -1 -1 -1 -5 -4 5 -1 -2 -2 0 -1 -5 -2 -3 10 11 3 3 1 3 3 5 2 0 2 39 1 2 2 5 3 0 2 2 0.57 1.77 28 L -1 -2 0 -2 -4 0 -2 -2 -4 2 3 0 3 0 -5 -4 -1 2 -4 1 6 3 5 3 0 5 3 4 0 9 28 6 7 4 0 1 4 2 0 9 0.29 1.68 29 E -2 0 0 3 0 1 3 0 0 -1 -2 1 0 -4 0 -1 -1 -4 -4 -1 4 4 5 14 2 6 16 9 2 4 4 9 2 1 5 3 3 0 0 5 0.20 1.58 30 P 0 -4 1 0 -5 1 0 0 3 0 -1 0 -3 1 1 0 0 -4 2 0 6 0 6 6 0 6 6 6 6 6 6 6 0 6 6 6 6 0 6 6 0.11 1.67 31 D 0 -3 -1 0 -5 -2 -2 5 -2 -3 -4 -1 -4 -5 -3 -2 -2 -5 -3 2 7 1 2 5 0 1 2 50 1 1 1 4 0 0 1 2 2 0 1 17 0.83 1.75 32 V 0 -3 -2 -2 -4 1 -1 -3 -5 3 -1 -2 -1 -4 -3 -2 -1 -5 -1 5 6 1 2 2 0 6 4 2 0 13 3 2 1 0 2 3 3 0 2 48 0.71 1.76 33 S 1 0 0 1 -2 1 1 -3 0 -2 -3 1 -4 0 -2 1 2 -1 2 -1 12 5 5 7 1 5 9 1 3 2 3 9 0 4 2 10 11 1 7 4 0.17 1.72 34 K 0 -1 2 2 -1 1 1 -2 -1 -1 -3 1 -1 -3 -2 3 0 0 -2 -3 6 3 9 10 1 7 8 2 2 3 2 10 1 1 2 22 6 1 1 2 0.28 1.72 35 I 0 -5 -5 -2 0 -5 -5 -5 0 2 0 -2 0 2 -5 -2 0 -5 2 5 7 0 0 3 2 0 0 0 3 9 6 2 2 8 0 2 5 0 7 43 0.69 1.73 36 D -2 -2 3 3 -1 0 3 -3 1 -2 -4 0 -1 -2 -5 1 1 -6 -2 -3 2 2 12 19 1 3 21 2 3 3 2 6 1 2 0 9 8 0 2 2 0.46 1.74 37 I -1 -5 -5 -6 2 -5 -3 -3 -5 5 -1 -5 0 0 -2 -3 -1 -5 -1 5 5 0 0 0 4 0 2 2 0 32 5 0 2 3 2 2 4 0 3 35 0.83 1.74 38 S -1 -2 4 6 -1 0 -1 -3 -1 -3 -4 -2 -2 -6 -2 1 -2 -6 -3 -4 5 2 16 44 1 3 3 1 1 1 1 2 1 0 2 11 2 0 1 1 0.92 1.84 39 L -1 0 -3 -4 -2 -3 -4 -4 -5 -1 4 -3 2 0 -1 -1 0 -1 -2 1 4 5 1 1 1 1 1 1 0 3 44 1 5 4 4 4 7 1 2 9 0.49 1.86 40 E 1 -1 -1 1 -3 0 5 -2 -1 -5 -3 2 -3 -6 2 -2 -2 -3 -2 -4 14 2 3 7 1 4 34 3 1 0 2 13 1 0 8 2 2 0 1 1 0.56 1.73 41 K -1 0 2 0 -5 3 1 -2 -2 -4 -3 3 0 -4 -4 1 3 -6 -5 -4 6 4 11 5 0 13 8 2 1 1 3 15 2 0 0 10 16 0 0 1 0.43 1.75 42 Q 2 -1 1 -3 -6 6 1 0 1 -6 -4 3 -1 -6 -5 -2 -4 -6 -3 -3 16 3 6 1 0 33 9 8 4 0 1 15 1 0 0 2 0 0 1 1 0.73 1.75 43 L -3 3 -2 -3 -5 0 -1 -5 0 -1 -1 5 0 -3 -5 0 3 -6 -3 -1 1 12 1 1 0 4 3 0 2 4 6 34 2 1 0 6 16 0 1 5 0.60 1.75 44 V 1 -4 -6 -6 -2 -5 -6 -5 -6 2 -1 -5 0 -3 -6 -5 -3 -6 -4 7 10 1 0 0 1 0 0 1 0 7 4 0 2 1 0 0 1 0 0 73 1.39 1.75 45 D -2 -1 -2 0 0 -2 0 -4 -2 0 -1 -1 -1 -2 -5 0 5 -2 0 1 2 4 1 5 2 2 5 1 1 5 6 4 1 2 0 7 39 1 3 9 0.49 1.75 46 V -2 -6 -6 -3 -2 -5 -6 -5 -3 3 -1 -5 -1 -1 -6 -3 -2 -2 -1 6 2 0 0 2 1 0 0 1 1 13 3 0 1 2 0 2 1 1 2 69 1.29 1.75 47 Y -3 -1 -1 1 -3 0 3 -4 -1 -1 -3 1 -1 -3 0 0 4 -1 -2 0 1 3 3 8 0 3 18 1 1 4 2 7 2 1 5 6 25 1 1 7 0.38 1.78 48 T 0 -4 -2 -1 -3 -3 -2 5 -3 -6 -4 -3 -5 -4 -1 2 2 -6 -3 -4 6 1 1 3 0 1 3 45 1 0 2 1 0 1 3 17 14 0 1 1 0.84 1.80 49 T 0 -2 2 3 -3 -2 0 -2 0 -3 -3 -1 -3 -2 -2 2 3 1 1 -3 6 2 11 18 0 1 6 3 2 1 2 3 0 1 2 15 17 2 6 1 0.39 1.81 50 L 2 -4 -6 -5 -3 -3 -4 -5 1 2 2 -2 0 -2 -2 -3 -2 -6 -3 5 15 1 0 1 1 1 0 0 4 9 21 3 2 1 2 1 2 0 1 35 0.64 1.81 51 P -1 -3 0 4 -5 0 0 -2 -3 -4 -4 -2 -3 -6 4 3 1 -7 -6 -4 5 1 3 25 0 4 6 3 0 1 2 2 0 0 19 20 9 0 0 0 0.70 1.81 52 Y 2 -2 -4 -1 -4 0 -2 -4 -3 -2 -2 -3 -1 -2 5 1 -2 -2 2 1 15 2 1 3 0 4 3 1 1 2 4 1 1 2 30 9 2 1 7 10 0.57 1.84 53 D 0 -3 0 4 -6 2 4 -3 -1 -5 -3 0 -3 -3 -3 1 -2 -6 -3 -4 8 1 5 25 0 7 25 2 1 1 3 6 0 1 1 11 2 0 1 1 0.61 1.85 54 F 0 -1 -2 2 -4 2 2 -3 -3 -1 -3 3 -3 -4 -4 -1 3 -6 -4 -1 8 3 1 13 0 9 13 2 0 3 2 16 1 1 0 3 19 0 0 5 0.43 1.84 55 I -3 -6 -7 -7 -2 -6 -6 -7 -6 4 4 -6 2 -2 -6 -5 -3 -6 -4 5 1 0 0 0 1 0 0 0 0 23 34 0 4 1 0 0 1 0 0 36 1.17 1.81 56 L -2 -2 -4 -6 -2 1 -3 -5 -2 3 4 -1 0 -2 -5 -3 -1 -2 -2 2 4 2 1 0 1 7 2 0 1 18 37 3 2 1 0 1 4 1 1 14 0.59 1.81 57 E 2 1 0 0 -6 2 4 -2 -2 -6 -5 3 -4 -6 -5 -1 -1 -3 -5 -4 16 7 5 5 0 8 28 2 1 0 0 19 0 0 0 4 3 0 0 1 0.64 1.80 58 K 4 1 -3 -5 -2 -1 -2 -4 -2 -2 -2 3 -3 -5 -5 0 3 -6 -4 -1 32 8 0 0 1 2 2 0 1 2 4 18 0 0 0 6 19 0 0 4 0.60 1.80 59 I -2 -6 -6 -7 -4 -6 -6 -7 -2 5 3 -6 -1 -3 -4 -5 -4 -6 -4 4 3 0 0 0 0 0 0 0 1 38 28 0 1 1 1 0 0 0 0 28 1.18 1.76 60 K 0 2 -1 -1 -2 3 4 -3 -1 -4 -4 3 -3 -5 -5 1 -1 -4 -4 -2 9 11 3 2 1 11 25 2 1 1 1 19 1 0 0 9 3 0 0 2 0.55 1.77 61 K 0 2 -1 -1 -6 0 0 -2 -3 -6 -5 6 -3 -6 -4 0 -2 -6 -5 -5 7 10 3 4 0 4 6 2 0 0 0 54 0 0 0 8 2 0 0 0 1.01 1.75 62 T 3 -4 -3 -4 0 -4 -2 -4 -4 -1 -2 -3 -3 -4 -4 1 6 -2 -5 -1 24 1 1 0 2 0 2 1 0 3 4 0 0 0 0 10 46 1 0 4 0.87 1.71 63 G -3 -2 -3 -4 -4 -4 -5 7 -4 -5 -6 -2 -3 -6 -5 -3 -4 -6 -6 -5 1 2 0 0 0 0 0 90 0 0 0 2 1 0 0 1 1 0 0 1 1.99 1.70 64 K -4 4 -3 -4 -6 -2 -3 -5 -3 -5 -4 6 -4 0 -5 -4 -3 -4 4 -5 1 17 0 0 0 0 0 0 0 0 1 59 0 4 0 0 0 0 16 0 1.39 1.62 65 E 1 -1 -1 -1 -5 2 3 -2 -2 -5 -4 4 -4 -6 1 -1 2 -4 -4 -4 10 2 3 3 0 9 17 3 1 0 1 28 0 0 7 3 12 0 0 1 0.54 1.55 66 V 2 -5 -5 -6 3 -5 -5 -5 -6 2 -2 -5 -1 -4 -5 -4 -2 -6 -4 6 17 0 0 0 6 0 0 0 0 10 1 0 1 0 0 0 2 0 0 61 1.16 1.46 67 R -2 4 3 -3 -5 3 -2 -4 2 -2 -1 4 -2 -3 -3 0 -1 -2 -4 -3 2 20 13 0 0 11 1 1 4 3 6 25 0 1 1 6 4 1 0 1 0.55 1.31 68 S 2 -2 -2 -2 -4 -2 -1 1 0 -3 -4 1 -4 -2 -3 5 1 -5 -2 -4 20 1 0 1 0 1 3 9 2 1 1 8 0 1 0 43 7 0 1 0 0.62 1.23 69 G 2 -4 -2 -2 1 0 -1 5 -4 -3 -4 -1 -4 -5 -4 -1 -3 4 -4 -2 19 0 1 2 3 5 4 50 0 1 1 3 0 0 0 4 0 5 0 2 0.85 1.17 70 K -2 2 0 -1 -6 3 5 -4 -3 -5 -5 3 -4 -6 -2 -2 -1 -5 -4 -2 3 9 5 2 0 11 41 0 0 0 0 21 0 0 1 0 4 0 0 3 0.83 1.12 71 Q -2 -3 -3 -2 -4 2 4 -4 -3 -1 -3 0 -3 1 -4 0 3 -5 -3 2 1 0 0 0 0 11 30 0 0 2 0 4 0 6 0 6 22 0 0 18 0.56 0.97 72 L -3 -5 -5 -5 -3 -4 -5 -6 -5 4 3 -4 2 -2 -5 -4 -3 -4 -3 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28 36 0 4 0 0 0 0 0 0 33 0.91 0.81 K Lambda Standard Ungapped 0.1342 0.3162 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1880 0.3178 PSI Gapped 0.0576 0.2670