Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 T -2 -3 2 -3 -3 -3 -3 -3 -3 -2 -3 -3 -3 -4 -4 4 4 -5 -4 3 0 0 12 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33 26 0 0 29 0.73 0.90 2 D -2 -2 6 3 -5 -1 0 -1 0 -5 -6 -2 -5 -6 1 2 -2 -6 -5 -4 3 1 42 17 0 2 4 3 2 0 0 1 0 0 8 16 0 0 0 1 0.89 1.09 3 D -1 -2 2 6 -5 1 -1 -2 -3 -3 -4 -2 -4 -5 -2 2 1 -6 -5 -4 3 2 7 45 0 6 2 2 0 2 1 1 0 0 1 18 7 0 0 1 0.80 1.13 4 A 4 -3 1 -2 -4 -2 -2 -2 -1 1 -3 -3 -2 -4 4 -1 -2 -5 -3 0 36 1 7 1 0 2 2 2 2 8 2 1 0 0 22 4 2 0 1 7 0.56 1.13 5 E 0 3 -3 -2 -5 2 2 -3 -3 -1 -1 2 0 0 -4 -2 -2 -5 -3 1 9 17 0 2 0 11 15 1 0 4 7 14 2 4 0 2 2 0 1 10 0.32 1.13 6 Q 1 -2 1 3 -5 3 3 0 -2 -4 -4 -1 -4 -4 -4 2 -1 -5 -4 -4 13 1 6 19 0 14 19 6 1 0 1 2 0 1 0 13 4 0 0 1 0.50 1.13 7 E -4 -3 -1 5 -6 0 6 -4 -3 -6 -6 -2 -5 -6 -4 -2 -2 -6 -5 -4 0 0 1 28 0 2 66 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 1.47 1.13 8 A 7 -4 -4 -4 -3 -3 -3 -2 -4 -4 -4 -3 -3 -5 -3 0 -2 -5 -4 -1 93 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 1 0 0 3 1.46 1.14 9 V -2 -3 -5 -4 0 -2 1 -5 -4 4 1 -3 0 -3 -5 -3 -1 -5 -4 4 2 1 0 0 2 1 12 0 0 27 14 1 2 0 0 1 2 0 0 33 0.66 1.16 10 A 2 -3 0 0 -4 2 2 -1 -3 -3 -2 -1 -2 -5 -4 4 -1 -5 -4 -2 20 0 3 4 0 9 12 3 0 1 4 3 1 0 0 37 1 0 0 2 0.54 1.16 11 R 7 -3 -4 -4 -3 -3 -3 -1 -4 -4 -4 -3 -4 -5 -3 -1 -3 -5 -4 -3 95 1 0 0 0 0 0 3 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1.52 1.15 12 L -4 -5 -6 -6 -4 -5 -6 -6 -5 0 6 -5 1 -2 -6 -5 -4 -4 -4 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 96 0 2 0 0 0 0 0 0 0 1.59 1.18 13 V -2 -3 -4 -4 0 2 0 -5 -5 4 1 -4 0 -3 -5 -3 1 -5 -4 4 2 1 0 0 2 9 7 0 0 24 11 0 2 0 0 1 8 0 0 32 0.61 1.18 14 A 5 -4 -1 -4 -3 0 -3 -1 -4 -4 -4 -3 0 -5 -4 3 0 -5 -4 0 57 0 3 0 0 4 0 4 0 0 0 0 3 0 0 21 4 0 0 5 0.86 1.20 15 L -4 -5 -6 -6 -4 -5 -6 -6 -6 -1 7 -5 0 -2 -6 -5 -4 -4 -4 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.68 1.20 16 G -2 -5 -3 -4 -5 -5 -5 7 -5 -7 -7 -4 -6 -6 -5 -3 -4 -5 -6 -6 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.23 1.26 17 Y -5 -5 -5 -6 -5 -4 -5 -6 -1 -4 -3 -5 -3 3 -6 -5 -4 1 9 -4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 10 0 0 0 1 88 0 2.37 1.26 18 K -1 0 1 -3 -5 -2 -2 -1 -3 -4 -5 6 -3 -6 -2 2 -1 -6 -5 -3 3 3 5 1 0 0 0 3 0 0 0 59 0 0 2 17 4 0 0 1 0.99 1.25 19 P 0 0 -1 -3 -5 2 0 -2 0 -4 -3 0 -4 -6 6 0 -2 -6 -4 -4 8 6 4 0 0 8 5 2 2 1 3 6 0 0 45 7 2 0 0 1 0.93 1.26 20 Q 3 -1 0 -4 -4 4 -2 -3 -3 -3 -3 1 0 -4 1 0 2 -5 -3 -1 25 3 4 0 0 21 0 1 0 1 2 9 2 0 7 5 13 0 1 5 0.45 1.26 21 E -3 -3 -2 3 -6 4 6 -5 -3 -3 -4 -1 -3 -6 -2 -2 -3 -2 -5 -4 0 0 1 15 0 16 59 0 0 1 1 1 1 0 2 2 0 1 0 1 1.20 1.26 22 A 6 -4 -4 -4 -1 -4 -4 -3 -4 0 -3 -3 -3 -5 -4 0 -3 -5 -4 -2 85 0 0 0 1 0 0 0 0 5 1 0 0 0 0 6 0 0 0 2 1.34 1.26 23 S 1 -1 -1 -1 -4 2 2 -3 -1 -3 0 0 -1 -2 -4 3 0 -3 -3 -2 13 3 2 2 0 9 15 1 1 1 9 6 2 2 0 23 7 0 1 3 0.29 1.26 24 R -3 5 -2 -3 -3 1 0 -2 -2 -5 -5 6 -4 -3 -1 -2 -2 -6 -4 -4 1 26 1 1 1 4 5 2 1 0 0 49 0 1 3 2 2 0 0 1 1.00 1.26 25 M 4 -2 -5 -5 -2 -4 -4 -4 -5 1 0 -4 6 -2 -4 -2 -2 -2 -2 2 44 2 0 0 0 0 0 0 0 6 9 0 20 1 0 2 1 1 1 12 0.77 1.26 26 V -1 -5 -6 -6 -2 -4 -4 -6 -6 4 1 -4 -1 -2 -5 -4 -2 -5 -4 6 4 0 0 0 0 1 1 0 0 22 11 1 1 1 0 0 1 0 0 58 1.08 1.26 27 S 1 2 2 1 -5 1 -1 -2 -1 -3 -4 4 -2 -5 -4 3 0 -6 -4 -3 11 11 8 6 0 7 2 2 1 1 1 23 1 0 0 20 4 0 0 1 0.47 1.25 28 K 2 1 0 0 -2 2 -1 -1 -1 -4 -4 5 -2 -4 -3 0 -2 -5 -4 -4 19 6 4 4 1 11 2 5 1 0 1 36 1 1 0 6 1 0 0 1 0.57 1.26 29 I 0 -5 -5 -6 -1 -4 -5 -6 -1 4 1 -5 -1 -2 -5 -4 -2 -5 -3 5 8 0 0 0 1 1 0 0 2 24 9 0 0 1 0 0 1 0 1 51 0.98 1.25 30 A 3 -2 0 1 -4 0 1 -2 1 -2 -3 1 -2 0 0 -1 -1 -2 2 -2 27 2 4 9 0 3 9 2 3 3 2 10 1 4 5 4 2 0 8 2 0.26 1.23 31 R 0 0 1 2 -5 2 2 -1 -2 -2 -4 4 -3 -5 -3 0 1 -6 -4 -2 9 4 6 10 0 10 13 4 1 2 1 24 0 0 0 5 9 0 0 2 0.41 1.25 32 P 0 -2 -2 3 -5 1 4 -2 -4 -4 -5 0 -5 -6 5 -1 -2 -6 -4 -4 8 1 1 15 0 4 29 3 0 1 0 5 0 0 26 4 2 0 1 1 0.78 1.25 33 D 0 -3 2 4 -2 -2 1 4 -2 -4 -5 -2 -5 -3 -4 0 -2 -6 -3 -4 8 1 9 22 1 1 8 36 1 1 1 2 0 1 0 6 1 0 1 0 0.68 1.25 34 A 1 -3 -3 0 -4 -1 -2 -4 -1 0 3 0 7 -3 -4 -1 -1 -3 -4 -2 14 1 1 7 0 3 2 1 2 3 23 6 29 0 1 4 3 0 0 1 0.58 1.24 35 S -2 -2 0 3 -4 -2 -1 -1 -4 -5 -5 -1 -4 -5 -1 4 3 -6 -5 -4 1 2 4 19 0 1 3 4 0 0 0 2 0 0 3 40 21 0 0 1 0.76 1.26 36 S 0 -4 -3 -4 4 -4 -3 -4 -5 -1 -1 -4 -3 -3 -2 4 3 -5 -4 3 8 1 1 0 7 0 0 0 0 3 6 0 0 1 2 30 16 0 0 25 0.60 1.26 37 E -1 -3 -3 0 -6 0 7 -4 -3 -6 -6 -1 -5 -6 -4 -2 -3 -6 -5 -5 4 0 0 3 0 1 88 1 0 0 0 2 0 0 0 2 0 0 0 0 1.70 1.26 38 T 0 -3 -1 4 -2 4 4 -2 -3 -4 -5 -2 -1 -6 -4 -1 2 -6 -5 -3 9 0 2 21 1 16 30 2 0 1 0 1 1 0 0 3 11 0 0 1 0.69 1.26 39 L -3 -5 -6 -6 -2 -5 -6 -6 -5 5 5 -4 1 -2 -6 -4 -2 -4 0 2 1 0 0 0 0 0 0 0 0 29 50 1 3 0 0 0 1 0 3 10 1.01 1.26 40 I -4 -6 -6 -6 -4 -5 -6 -7 -6 7 2 -5 -1 -3 -6 -5 -3 -5 -4 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 80 15 0 0 0 0 0 0 0 0 5 1.60 1.26 41 R -4 6 -3 -4 -2 -1 -2 -5 -3 -5 -5 5 -1 -5 -3 -3 -3 -5 -3 -4 0 53 0 0 1 1 0 0 0 0 0 39 1 0 1 1 1 0 1 1 1.43 1.26 42 E 2 0 -1 -1 -5 2 3 -2 0 -2 2 2 -1 -3 -4 -1 -2 -5 -4 -3 19 5 2 4 0 8 17 2 2 2 20 11 1 1 0 3 1 0 0 1 0.31 1.26 43 A 7 -4 -4 -4 -1 -3 -4 -1 -4 -4 -4 -3 -4 -5 -4 1 -2 -5 -5 -2 87 0 0 0 1 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 7 1 0 0 2 1.42 1.26 44 L -4 -5 -6 -7 -4 -5 -6 -7 -6 -1 7 -5 0 -2 -6 -5 -4 -4 -4 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.71 1.26 45 R -3 4 -3 -3 -6 3 -2 -4 -2 -5 -5 6 -2 -6 -4 -3 -3 -6 -4 -5 1 24 0 0 0 12 0 0 1 0 0 60 1 0 0 0 1 0 0 0 1.36 1.21 46 A 2 -1 3 -2 -4 -1 -1 1 0 -5 -3 -1 -3 -3 -4 4 -1 -5 -3 -3 20 3 15 1 0 2 2 10 2 0 2 2 1 1 0 34 2 0 0 1 0.54 1.12 47 A 3 -2 -4 -5 -3 -3 -4 -4 -4 -1 0 -3 8 -3 -4 0 0 -4 -4 -1 26 2 0 0 0 0 0 0 0 1 4 0 55 0 0 6 5 0 0 2 1.17 1.07 48 L -3 -5 -5 -6 -3 -4 -5 -6 -5 3 4 -5 5 -2 -5 -4 -3 -4 -3 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18 42 0 14 0 0 0 0 0 0 26 0.95 0.94 K Lambda Standard Ungapped 0.1227 0.3108 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.2079 0.3162 PSI Gapped 0.0636 0.2670