Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 M -4 -5 -5 -6 -5 -4 -5 -6 -5 -2 0 -5 11 -3 -6 -5 -4 -5 -4 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 0 95 0 0 0 0 0 0 0 2.64 1.55 2 D -3 -1 0 5 -6 0 4 -4 0 -5 -4 1 -5 -6 -4 0 1 -6 -5 -5 2 3 4 30 0 3 30 0 2 0 2 6 0 0 0 8 9 0 0 0 0.82 1.62 3 A 0 -1 -2 1 -6 2 5 -3 -1 -3 -5 1 -5 -4 2 -1 -1 -6 -5 -2 9 3 1 7 0 9 38 1 1 1 1 8 0 1 10 4 3 0 0 4 0.64 1.63 4 K 0 3 -2 0 -2 1 2 -3 1 -1 -3 3 -3 -4 -2 0 -1 1 -1 -3 9 18 1 5 1 4 14 2 3 4 3 20 1 1 1 6 3 2 2 1 0.38 1.65 5 A 0 0 1 2 1 1 -1 -5 8 -5 -5 -1 -3 -3 -3 -1 -4 -5 1 -5 9 5 5 13 3 7 2 0 41 1 1 3 0 1 1 4 0 0 4 0 1.07 1.63 6 R -3 6 -3 -3 -6 1 -1 -4 -4 -4 -3 4 -4 -6 -5 -3 -4 3 -3 -4 2 50 1 1 0 5 3 1 0 1 2 27 0 0 0 1 0 4 0 1 1.24 1.64 7 N -1 0 3 2 -5 3 3 -3 1 -4 -2 1 1 -5 -5 1 -2 -6 -5 -4 5 5 12 10 0 14 17 1 3 1 5 9 4 0 0 10 2 0 0 1 0.46 1.64 8 C 1 -1 -2 -5 4 -3 -5 -6 -2 4 3 -1 -1 -2 -5 -3 -1 -5 -2 1 11 4 2 0 9 1 0 0 1 20 30 3 1 1 0 1 4 0 1 10 0.56 1.66 9 L -5 -5 -7 -7 -4 -5 -6 -7 -6 3 6 -4 0 -2 -6 -6 -4 -5 -4 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13 83 1 2 1 0 0 0 0 0 0 1.56 1.66 10 L -3 5 -1 -2 -6 3 1 -5 -2 -1 1 2 0 -2 -5 -2 1 -3 -5 -2 1 30 2 3 0 11 8 0 1 3 12 11 3 2 0 2 8 0 0 3 0.54 1.71 11 Q -1 5 0 -1 -3 3 0 -4 1 -3 -4 4 -1 -6 -5 0 -1 -6 -3 -2 4 26 4 3 1 13 5 1 3 2 1 21 1 0 0 8 3 0 1 3 0.60 1.72 12 H -4 -2 6 -3 2 0 -3 -4 7 -5 -2 0 -2 -1 -5 -2 -3 -6 0 -3 1 1 39 0 4 4 1 1 27 0 5 5 1 3 0 2 1 0 3 2 1.16 1.73 13 R -3 7 -3 -5 -6 0 -3 -4 0 -2 0 0 2 -1 -5 -2 -4 0 1 -5 1 61 1 0 0 3 1 1 2 2 9 3 4 3 0 2 0 1 4 0 1.22 1.74 14 E -1 -2 -2 0 -4 0 2 -3 0 -1 0 -2 2 -4 0 -1 1 -6 -2 3 5 2 2 6 0 5 14 2 3 3 7 3 6 1 6 5 10 0 1 22 0.25 1.74 15 A 2 0 0 0 -1 0 2 -3 -1 -2 0 1 -1 0 -2 0 0 -5 1 0 17 6 4 5 2 4 12 1 1 2 8 7 1 4 2 6 6 0 5 6 0.13 1.75 16 L -5 -4 -6 -7 -5 -3 -6 -7 -6 3 6 -5 1 1 -6 -5 -3 -1 -4 -1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 16 69 1 2 5 0 0 1 1 0 3 1.29 1.71 17 E 0 -3 -4 -4 3 -3 0 -4 -3 3 -1 -2 -1 0 -5 0 0 -6 -3 4 9 1 0 1 6 1 8 1 1 14 5 2 1 4 0 6 6 0 1 34 0.52 1.73 18 K -2 4 1 1 -3 3 3 -2 0 -6 -5 3 -4 -5 -3 1 0 -6 -5 -5 3 18 8 8 1 11 16 2 2 0 1 15 0 0 1 8 5 0 0 1 0.54 1.72 19 D -3 1 2 5 -1 1 2 -2 2 -2 -4 -1 -2 -6 -5 0 -1 -6 -3 -2 1 6 11 29 1 5 15 3 4 3 1 3 1 0 0 7 4 0 1 3 0.56 1.70 20 I -4 -5 -6 -6 -1 -5 -6 -5 -6 4 5 -5 4 -3 -5 -4 -2 -5 -4 1 1 0 0 0 1 0 0 1 0 25 51 0 10 0 1 1 2 0 0 8 1.11 1.69 21 K -4 2 2 4 -3 2 1 -3 -2 -2 -3 1 -2 -4 -2 0 0 -6 -3 -1 1 10 10 23 0 9 9 1 1 2 3 9 1 1 2 6 6 0 1 5 0.43 1.71 22 T -1 -4 -5 -4 -3 -5 -5 -4 -4 0 1 -5 -1 0 4 -2 2 -2 -3 4 6 1 0 1 1 0 0 1 0 4 15 0 1 4 21 2 14 1 1 28 0.64 1.71 23 S -1 1 1 3 -3 2 2 -3 0 -1 -2 0 -4 -6 -2 3 -1 -6 -5 -3 5 6 6 17 1 9 13 1 3 3 4 6 0 0 2 19 4 0 0 2 0.38 1.70 24 Y -1 0 -2 3 1 -1 1 0 2 -3 -4 0 -3 -2 2 1 -3 -5 3 -2 4 5 1 15 4 2 9 7 4 2 2 5 1 2 11 12 1 0 11 3 0.30 1.71 25 I -4 -6 -4 -6 -3 -5 -6 -7 -2 5 3 -6 0 0 -6 -5 -2 -5 -3 4 1 0 1 0 1 0 0 0 1 36 27 0 1 3 0 0 2 0 1 27 1.07 1.71 26 M -2 -2 -6 -6 2 -5 -6 -6 -5 2 4 -3 3 1 -4 -4 0 5 1 1 3 2 0 0 4 0 0 0 0 13 36 1 8 5 1 1 6 7 5 9 0.70 1.71 27 D -1 -2 2 6 -3 0 0 -1 -2 -3 -5 -2 -5 -5 2 0 -1 -6 -3 -3 4 2 7 41 1 4 6 4 1 2 1 2 0 0 10 8 4 0 1 2 0.75 1.74 28 H -2 1 0 -1 -1 0 0 -2 6 -3 -2 0 -3 0 -1 0 -3 -1 4 -2 4 7 5 4 1 5 5 3 21 1 3 6 0 4 3 7 1 1 16 4 0.50 1.75 29 M -4 -5 -6 -6 -4 -5 -6 -6 -6 -1 6 -5 4 -1 -6 -5 -4 -5 -4 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 83 0 10 2 0 0 0 0 0 1 1.57 1.67 30 I -3 1 -5 -4 -4 0 -3 -5 -1 3 3 -2 0 1 -5 -3 -2 -2 3 1 2 9 0 1 0 4 2 0 2 18 26 2 2 6 0 2 2 0 12 8 0.47 1.64 31 S 1 -1 -1 -1 -3 4 3 -1 -1 -4 -5 0 -4 -4 -4 3 0 -5 -2 -4 11 2 3 3 1 16 22 4 1 1 1 5 0 1 0 22 4 0 1 1 0.53 1.65 32 D 0 3 1 2 2 0 2 -1 2 -5 -4 3 -2 -5 -3 0 -2 -5 -3 -4 6 13 7 12 4 4 14 5 4 0 1 17 1 0 1 5 2 0 1 1 0.42 1.69 33 G -3 2 1 2 -1 0 2 4 -2 -6 -4 1 -3 -2 -4 -1 -3 -5 -2 -5 1 9 6 9 1 3 13 34 1 0 1 10 1 2 1 3 1 0 1 0 0.59 1.69 34 F -2 -5 -6 -4 -2 -3 -4 -5 -2 5 0 -3 -2 -2 -5 -5 -1 0 0 5 3 0 0 1 1 1 1 1 1 30 5 1 0 2 0 0 3 1 3 45 0.99 1.71 35 L -5 -5 -6 -6 -5 -5 -6 -6 -5 4 4 -6 1 5 -6 -5 -4 -4 -1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25 41 0 3 24 0 0 0 0 2 5 1.15 1.71 36 T -3 -2 2 0 -1 -1 0 -3 -2 -3 -3 -2 -4 -5 -3 3 6 -6 -5 -2 1 2 10 5 1 2 5 1 1 1 2 2 0 0 1 19 44 0 0 2 0.82 1.71 37 I -2 0 -1 2 -2 2 3 -2 0 -1 0 0 -1 -2 1 -1 -1 -1 -2 -1 4 4 3 12 1 8 19 3 3 5 9 5 1 2 8 4 4 1 1 4 0.21 1.71 38 S 0 -1 0 4 -3 1 4 -2 1 -3 -3 -2 1 -3 -1 0 -2 -6 0 -2 7 3 4 19 1 7 28 3 4 1 2 1 3 1 3 6 2 0 4 3 0.47 1.76 39 E -3 -2 -1 5 -2 1 4 -5 3 -3 -3 -4 6 -5 -5 -3 -2 -6 -1 -2 2 1 2 27 1 7 26 0 6 1 2 0 18 0 0 1 2 0 2 2 0.90 1.83 40 E 0 1 -2 -2 1 -2 1 -2 2 2 -1 2 2 -1 -5 -3 -1 -1 2 1 8 6 1 2 3 1 11 3 5 11 6 13 5 3 0 2 3 1 6 9 0.19 1.75 41 E -2 -2 -1 4 -2 1 6 -3 -1 -3 -4 0 -2 -6 -4 -2 -3 -6 -2 -4 4 1 2 19 1 6 49 2 1 1 1 4 1 0 0 2 1 0 1 1 0.97 1.75 42 K -2 2 -1 2 -2 1 2 -2 0 0 -2 2 0 -3 -1 -1 -1 0 -1 -1 2 12 3 12 1 5 14 3 2 7 4 12 2 1 3 3 4 1 2 5 0.21 1.75 43 V -2 -6 -6 -6 -4 -5 -6 -6 -6 7 1 -5 0 0 -5 -5 -4 -5 -1 3 3 0 0 0 0 0 0 0 0 57 11 0 2 3 0 0 0 0 2 20 1.28 1.75 44 R -2 3 1 0 -1 3 1 -3 -1 -3 0 3 0 -2 -5 -1 -2 -1 2 -2 3 13 7 4 1 11 7 2 1 1 9 18 3 2 0 4 2 1 8 3 0.34 1.83 45 N 2 -1 3 -1 2 1 -2 -2 0 -3 -3 -1 -2 -3 -3 3 0 -6 -3 -2 18 4 14 3 4 7 2 3 3 2 2 3 1 1 1 23 6 0 1 2 0.37 1.81 46 E -2 0 0 -1 2 3 3 -1 0 -1 -2 3 1 -3 -3 -1 -1 -6 -2 -3 4 4 4 3 4 15 16 5 2 5 5 15 3 1 1 5 3 0 1 2 0.29 1.84 47 P -1 1 -1 -2 -3 0 -1 1 -1 -2 -3 1 -2 -4 4 0 2 -6 -5 -2 5 7 3 2 1 3 3 9 1 2 2 8 1 1 22 8 11 0 0 3 0.32 1.82 48 T -3 -2 1 -2 0 0 0 -1 -2 -3 -4 -2 0 -4 -3 1 6 -6 -5 -1 1 2 5 1 2 4 7 4 1 1 1 2 2 1 1 12 44 0 0 3 0.63 1.79 49 Q -2 4 1 -1 -3 2 0 -3 0 -3 -3 1 -2 -4 0 1 0 -6 -3 -2 3 25 7 3 1 10 5 2 2 2 2 7 1 1 5 10 5 0 1 3 0.33 1.81 50 Q 0 3 -2 -2 -3 2 1 -3 1 -2 -2 1 -1 1 0 0 0 -5 0 -2 7 16 1 2 1 10 7 2 4 2 4 8 1 6 5 7 5 0 3 3 0.16 1.80 51 Q 0 1 0 4 -6 2 3 -2 -1 -2 -2 1 -1 -4 -3 -1 -2 -6 -5 -4 7 6 3 24 0 7 16 3 1 2 5 8 2 1 1 4 2 0 0 1 0.36 1.80 52 R -2 5 -2 -4 -6 5 -2 -3 -4 -4 -4 4 0 -6 -5 -3 -2 -6 -5 -2 3 26 1 0 0 23 1 1 0 1 1 26 2 0 0 1 2 0 0 3 0.88 1.81 53 A 4 -1 3 -3 0 -4 -3 -3 -5 -1 -2 -2 1 -2 -5 -1 0 -6 -5 2 36 4 13 1 2 0 1 1 0 3 3 2 4 1 0 3 6 0 0 13 0.46 1.81 54 A 0 4 -1 0 -3 -1 2 0 1 -3 -2 0 1 -2 -5 -1 -2 0 0 -2 9 26 3 5 1 2 13 7 3 1 3 4 3 1 0 3 2 1 4 4 0.29 1.81 55 M 1 0 -1 -1 1 0 2 -4 1 -1 -2 2 2 1 -4 -1 -1 -5 0 -1 11 5 3 3 3 4 16 0 3 3 4 13 5 6 0 3 4 0 3 3 0.12 1.33 56 L -4 -5 -5 -6 -4 1 -5 -6 -5 1 4 -5 3 4 1 -5 -4 -4 -3 1 0 0 0 0 0 6 0 0 0 7 43 0 6 15 6 0 0 0 0 7 0.67 1.33 57 I -3 -5 -6 -6 0 -2 -5 -6 0 4 4 -5 2 0 -6 -3 -2 -4 2 1 2 0 0 0 2 2 0 0 2 19 35 0 5 4 0 2 2 0 7 10 0.61 1.61 58 K -2 0 1 4 -1 -1 1 -3 -1 0 -2 0 0 -2 -5 1 0 -6 -2 -3 3 4 6 22 1 3 9 2 2 7 4 6 2 2 0 12 6 0 1 2 0.24 1.61 59 M -2 -3 -2 2 0 -2 -1 -6 -1 3 2 -2 3 2 -5 -3 0 -5 1 0 2 2 1 10 2 2 3 0 2 15 17 2 7 9 0 2 7 0 4 6 0.25 1.61 60 I -3 -3 -3 -4 4 2 -3 -4 -3 1 0 -3 3 2 -4 0 1 -3 2 1 1 0 0 0 8 9 1 1 0 9 9 0 9 9 0 9 9 0 9 9 0.28 1.12 61 L -1 0 -2 -3 0 0 -1 -3 0 0 2 0 1 -1 3 -2 -1 -5 -1 -2 5 6 2 1 2 4 4 2 3 5 22 6 4 3 16 3 3 0 3 2 0.19 1.85 62 K -1 3 -1 -2 2 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1 -6 -3 9 -7 -5 -4 -3 0 -2 0 0 0 0 1 0 2 0 1 2 14 0 0 75 0 0 1 0 1 2 1.97 1.86 72 Y -3 1 -5 -6 6 -3 -5 -6 -1 2 2 0 0 -1 -6 -5 -2 -4 4 2 1 7 0 0 15 1 0 0 1 10 22 6 2 2 0 0 2 0 15 15 0.68 1.80 73 N -2 0 3 3 -2 1 3 -3 0 -3 -2 1 -3 -3 -5 1 -1 -5 1 -3 3 5 11 15 1 5 17 1 2 2 4 9 1 1 0 10 3 0 6 2 0.37 1.82 74 A 4 -5 -4 -5 5 -1 -3 -2 0 -1 -3 -3 -4 -4 -5 3 -1 -1 -1 0 40 0 0 0 10 3 1 3 2 4 1 1 0 1 0 22 3 1 3 6 0.71 1.79 75 L -3 -2 -6 -7 0 -1 -6 -7 -2 1 6 -5 0 -3 -6 -5 -4 -5 -2 -1 1 2 0 0 2 3 0 0 1 6 77 0 2 0 0 1 0 0 1 4 1.33 1.80 76 L -3 3 -1 0 0 2 2 -3 -2 0 2 2 1 -3 -4 -2 -2 -2 -2 -1 1 17 2 4 2 9 11 2 1 5 18 11 3 1 0 3 2 1 2 4 0.32 1.65 77 H -2 0 1 1 1 2 4 -4 4 -2 -4 3 -3 -4 -3 -1 -3 -3 -3 -3 4 4 6 6 3 9 26 1 8 3 1 19 0 1 1 3 1 0 1 2 0.56 1.82 78 E -1 -2 1 2 -3 -2 4 -3 0 -3 -3 0 -5 -3 -3 1 3 -6 -4 -2 4 2 6 13 1 1 25 2 2 1 3 5 0 1 1 10 21 0 0 2 0.50 1.82 79 G -1 -1 2 2 1 -1 0 4 -2 -3 -3 -1 0 -1 -3 -1 0 -5 1 -2 6 3 8 12 3 3 5 26 1 2 3 4 2 3 1 3 5 0 5 4 0.30 1.70 80 Y -4 -4 0 -1 -2 5 -3 -5 4 -5 -2 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