JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_xRZSPF0.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|C|C|C|C|C|C|C|C|C|C|C|C|C|C|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet |H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E|E|||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||E|E|E|||||E|E|E|E|||E|E|E|E|E||||||||E|E|E|||||||||E|E||||||||E|E|E||||||E|E|E|E|E|E||H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||E|E|E|E|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||E|E|E|E|E||||||H|H|||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|H|H|H|H|H|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 7|3|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|7|5|3|7|8|1|1|3|3|2|2|3|3|1|3|6|7|7|7|7|7|7|7|7|6|4|0|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|8|6|0|4|7|8|7|7|7|5|2|4|3|3|6|7|6|1|7|8|7|1|1|5|8|9|8|6|2|6|7|7|7|7|0|2|3|0|3|5|7|7|7|7|6|1|1|1|2|5|6|7|7|6|4|4|6|1|2|7|8|7|0|7|8|8|7|5|1|2|5|8|8|9|9|8|8|7|5|1|6|7|7|7|6|6|5|1|6|7|7|4|4|7|8|7|6|3|6|8|9|9|9|9|9|9|9|8|8|2|0|6|9|6|0|8|8|8|7|4|4|7|8|7|0|2|7|8|9|9|9|9|9|8|6|2|3|5|6|7|8|7|4|4|7|8|7|1|4|6|5|3|0|3|1|1|0|2|4|5|5|5|5|6|3|7|8|9|9|9|9|9|9|8|6|2|0|7|8|8|7|2|0|3|2|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|8|6|2|6|7|1|1|0|1|2|5|5|2|1|5|7|7|4|3|6|8|8|9|9|9|9|9|8|8|5|2|6|8|8|9|9|9 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off -|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|B|-|-|-|B|B|-|-|B|-|-|B|-|-|B|B|-|B|B|B|B|B|B|-|B|-|B|-|B|B|-|B|B|B|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|B|-|-|B|B|B|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|B|-|B|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|-|-|-|B|B|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|-|B|B|B|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|B|B|-|B|B|-|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|B|-|B|-|-|-|-|B|-|-|-|B|B|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|-|B|B|-|B|B|B|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|B|-|B|B|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|B|-|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|-|-|B|-|B|B|-|B|B|-|B|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|-|B|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|B|-|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|B|-|B|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|-|B|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles |H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|E|E|E|E|||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||E|E|E|||||E|E|E|E|||E|E|E|E|E|||||||E|E|E|||||||||E|E|E||||||||E|E|||||||E|E|E|E|E|E||H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||E|E|E|E|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||E|E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||E|E|E|E||||||H|H||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E||H|H|H|H|H|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles |H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||H|H|H|H|H|H|||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||E|E|||||E|E|E|E|E||E|E|E|E|E|||||||||E|E||||||||||||||||||E|E|E||||||E|E|E|E|E|||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||E|E|E|E|E|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||E|E|E|E|E||||||H|H|H||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||H|H|E|H|H|H|H|H|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*|*|*|*|*|*|*|*| | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | |*| | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | |*|*| |*| | | | | | | |*|*|*| | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | |*| | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | |*| |*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | |*|*| | | | | | | | | | | | | | | |*|*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | |