Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 I -3 -4 -5 -5 -3 -4 -4 -5 -4 6 2 -4 2 -1 -4 -4 -2 -4 -3 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 67 20 0 6 0 0 0 0 0 0 7 0.86 0.47 2 H -3 -2 -1 -3 -5 -1 -1 -4 10 -5 -4 -2 -3 -3 -4 -2 -3 -4 1 -5 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.02 0.51 3 P -2 -3 -3 1 -4 -2 -2 -3 -3 -4 -4 -2 -4 -5 8 0 -2 -5 -4 -4 0 0 0 10 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 84 6 0 0 0 0 2.04 0.51 4 N 0 -1 4 -1 -4 5 0 -3 -1 -3 -4 3 -2 -4 -3 -1 -2 -4 -3 -1 7 0 28 0 0 41 0 0 0 0 0 18 0 0 0 0 0 0 0 6 0.71 0.51 5 F -3 -3 -4 -5 -4 -3 -4 -5 3 -2 0 -4 -1 6 -5 -3 -3 0 6 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 9 0 9 0 0 47 0 0 0 0 36 0 1.16 0.51 6 V 1 -4 -4 -4 -2 -3 -4 -4 -4 3 1 -3 -1 -2 1 -3 -2 -4 -3 5 12 0 0 0 0 0 0 0 0 13 10 0 0 0 9 0 0 0 0 55 0.62 0.51 7 G -2 1 3 -2 -4 -2 -2 1 -2 -3 -4 1 -3 -4 5 0 1 -5 -4 -1 0 7 21 0 0 0 0 13 0 0 0 9 0 0 30 5 10 0 0 6 0.63 0.51 8 D -3 -3 0 8 -5 -2 0 -3 -3 -5 -5 -2 -5 -5 -3 -2 -2 -6 -5 -5 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.69 0.51 9 K -2 1 -2 -3 -4 3 -1 -4 -2 0 1 4 4 -3 -3 -2 -2 -4 -3 -2 0 6 0 0 0 15 0 0 0 6 17 38 18 0 0 0 0 0 0 0 0.53 0.51 10 S 2 -2 -2 -3 -2 -2 -2 -3 2 -1 -2 1 -2 -3 -3 2 3 -4 -3 3 17 0 0 0 0 0 0 0 7 0 0 9 0 0 0 20 20 0 0 27 0.38 0.51 11 K -2 1 1 -2 -4 0 -1 -3 -2 -3 -4 6 -3 -4 -3 -2 -2 -5 -3 -1 0 0 6 0 0 0 0 0 0 0 0 87 0 0 0 0 0 0 0 7 1.03 0.51 12 E 1 2 0 -2 -4 2 2 -3 -2 0 0 1 -2 -3 -3 -2 -2 7 -2 -2 13 14 5 0 0 12 17 0 0 9 8 7 0 0 0 0 0 16 0 0 0.44 0.51 13 F -4 -4 -5 -5 -4 -5 -5 -5 -3 -1 -1 -5 -1 8 -5 -4 -4 0 2 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 1.70 0.51 14 S 2 -2 -1 -2 -2 -2 -2 0 -2 -3 -4 0 -3 -4 -2 5 2 -4 -3 -3 15 0 0 0 0 0 0 4 0 0 0 6 0 0 0 63 12 0 0 0 0.70 0.51 15 R -3 7 -2 -3 -5 0 -1 -4 -1 -4 -4 3 -3 -3 -3 -2 -2 -3 1 -4 0 81 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13 0 0 0 0 0 0 6 0 1.25 0.51 16 L -3 -2 -4 -4 -3 2 -2 -4 -3 0 5 1 3 -2 -4 -3 -2 -3 -3 -1 0 0 0 0 0 15 0 0 0 0 68 11 7 0 0 0 0 0 0 0 0.67 0.51 17 G -2 -2 3 3 -3 -2 -1 2 -2 -4 -4 1 -3 -4 -3 2 3 -5 -4 -3 0 0 17 17 0 0 0 17 0 0 0 9 0 0 0 19 22 0 0 0 0.51 0.51 18 K -2 3 -2 -3 -4 -1 -1 -4 -2 -2 1 5 -1 -3 -3 -2 -2 -4 -3 0 0 12 0 0 0 0 0 0 0 0 20 60 0 0 0 0 0 0 0 8 0.68 0.51 19 E 0 -2 -2 1 -4 2 3 -3 -2 -4 -2 1 -3 -4 5 1 0 -4 -4 -3 6 0 0 6 0 9 20 0 0 0 4 8 0 0 32 10 6 0 0 0 0.65 0.51 20 E -1 -2 -1 4 -5 0 5 0 -2 -4 -4 1 -4 -5 -3 -1 -1 -5 -4 -4 4 0 0 29 0 0 48 8 0 0 0 7 0 0 0 0 4 0 0 0 0.80 0.51 21 M -2 -2 -3 -4 -3 1 -3 -4 -3 0 1 -2 9 -1 -4 -3 -2 -3 -2 -1 0 0 0 0 0 9 0 0 0 0 0 0 91 0 0 0 0 0 0 0 1.33 0.51 22 M -3 0 -3 0 -3 -3 -3 -4 -4 6 0 1 2 -2 -4 -3 -2 -4 -3 1 0 6 0 8 0 0 0 0 0 61 0 14 5 0 0 0 0 0 0 6 0.61 0.51 23 A 4 0 1 1 -2 -2 1 -2 -3 -2 -1 -2 -2 -4 -3 1 -1 -4 -3 0 56 4 7 8 0 0 9 0 0 0 6 0 0 0 0 6 0 0 0 5 0.45 0.51 24 E -2 -2 -2 1 -5 0 6 -4 3 -1 -3 -1 2 -4 -3 -2 -2 -4 -3 -3 0 0 0 6 0 0 71 0 9 6 0 0 8 0 0 0 0 0 0 0 0.93 0.51 25 M 1 -3 -4 -5 -3 -2 -4 -4 -3 0 3 -3 7 -1 -4 -3 -2 -3 -3 -1 15 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37 0 49 0 0 0 0 0 0 0 0.85 0.51 26 L 0 0 2 3 -4 3 2 -3 -2 0 0 0 -2 -3 -3 -2 -2 -4 -3 -1 8 5 10 20 0 15 13 0 0 5 13 6 0 0 0 0 0 0 0 5 0.31 0.51 27 Q 1 1 -1 -2 -3 2 1 -2 -2 -3 -2 2 -2 -4 -2 3 1 -4 -3 -3 14 7 0 0 0 11 11 0 0 0 4 12 0 0 0 35 6 0 0 0 0.42 0.51 28 R -3 3 1 -3 -4 1 0 -4 1 0 0 -1 3 -1 -4 -2 -2 -2 4 1 0 23 8 0 0 6 6 0 3 6 9 0 10 0 0 0 0 0 16 13 0.33 0.51 29 G 0 -3 2 -2 -4 -3 -3 6 -3 -5 -5 -3 -4 -5 -3 -1 -3 -4 -4 -4 6 0 14 0 0 0 0 80 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.30 0.51 30 F -1 0 -4 -5 -3 -3 -4 -4 -3 2 1 -3 2 6 -4 -3 -3 -2 0 1 6 7 0 0 0 0 0 0 0 15 7 0 8 50 0 0 0 0 0 8 0.72 0.51 31 E 1 -2 -2 3 -4 -1 4 -3 -2 -3 -3 1 1 -4 -3 -1 1 -4 -3 0 15 0 0 18 0 0 34 0 0 0 0 9 6 0 0 0 11 0 0 6 0.47 0.51 32 Y -3 -3 -4 -5 -3 -3 -4 -5 2 2 -1 -3 -2 3 -4 -3 -3 0 7 1 0 0 0 0 0 0 0 0 6 13 0 0 0 13 0 0 0 0 56 13 1.02 0.51 33 N -1 -2 5 2 2 -1 2 -2 -2 -4 -4 -2 -4 -5 4 1 -2 -5 -4 -4 5 0 34 12 6 0 13 0 0 0 0 0 0 0 23 9 0 0 0 0 0.73 0.51 34 E 0 -2 -1 4 -4 -1 3 -3 -2 -4 -2 0 -3 -3 3 0 -2 -4 0 -3 6 0 0 29 0 0 27 0 0 0 6 7 0 0 15 6 0 0 5 0 0.57 0.51 35 S 0 -1 2 0 -3 -1 -1 1 -2 -4 -4 4 -3 -4 -3 1 2 4 -3 -3 6 0 9 4 0 0 0 9 0 0 0 37 0 0 0 13 17 6 0 0 0.47 0.51 36 D 2 -2 -1 4 -3 -2 0 -3 -2 -3 -3 0 4 -3 -3 0 1 -4 1 -2 18 0 0 35 0 0 5 0 0 0 0 6 15 0 0 7 8 0 7 0 0.46 0.51 37 T -1 -2 -1 0 -3 0 0 0 -3 -2 -3 1 -2 -4 -3 0 5 -4 -3 0 0 0 0 5 0 5 5 6 0 0 0 9 0 0 0 4 61 0 0 6 0.61 0.51 38 K -2 4 -2 -2 -5 0 -1 -3 -2 -4 -4 6 -3 -5 -3 -2 -2 -4 -3 -4 0 22 0 0 0 0 0 0 0 0 0 78 0 0 0 0 0 0 0 0 1.13 0.51 39 T 3 -2 -2 2 -3 -1 1 -2 -3 -3 -3 2 -3 -4 0 1 1 -4 -3 0 33 0 0 13 0 0 12 0 0 0 0 13 0 0 4 9 9 0 0 8 0.35 0.51 40 Q 0 -1 -1 2 -4 5 3 -3 -2 -4 -4 2 -2 -4 -3 -1 -2 -4 -3 -1 10 0 0 13 0 38 22 0 0 0 0 12 0 0 0 0 0 0 0 5 0.66 0.51 41 L -3 0 -4 -5 -3 -3 -4 -5 -4 3 5 -3 2 -1 -4 -4 -2 -3 -3 0 0 8 0 0 0 0 0 0 0 18 70 0 3 0 0 0 0 0 0 0 0.79 0.51 42 I 0 -4 -3 -3 5 -3 0 -4 -4 2 -1 -3 1 -3 -4 -2 1 -4 -3 4 5 0 0 0 15 0 9 0 0 12 0 0 4 0 0 0 11 0 0 45 0.55 0.51 43 A 2 0 -2 2 -4 -1 -1 -2 -2 -4 -4 5 -3 -4 2 -1 0 -4 -3 -3 19 0 0 11 0 0 0 0 0 0 0 55 0 0 8 0 7 0 0 0 0.63 0.47 44 S 0 -2 -2 -3 3 -2 -2 0 -3 3 0 3 -1 -3 -3 2 -1 -4 -3 0 5 0 0 0 7 0 0 7 0 24 7 22 0 0 0 23 0 0 0 5 0.28 0.47 45 F -3 -4 -4 -5 -4 -4 -4 -5 -1 -2 -1 -4 -2 7 -5 -3 -3 0 7 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 55 0 0 0 0 45 0 1.41 0.47 46 K -2 5 2 -2 -5 0 -1 -3 -2 -4 -4 5 -3 -4 -3 -2 -2 -4 -3 -4 0 37 10 0 0 0 0 0 0 0 0 53 0 0 0 0 0 0 0 0 0.95 0.47 47 K -2 3 1 -2 -5 0 -1 -3 -2 -4 -4 6 -3 -5 -3 -1 -2 -4 -3 -4 0 12 7 0 0 0 0 0 0 0 0 80 0 0 0 0 0 0 0 0 1.03 0.47 48 Q 1 -1 -1 -2 -3 5 2 2 -2 -4 -4 -1 -2 -4 -3 1 1 -4 -3 -3 14 0 0 0 0 44 10 15 0 0 0 0 0 0 0 9 8 0 0 0 0.60 0.47 49 L -3 -4 -5 -5 -3 -4 -4 -5 -3 1 4 -4 2 4 -4 -4 -3 -2 2 -1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7 54 0 5 25 0 0 0 0 8 0 0.76 0.47 50 R -2 5 -2 -3 -4 -1 -1 -3 -2 0 -2 4 3 -4 2 -2 -2 -4 -3 -2 0 41 0 0 0 0 0 0 0 7 0 29 11 0 12 0 0 0 0 0 0.69 0.44 51 K -2 0 1 -2 -4 2 1 -3 -2 -3 1 5 -2 -3 -3 -2 -2 -4 -3 -3 0 0 7 0 0 7 8 0 0 0 16 61 0 0 0 0 0 0 0 0 0.63 0.44 52 S 2 1 -2 -3 -3 -2 -2 -2 -2 0 -2 2 -2 4 -3 2 -1 -2 2 -2 24 7 0 0 0 0 0 0 0 8 0 14 0 22 0 18 0 0 7 0 0.33 0.44 53 L -2 -3 -4 -4 -2 -3 -4 -5 -4 2 5 -3 4 -1 -4 -3 1 -3 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13 64 0 12 0 0 0 11 0 0 0 0.70 0.44 54 K -2 2 -1 -2 -4 3 0 -3 -2 -4 -4 6 -2 -4 -2 -1 -2 -4 -3 -4 0 8 0 0 0 14 0 0 0 0 0 78 0 0 0 0 0 0 0 0 0.96 0.41 K Lambda Standard Ungapped 0.1297 0.3141 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1751 0.3180 PSI Gapped 0.0536 0.2670