Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 L -4 -6 -6 -7 -4 -6 -6 -7 -7 3 -2 -6 -2 -4 -6 -5 -3 -6 -4 7 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16 1 0 0 0 0 0 0 0 0 83 1.81 1.72 2 D -4 -2 3 6 -6 0 -1 -4 -3 -5 -4 -1 -3 -5 -4 2 -1 -7 -4 -5 0 2 13 53 0 4 3 1 0 0 1 3 1 0 0 14 3 0 1 1 1.17 1.81 3 C -4 -7 -6 -4 12 -6 -7 -6 -6 -5 -5 -6 -5 -6 -6 -3 -4 -6 -6 -4 0 0 0 1 97 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 3.62 1.89 4 G -2 -2 -2 -3 -2 -1 -2 6 -4 -6 -5 -2 -5 -6 2 -1 -3 -6 -5 -6 2 2 1 1 1 3 2 68 0 0 1 3 0 0 9 5 1 0 0 0 1.36 1.94 5 I 0 -1 0 2 -4 2 -1 -5 1 -2 -2 0 -2 -2 4 0 0 -2 -2 -1 8 3 5 11 0 8 4 0 3 3 4 5 1 2 23 7 6 1 2 4 0.38 1.94 6 P -3 -5 -5 -5 -6 -4 -4 -6 -6 -4 -3 -4 -5 -7 9 -3 -3 -7 -6 -4 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 3 0 0 0 90 1 1 0 0 1 2.69 1.92 7 E -1 0 -2 0 -6 -1 1 2 -3 -3 -4 -1 -4 -5 6 -2 -2 -7 -6 -3 6 5 2 6 0 2 11 14 1 1 2 3 0 0 39 3 3 0 0 2 0.85 1.95 8 S 0 -2 2 2 -6 0 2 -3 -1 -1 -3 0 -3 -4 3 1 0 -3 -3 -1 7 2 8 10 0 4 15 2 2 3 2 5 0 0 15 12 4 0 1 5 0.33 1.95 9 I -3 -4 -5 -6 -5 -5 -5 -4 -4 5 3 -4 -2 -2 3 -4 -2 -6 -5 3 1 1 0 0 0 0 0 1 0 36 24 1 0 1 14 1 2 0 0 17 0.94 1.95 10 E 1 -1 -2 1 -4 0 3 -4 0 -3 -1 0 -3 -4 4 0 0 -4 -2 -3 11 3 2 8 0 4 16 1 2 1 7 5 1 1 20 8 7 0 2 1 0.38 1.95 11 N -4 -3 7 0 -5 -2 -3 -2 6 -6 -5 -2 -3 -2 -3 -1 -3 -6 -2 -5 1 1 61 4 0 1 1 3 17 0 1 2 1 2 1 4 1 0 1 0 1.56 1.93 12 G 1 -4 -3 -5 -4 -4 -4 7 -4 -5 -6 -5 -3 -5 -5 -1 -2 -6 -6 -4 13 1 0 0 0 0 1 75 0 0 0 0 1 0 0 4 2 0 0 1 1.63 1.92 13 K -1 2 0 2 -4 3 -1 -2 1 -2 -3 1 -1 1 -5 0 0 0 4 -1 5 9 4 10 0 11 3 3 3 3 3 10 1 5 0 6 6 1 13 4 0.28 1.86 14 V -1 -3 -4 -6 -2 -3 -5 -4 0 3 0 -3 0 3 -2 -3 -1 0 1 5 5 2 0 0 1 1 0 1 2 16 9 2 2 10 2 2 3 1 4 35 0.61 1.87 15 E -2 0 1 -1 -3 -1 2 -4 2 -1 -2 -1 -2 -2 -4 2 4 -3 -2 -1 2 5 7 4 0 3 16 1 6 4 4 3 1 2 1 13 22 0 1 5 0.36 1.83 16 D -1 -2 0 0 -1 -3 -1 3 2 -2 -1 -3 -3 2 -1 2 -1 -1 2 -2 4 2 4 5 1 1 5 21 5 2 6 1 0 10 3 14 3 1 7 3 0.28 1.86 17 P 0 -1 1 -1 -2 -2 0 0 -1 -1 0 -1 -2 1 3 2 0 -4 -1 -1 7 3 7 4 1 2 6 6 1 4 8 3 1 6 13 17 6 0 2 4 0.16 1.72 18 E -2 -2 3 3 -3 -1 2 1 2 -4 -3 -1 -3 -4 1 0 2 -5 0 -3 3 2 11 13 1 3 13 9 5 1 3 4 0 1 7 6 13 0 3 1 0.32 1.82 19 S -2 0 0 1 -2 -1 0 1 -2 -3 0 -1 -1 1 -3 2 0 -5 0 1 3 5 5 7 1 3 6 11 1 1 11 4 1 5 1 15 5 0 3 11 0.12 1.80 20 T -2 -2 2 -1 -3 -2 -3 -4 -3 -2 -2 -2 -2 1 0 1 5 -4 2 -2 2 2 9 3 1 1 1 1 1 2 3 2 1 7 4 9 43 0 7 3 0.68 1.76 21 L -2 0 -2 -3 -4 0 0 -2 0 -1 1 -1 -1 0 -3 0 4 -2 -1 1 3 5 2 1 0 4 5 3 3 3 12 4 1 4 1 6 29 1 2 11 0.31 1.72 22 F -3 -4 -4 -4 -2 -4 -3 -4 -1 -3 -1 -5 1 5 -2 -4 -3 2 7 -1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 5 0 4 27 2 1 1 2 45 4 1.37 1.73 23 G -3 -1 -1 -2 -3 2 -1 5 -2 -5 -3 1 -3 -6 1 -1 -2 -5 -4 -4 1 3 3 1 1 9 4 46 1 0 3 10 1 0 8 5 2 0 1 1 0.78 1.78 24 S 2 -3 0 0 -2 -2 0 -2 0 -4 -5 -1 -3 -4 -3 5 -1 -5 -3 -4 16 1 3 5 1 1 5 2 2 1 1 3 1 1 1 53 3 0 1 1 0.83 1.79 25 V -2 2 -2 -3 -3 1 2 -4 -3 -1 -2 1 -1 -3 -5 1 2 -3 -3 3 3 10 2 1 0 5 13 1 1 4 4 9 2 1 0 12 12 0 1 20 0.33 1.81 26 I 1 -6 -1 -6 0 -5 -5 -6 -6 4 -1 -5 -1 -2 -5 -3 0 -1 -4 5 11 0 4 0 2 0 0 0 0 24 4 0 1 1 0 1 4 1 0 47 0.99 1.81 27 R -2 3 -1 -2 -5 3 2 -4 3 -2 -2 0 -2 -3 -4 0 2 -2 -1 -1 2 17 3 2 0 14 11 1 7 3 4 4 1 1 1 6 16 1 2 4 0.40 1.75 28 Y -4 -4 -2 -5 -2 -4 -5 -6 -1 -3 -3 -4 -4 3 -5 -1 -3 0 9 -3 0 1 2 0 1 0 0 0 1 1 1 1 0 11 0 4 1 1 72 1 2.01 1.75 29 T -1 1 -1 -3 -2 2 0 -3 2 -1 -4 0 -1 -2 -3 3 1 -5 2 -1 5 9 2 1 1 9 6 2 6 3 1 5 2 2 1 26 9 0 7 4 0.35 1.82 30 C -4 -6 -5 -6 11 -6 -6 -5 -6 -4 -2 -6 -4 -5 -6 -4 -4 -5 -5 -4 0 0 0 0 92 0 0 0 0 0 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3.32 1.82 31 E -3 1 4 2 -5 3 1 -3 1 -2 -3 2 -1 -2 -3 0 -2 -1 -2 0 2 6 17 12 0 12 8 1 3 3 3 12 2 2 1 6 2 1 1 7 0.36 1.73 32 E 0 -1 1 2 -5 0 5 -2 2 -4 -4 0 -3 -3 -1 0 -2 -1 -2 -3 7 3 6 10 0 3 38 2 4 1 2 4 1 1 3 8 2 1 1 2 0.58 1.78 33 P -3 -3 -2 2 -5 -3 -3 5 -2 -3 -3 -2 -3 -1 5 -2 -2 -2 -5 -3 2 1 2 11 0 1 1 39 1 1 3 2 1 3 24 2 2 1 0 2 0.86 1.74 34 Y -3 -2 -2 -3 -2 -3 -3 0 1 -3 -1 -3 -2 5 -3 -3 -3 0 7 -3 2 2 2 1 1 1 2 8 3 1 7 1 1 24 1 2 1 1 37 1 1.02 1.67 35 Y -3 -1 -3 -4 -2 -1 -3 -4 0 -1 -2 -2 -2 3 -5 -2 1 0 8 0 1 3 1 1 1 2 2 2 2 3 2 2 1 9 0 2 8 1 52 6 1.22 1.79 36 Y -2 1 -1 -3 -2 2 0 -3 1 -2 0 2 2 -1 -2 1 2 2 -1 -1 3 7 2 1 1 10 5 1 3 3 10 12 5 2 2 11 13 3 2 4 0.21 1.77 37 M -2 -1 -4 -4 -5 -3 -3 -4 2 0 5 -3 5 -2 -3 -2 -2 -5 -2 0 4 3 1 1 0 1 2 1 5 5 50 1 13 1 1 3 3 0 1 5 0.77 1.87 38 E -1 1 2 -1 -5 1 1 -2 0 -1 -2 0 0 -2 0 2 0 -6 -1 1 4 7 8 3 0 6 9 4 2 4 4 7 2 2 5 14 5 0 2 10 0.12 2.00 39 G -1 -1 0 -1 -5 0 -1 5 1 -1 -2 0 0 -1 0 -1 0 -5 -4 -2 4 3 4 4 0 4 5 38 4 3 4 5 3 3 4 4 6 0 0 3 0.44 1.89 40 G -1 0 0 0 3 1 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 -5 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0 5 5 0.07 2.01 41 G -1 0 1 0 -5 1 0 -1 2 0 -1 0 2 -4 0 0 0 -5 1 0 6 6 6 6 0 6 6 6 6 6 6 6 6 0 6 6 6 0 6 6 0.10 1.78 42 E -1 0 1 0 -5 1 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 0 0 -5 1 0 6 6 5 6 0 5 6 6 5 6 6 6 5 5 6 6 6 0 5 6 0.08 1.89 43 Y -1 3 -2 -5 -5 -1 -2 -5 0 2 0 -1 0 0 -2 1 -2 -3 5 -1 4 17 2 0 0 3 2 0 2 10 10 3 2 3 2 9 2 0 24 5 0.49 1.70 44 H -1 0 0 -2 1 2 -1 -3 1 -1 -2 -2 -1 -2 -3 0 4 0 -1 2 4 5 4 2 3 10 4 2 3 4 3 2 1 2 1 8 26 1 2 13 0.32 1.73 45 C -3 -5 -5 -2 11 -5 -5 -2 -5 -4 -2 -2 -4 -1 -5 -2 0 -5 -5 -4 0 0 0 3 73 0 0 3 0 0 4 3 0 3 0 3 5 0 0 0 2.35 1.75 46 A -1 -1 2 -1 1 1 1 -1 -1 -2 -1 -2 0 -2 -1 2 3 -5 -2 -2 4 3 9 3 3 7 10 6 1 2 8 2 2 1 3 14 17 0 2 2 0.19 1.68 47 G 3 -1 -1 -1 -1 -1 2 -1 -1 -1 -3 -1 -1 -3 -1 2 1 -5 -2 -1 26 4 2 4 1 3 13 4 2 4 3 3 1 1 3 13 8 0 1 4 0.26 1.74 48 N -3 -1 4 4 -6 3 1 -2 1 -4 -3 -1 -2 -6 -2 1 -1 -1 -3 -4 1 3 19 24 0 14 7 2 3 1 3 3 1 0 2 9 4 1 1 1 0.62 1.87 49 G -2 -1 -2 -3 -2 -2 -3 7 -2 -6 -5 0 -3 -4 -5 -2 -3 -1 -6 -4 3 4 2 1 1 2 2 72 1 0 1 5 1 1 0 1 1 1 0 1 1.39 1.89 50 S -2 0 -1 -2 -5 3 1 -4 -1 0 -2 3 -2 0 -2 0 3 -2 -2 -1 2 4 3 2 0 15 8 1 1 5 5 18 1 4 2 7 16 1 1 5 0.32 1.87 51 W -5 -3 -6 -7 -1 -5 -6 -6 -5 -5 -3 -6 -4 -1 -6 -6 -3 13 0 -6 0 2 0 0 1 0 0 0 0 0 2 0 0 2 0 0 2 89 1 0 3.84 1.77 52 V -2 -1 0 0 -4 0 0 -3 -2 -1 -3 2 -1 -3 -4 4 2 -5 -3 0 2 4 4 6 0 3 5 1 1 4 2 15 2 1 0 32 11 0 1 7 0.43 1.66 53 N -2 -2 4 2 -4 -1 -1 2 1 -3 -3 -1 -4 -2 0 2 -1 -2 -3 -3 3 2 19 13 0 2 3 18 3 1 3 3 0 2 4 16 4 1 1 1 0.44 1.57 54 E 0 1 -1 1 -4 0 2 -1 0 -2 -3 1 -3 -3 3 0 1 1 -2 -2 9 9 3 6 0 4 14 4 2 2 3 7 0 1 15 7 8 2 1 3 0.24 1.53 55 V 1 -1 -1 1 -3 3 1 -2 0 -1 -1 1 -2 -2 2 -1 0 -2 -2 0 11 3 3 8 0 12 8 3 2 3 7 9 1 2 9 4 6 1 1 7 0.16 1.47 56 L -1 -2 0 0 -3 -2 -1 1 -2 0 1 -1 0 -3 5 -2 -1 1 -2 -1 5 2 4 6 1 2 5 10 1 5 13 3 2 1 27 3 3 2 1 4 0.39 1.40 57 G -2 1 1 -1 1 1 1 3 1 -1 -2 0 -2 -3 -2 1 -1 0 -2 0 3 8 8 4 2 5 8 21 3 3 4 5 1 1 2 9 3 1 2 7 0.19 1.50 58 P -2 -1 -2 -1 8 -1 2 -2 -2 -2 -3 1 -2 -3 -1 -2 0 -4 -2 -2 4 4 2 3 37 2 13 3 1 2 2 8 1 1 4 2 6 0 1 3 0.92 1.57 59 E -2 1 -1 -1 -5 1 4 -3 -2 -3 -3 4 -2 -4 -2 0 0 -5 -4 -2 2 6 2 3 0 6 32 1 1 2 3 21 1 1 2 7 6 0 0 3 0.58 1.71 60 L 1 -2 -4 -4 -2 -2 0 -4 -5 3 3 -2 0 -3 3 -2 -2 -2 -3 1 11 3 1 0 1 2 7 1 0 15 25 2 2 1 13 3 2 1 1 10 0.40 1.79 61 P -2 -4 -3 -3 -5 -3 -5 -6 -5 2 -3 -3 -2 -4 7 -3 -2 -6 -5 1 3 1 1 1 0 1 0 0 0 14 1 1 1 0 59 2 2 0 0 11 1.54 1.88 62 K -2 2 -1 0 -4 2 1 -4 -1 -1 -3 2 -2 -4 -2 1 2 -2 -3 2 2 12 2 5 0 8 10 1 2 3 2 12 1 0 1 10 14 1 1 12 0.31 1.91 63 C -4 -7 -3 -7 11 -6 -7 -6 -6 -5 -5 -6 -5 -3 -6 -4 -3 -6 -6 -4 0 0 1 0 96 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 3.52 1.84 64 V -3 -1 -4 -3 -5 1 4 -2 -1 1 2 -1 -1 -2 -1 -2 -2 -5 -2 2 2 3 0 1 0 7 25 3 1 7 21 3 2 2 3 2 2 0 1 16 0.41 1.78 65 P -1 -4 -5 -3 -4 -3 -2 -4 -5 -6 -5 -3 -5 -7 8 -4 -4 -7 -6 -5 6 1 0 1 0 1 3 0 0 0 1 1 0 0 85 0 0 0 0 0 2.42 1.69 66 V -3 -6 -6 -6 -4 -5 -6 -6 -6 2 -2 -5 -2 -4 -6 -5 -3 -6 -4 7 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9 0 0 0 0 0 0 0 0 0 91 1.85 1.56 K Lambda Standard Ungapped 0.1415 0.3142 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1539 0.3175 PSI Gapped 0.0471 0.2670