Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 F -4 -6 -6 -6 -4 -6 -6 -6 -5 7 1 -6 -1 5 -6 -5 -4 -4 1 -1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 62 11 0 0 23 0 0 0 0 4 0 1.35 1.21 2 D -4 -4 0 8 -6 -2 2 -4 -4 -6 -6 -2 -6 -6 -1 -3 -4 -7 -6 -6 1 0 3 80 0 1 13 0 0 0 0 1 0 0 2 0 0 0 0 0 1.80 1.23 3 L 2 -5 -5 -6 -4 -5 -5 -5 -5 4 3 -5 1 0 -3 -3 0 -5 -4 1 20 0 0 0 0 0 0 0 0 27 32 0 2 3 1 1 6 0 0 8 0.71 1.29 4 A 1 2 2 2 -5 3 -1 1 -2 -4 0 -1 -3 0 -2 0 -3 -5 -4 -3 14 12 9 11 0 14 3 11 1 1 10 2 0 4 2 7 0 0 0 1 0.29 1.32 5 S 3 -4 2 2 -3 -2 0 2 3 -4 -3 -3 -3 -5 -3 2 0 -6 -5 -3 24 0 9 11 0 1 5 15 6 1 3 0 0 0 1 17 6 0 0 1 0.46 1.37 6 E -3 -2 -3 1 -7 0 7 -5 -1 -6 -6 -2 -5 -6 0 -3 -4 -6 -5 -6 1 2 0 6 0 1 85 0 1 0 0 0 0 0 4 0 0 0 0 0 1.70 1.38 7 Q -1 0 2 0 -5 5 3 -2 0 -6 -5 0 -4 -6 -4 2 2 -6 -5 -5 3 5 9 4 0 27 18 3 2 0 0 3 0 0 0 14 12 0 0 0 0.67 1.41 8 H -3 -1 5 1 -6 3 1 -4 5 -4 -5 1 -4 -5 -5 -1 2 -6 -2 -3 1 3 28 6 0 14 7 0 16 1 0 8 0 0 0 2 12 0 1 2 0.79 1.43 9 T -2 -4 -3 -4 -4 -3 -4 -4 -5 -2 -4 -1 -4 -5 -2 2 7 -6 -5 -2 1 0 0 0 0 0 0 1 0 2 0 3 0 0 1 14 76 0 0 1 1.46 1.45 10 V 2 -2 -2 -5 -4 -2 -5 -5 -2 3 1 -3 3 1 -5 0 0 -5 -1 3 21 2 2 0 0 2 0 0 1 15 11 1 7 6 0 8 5 0 2 17 0.41 1.47 11 R -1 2 2 -2 -5 3 -3 -4 2 -3 -2 1 7 -1 -5 0 -1 -5 -4 -1 4 10 9 1 0 14 1 1 6 1 2 7 29 3 0 6 3 0 0 4 0.64 1.48 12 D -1 -5 -1 7 -6 -3 0 -4 -2 -6 -6 -4 -6 -7 4 -2 -3 -7 -6 -6 5 0 2 66 0 0 5 1 1 0 0 0 0 0 19 1 1 0 0 0 1.56 1.48 13 T 0 -3 -2 -5 -5 -3 -4 -3 0 -1 -2 -4 1 -1 6 -2 3 -1 -5 -1 8 1 2 0 0 1 0 2 2 3 3 0 4 3 42 2 20 1 0 5 0.95 1.50 14 A 4 -4 -2 3 -5 0 4 -3 -3 -4 -4 -2 1 -4 -4 -1 -1 -6 -5 -3 33 0 1 18 0 3 30 1 0 0 1 1 4 0 0 3 2 0 0 1 0.78 1.51 15 F -5 -6 -6 -7 -5 -6 -6 -6 -5 -2 1 -6 -3 9 -7 -6 -4 -2 0 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 13 0 0 82 0 0 1 0 0 2 2.09 1.51 16 L -5 -5 -7 -7 -4 -5 -6 -7 -6 0 7 -6 0 -3 -6 -6 -4 -5 -4 -1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 96 0 1 0 0 0 0 0 0 1 1.76 1.51 17 M -2 -4 -5 -4 -5 0 -2 -4 -5 -1 0 -4 10 -2 -6 -4 -3 -5 -4 0 2 0 0 1 0 4 3 1 0 2 4 0 76 1 0 1 1 0 0 4 1.89 1.51 18 E -1 -2 -2 -1 -6 6 5 -4 -1 -6 -4 0 -4 -6 -4 -1 -2 -6 -5 -5 5 1 1 3 0 39 38 0 1 0 2 4 0 0 0 4 2 0 0 0 1.16 1.51 19 Q -1 -3 -3 -4 -5 8 -2 -4 -1 2 -4 -2 2 -5 -5 -3 -3 -5 -4 -1 5 0 0 0 0 68 0 1 1 11 0 0 5 0 0 0 1 0 0 4 1.39 1.51 20 L -4 -5 -6 -6 -5 -4 -5 -6 -5 1 2 -5 10 -1 -6 -5 -4 -5 -4 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6 16 0 73 1 0 0 0 0 0 0 2.00 1.64 21 E -2 -2 -3 0 -6 3 7 -4 -2 -5 -4 -2 -1 -6 -4 -3 -2 -6 -5 -4 3 1 0 4 0 10 67 1 1 0 2 1 2 0 0 1 2 0 0 1 1.26 1.61 22 L -3 -3 -6 -7 -5 -4 -6 -6 -5 1 3 -4 1 -2 -6 -5 -4 11 0 -2 2 2 0 0 0 0 0 0 0 7 26 1 3 0 0 1 1 48 2 1 1.83 1.61 23 R -5 8 0 -4 -6 -2 -2 -5 1 -6 -5 -1 -4 -6 -5 -4 -4 -6 -5 -6 0 85 4 0 0 1 1 0 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.95 1.61 24 E -4 -3 -3 -1 -7 -1 8 -5 -3 -4 -6 -2 -2 -6 -4 -3 -4 -6 -5 -5 0 0 0 2 0 0 91 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1.92 1.63 25 E 4 1 -2 -1 -5 2 3 -3 -1 -5 -3 0 0 -5 -4 0 1 -6 -5 -4 31 6 1 2 0 9 21 1 1 0 2 4 3 0 0 5 8 0 0 1 0.51 1.62 26 L -4 -4 -6 -6 -4 -4 -6 -6 -6 2 6 -5 1 -2 -6 -5 -3 -2 -4 2 1 1 0 0 0 1 0 0 0 8 70 0 2 1 0 0 1 1 0 11 1.22 1.76 27 D 1 -4 -3 4 -6 0 6 -3 -2 -5 -5 -3 0 -6 -4 -2 -3 -6 -5 -4 10 0 1 24 0 2 49 2 1 1 1 0 3 0 0 3 1 0 0 1 1.08 1.75 28 E 0 -3 0 5 -3 -1 5 -4 -3 -4 -4 -3 -5 -5 -4 -1 -2 -6 -5 -4 8 1 4 33 1 2 37 1 0 1 1 0 0 0 0 4 2 0 0 1 0.96 1.74 29 I 4 -4 -4 -5 0 -4 -4 -3 -4 4 1 -4 -2 -2 -4 -2 -2 -4 -4 0 40 1 0 1 2 0 1 2 0 27 12 1 0 2 1 1 1 0 0 5 0.73 1.61 30 E 0 4 -2 -1 -4 2 3 -3 1 -2 -4 1 -2 -2 -1 0 0 -4 -2 -2 8 20 2 3 0 9 17 2 3 2 2 6 1 2 3 6 6 0 1 3 0.34 1.66 31 Q 1 -1 1 3 -3 1 1 -2 3 -3 -3 -1 -1 -3 -4 2 0 -4 -3 -3 13 3 6 15 1 7 8 3 8 1 2 3 1 1 1 14 6 0 1 1 0.30 1.64 32 A 4 -1 -1 -1 0 1 0 -1 -2 -3 -3 -1 -2 -5 -3 3 0 -5 -3 -2 31 3 2 3 2 6 6 5 1 1 2 3 1 0 1 21 4 0 1 3 0.39 1.74 33 K 2 0 0 2 -1 1 1 0 0 -4 -5 3 -3 -5 -1 1 0 -5 -5 -3 15 5 3 11 1 6 9 8 2 1 1 15 1 0 3 8 5 0 0 2 0.27 1.76 34 D -1 -3 2 7 -5 -1 0 -2 -4 -5 -6 -3 -5 -6 -1 -1 -2 -6 -5 -5 5 1 10 60 0 2 5 3 0 0 1 0 0 0 3 5 2 0 0 0 1.26 1.77 35 E 0 -2 -3 -1 -5 -1 3 -3 0 0 1 -1 0 -2 3 -1 -2 -3 -3 1 8 2 1 3 0 3 18 2 2 6 12 3 2 2 13 4 2 0 1 10 0.20 1.79 36 A 3 -3 0 4 -5 1 2 -2 0 -3 -4 -2 -2 -6 -2 0 0 -6 -5 -3 20 1 4 24 0 6 13 3 2 1 1 1 1 0 2 7 5 0 0 2 0.44 1.81 37 R 4 0 -3 -2 -3 2 3 0 -2 -3 -2 -1 -3 -6 -5 -2 -1 -6 -5 -2 38 5 1 2 1 8 16 7 1 1 3 4 1 0 0 1 4 0 0 2 0.49 1.84 38 L -3 -3 -6 -6 -3 -5 -6 -7 -3 3 5 -4 1 -2 -6 -5 -4 -5 -2 1 1 1 0 0 1 0 0 0 1 16 60 1 2 1 0 0 0 0 2 8 1.04 1.85 39 E 2 -1 0 4 -5 1 3 -3 -1 -4 -3 -1 -1 0 -4 -2 0 -6 -1 -3 16 3 5 21 0 5 15 1 1 1 3 4 1 4 1 2 5 0 3 2 0.31 1.85 40 S 3 0 -1 2 -5 2 1 -2 0 -4 -4 0 -4 -6 -3 1 0 -6 -5 -2 27 5 2 12 0 8 9 2 2 1 1 6 0 0 1 10 5 0 0 3 0.35 1.82 41 F -3 -5 -5 -4 -5 -4 -4 -6 -3 1 4 -5 0 6 -5 -3 -3 -4 -1 -1 2 0 0 1 0 1 1 0 1 8 39 0 2 31 0 2 2 0 1 3 0.90 1.79 42 I 1 1 -2 2 -5 0 1 -2 2 0 0 1 0 0 -4 0 -1 -5 0 -3 10 6 2 10 0 5 8 4 4 7 9 9 2 3 0 7 3 0 3 1 0.08 1.78 43 K 2 1 0 1 -3 2 0 -1 1 -4 -3 2 0 -4 -3 1 0 -6 -5 -3 15 7 4 8 0 9 6 5 4 1 2 12 2 1 1 11 5 0 0 2 0.20 1.82 44 R -2 4 -2 1 -6 3 4 -4 1 -5 -4 1 -1 -4 -5 -1 -1 -6 -3 -3 3 20 1 7 0 12 27 1 3 0 1 6 1 1 0 3 3 0 1 2 0.59 1.87 45 V -1 -5 -1 -4 -5 -3 -4 -6 -6 3 3 -5 1 -1 -6 -3 -1 -5 -2 4 6 0 4 1 0 1 1 0 0 17 26 0 3 2 0 2 3 0 1 26 0.58 1.87 46 K 0 3 0 1 -4 3 1 -2 0 -5 -3 3 -3 -4 -5 0 -2 -6 -3 -4 8 16 5 7 0 12 9 2 2 0 3 17 1 1 0 7 3 0 1 1 0.36 1.87 47 K 2 -1 0 0 -3 4 1 0 0 -3 -3 2 -4 -6 -5 0 0 -6 -5 -2 18 3 4 4 0 18 10 6 2 1 3 11 0 0 0 5 5 0 0 3 0.32 1.89 48 M 2 -1 -2 0 -5 1 2 -4 1 -2 -1 1 4 -4 -5 -1 -1 3 -2 -2 18 4 2 4 0 6 15 0 3 2 7 8 11 0 0 4 4 3 2 3 0.26 1.90 49 F -1 3 -3 -3 -4 3 -1 -3 1 2 1 -1 2 0 -6 -2 -1 -2 1 -1 5 15 1 1 0 13 4 2 4 11 11 3 5 5 0 3 3 1 5 4 0.23 1.90 50 D 0 3 0 2 -3 3 1 -3 -1 -3 -2 3 -5 -6 -5 -1 0 -6 -5 -4 7 13 4 12 1 12 9 2 2 2 5 17 0 0 0 4 6 0 0 1 0.35 1.90 51 T 2 0 0 1 -5 3 3 -1 1 -3 -4 1 -3 -6 -4 0 1 -6 -5 -2 16 4 4 6 0 13 16 5 3 1 2 7 1 0 0 5 9 0 0 3 0.30 1.90 52 R -2 3 -3 -4 2 1 -3 -5 0 0 3 -1 2 -3 -6 -4 -3 3 0 -1 4 16 2 1 5 6 2 0 2 5 30 3 4 0 0 1 2 4 4 4 0.40 1.90 53 H -3 -1 -1 -3 -2 1 -1 -5 2 1 3 -2 1 0 -6 2 -1 -3 1 0 1 4 3 1 1 5 5 0 5 8 24 2 3 4 0 14 3 0 5 6 0.22 1.90 54 Q 2 1 1 1 0 3 1 -1 0 -4 -4 0 -3 -5 -4 0 0 -6 -4 -3 20 7 5 8 2 15 9 4 2 1 2 5 0 0 1 7 5 0 0 2 0.28 1.88 55 L 0 0 -1 0 -4 4 3 -2 -1 -2 -1 1 -2 -6 -5 1 -1 -6 -5 -3 9 5 2 5 0 18 18 3 1 2 7 7 1 0 0 10 4 0 0 1 0.32 1.88 56 M -3 -6 -7 -7 1 -4 -5 -7 -6 2 4 -6 4 4 -6 -6 -4 -5 -2 0 1 0 0 0 3 1 1 0 0 11 44 0 10 19 0 0 1 0 0 6 0.99 1.88 57 V 3 0 -3 -2 -3 1 2 0 -2 -3 -1 0 -2 -4 -4 1 0 -6 -5 1 25 5 1 2 1 5 13 8 1 1 6 6 1 0 0 9 4 0 0 9 0.24 1.89 58 E 1 0 0 1 -6 4 2 -2 0 -1 -4 0 -3 -6 -4 0 1 -2 -5 -2 12 5 4 6 0 16 15 3 2 4 2 4 1 0 1 8 8 1 0 3 0.28 1.89 59 Q 3 -3 -2 0 1 4 1 -4 -1 -2 2 -3 -2 -2 -5 0 -1 -2 -4 -3 24 1 1 5 3 16 8 1 2 2 21 0 1 2 0 6 3 0 0 1 0.39 1.89 60 L -5 -4 -3 -3 -2 -5 -5 -6 -5 2 5 -6 -1 5 -5 -4 -4 4 2 -2 0 1 1 2 1 0 1 0 0 11 46 0 1 20 0 1 0 5 6 1 0.95 1.85 61 D 0 -1 3 6 -6 1 1 -3 -2 -4 -5 -1 -5 -6 -3 0 -2 -6 -6 -4 9 3 11 43 0 6 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