Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 W -6 -6 -7 -7 -5 -6 -6 -6 -5 -4 -4 -6 -4 7 -7 -6 -5 11 1 -5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44 0 0 0 54 2 0 2.86 1.51 2 D -1 -2 3 5 -4 0 3 -1 -3 -5 -3 -2 -4 -5 -4 0 -2 1 -2 -4 4 1 12 35 0 3 18 5 0 0 3 1 0 0 0 8 3 2 1 1 0.72 1.71 3 S 1 2 2 0 2 1 -2 -3 3 -3 -2 1 -1 -2 -4 2 1 -3 0 -2 10 10 8 4 4 5 2 1 6 1 5 9 1 2 0 17 7 0 4 2 0.25 1.76 4 L -5 -6 -7 -7 -5 -6 -6 -7 -6 1 6 -6 3 0 -6 -6 -4 -5 -4 -1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6 83 0 5 3 0 0 0 0 0 3 1.59 1.78 5 P -3 -5 -4 -4 -6 -4 -4 -5 -4 -5 -5 -4 -6 -5 8 0 -2 -7 -4 -6 1 0 1 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 86 6 2 0 1 0 2.50 1.84 6 D -2 -1 0 6 -4 -1 2 -4 1 -3 -3 -1 -4 -3 1 0 -1 -4 -1 -2 4 3 3 41 0 2 12 1 4 1 2 3 0 1 7 5 5 0 2 3 0.72 1.86 7 E -4 -3 -2 2 -4 -1 7 -4 1 -5 -5 -1 -5 -4 -1 -1 -3 -6 -3 -3 0 1 1 10 0 1 67 1 3 0 1 3 0 1 3 4 1 0 1 2 1.32 1.84 8 L -3 -6 -5 -7 0 -5 -6 -6 -6 5 4 -6 1 -3 -4 -5 -1 -6 -4 4 2 0 0 0 2 0 0 0 0 31 33 0 2 0 1 0 3 0 0 24 1.02 1.85 9 L -1 -2 -5 -6 1 -2 -4 -5 -4 2 5 -3 1 -1 -6 -2 -3 3 -3 1 6 2 0 0 3 2 1 1 0 9 51 2 3 2 0 4 1 4 1 9 0.73 1.86 10 L -2 -2 -5 -5 -2 -2 -1 -6 -2 2 5 -4 2 0 -5 -3 -3 -3 -1 1 3 2 0 0 1 2 5 0 1 9 52 1 4 4 0 2 1 0 2 9 0.74 1.86 11 G -2 3 1 -2 -1 2 0 -2 6 -4 -2 3 -1 -3 -4 -1 -1 -6 0 -4 3 17 6 2 1 9 6 3 17 1 4 15 2 1 0 4 3 0 3 1 0.53 1.84 12 I -4 -6 -7 -7 -2 -6 -6 -7 -7 7 -1 -6 -1 -2 -6 -5 -3 -2 -5 3 1 0 0 0 1 0 0 0 0 73 3 0 1 1 0 1 1 1 0 18 1.71 1.83 13 F -4 -6 -7 -7 -2 -6 -7 -7 -3 -2 3 -6 0 8 -7 -6 -4 -1 0 -3 1 0 0 0 1 0 0 0 1 1 24 0 1 68 0 0 1 1 1 1 1.86 1.84 14 S 0 0 -1 -2 -1 2 -1 -1 -1 -4 -3 0 -2 -3 -4 5 0 -3 -3 -3 7 5 2 1 1 9 3 4 2 1 2 6 1 1 0 48 4 0 1 1 0.67 1.93 15 C -4 -1 -2 -5 1 -2 -4 -5 4 -3 -1 -3 -1 5 -6 -3 -4 3 7 -4 1 4 2 0 3 2 1 0 8 1 5 1 2 25 0 2 1 4 39 0 1.30 1.93 16 L -4 -4 -7 -7 0 -5 -5 -7 -6 0 6 -6 1 -1 -6 -5 -3 -5 -4 0 1 1 0 0 2 0 1 0 0 2 84 0 2 2 0 1 1 0 0 4 1.53 1.91 17 C -3 -3 1 5 1 -2 0 -2 -2 -5 -5 -2 -3 -5 4 2 0 -4 -4 -5 1 1 6 27 3 1 5 3 1 0 1 2 1 0 23 17 5 0 1 0 0.78 1.91 18 L 1 -3 -4 -3 -1 -2 -2 -2 2 0 1 -2 0 0 4 -2 0 0 -2 1 11 1 0 1 1 2 3 4 5 5 16 2 2 4 21 2 5 1 2 10 0.33 1.91 19 P -1 2 -1 -1 -3 2 0 -3 1 -2 -2 3 -1 -2 2 -1 0 -2 -1 -1 6 11 3 3 1 8 6 2 3 3 3 17 1 2 11 5 5 1 3 5 0.25 1.92 20 E -2 -3 -1 6 -3 -1 2 -3 -1 -4 -5 -3 -2 -4 -4 2 1 -3 -4 -4 2 1 2 43 1 3 15 1 2 1 0 0 1 1 0 18 8 0 1 1 0.95 1.90 21 L -4 0 -4 -6 -3 -4 -6 -7 -4 1 6 -3 0 -1 -6 -4 -3 -3 -3 0 1 6 1 0 1 1 0 0 0 7 72 1 1 2 0 1 1 0 1 6 1.21 1.90 22 L 1 -2 -3 -5 7 -4 -4 -1 -3 1 3 -4 1 -1 -3 -2 -2 -2 -1 1 11 3 1 1 19 1 1 5 0 7 25 1 3 2 1 3 2 0 3 11 0.55 1.88 23 K 0 6 1 -3 2 1 -2 -3 0 -2 -3 1 -2 -4 -4 0 -1 -3 -3 -2 7 39 8 1 4 5 1 1 2 3 2 9 1 1 1 8 4 0 1 2 0.66 1.88 24 V 4 -5 -4 -6 7 -4 -5 -4 -6 0 1 -4 0 -2 -4 -1 -2 -2 -4 2 30 0 1 0 24 1 0 1 0 5 12 1 2 1 0 3 2 1 0 16 0.90 1.88 25 S 3 0 -3 -4 0 0 -2 1 -3 -3 -4 -2 0 -3 -3 4 0 -6 -4 -3 27 5 1 0 2 4 2 9 0 1 1 1 2 1 1 35 4 0 1 1 0.64 1.88 26 G 0 3 -3 -4 4 4 -2 -2 -2 -2 2 -2 0 -3 -4 0 -1 -3 -3 -2 7 15 1 0 7 20 2 3 1 2 21 2 2 1 1 7 4 0 1 2 0.44 1.89 27 V -2 -6 -6 -6 0 -5 -5 -6 -6 0 -2 -5 -1 -4 -5 -2 1 -6 -5 7 3 0 0 0 2 0 0 0 0 3 2 0 1 0 0 3 10 0 0 76 1.50 1.89 28 C -3 -5 0 -4 10 -5 -5 -4 -5 -5 -5 -4 -5 -6 -5 3 -3 -6 -5 -4 1 0 5 1 67 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 22 1 0 0 0 2.35 1.87 29 K -3 6 -3 -4 -3 0 -3 -4 2 -5 -5 5 -3 -6 -4 -1 -2 0 -3 -4 1 42 1 0 1 3 1 1 4 1 1 34 0 0 0 5 2 1 1 1 1.20 1.88 30 R -2 6 0 -3 -4 2 -2 -4 3 -4 -2 2 -2 -3 -4 0 0 -2 -1 -4 3 41 4 1 0 8 2 1 6 1 4 9 1 1 1 8 5 1 2 1 0.75 1.92 31 W -5 -6 -7 -8 -3 -6 -6 -6 -2 -4 -1 -6 -1 4 -7 -6 -5 12 0 -4 1 0 0 0 1 0 0 0 1 1 6 0 1 17 0 0 1 70 1 1 3.09 1.88 32 Y -2 5 3 -3 -1 1 -2 -4 5 -6 -4 1 -3 -2 -5 -2 -4 -1 4 -6 2 27 15 1 2 5 1 1 15 0 2 7 1 1 0 3 1 1 16 0 0.89 1.88 33 R 0 4 0 0 -1 1 1 -3 2 -2 -3 1 -2 -2 -4 0 0 -3 0 -2 7 24 4 5 1 7 10 2 4 2 3 7 1 2 0 8 5 0 3 3 0.35 1.89 34 L -1 -4 -5 -7 1 -5 -5 -6 -4 3 5 -5 2 -1 -5 -4 -2 -1 -3 3 5 1 0 0 3 0 0 0 0 16 47 0 4 2 0 1 2 1 1 17 0.89 1.90 35 A 5 -4 -3 -4 4 -5 -5 -2 -4 0 -2 -4 -2 0 -4 2 0 -6 -4 0 43 0 1 0 8 0 0 2 0 6 4 0 1 3 0 16 6 0 0 7 0.71 1.90 36 S -2 2 3 0 0 1 0 -3 2 -4 -1 0 0 1 -5 2 -1 2 1 -3 2 10 12 5 2 5 6 1 4 1 7 4 3 7 0 16 4 2 5 2 0.25 1.91 37 D -4 -2 0 7 -3 -1 0 -4 1 -4 -5 -3 -2 -5 -5 -1 -1 -7 -3 -5 1 2 4 69 1 2 4 0 4 1 1 1 1 0 0 5 4 0 1 1 1.49 1.91 38 E -3 -1 3 3 -4 0 3 0 -1 -5 -5 -1 -5 -4 4 0 -2 -4 -4 -5 2 4 12 16 0 3 19 6 2 1 1 3 0 1 21 5 2 0 0 0 0.66 1.90 39 S 0 1 0 -1 0 1 1 -3 0 -2 0 -1 -1 0 -3 3 1 -1 -1 -1 8 7 4 3 2 7 7 2 2 2 8 3 1 4 1 22 8 1 2 5 0.18 1.91 40 L -4 -3 -4 -7 -3 -5 -6 -6 -3 1 6 -6 0 0 -5 -5 -3 -5 -4 1 1 2 1 0 0 0 0 0 1 6 75 0 1 3 0 1 1 0 0 7 1.28 1.91 41 W -6 -6 -7 -8 -6 -5 -6 -6 -6 -6 -5 -7 -5 -2 -7 -6 -6 13 1 -6 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 98 2 0 4.42 1.83 K Lambda Standard Ungapped 0.1432 0.3255 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1974 0.3182 PSI Gapped 0.0604 0.2670