Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 R -4 6 -3 -4 -6 3 -2 -5 2 -6 -5 5 -4 -6 -5 -3 -4 -6 -4 -6 0 49 0 0 0 14 0 0 5 0 0 32 0 0 0 0 0 0 0 0 1.48 1.52 2 P -2 -4 -2 -2 -6 0 0 -5 -3 -4 -5 -1 -4 -7 8 -3 -2 -7 -5 -4 2 1 2 1 0 4 6 0 1 1 0 4 0 0 73 1 2 0 0 1 1.95 1.82 3 D 1 -2 1 5 -4 -2 3 -3 1 -4 -5 -1 -4 -5 -1 -1 -3 -2 -3 -2 11 1 7 35 0 1 21 2 3 1 1 4 0 0 3 4 1 1 1 3 0.74 1.88 4 F -2 1 -4 -4 0 -3 -3 -5 -1 4 0 -2 -1 3 1 -2 -2 -3 2 2 4 8 1 1 2 1 2 1 2 22 8 2 1 14 8 3 2 0 6 14 0.42 1.90 5 C -3 -7 -6 -7 12 -6 -7 -4 -6 -5 -5 -6 -5 -6 -6 -3 -3 -6 -6 -4 1 0 0 0 96 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 3.57 1.95 6 L -2 0 0 -2 -3 1 0 -3 1 -2 2 0 1 1 -5 2 1 1 0 -2 3 4 5 2 0 7 5 2 3 2 20 6 3 7 0 15 8 2 3 2 0.20 2.00 7 E -1 -2 -4 -3 -4 2 1 -4 -1 -2 5 -1 2 -2 -5 -3 -4 -1 -1 -2 4 2 1 2 0 11 11 1 2 1 49 3 5 1 0 1 1 1 2 2 0.69 2.00 8 P -2 -1 -3 0 -6 -1 0 -3 -2 -4 -4 0 -2 -4 7 -1 -2 -3 -3 -4 3 3 1 5 0 3 6 2 1 1 2 6 1 1 58 4 2 0 1 1 1.36 2.00 9 P 1 0 -4 -4 -6 -1 -2 -3 -1 -1 0 2 3 -4 5 -1 -3 -4 -2 -1 11 5 1 1 0 3 2 1 1 3 11 13 7 1 28 5 1 0 2 5 0.55 2.00 10 Y 0 -2 0 5 -5 0 2 -4 -1 -3 -3 1 -3 -2 -1 -1 -3 -3 0 0 7 2 4 33 0 3 14 1 1 1 2 8 1 2 3 5 1 0 4 8 0.55 2.00 11 A 0 1 -2 -1 -4 0 1 -3 1 -1 -3 0 -1 -2 3 0 2 -3 -2 1 6 7 2 3 0 5 10 2 4 4 2 6 2 2 14 7 13 0 2 9 0.23 1.98 12 G -3 -3 -3 -3 -4 -4 -3 7 -4 -7 -5 -4 -6 -6 -5 -2 -4 -6 -6 -5 1 1 1 1 0 1 1 89 0 0 1 1 0 0 0 2 0 0 0 1 2.02 1.96 13 A -3 1 1 0 -4 -1 -1 -3 0 -2 -2 -1 -2 -3 6 1 0 -4 -2 -2 1 9 6 4 0 2 3 1 2 2 4 3 1 1 37 11 6 0 1 3 0.68 1.98 14 C -3 -5 -5 -7 11 -6 -6 -1 -4 -4 -5 -6 -5 -4 -5 -3 -4 -3 -4 -4 1 1 0 0 86 0 0 6 0 0 0 0 0 1 1 1 0 0 0 0 3.06 1.97 15 R -2 4 1 -1 -3 0 -1 -2 0 -4 -2 3 -1 -1 -4 0 1 -1 -1 -4 2 26 7 4 0 4 4 4 2 0 4 18 2 2 1 6 8 1 2 1 0.46 1.99 16 A 4 -1 0 1 -4 -1 -1 3 -1 -4 -4 -1 -1 -4 -2 0 -2 -4 -3 -3 37 3 5 8 0 3 4 19 1 1 1 3 1 0 2 5 2 0 1 1 0.54 1.98 17 R 0 1 2 -3 -3 -2 -2 -3 1 -1 0 0 1 1 -2 1 -1 4 4 -2 8 7 9 2 0 2 3 2 4 3 8 5 3 6 2 13 3 5 16 3 0.28 1.96 18 I -2 -3 -2 -3 -3 -1 -1 -5 1 3 1 -2 2 4 -5 -2 0 -2 0 1 4 2 2 1 0 3 5 1 3 18 10 3 6 19 0 4 6 0 3 10 0.40 1.93 19 I -2 2 -2 -3 -4 0 0 -5 0 1 0 0 -1 -2 5 -1 1 -1 -1 0 3 9 2 1 0 5 5 1 2 9 10 5 1 2 24 4 8 1 2 6 0.38 1.92 20 R -2 7 -3 -5 -3 -1 -3 -3 0 -6 -3 2 1 -4 -4 -1 -4 -3 -2 -2 4 63 1 0 1 2 1 2 2 0 2 9 3 0 0 5 0 0 2 3 1.30 1.90 21 Y -5 -4 -5 -7 -3 -5 -6 -6 -1 -4 -4 -6 -4 4 -7 -5 -4 11 6 -4 1 1 1 0 1 0 0 0 1 1 1 0 0 18 0 1 1 47 28 1 2.47 1.89 22 F -1 -3 -4 -6 -3 -4 -5 -1 2 -4 -4 -5 -2 5 -6 -2 -2 4 8 -4 7 1 1 0 1 1 0 5 5 0 0 0 1 19 0 4 3 4 45 1 1.27 1.94 23 Y -4 -4 -5 -4 -1 -5 -5 -6 1 -4 -3 -5 -2 6 -6 -4 -5 2 8 -4 1 1 0 1 1 0 0 0 2 0 2 0 1 31 0 1 0 2 53 0 1.85 1.89 24 N -4 -2 6 6 -6 -2 -2 -4 0 -3 -5 -3 -5 -6 -5 -1 -3 -6 -2 -3 1 2 38 38 0 1 2 0 2 1 1 1 0 0 0 4 1 0 2 2 1.24 1.96 25 A 1 0 -1 -2 -3 0 -2 -1 0 -2 -3 1 0 -1 4 1 0 0 -1 -1 14 4 3 2 1 3 2 4 2 2 2 9 3 2 17 12 6 1 2 5 0.21 1.99 26 K 0 1 0 0 -5 1 2 -3 0 -2 -2 1 0 -1 -3 1 2 -2 0 0 8 7 4 4 0 6 11 2 2 2 5 9 2 3 1 10 12 1 3 6 0.11 1.95 27 A 1 -1 0 0 -2 0 0 -3 -1 -2 -2 1 -1 -3 -3 3 3 -1 -2 -1 10 3 4 5 1 3 5 1 2 3 4 9 1 1 1 19 20 1 2 4 0.26 1.91 28 G -2 1 2 0 -2 1 -1 4 1 -4 -4 2 1 -1 -3 -2 -2 -1 -2 -4 2 7 11 5 1 7 4 27 3 1 2 11 3 2 1 3 2 1 2 1 0.38 1.84 29 L 0 2 -1 -2 -2 2 1 -3 1 -1 -2 2 1 -1 -4 1 1 -1 -2 0 9 12 3 2 1 9 8 1 3 3 3 11 4 3 0 9 8 1 1 6 0.16 1.79 30 C -2 -2 -5 -6 11 -5 -6 -5 -6 -4 -4 -5 -4 -5 -1 -4 -2 2 -5 -4 3 3 0 0 81 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 3 3 0 0 2.73 1.74 31 Q -2 1 -2 -1 -5 3 3 -3 1 -1 -1 1 2 -2 -4 -1 -1 -1 -1 1 3 8 2 2 0 11 22 2 3 4 6 8 4 2 0 4 3 1 2 9 0.25 1.72 32 T 0 2 -2 -2 1 1 2 -3 0 -2 -2 0 0 -2 3 -1 0 0 0 -2 9 10 2 1 3 7 14 2 3 2 4 6 2 2 15 5 7 1 3 2 0.26 1.72 33 F -3 -3 -6 -4 -1 -3 -6 -6 -4 -2 -1 -6 0 8 -6 -3 -3 1 1 -3 2 1 0 1 1 1 0 0 0 1 5 0 2 74 0 2 1 1 2 1 1.78 1.77 34 V -2 -2 0 -2 -5 -2 -1 -4 -1 4 -1 -1 3 0 -2 -2 0 4 0 2 3 3 4 2 0 2 4 1 2 22 4 4 8 4 2 3 6 6 4 14 0.32 1.77 35 Y -1 -2 -3 -4 0 -3 -3 -4 0 -3 -3 -5 -4 3 -6 -2 -3 4 8 -3 4 2 1 1 2 1 2 1 2 1 1 0 0 9 0 3 1 5 61 1 1.59 1.78 36 G -3 -1 -1 -1 -1 -1 -3 5 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -3 2 0 -1 -2 -4 1 4 2 3 1 3 1 50 1 1 2 3 1 1 1 16 7 1 2 1 0.84 1.84 37 G -2 -2 -1 -2 -3 -3 -4 7 -2 -4 -5 -3 -6 -4 -4 -2 -4 -6 -3 -5 2 2 2 2 1 1 1 79 1 1 1 1 0 1 1 2 1 0 1 1 1.63 1.94 38 C -3 -4 -4 -5 11 -4 -5 -4 -4 -3 -3 -4 -2 -4 -5 -3 -3 -2 -4 -2 1 1 1 1 82 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2.77 1.94 39 R -2 2 0 1 -3 1 0 4 2 -4 -2 0 -1 -3 -3 -1 -3 -2 -2 -4 2 9 4 9 1 6 6 34 6 1 4 5 1 1 1 5 1 1 2 1 0.49 1.93 40 A -1 -2 -2 -2 -6 -2 -2 6 -1 -5 -5 -2 -4 -6 -2 -2 -2 -2 -1 -5 5 2 2 2 0 1 3 67 1 1 1 3 0 0 2 2 3 0 2 1 1.25 1.94 41 K -4 -1 8 -1 -6 -3 -3 -1 -2 -4 -6 0 -5 -5 -2 -1 -1 -7 -3 -5 1 3 70 2 0 1 1 4 1 1 1 6 0 1 2 4 4 0 1 1 1.56 1.95 42 R 2 2 0 0 -1 1 1 2 -1 -3 -2 1 0 -3 -1 0 -2 -3 -4 -2 14 10 5 4 1 5 10 17 2 1 5 9 3 1 3 5 2 0 0 3 0.21 1.96 43 N -5 -3 8 -1 -6 -1 -3 -3 -1 -6 -6 -2 -5 -3 -5 -2 -3 -6 -3 -4 0 1 87 1 0 2 1 1 1 0 0 1 0 1 0 1 0 0 1 1 2.15 1.89 44 N -3 4 7 -3 -3 -2 -2 -5 0 -3 -3 -1 -1 -3 -1 0 -2 0 -2 -3 2 19 47 0 1 1 2 0 2 1 2 3 2 1 3 6 2 2 2 2 0.98 1.92 45 F -6 -6 -6 -4 -6 -6 -6 -6 -2 -4 -2 -6 -3 9 -7 -6 -5 0 2 -4 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 89 0 0 0 1 5 0 2.49 1.84 46 K 0 0 0 1 -1 1 3 -1 0 -2 0 1 -1 -3 1 -2 -3 -3 -1 -2 7 5 4 7 1 6 19 5 2 2 12 9 1 1 8 3 1 0 2 4 0.19 1.85 47 S -3 -1 1 -1 -2 -3 -3 -4 -3 -4 -4 -1 -3 -2 -4 4 5 -3 -2 -4 1 4 6 3 1 1 1 1 0 1 1 3 1 1 0 32 42 0 1 0 0.97 1.87 48 A -2 2 -3 -3 1 2 3 -4 -2 -1 1 3 0 -2 -3 -3 -3 -2 0 -2 3 12 1 1 3 7 21 1 1 4 15 18 2 2 1 1 1 1 3 3 0.42 1.88 49 E 0 -1 -1 1 -6 2 5 -2 1 -3 -3 1 -1 -3 -4 0 -1 -3 -1 -3 9 3 3 8 0 8 33 3 3 2 3 9 2 1 0 5 4 0 2 1 0.49 1.89 50 D 0 -2 -1 4 -4 1 5 -4 -1 -2 -3 0 -3 -5 -5 -1 -2 -4 -2 -4 10 1 2 19 0 5 41 1 1 2 3 6 1 0 0 3 3 0 1 1 0.76 1.90 51 C -4 -5 -6 -7 12 -6 -7 -6 -6 -5 -3 -6 -5 -3 -6 -3 -4 -6 -3 -4 0 1 0 0 95 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 1 0 3.48 1.87 52 L -3 2 0 -2 -4 3 3 -5 -1 0 1 0 5 -3 -5 -3 -2 0 -3 -1 1 11 5 2 0 11 21 0 1 5 11 6 14 1 0 2 2 1 1 5 0.49 1.87 53 R 0 3 2 0 -3 2 1 -3 0 -3 -2 2 -1 -3 -5 1 -1 0 -2 -2 8 17 8 5 0 8 10 1 2 1 4 14 2 1 0 11 3 1 1 3 0.34 1.88 54 T 2 1 -1 -4 -4 -2 -1 -4 0 0 -2 0 0 0 -5 0 4 -3 0 1 14 7 3 1 0 2 3 0 2 5 3 6 2 4 0 6 27 0 3 9 0.37 1.89 55 C -4 -7 -6 -7 12 -6 -7 -6 -7 -5 -5 -7 -5 -6 -6 -4 -4 -6 -6 -4 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3.73 1.81 56 G 2 1 -2 -4 -5 -1 -2 4 1 -4 -3 1 -2 -4 -3 2 -2 -6 -4 -1 14 7 2 0 0 2 2 34 4 1 2 7 1 0 1 17 2 0 0 4 0.54 1.68 57 G 0 -4 3 0 -3 -3 -3 6 -3 -6 -6 -2 -5 -6 0 1 -3 -6 -4 -6 6 0 13 4 0 1 1 53 0 0 0 3 0 0 4 12 1 0 0 0 1.02 1.56 58 A 4 -4 -4 -5 -3 -4 -4 -4 -5 -2 -4 -4 -3 -5 -4 2 2 -6 -4 4 40 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18 13 0 0 30 0.89 1.41 K Lambda Standard Ungapped 0.1439 0.3296 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1713 0.3196 PSI Gapped 0.0524 0.2670