Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 N -1 -1 6 1 -3 0 -1 -1 0 -4 -4 -1 -3 -4 -2 2 0 -4 -3 -3 0 0 80 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20 0 0 0 0 0.82 0.16 2 L -3 -4 -4 -5 -3 -4 -4 -4 -2 -1 2 -4 0 7 -4 -3 -3 0 4 -1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19 0 0 71 0 0 0 0 10 0 1.04 0.33 3 P -2 -3 -3 -3 -4 -3 -2 -3 -3 -4 -4 -2 -4 -5 8 -2 -2 -5 -4 -4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 2.53 0.46 4 I 4 -3 -2 0 -3 -2 -2 1 -3 1 -3 -2 -3 -4 3 0 0 -4 -4 -2 43 0 0 7 0 0 0 11 0 10 0 0 0 0 17 5 5 0 0 0 0.52 0.55 5 M -2 -5 -4 -5 10 -2 -5 -4 -4 -1 -3 -4 1 -4 -4 -1 -2 -4 -4 -2 0 0 0 0 84 3 0 0 0 3 0 0 4 0 0 5 0 0 0 0 2.07 0.65 6 T 1 -2 -2 1 -1 -2 -2 -3 -3 -3 -4 -1 -3 -1 -3 3 5 -4 -3 -3 11 2 0 10 1 0 0 0 0 0 0 3 0 3 0 30 40 0 0 0 0.65 0.72 7 A 5 -3 -2 -4 0 -3 -3 -2 -3 -3 -3 -3 -3 -3 1 0 -1 -4 2 -1 71 0 1 0 2 0 0 0 0 0 1 0 0 0 7 5 1 0 8 3 0.82 0.72 8 P -1 -4 -2 -2 -4 -2 -2 -3 -4 -4 -5 -3 -4 -5 8 -2 -3 -5 -5 -2 5 0 2 2 0 2 2 2 0 0 0 0 0 0 85 0 0 0 0 2 2.12 0.76 9 A 5 -3 -1 -3 -3 -1 1 -1 -3 -3 -3 0 -3 -4 -1 -1 -1 3 -3 -1 68 0 2 0 0 2 8 2 0 0 0 5 0 0 2 0 3 4 0 2 0.75 0.76 10 Y -4 -4 -5 -2 -4 -4 -4 -5 -2 -4 -3 -4 -3 3 -5 -4 -4 10 7 -4 0 0 0 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9 0 0 0 47 41 0 2.15 0.79 11 V 1 -3 1 3 -4 1 1 -3 -3 -2 -3 -1 -3 -4 0 2 0 -5 -1 2 11 0 8 19 0 6 9 0 0 0 0 3 0 0 3 15 5 0 2 20 0.33 0.79 12 P 3 -3 -1 0 -3 -1 0 -3 -3 -2 -3 -2 -3 -4 5 3 -1 -5 -4 -3 26 0 3 4 0 2 5 0 0 3 2 1 0 0 27 25 3 0 0 0 0.66 0.79 13 G 0 -4 2 1 -4 -2 -2 6 -3 -5 -5 -3 -4 -5 -4 0 0 -5 -5 -4 5 0 9 6 0 1 2 64 0 0 0 0 0 0 0 7 5 0 0 0 1.04 0.79 14 T 1 -2 1 -3 -3 0 -1 -1 -1 -2 -2 2 -1 -4 -1 2 4 -5 -4 -2 9 1 6 0 0 5 3 4 1 3 2 13 1 0 2 14 35 0 0 1 0.43 0.79 15 T 1 -3 2 0 -3 0 1 -2 -3 0 -3 -3 -2 -4 -2 0 3 -5 -3 3 13 0 11 4 0 4 8 2 0 6 0 0 0 0 1 6 21 0 0 24 0.33 0.78 16 Y -3 -4 -4 -5 0 -3 -4 -5 1 -3 -3 -4 -3 1 -5 -3 -3 0 9 -3 2 0 0 0 2 0 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 94 0 2.03 0.79 17 A 0 -2 3 -2 -3 0 -2 -2 -1 -2 -1 -2 -3 -4 2 2 3 -5 -4 1 5 1 20 0 0 5 0 1 1 0 6 0 0 0 10 13 25 0 0 13 0.43 0.79 18 Q 1 -2 -1 -3 -4 2 0 6 -3 -5 -5 -2 -4 -5 -4 0 -2 -4 -4 -4 12 2 1 0 0 12 5 61 0 0 0 1 0 0 0 4 2 0 0 0 0.99 0.79 19 G -2 -4 -1 -3 -4 -4 -4 7 -4 -6 -6 -3 -5 -5 -4 -1 -3 -4 -5 -5 0 0 3 0 0 0 0 93 0 0 0 0 0 0 0 4 0 0 0 0 1.76 0.79 20 A 1 -3 1 5 -4 -1 0 -3 -3 -4 -3 -2 -4 -5 -3 2 1 -5 -4 -4 16 0 5 43 0 3 4 0 0 0 2 0 0 0 0 17 11 0 0 0 0.73 0.79 21 L -3 1 -1 -3 -4 5 1 -4 -3 0 0 1 -2 -4 -4 -2 2 -4 -3 2 0 6 2 0 0 30 8 0 0 5 10 8 0 0 0 1 14 0 0 16 0.45 0.79 22 V -1 -4 -5 -5 -3 -4 -4 -5 -5 2 -1 -4 -1 -3 -4 -3 -2 -5 -3 7 2 0 0 0 0 0 0 0 0 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 94 1.32 0.79 23 S -1 1 -2 -2 -3 -2 -1 -3 -3 -1 -4 -2 -3 -2 -3 5 3 -5 -3 -1 0 7 0 0 0 0 4 0 0 3 0 0 0 1 0 60 20 0 0 4 0.78 0.79 24 Y -4 -3 -3 -2 -4 -2 -3 -5 5 -3 -3 -4 -3 4 -5 -3 -4 0 8 -3 0 0 0 2 0 2 0 0 18 0 0 0 0 15 0 0 0 0 63 0 1.57 0.79 25 Q -2 -2 5 2 -5 4 1 1 -2 -5 -5 1 -4 -5 -4 -1 -2 -5 -4 -5 1 0 40 9 0 19 9 12 0 0 0 9 0 0 0 1 0 0 0 0 0.81 0.79 26 G -2 -4 0 -3 -4 -2 -4 7 -4 -5 -5 -3 -4 -5 -4 -1 -2 -4 -5 -5 0 0 4 0 0 2 0 90 0 0 0 0 0 0 0 1 2 0 0 0 1.64 0.78 27 Y -1 1 -1 -3 -4 -2 -3 -4 6 -2 -2 1 -3 -1 -4 1 -2 -2 6 -3 5 8 3 0 0 0 0 0 22 2 4 10 0 0 0 10 1 0 34 0 0.77 0.79 28 V -2 -3 -1 -4 -3 -2 -2 -5 -1 4 0 -1 1 -2 -4 -2 2 -4 1 2 1 0 3 0 0 2 2 0 2 34 6 4 4 0 0 1 18 0 6 17 0.47 0.79 29 W -4 -4 -5 -6 -4 -4 -5 -5 -3 -4 -3 -5 -3 0 -5 -4 -4 11 5 -4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 75 25 0 2.95 0.79 30 Q -2 3 -2 -2 -5 5 3 -4 -2 -4 -3 3 -3 -2 -3 0 1 -4 -3 -4 1 18 0 0 0 30 18 0 0 0 1 16 0 2 0 4 9 0 0 0 0.71 0.79 31 T 6 -3 -2 -3 -2 -3 -3 -2 -3 -3 -3 -3 -3 -4 -3 1 0 -5 -4 -1 86 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8 3 0 0 2 1.11 0.79 32 K -3 1 0 -2 -5 3 0 -3 -2 -5 -4 6 -3 -5 -3 -1 -2 -5 -4 -4 0 1 2 1 0 14 2 0 0 0 0 77 0 0 0 3 0 0 0 0 1.21 0.79 33 W -4 -5 -5 -6 1 -4 -5 -5 -3 -4 -3 -5 -3 0 -6 -4 -4 12 4 -4 0 0 0 0 4 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 81 14 0 3.01 0.79 34 G -1 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -1 -2 -2 -2 -2 -2 -1 -2 -1 -2 10 0 0 5 2 2 2 1 2 3 6 1 2 4 2 1 2 2 5 2 49 1 7 1.32 0.47 35 Y -3 -3 -1 -4 -3 -3 -2 -4 -3 -2 -3 -3 1 1 -4 -1 4 8 3 0 0 0 3 0 0 0 2 0 0 1 0 0 4 7 0 2 37 25 11 7 0.99 0.77 36 I 2 -1 -2 -1 -3 4 -1 -3 -1 -2 -3 1 -3 -4 -3 1 4 -4 -1 -3 16 2 0 3 0 22 2 0 1 3 1 10 0 0 0 12 27 0 2 0 0.48 0.79 37 T -1 -3 4 -1 -4 2 -1 4 -3 -5 -5 -2 -4 -5 -3 3 1 -5 -4 -4 2 0 20 2 0 11 2 33 0 0 0 1 0 0 0 22 7 0 0 0 0.69 0.79 38 S 0 -1 1 2 -4 2 3 -1 1 -4 -4 -2 -3 -2 -3 3 1 -5 -3 -4 5 3 6 12 0 8 21 5 4 0 0 0 0 1 0 29 7 0 0 0 0.49 0.79 39 A 1 -1 -2 -2 -3 2 2 -3 -3 -1 -3 0 -2 -4 -2 -1 4 -5 -4 1 12 1 0 0 0 10 17 0 0 4 0 6 0 0 1 2 35 0 0 12 0.48 0.79 40 P -3 -4 -4 -3 -5 -3 -3 -4 -4 -5 -5 -3 -4 -6 8 -3 -3 -6 -5 -4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 2.72 0.74 41 G 1 -3 -1 0 -4 -3 -2 5 -3 -5 -5 -2 -4 -5 -2 2 0 -5 -4 -4 10 0 2 4 0 0 2 58 0 0 0 1 0 0 1 14 7 0 0 0 0.92 0.74 42 S 1 -3 1 -1 -3 -1 -1 0 1 -2 -4 -2 -3 -2 -3 4 3 -5 -3 -1 8 0 7 3 0 1 2 7 3 3 0 0 0 1 0 42 20 0 0 3 0.52 0.75 43 D 0 -3 3 5 -4 -2 0 0 -3 -4 -4 -2 -4 -5 -3 1 3 -5 -2 -4 10 0 16 36 0 0 4 6 0 0 0 0 0 0 0 8 19 0 1 0 0.68 0.75 44 S 0 -3 1 4 -4 -1 1 3 -3 -2 -4 -2 -4 -5 -1 2 -1 -5 -4 -4 8 0 5 23 0 2 7 28 0 3 0 1 0 0 3 17 2 0 0 0 0.53 0.72 45 A 2 -3 -3 -2 -3 1 1 -1 -3 -2 -3 -2 -1 -4 2 2 0 -5 -4 2 22 0 0 1 0 8 12 3 0 0 0 0 1 0 9 20 3 0 0 20 0.37 0.72 46 W -4 -4 -5 -6 -4 -4 -5 -2 -4 -4 -3 -5 -3 -1 -5 -4 -4 12 1 -5 0 0 0 0 0 0 0 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 96 0 0 3.42 0.68 47 L 0 -1 -2 -2 -4 2 4 -3 -2 -3 1 3 -2 -4 -3 -1 0 -4 -3 -1 8 0 0 0 0 10 31 0 0 0 14 24 0 0 0 3 7 0 0 3 0.46 0.62 48 K -1 0 0 2 -4 1 -1 -4 -3 -2 3 3 -1 0 -3 -2 -2 -4 0 -1 3 3 4 16 0 8 2 0 0 0 34 22 0 3 0 0 0 0 3 2 0.35 0.63 49 V -2 -2 -4 -4 -3 2 -3 -5 -4 4 2 -3 2 -2 -4 -3 -2 -4 -3 4 0 2 0 0 0 11 0 0 0 31 14 0 4 0 0 0 0 0 0 38 0.66 0.62 50 G 0 -3 -2 -3 -4 -3 -3 6 -3 -5 -5 -1 -4 -4 -3 1 -2 -4 -4 -4 7 0 0 0 0 0 0 75 0 0 0 4 0 0 0 15 0 0 0 0 1.18 0.55 51 R -2 1 1 4 -4 1 4 0 -2 -4 -4 -1 -3 -4 1 -1 0 -4 -4 -4 0 8 6 26 0 5 37 6 0 0 0 0 0 0 7 0 5 0 0 0 0.63 0.42 52 V -2 -3 -4 -4 -2 -3 -4 -4 -4 4 2 -3 3 -1 -4 -3 -1 -3 -2 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34 18 0 9 0 0 0 0 0 0 39 0.57 0.28 K Lambda Standard Ungapped 0.1317 0.3159 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1802 0.3189 PSI Gapped 0.0552 0.2670