JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_TLcZ38d.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet |||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|E|E|E||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E|E|||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||E|E|E|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E|E|E|||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 9|9|2|4|4|8|9|9|9|8|8|7|1|4|8|7|1|2|7|6|1|0|7|7|7|8|7|6|4|2|8|9|9|9|9|8|8|7|5|3|7|0|2|3|3|4|7|6|1|3|3|2|2|1|2|5|7|7|7|6|5|6|6|6|2|7|8|9|9|9|9|9|8|6|1|3|7|2|0|8|8|5|3|1|0|1|7|7|6|7|7|7|5|2|4|0|5|7|6|3|7|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|7|3|2|5|8|8|6|0|6|8|8|8|6|1|5|7|7|7|7|6|6|7|7|7|7|7|7|7|7|7|6|6|5|4|2|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|5|1|7|8|8|1|3|4|0|0|6|7|7|7|7|7|7|7|6|0|3|7|8|9|9|9|9|9|9|9|9|8|8|5|2|6|7|7|5|6|0|1|1|2|1|7|7|7|7|7|6|5|2|7|8|9|9|9|9|9|9|9|9|8|5|2|7|8|8|4|4|6|4|2|0|2|8|8|7|7|6|3|7|8|9|9|9|9|9|9|9|9|8|8|5|3|8|8|6|0|8|9|9|8|8|6|1|5|7|7|7|7|6|6|7|7|7|7|6|5|3|3|6|7|7|7|7|2|0|7|8|9|9|9|9|9|9|8|5|1|8 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off -|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|B|-|-|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|B|B|-|B|B|-|B|B|-|-|B|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|B|B|-|B|B|B|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|B|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|B|B|-|-|-|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|-|B|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles |||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||E|E|E|E||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||E|E|E|E||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E|E|||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E|E|||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||E|E|E|E|E||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E|E|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E|E|E|||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles |||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|||||E|E|E|E|E||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|||||||||||||E||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E|E|E|||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E|E|E|||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree | | | | | | | | | | | |*| | | | |*| | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | |*|*|*|*|*| | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | |*| | | |*|*|*|*| | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | |*| | | | | | | | | |*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*|*|*|*| | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*| | | | | | | | | | | |