JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_Jlosg1v.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|c|c|c|c|c|c|c|c|c|c|c|c|c|c|c|c|c|c|c|c|c|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet |||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|||||||E|E|E|E|E||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||H|H|H|H|H|H||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||H|H|H|H|H|H|H|H|||||||H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|||E|E|E||||||E|E|E|E|E|||||||||||||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E||||||||E|E||||||||||E|E|E|E|E|| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 8|9|8|8|7|7|7|8|8|7|7|6|5|2|7|8|9|9|9|8|8|8|7|1|5|8|3|6|8|8|6|3|7|8|8|6|1|7|8|8|6|3|3|3|8|8|8|8|8|7|4|2|5|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|6|5|2|0|2|9|9|9|9|9|9|9|8|6|2|5|7|1|3|7|9|9|8|8|7|5|4|1|0|0|1|1|0|0|1|2|1|1|1|2|2|1|0|5|7|7|7|7|6|2|4|3|4|4|4|0|4|3|3|1|1|1|0|0|1|1|5|7|8|7|7|7|6|0|3|2|4|3|2|1|4|3|1|0|1|6|4|6|7|7|8|7|7|6|0|3|7|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|2|3|4|7|8|8|7|0|2|1|3|2|4|3|0|0|2|5|7|8|7|6|3|7|8|9|9|9|9|9|9|9|9|8|6|0|5|8|1|4|2|8|9|9|9|9|9|9|9|9|8|6|1|1|8|8|1|2|8|9|8|8|8|6|0|4|7|8|8|1|2|2|1|1|1|1|2|0|2|7|7|6|7|7|7|7|7|5|0|3|5|6|3|1|3|6|7|6|0|2|3|1|1|1|4|6|7|1|1|1|1|1|0|0|2|3|3|6|6|6|4|1|4|6|6|7|7|7|6|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|5|0|2|2|7|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|7|5|2|7|8|5|1|1|2|6|7|7|7|6|3|3|3|0|3|6|7|6|4|6|6|3|0|5|4|4|3|2|8 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off B|B|-|B|B|B|-|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|B|B|B|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|-|B|B|B|B|B|-|B|-|-|B|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|B|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|-|-|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|B|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|B|-|B|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|B|-|B|-|B|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|-|-|B|-|-|B|-|B|B|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|B|B|-|B NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|B|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|B|-|-|B|B|B|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|B|B|B|-|-|B|B|-|-|-|B|-|B|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|B|-|B|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles |||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|||||||E|E|E|E|E||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||H|H|H|H|H|H|H||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||H|H|H|H|H|H|H|H||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|||E|E|E|||||E|E|E|E|E|E||||||||||||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||E|E|||||||||||E|E|E|E|E| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles ||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E||H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E|||||||||||||||E|E|E|||H||||H|H|H|H|H|H|||||||||||H|H|H|H|H|||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||H|H|H|H|H|H|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||H|H|H|H|H|H|H|H|||||||E|E|E|E|E||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|||E|E||||||||||||E|E|||||||||||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E||||||||E|E|E|||||||||E|E||||| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*| | | | | | | | | |*| | | |*| | | | | | | |*|*|*|*|*|*|*|*|*|*|*|*|*|*|*|*|*| | | | | | |*|*|*|*|*|*| |*|*|*| | | | | | |*| | | | | | | |*|*| | | | | |*|*|*|*|*| | | | | | | | | |*|*| | | 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