Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 F -4 -5 -5 -6 -4 -5 -5 -5 -3 -2 -2 -5 -2 8 -6 -4 -4 9 2 -3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 68 0 0 0 29 3 0 1.88 0.67 2 L -3 -4 -5 -5 -3 -4 -5 -5 -5 3 5 -4 4 -1 -5 -4 -3 -4 -3 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17 63 0 13 0 0 0 0 0 0 6 0.92 0.70 3 D -2 -2 0 5 -5 0 6 -2 -2 -5 -5 -2 -4 -5 -3 -2 -1 -5 -4 -4 2 0 2 36 0 1 53 1 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0 1 1.12 0.74 4 G -2 2 4 -1 -5 0 -1 4 -1 -5 -5 4 -4 -5 -4 -1 -3 -5 -4 -5 2 10 26 1 0 3 2 28 1 0 0 26 0 0 0 1 0 0 0 0 0.74 0.76 5 I -3 -5 -5 -5 0 -5 -5 -6 -5 7 1 -5 1 -2 -5 -4 -3 -4 -3 2 0 0 0 0 1 0 0 0 0 79 10 0 2 0 0 0 0 0 0 5 1.20 0.76 6 D -2 -3 0 4 -5 1 5 -3 -3 -5 -5 -1 -4 -5 3 -1 -1 -5 -4 -4 2 0 2 27 0 5 38 1 0 0 0 1 0 0 15 2 3 0 0 1 0.85 0.79 7 K -1 0 -3 -2 -5 2 2 -4 -3 -3 -2 4 -1 -5 5 0 -2 -5 -4 -4 4 2 0 1 0 10 14 0 0 1 3 27 1 0 29 5 1 0 0 0 0.73 0.77 8 A 6 -3 -4 -4 -2 -3 -3 -2 -4 -3 -2 -3 -3 -4 3 -1 -2 -5 -4 -2 85 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 0 0 12 0 0 0 0 0 1.09 0.72 9 Q -3 1 -2 -2 -5 6 3 -4 0 -1 -4 1 -3 -5 1 -2 -2 -4 -3 -2 0 5 0 0 0 53 21 0 1 4 0 7 0 0 7 0 1 0 0 2 0.91 0.72 10 E -2 -2 -1 2 -5 -1 6 1 -2 -1 -1 -1 -1 -4 -3 -2 -3 -5 -4 -3 1 0 2 7 0 0 62 13 0 6 6 2 1 0 0 0 0 0 0 0 0.81 0.72 11 E 1 -2 0 4 -5 -1 5 -3 0 -5 -5 -2 -4 -4 -3 1 -2 -5 -1 -4 11 0 3 20 0 0 51 0 2 0 0 0 0 0 0 10 0 0 3 0 0.85 0.74 12 H -4 -2 3 -3 -5 -1 -2 -4 10 -5 -2 -3 -3 -3 -4 -3 -3 -4 0 -5 0 0 12 0 0 0 0 0 83 0 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.91 0.75 13 E -1 -1 -1 2 -5 1 5 1 -1 -4 -3 -2 -4 -4 -3 -1 0 -1 -1 -3 3 3 2 8 0 4 49 13 1 0 2 0 0 0 0 4 5 1 2 1 0.63 0.75 14 K -3 3 3 -2 -5 1 -1 -3 1 -4 -1 6 -3 -4 -3 -2 -2 -5 -3 -4 0 13 14 0 0 3 0 0 3 0 7 58 0 0 0 0 0 0 0 0 0.86 0.69 15 Y -3 -4 -3 -4 1 -3 -4 -4 2 -3 -2 -4 -3 4 -4 1 -3 7 6 -3 0 0 0 0 3 0 0 0 5 0 3 0 0 17 0 14 0 16 36 0 1.02 0.72 16 H -4 -2 -2 -3 -5 -2 -2 -4 10 -4 0 -3 -2 -2 -4 -3 -3 -3 3 -4 0 0 0 0 0 0 0 0 76 0 14 0 0 0 0 0 0 0 11 0 1.69 0.72 17 S -1 0 1 -3 2 3 -2 -1 -3 -4 -2 -2 -3 -4 -4 4 2 -4 0 -1 4 4 6 0 4 17 0 4 0 0 4 0 0 0 0 31 13 0 4 4 0.39 0.94 18 N -2 -3 3 2 -3 -2 -2 2 -3 2 -3 -3 -3 -4 -3 2 2 -4 -4 -2 0 0 14 14 0 0 0 14 0 14 0 0 0 0 0 14 14 0 0 0 0.27 0.67 19 W 2 -5 -5 -5 -4 -4 -1 -5 -5 1 -2 -2 1 -3 2 -2 -1 8 0 2 20 0 0 0 0 0 5 0 0 7 3 3 3 0 11 3 4 23 3 16 0.81 1.44 20 R -1 3 -1 -1 -6 3 0 -2 2 -5 -3 5 0 -5 -1 -2 -1 1 -4 -2 4 15 3 3 0 11 6 2 5 0 3 32 2 0 4 2 4 2 0 2 0.55 1.44 21 A 1 -4 -1 0 -5 0 1 0 1 0 -4 -1 0 0 -5 3 1 -4 4 -4 12 0 2 5 0 5 8 7 3 6 0 3 2 4 0 20 8 0 15 0 0.35 1.44 22 M -4 -5 -6 -6 -4 -5 -5 -6 -5 1 5 -5 5 -3 -1 -5 -4 -5 -4 -1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6 67 0 16 0 3 0 0 0 0 3 1.19 1.37 23 A 3 3 -3 -4 0 1 -1 -2 4 -2 -4 0 -4 -5 -1 1 -1 -5 -4 0 25 17 0 0 2 7 2 2 9 2 0 4 0 0 3 12 2 0 0 8 0.41 1.37 24 S -3 1 -1 2 -5 1 1 -3 5 -3 0 -1 -4 0 -5 2 0 2 -1 -3 1 7 3 10 0 7 9 2 17 1 9 2 0 4 0 14 5 2 1 1 0.35 1.37 25 D -1 0 -1 3 2 2 3 -4 0 -5 -4 4 -1 -6 -4 -2 0 -6 -5 -5 4 4 2 19 4 8 21 0 2 0 1 24 2 0 0 1 6 0 0 0 0.61 1.28 26 F -4 -4 -5 -5 -4 -5 -5 -5 -3 -2 1 -5 -2 7 -5 -4 -4 -1 5 -3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16 0 0 54 0 0 0 0 17 0 1.15 0.94 27 N -1 -1 3 0 1 1 -1 3 2 -1 -1 0 -3 -4 -4 -1 -1 -5 -4 -4 3 3 18 4 3 5 4 21 5 3 8 5 0 0 0 4 3 0 0 0 0.23 0.94 28 L -3 -4 -5 -5 -3 -4 -4 -5 -4 4 4 -1 2 -2 -4 -4 -3 -4 -3 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33 42 4 4 0 0 0 0 0 0 4 0.62 0.69 29 P -2 -4 -3 -3 -4 -3 -3 -4 -4 -4 -4 -3 -4 -5 8 0 0 -5 -4 -4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 77 6 7 0 0 0 1.81 0.69 30 P -1 2 1 -3 -5 1 -2 -2 0 -4 -2 2 -1 -5 6 -1 0 -5 -4 -4 4 14 7 0 0 6 0 3 2 0 4 16 2 0 35 2 5 0 0 0 0.74 0.80 31 V 0 -2 -2 -2 -3 -1 -2 -4 -4 3 2 -2 1 -3 -4 -1 0 -5 -4 3 8 2 1 2 0 3 2 0 0 19 20 1 3 0 0 6 6 0 0 23 0.34 0.91 32 V 2 -4 -4 -4 -3 1 -2 -2 -4 2 0 -4 -2 -3 -4 -3 -2 -5 -4 5 17 0 0 0 0 9 2 2 0 11 5 0 0 0 0 0 0 0 0 52 0.68 0.89 33 A 6 -3 -4 -4 -2 -3 -3 -2 -4 -3 -4 -3 -3 -4 0 -1 -2 -5 -4 -2 90 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 0 0 1.16 0.81 34 K -2 4 -1 -2 -5 0 3 -4 -2 -4 -5 6 -3 -5 -3 -2 -3 -5 -4 -4 1 19 1 0 0 1 16 0 0 1 0 59 0 0 0 1 0 0 0 0 1.06 0.83 35 E -1 0 -2 3 -5 4 6 -4 0 -5 -5 0 -4 -5 -3 -2 -3 -5 -4 -4 5 3 0 13 0 22 54 0 2 0 0 3 0 0 0 0 0 0 0 0 1.04 0.83 36 I -3 -5 -5 -5 -3 -5 -5 -6 -5 7 0 -5 -1 -2 -5 -4 -3 -5 -3 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 93 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.45 0.83 37 V -2 -3 -5 -5 -3 -4 -4 -4 -5 3 0 -2 -1 -3 -5 -4 -1 2 -3 6 0 1 0 0 0 0 0 1 0 10 5 2 0 0 0 0 2 3 0 75 1.05 0.83 38 A 3 0 4 -1 -4 3 0 -2 -1 -4 -4 0 -3 -5 -1 -1 -1 -5 -3 -4 33 4 26 2 0 15 6 1 1 0 0 4 0 0 2 1 1 0 1 0 0.55 0.83 39 S -1 0 0 -2 2 4 0 -3 0 -4 -3 1 -1 -5 -3 4 2 -5 -4 -3 2 4 4 1 5 19 6 0 2 0 2 8 2 0 0 33 12 0 0 1 0.51 0.83 40 C -2 -3 -5 -6 11 -5 -6 -5 -5 -3 -3 -5 -3 -4 -5 -3 -3 -4 -1 -3 0 2 0 0 95 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 2.69 0.83 41 D 0 -3 1 4 -2 -1 2 -4 1 -4 -3 -2 -4 -5 5 -1 -1 -5 -4 -4 6 0 7 23 1 1 13 0 4 0 3 2 0 0 28 4 3 0 0 0 0.69 0.83 42 K -2 0 1 -2 -5 3 0 -3 0 0 -2 5 -3 -4 -3 -1 -1 -5 -4 0 2 1 6 1 0 16 4 1 2 8 3 44 0 0 0 3 3 0 0 7 0.57 0.83 43 C -2 -6 -5 -6 11 -5 -6 -5 -5 -3 -2 -5 -3 -2 -5 -3 -3 -4 -4 -3 2 0 0 0 94 0 0 0 0 0 3 0 0 2 0 0 0 0 0 0 2.63 0.83 44 Q -3 1 -2 -2 -5 8 0 -4 1 -5 -3 1 -1 -5 -3 -2 -3 -4 -3 -4 0 6 0 0 0 79 0 0 3 0 1 5 1 0 0 0 0 0 0 0 1.33 0.80 45 L -3 -2 0 -3 -4 5 -2 -2 -3 3 3 -2 1 -3 -4 -2 -1 -4 -3 0 0 1 6 0 0 29 0 4 0 19 27 1 3 0 0 1 4 0 0 5 0.48 0.77 46 K -3 3 -2 -3 -5 2 -1 -4 -2 -5 -4 6 -3 -5 -3 -2 -3 -5 -4 -4 0 16 0 0 0 10 0 0 0 0 0 74 0 0 0 0 0 0 0 0 1.22 0.72 K Lambda Standard Ungapped 0.1314 0.3177 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1915 0.3171 PSI Gapped 0.0586 0.2670