Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 G -2 -5 -2 -3 -5 -4 -4 7 -4 -6 -6 -4 -5 -5 -4 -2 -4 -5 -5 -5 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.03 0.92 2 P 0 -5 -2 -3 -4 -4 -3 -5 -4 -5 -6 -4 -5 -5 8 -3 -3 -6 -6 -5 8 0 2 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 87 0 0 0 0 0 2.46 1.38 3 A 3 -5 -3 -4 -1 -4 -4 5 -5 -5 -5 -4 -5 -6 -4 3 -1 -6 -5 -4 29 0 0 0 1 0 0 45 0 0 0 0 0 0 0 22 3 0 0 0 1.13 1.46 4 A 7 -4 -4 -5 2 -4 -4 -2 -3 -4 -4 -4 -4 -5 -4 -1 -3 -6 -5 -1 90 0 0 0 4 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 3 1.60 1.49 5 S 1 -3 -3 -3 0 -3 -3 -3 -4 -5 -5 -3 2 -5 -4 6 0 -5 -5 -3 12 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 5 0 0 76 3 0 0 1 1.33 1.49 6 A 5 2 -4 -4 2 -2 0 -3 4 -2 -4 -1 -2 -5 -4 0 -2 -5 -1 0 46 12 0 0 4 1 5 1 11 2 1 3 1 0 0 5 1 0 2 6 0.69 1.49 7 V 2 -5 0 -5 -1 -4 -5 -5 -5 -1 -2 -5 0 -3 -2 -3 -1 -6 -3 6 20 0 5 0 1 0 0 0 0 0 1 0 2 1 2 0 4 0 0 64 1.09 1.51 8 I -4 -5 -6 -6 -4 -5 -6 -6 -3 6 2 -5 -1 0 -6 -3 -2 -5 -1 2 0 0 0 0 0 0 0 0 1 58 16 0 0 3 0 2 2 0 2 14 1.22 1.54 9 L -4 -2 -3 -5 -2 -4 -5 -3 0 -2 5 2 -1 -2 -3 -4 -3 -4 4 0 0 2 1 0 1 0 0 2 3 1 52 14 1 0 1 1 1 0 14 7 0.81 1.53 10 P 4 -3 -4 -4 -3 -4 -4 3 -5 -3 -3 -4 -4 -4 2 2 -3 -6 -5 1 35 1 0 0 0 0 0 24 0 1 1 0 0 0 9 18 0 0 0 9 0.74 1.57 11 Q -2 -1 0 2 -4 1 4 2 -1 -5 -5 0 -5 -6 2 0 0 -2 -4 -4 1 2 3 10 0 7 32 13 1 1 1 5 0 0 8 7 6 1 0 1 0.57 1.58 12 L -1 1 -2 -2 -5 -1 1 4 -1 0 0 0 -1 -4 -5 -2 0 -6 -4 0 5 8 2 2 0 3 9 34 2 7 9 5 1 0 0 2 5 0 0 7 0.40 1.58 13 T 0 -2 1 3 -4 0 4 -3 3 -5 -4 0 -5 -2 -3 -1 0 -4 1 -3 8 1 6 19 0 3 27 2 8 0 1 5 0 2 1 4 6 0 5 2 0.55 1.56 14 S 1 -3 -2 -3 -2 -2 0 2 -2 -2 -3 -1 -3 -4 -3 5 1 -4 -2 -3 12 1 1 1 1 1 5 12 1 2 3 4 0 1 1 43 8 0 1 1 0.57 1.54 15 Q 0 0 1 3 -3 1 1 2 -1 -4 -5 0 -3 -1 -3 -1 2 3 -1 -2 6 4 7 15 0 7 10 13 2 1 0 6 0 3 1 5 11 4 2 3 0.27 1.53 16 N 2 0 4 2 -5 1 0 1 -1 -3 -5 0 -3 -5 -1 0 0 -2 -3 -3 16 4 17 13 0 6 7 11 1 1 1 6 0 0 4 6 5 1 1 2 0.35 1.51 17 V -1 -5 -5 -3 -4 -4 -5 -3 -5 2 -1 -4 -2 0 5 -3 -2 -5 0 4 5 0 0 1 0 0 0 2 0 12 5 0 1 3 34 1 2 0 4 29 0.91 1.46 18 T 1 2 -2 -2 -1 1 0 -1 -2 -1 -1 0 -2 -4 -3 2 1 -5 -2 2 11 14 1 1 1 7 6 4 1 4 5 6 1 0 1 15 8 0 1 13 0.22 1.45 19 F -2 -5 -4 -3 -5 -5 -4 -4 -3 1 -1 -4 -1 6 -3 -4 -2 -2 7 0 3 0 1 2 0 0 1 1 0 8 4 0 1 35 1 1 2 0 34 6 1.19 1.42 20 D 0 0 -1 3 -4 -1 3 0 1 -2 -4 0 -4 -4 -3 1 2 -5 0 -3 7 5 3 14 0 2 19 8 3 2 2 5 0 1 1 12 11 0 3 2 0.31 1.41 21 N -2 -4 4 -2 -4 -2 -4 6 0 1 -4 -3 -4 -4 -5 -3 -2 -5 -4 -2 2 1 23 1 0 2 0 54 2 9 1 0 0 1 0 1 2 0 0 2 1.10 1.42 22 V -2 -5 -5 -3 -4 -4 -4 -6 -3 3 4 -3 2 -1 -3 -3 -3 -2 -4 3 2 0 0 1 0 0 1 0 1 16 44 1 4 2 1 1 1 1 0 24 0.81 1.37 23 Q 3 -2 0 3 -3 -1 4 -1 -2 -4 -4 -2 -3 -4 -1 -1 -1 -5 -3 -2 24 1 3 18 0 2 30 4 1 1 1 1 0 1 3 3 4 0 1 2 0.58 1.34 24 N 1 -1 0 2 -4 2 4 -3 0 -4 -3 2 -3 -6 -3 -2 -1 -6 -5 -3 14 3 4 12 0 7 33 1 2 1 2 12 0 0 1 2 3 0 0 1 0.58 1.33 25 A 6 -4 -4 -5 0 -4 -3 -3 -5 1 -3 -4 -2 -3 -4 -1 -2 -5 -4 1 74 0 0 0 2 0 1 1 0 7 1 0 1 1 0 2 1 0 0 10 1.14 1.33 26 V -3 -5 -6 -6 0 -5 -4 -5 -5 0 6 -3 4 0 -6 -4 -3 -4 -2 -1 1 0 0 0 2 0 1 1 0 2 75 1 9 3 0 1 1 0 1 2 1.18 1.31 27 G 4 0 -1 -2 -2 0 1 0 -2 -4 -3 1 -2 -5 -3 2 -1 -5 -5 -3 38 4 2 2 0 4 9 6 1 1 2 9 1 0 1 16 3 0 0 1 0.49 1.31 28 A 0 -3 -3 -2 -5 -2 1 -2 -3 -1 -4 -1 -1 -4 6 -1 0 -3 -5 1 7 0 1 1 0 1 12 3 0 3 1 4 1 0 46 4 5 0 0 10 0.95 1.29 29 D -1 -2 2 4 -3 -1 4 3 0 -6 -5 -1 -5 -6 -1 -2 -3 -6 -3 -5 4 1 11 23 1 2 25 23 2 0 1 2 0 0 3 1 1 0 1 0 0.71 1.24 30 L -1 -3 -1 -2 -1 -2 -4 -4 -4 -1 -2 -3 -2 -4 -4 3 5 -5 -4 3 4 1 2 2 1 1 0 0 0 1 2 0 1 0 0 22 37 0 0 26 0.75 1.24 31 Q -1 0 0 5 -2 4 0 -3 -1 -3 -4 1 -3 -1 -4 -1 0 -2 0 -4 4 5 4 34 1 20 4 1 1 2 0 8 0 3 0 4 6 0 3 1 0.62 1.24 32 I -2 -5 -6 -6 -4 -5 -5 -6 -5 3 3 -5 1 0 0 -4 -3 -5 -2 5 3 0 0 0 0 0 0 0 0 16 29 0 2 4 5 0 0 0 1 40 0.84 1.13 33 R -4 7 -3 -4 -2 -1 -2 -4 6 -3 -3 0 -2 -3 -5 -3 -3 -5 -1 -3 0 62 0 0 1 1 2 1 22 1 2 2 1 1 0 0 1 0 1 2 1.35 1.13 34 L -4 -5 -3 -6 -4 -5 -5 -6 -5 4 4 -5 1 0 -5 -5 -3 1 -1 2 0 0 2 0 0 0 0 0 0 29 48 0 2 3 0 0 0 2 2 13 0.96 1.14 35 F -5 -5 -5 -6 -5 -5 -5 -6 -3 -3 -1 -5 -2 8 -6 -5 -4 -1 5 -3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 0 0 72 0 0 0 0 23 0 1.93 1.14 36 G 0 -4 -1 -1 -1 -2 -4 7 -4 -6 -6 -4 -5 -6 -4 -1 -1 -5 -5 -5 6 0 3 3 2 2 0 77 0 0 0 0 0 0 0 4 4 0 0 0 1.45 1.14 37 K -4 1 -1 -4 -6 0 -2 -2 2 -6 -5 7 -4 -6 -1 -1 -3 -6 -4 -5 0 5 3 0 0 3 0 3 5 0 0 76 0 0 3 4 0 0 0 0 1.47 1.47 38 P 0 -2 -2 -4 -5 -1 -2 -1 2 -5 -4 -1 -1 -6 7 -2 -1 -6 -5 -5 9 2 2 0 0 3 2 4 5 0 2 4 2 0 60 3 4 0 0 0 1.42 1.47 39 E -2 0 0 0 -2 1 5 -3 3 -1 -3 0 -2 -2 -2 -1 0 -1 -2 -2 2 6 4 5 1 5 39 2 8 4 1 4 1 2 1 4 5 1 1 4 0.53 1.47 40 I 3 -4 -4 -5 2 -1 -4 -1 -5 1 -2 -4 0 -5 1 2 3 -6 -5 2 22 0 0 0 4 3 0 5 0 8 3 0 2 0 6 14 19 0 0 16 0.47 1.47 41 D -1 4 0 1 -2 0 1 -1 4 -3 -3 1 -1 1 -5 -1 -2 -4 2 -3 4 20 4 8 1 4 8 5 12 1 2 9 1 6 0 3 2 0 7 1 0.39 1.45 42 G 0 -1 -3 -3 -5 -3 0 4 -2 -2 -4 -1 -4 -3 4 -2 0 -5 0 1 8 3 1 1 0 1 5 29 1 2 1 4 0 1 24 2 5 0 4 10 0.56 1.22 43 S -3 3 0 -2 -3 0 -1 3 4 -4 -2 1 -3 0 1 -1 -2 -2 1 -3 1 16 3 1 1 4 2 21 12 0 5 10 1 5 6 5 1 0 5 1 0.39 1.22 44 R -2 8 -3 -4 -1 0 -2 -5 0 -5 -4 1 -4 -5 -5 -1 -3 -5 -4 -5 3 81 0 0 1 4 1 0 2 0 1 3 0 0 0 3 0 0 0 0 1.64 1.22 45 R -4 7 -3 -4 1 -1 -3 -5 -3 -3 -5 3 -4 -5 -1 -3 -4 -5 -4 -2 0 71 0 0 4 1 0 0 0 1 0 17 0 0 3 0 0 0 0 3 1.49 1.22 46 L -4 -2 -5 -6 -4 -4 -5 -6 -5 0 3 -4 9 -2 -5 -4 -3 -4 -4 1 0 2 0 0 0 0 0 0 0 3 29 0 58 0 0 0 0 0 0 8 1.54 1.22 47 G 1 -5 -3 -4 -5 -4 -4 7 -5 -6 -6 -4 -5 -6 -5 -1 -4 -5 -6 -5 11 0 0 0 0 0 0 86 0 0 0 0 0 0 0 3 0 0 0 0 1.80 1.22 48 V -2 -4 -4 -5 -4 -4 -4 -5 5 1 -1 -4 0 -3 -5 -4 -1 -5 -3 6 1 0 0 0 0 0 0 0 15 3 4 0 2 0 0 0 2 0 0 72 1.25 1.16 49 A 5 -4 -4 -5 -1 -4 -4 -1 -5 1 0 -4 1 -3 -4 -2 0 -5 -3 3 47 0 0 0 1 0 0 4 0 9 7 0 4 1 0 1 5 0 1 21 0.68 1.16 50 L -2 -5 -3 -5 -1 -4 -5 -6 -5 0 5 -5 0 -1 -5 -3 2 -4 -4 1 2 0 1 0 1 0 0 0 0 2 67 0 1 1 0 1 15 0 0 8 0.96 1.16 51 A 5 -4 -3 -3 2 -3 -4 -2 -2 0 -3 -3 -2 -4 -4 0 0 -5 -3 1 64 0 1 1 4 0 0 1 1 6 0 0 1 0 0 6 5 0 1 10 0.88 1.16 52 T -2 3 -1 -4 -2 -2 -3 -4 -1 -1 1 -1 -1 -2 -4 0 5 -1 0 0 2 16 2 0 1 1 1 1 1 3 13 3 1 1 0 6 37 1 4 6 0.50 1.21 53 A 4 -2 0 3 -4 -3 -2 4 -2 -5 -5 -3 -4 -5 -4 -1 -3 -5 -5 -4 42 2 3 17 0 0 1 31 1 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0.89 1.19 54 E 0 -1 0 3 -4 -1 4 -2 -2 -2 -4 1 -3 -5 2 0 -1 -6 -3 -3 10 2 3 17 0 1 30 2 1 3 1 8 0 0 10 5 3 0 1 1 0.52 1.24 55 S -3 -3 3 6 -3 -2 -1 -3 -2 -5 -5 -2 -4 -5 -3 3 3 -6 -5 -4 0 1 11 43 0 1 2 1 1 0 0 1 0 0 1 20 18 0 0 1 0.98 1.23 56 V -1 -2 -4 -5 0 -3 -4 -5 -5 4 0 -3 2 -3 -2 -3 1 -5 -3 5 5 3 0 0 2 1 1 0 0 23 7 1 4 0 2 1 9 0 0 41 0.73 1.25 57 V -1 -2 0 4 -5 0 5 -2 -2 -2 -4 -1 -4 -3 -3 0 0 -6 -5 -2 6 1 4 22 0 3 41 2 0 3 1 3 0 1 1 5 5 0 0 3 0.73 1.27 58 D 0 -1 -2 1 -4 2 4 -4 -2 -2 -3 1 -2 -5 -3 -1 1 -5 -3 0 9 2 1 7 0 11 32 1 1 3 3 8 1 0 0 4 10 0 1 6 0.47 1.32 59 A 6 -4 -2 -4 -3 -3 -3 -3 -4 -2 0 -3 -3 -4 -4 -1 -1 -5 -4 -1 79 0 1 0 0 0 1 0 0 2 10 0 0 0 0 2 3 0 0 2 1.17 1.28 60 I -3 6 -4 -4 -2 -2 -2 -5 -3 0 1 1 -1 -4 -5 -3 -2 -5 -3 0 1 56 0 1 1 1 1 0 0 6 15 6 1 0 0 1 2 0 0 7 0.99 1.30 61 E 1 1 -1 3 -4 2 4 -2 -2 -4 -4 1 -3 -4 -4 0 -1 -5 -4 -3 10 6 2 18 0 8 32 2 1 1 2 9 0 1 0 5 3 0 0 1 0.59 1.32 62 R -2 5 1 -2 -4 0 -2 -2 -2 -1 -2 5 -3 -4 -4 -3 -2 -5 -4 -2 2 33 5 2 0 3 1 2 1 4 3 37 0 0 0 1 2 0 0 3 0.86 1.35 63 A 6 -4 -4 -5 -1 -4 -4 -2 -4 -4 -3 -4 -3 -5 -4 -1 -1 -5 -5 0 87 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 2 0 0 6 1.42 1.34 64 K 0 3 0 -1 -2 1 1 -3 -2 -1 -1 4 -2 -4 -4 -2 -1 -3 -4 0 6 17 4 3 1 7 10 2 0 4 6 26 1 0 0 2 4 0 0 6 0.41 1.37 65 H 1 4 -1 -1 -5 2 2 -4 -1 -2 0 2 -1 -1 -4 -2 -1 -5 -3 -2 10 21 3 3 0 11 15 0 1 2 8 14 1 2 0 1 4 0 1 2 0.40 1.38 66 A 5 -5 -2 -5 2 -4 -4 -3 -5 0 -1 -4 0 -4 -4 0 -1 -5 -4 3 49 0 1 0 4 0 0 1 0 3 6 0 2 0 0 5 2 0 0 26 0.82 1.36 67 A 5 -1 -4 -4 -4 -2 -3 -2 -2 -1 -3 1 -2 -3 -4 1 -2 -3 0 -1 60 4 0 0 0 1 1 2 1 3 2 9 0 0 0 8 0 0 4 4 0.80 1.38 68 G 2 -1 1 2 -3 1 2 0 1 -4 -5 1 -3 -5 -4 3 -1 -6 -5 -4 19 4 5 9 0 5 11 7 3 0 0 9 1 0 0 21 3 0 0 0 0.42 1.39 69 Q 2 1 -1 -2 -1 1 -2 -3 0 -2 0 4 0 -3 -4 0 1 -5 -2 -3 17 8 2 1 1 6 2 1 2 2 11 26 3 1 0 7 9 0 1 1 0.36 1.40 70 V -4 -5 -6 -6 -4 -5 -6 -5 -6 5 3 -5 0 -2 -6 -5 -3 -5 -4 5 0 0 0 0 0 0 0 1 0 38 22 0 1 1 0 0 0 0 0 38 1.20 1.38 71 K -2 3 0 -1 -4 1 1 -2 0 -3 -3 4 -2 -4 -4 0 1 -5 -4 -3 2 16 4 3 0 6 10 2 2 1 2 29 1 1 0 7 10 0 0 2 0.51 1.36 72 V -3 -5 -6 -6 -2 -5 -5 -6 -6 5 0 -5 1 -3 -4 -5 -2 -5 -4 6 0 0 0 0 1 0 0 0 0 32 6 0 3 0 1 0 1 0 0 58 1.31 1.33 73 Q -3 3 -1 -3 -5 2 3 -3 3 -5 -5 4 -4 -5 -4 1 -1 -5 -3 -3 1 15 1 0 0 10 18 1 8 0 0 29 0 0 0 13 4 0 1 1 0.72 1.19 74 G -2 -4 -2 -3 -5 -4 -4 7 -4 -6 -6 -3 -5 -5 -4 -2 -4 -5 -5 -5 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.95 0.81 K Lambda Standard Ungapped 0.1304 0.3146 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1973 0.3184 PSI Gapped 0.0604 0.2670