Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 I -3 -5 -5 -5 -3 -5 -5 -6 -5 7 0 -5 0 -2 -5 -4 -2 -4 -3 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 95 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 1.38 0.68 2 D 0 -3 -1 2 -3 -2 -2 -1 -3 -4 -4 -2 -4 -4 1 6 -1 -5 -4 -4 2 0 0 11 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 6 80 0 0 0 0 1.01 0.69 3 T 0 -3 -2 -3 -4 -2 -1 0 -4 -3 0 -2 -3 -4 7 -1 0 -5 -4 -2 9 1 1 0 0 1 4 8 0 1 10 1 0 0 51 4 7 0 0 2 0.98 0.69 4 S 0 -4 -3 -4 -3 -3 -3 -4 -4 0 2 -3 5 -2 1 1 2 2 -3 1 9 0 0 0 0 0 0 0 0 3 25 0 16 1 6 10 17 3 0 9 0.41 0.70 5 V -2 -4 -5 -5 -3 -4 -4 -5 -5 3 0 -4 -1 -3 -4 -3 0 -5 -3 6 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11 2 0 0 0 0 0 3 0 0 84 1.13 0.70 6 S 0 1 1 -1 -4 2 0 2 -1 -2 -4 1 -3 -5 -3 3 2 -5 -4 -3 7 6 6 2 0 9 6 16 1 2 0 9 0 0 0 21 16 0 0 0 0.36 0.70 7 L 1 -4 -4 -5 -3 -4 -4 0 -4 0 4 -4 0 3 -4 -3 -1 -3 -2 0 11 0 0 0 0 0 0 8 0 2 55 0 0 14 0 0 3 0 0 6 0.61 0.70 8 W -4 -5 -6 -6 -4 -4 -5 -4 -4 -5 -3 -5 -3 -1 -6 -5 -4 13 1 -5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 3.63 0.70 9 K -3 1 -2 -2 -5 2 -1 -3 -2 -5 -4 7 -3 -5 -3 -2 -2 -5 -4 -4 0 2 0 0 0 6 0 0 0 0 0 92 0 0 0 0 0 0 0 0 1.38 0.70 10 G -2 -4 -2 3 -5 -3 -1 7 -4 -6 -6 -3 -5 -5 -4 -2 -3 -5 -5 -5 0 0 0 17 0 0 2 80 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1.43 0.70 11 A -1 -4 -5 -3 -3 -4 -4 -3 -5 4 0 -4 1 0 0 -3 -1 6 -2 3 6 0 0 2 0 0 0 1 0 30 7 0 2 3 4 0 3 13 0 27 0.64 0.70 12 L 2 -4 -4 -4 -3 -3 -4 -1 -4 -1 3 -3 0 1 -4 -1 3 5 -2 0 21 0 0 0 0 0 0 3 0 0 29 0 1 7 0 4 19 8 0 7 0.44 0.70 13 K -2 1 -2 -2 -5 0 -1 -3 -2 -5 -4 7 -3 -5 -3 -2 -2 -5 -4 -4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 1.50 0.70 14 P -3 -4 -4 -4 -5 -3 -3 -4 -4 -3 -4 -3 -4 -4 8 -3 -1 2 1 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 84 0 2 3 6 3 2.09 0.70 15 L 0 -4 -5 -5 -3 -4 -4 -5 -4 2 5 -4 1 1 -4 -4 -3 -4 -3 2 7 0 0 0 0 0 0 0 0 7 62 0 1 4 0 0 0 0 0 14 0.71 0.70 16 A 4 -3 -3 -3 -3 -3 -3 4 -3 -4 -3 -3 2 -4 -3 1 -2 -4 -4 -3 46 0 0 0 0 0 0 32 0 0 0 0 6 0 0 10 0 0 0 0 0.74 0.70 17 A 3 -3 -1 -4 -3 -3 -3 -2 -4 0 2 -3 1 -3 -3 0 2 -4 -3 1 29 0 3 0 0 0 0 2 0 3 24 0 4 0 0 7 12 0 0 12 0.32 0.70 18 A 4 -4 -4 -4 -3 -3 -4 -1 -4 0 2 -3 1 0 -3 -2 -2 -4 -3 2 41 0 0 0 0 0 0 5 0 5 21 0 3 3 0 0 0 0 0 17 0.44 0.70 19 G 4 -4 -3 -3 -3 -3 -3 4 -4 -2 -3 -3 -2 -4 -3 -1 0 -4 -4 -1 46 0 0 0 0 0 0 36 0 1 2 0 1 0 0 1 5 0 0 4 0.71 0.70 20 F -2 -4 -5 -5 -3 -3 -4 -5 -4 3 2 -4 7 4 -5 -4 -3 -3 -1 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 18 17 0 33 23 0 0 0 0 0 1 0.81 0.70 21 I 3 -4 -3 -4 -1 -3 -4 4 -4 1 -1 -3 -2 0 -4 -1 -2 -4 -3 2 27 0 0 0 1 0 0 31 0 8 6 0 0 4 0 3 0 0 0 14 0.44 0.70 22 A 4 -4 -3 -4 0 -3 -3 2 -4 0 1 -3 -2 1 -3 -1 -2 -4 -3 1 40 0 0 0 2 0 0 16 0 5 14 0 0 6 0 2 1 0 0 9 0.38 0.70 23 T 3 -3 -3 -3 -3 -3 -3 -1 -4 0 -1 -3 0 -3 -3 0 5 -4 -3 1 26 0 0 0 0 0 0 3 0 4 5 0 3 0 0 3 44 0 0 8 0.54 0.70 24 F 4 -4 -4 -4 -3 -3 -3 -1 -4 0 1 -3 -1 3 -3 -1 -2 -3 -2 2 41 0 0 0 0 0 0 4 0 3 13 0 1 14 0 3 1 0 0 16 0.42 0.70 25 A 3 -4 -4 -5 -3 -3 -4 -3 -4 1 3 -4 -1 0 -4 -2 -2 -4 -3 2 34 0 0 0 0 0 0 1 0 5 37 0 0 4 0 0 0 0 0 15 0.50 0.70 26 G 4 -4 -3 -3 -3 -3 -3 4 -4 -2 -2 -3 -3 -1 -3 0 -1 -4 -3 0 36 0 0 0 0 0 0 37 0 1 3 0 0 4 0 4 3 0 0 7 0.60 0.70 27 L 2 -3 -2 -3 -3 -3 0 5 -3 -3 -1 -3 -3 -2 -3 2 -1 -4 -4 -2 22 0 0 0 0 0 5 41 0 0 7 0 0 2 0 17 3 0 0 3 0.60 0.70 28 I -1 -4 -5 -5 2 -4 -5 -5 -4 3 1 -4 0 6 -5 -4 -1 1 0 1 5 0 0 0 6 0 0 0 0 16 14 0 2 45 0 0 3 1 1 8 0.80 0.70 29 F 0 -4 -5 -5 -4 -4 -5 -3 -3 0 1 -4 -1 7 -5 -3 -2 -2 1 0 9 0 0 0 0 0 0 1 0 4 14 0 1 60 0 1 1 0 2 6 0.99 0.70 30 H -3 -2 -1 -3 -5 -1 -2 -4 10 -5 -5 -2 -3 -3 -4 -3 -4 -4 0 -5 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.32 0.70 31 Y -3 0 -4 -5 -4 -3 -4 -1 2 -3 -3 -1 -3 2 -5 -3 -3 0 9 -3 0 5 0 0 0 0 0 5 3 0 0 3 0 5 0 0 0 0 78 0 1.53 0.70 32 I -2 -4 -4 -5 -3 -4 -4 -5 -5 4 1 -4 3 -1 -4 -2 1 -4 -3 4 2 0 0 0 0 0 0 0 0 32 9 0 10 2 0 1 8 0 0 36 0.72 0.70 33 G 0 3 -2 -3 -4 -2 -3 2 -3 -1 -3 0 0 0 -3 -1 4 -4 -3 -1 5 19 0 0 0 0 0 20 0 3 0 6 3 5 0 0 36 0 0 4 0.49 0.70 34 I 0 -2 -1 -4 -3 -2 -3 -2 -1 2 -1 1 -1 -1 -4 -3 -1 -5 -3 5 6 1 3 0 0 1 0 2 2 9 0 13 0 3 0 0 3 0 0 58 0.60 0.70 35 G -2 -1 -2 -3 -4 -3 -4 7 -4 -6 -6 -2 -5 -5 -4 -2 -3 -4 -5 -5 0 4 0 0 0 0 0 93 0 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 1.67 0.70 36 P -1 1 -4 -3 -5 -3 -3 -3 -4 -5 -5 -2 -4 -5 8 -2 -3 -5 -5 -4 3 10 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 85 0 0 0 0 0 2.13 0.68 37 N -3 -2 7 -1 -4 0 -2 -2 -1 -2 -3 1 -3 -4 -3 0 -2 -5 -3 -3 0 0 75 0 0 2 0 0 0 4 2 8 0 0 0 5 0 0 0 1 1.16 0.65 38 K -3 4 -2 -1 -4 1 3 -3 -1 0 -3 2 -3 -4 -2 -1 1 -5 -3 0 0 29 1 2 0 4 27 1 1 6 2 9 0 0 1 3 8 0 0 6 0.48 0.66 39 E 0 -3 -3 -3 -3 -2 3 -4 -2 0 -1 -2 -2 -3 0 -2 2 -5 -3 5 8 0 0 0 0 0 20 0 1 1 1 2 0 0 4 0 12 0 0 51 0.55 0.67 40 V -1 -2 -1 3 -4 0 3 -2 1 -3 -4 0 -3 -4 1 2 0 -5 -4 1 2 1 1 15 0 2 24 3 4 0 0 4 0 0 6 20 6 0 0 12 0.39 0.69 41 D -1 -1 -2 4 -5 0 6 -4 -2 -5 -4 1 -2 -5 -2 -1 -2 -5 -4 -3 4 3 0 23 0 0 57 0 0 0 1 6 1 0 1 2 2 0 0 1 0.92 0.69 42 D -1 -2 -1 4 -5 1 5 -3 0 -4 -4 -1 -4 -5 0 -2 -2 -5 -4 -2 3 0 0 30 0 4 47 1 3 0 1 2 0 0 4 1 2 0 0 3 0.86 0.71 43 D -2 -3 -1 6 -5 1 4 -2 2 -5 -3 -2 -4 -5 -3 -2 -2 -5 -4 -4 3 0 0 52 0 4 30 1 5 0 3 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1.02 0.69 44 E -3 -2 -1 4 -5 2 6 -4 2 -3 -5 0 -4 -5 -3 -2 -1 -5 -3 -4 0 0 2 21 0 6 58 0 6 2 0 4 0 0 0 0 2 0 0 0 0.98 0.66 45 E -2 -1 -1 3 -5 3 5 -3 -2 -5 -4 3 -3 -5 -3 -2 -2 -5 -4 -4 0 0 0 15 0 15 53 0 0 0 0 17 0 0 0 0 0 0 0 0 0.95 0.58 K Lambda Standard Ungapped 0.1409 0.3190 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1850 0.3158 PSI Gapped 0.0566 0.2670