Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 N -3 -2 8 -1 -4 -2 -2 -2 -2 -5 -5 -2 -4 -5 -4 2 -2 -6 -4 -5 0 0 80 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20 0 0 0 0 1.58 0.86 2 A 0 1 3 -3 -4 3 -2 -1 -2 -2 -4 1 -3 -4 -3 3 1 -5 -1 -3 8 8 18 0 0 15 0 5 1 3 1 7 0 0 1 23 7 0 3 1 0.44 0.98 3 E 0 -3 1 -1 -4 2 2 -2 -2 2 -1 -2 -3 -4 2 0 1 -5 -4 0 10 0 8 2 0 9 15 3 0 16 6 0 0 0 9 8 8 0 0 7 0.25 0.99 4 A 1 -4 -4 -5 -1 -3 -4 -4 -5 1 -2 -4 0 -3 -4 -2 1 -5 -4 6 13 0 0 0 1 1 0 1 0 3 1 0 2 0 0 1 10 0 0 68 0.98 1.02 5 S 2 -3 -2 -3 -4 -3 -3 3 -3 -5 -3 -3 -2 -2 4 3 -2 -5 -4 -4 19 1 1 0 0 0 0 26 1 0 2 0 1 2 22 26 1 0 0 0 0.76 1.05 6 R 0 2 1 1 -5 1 1 0 0 -4 -4 3 -2 -5 0 1 0 -5 -4 -3 8 10 7 8 0 6 8 5 2 0 0 23 1 0 4 9 7 0 0 2 0.35 1.05 7 V -1 -5 -5 -5 -3 -4 -4 -5 -5 3 3 -5 -1 1 -5 -3 -1 -4 -3 5 4 0 0 0 0 0 1 0 0 15 25 0 0 5 0 2 3 0 0 45 0.82 1.04 8 Y -4 -4 -4 -5 -5 -4 -4 -5 -1 -4 -3 -4 -3 2 -5 -4 -4 0 9 -3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 0 94 0 2.34 1.04 9 E -1 4 0 0 -5 3 2 -3 1 1 -1 1 -2 -3 -4 -1 -2 -5 -4 -3 4 26 5 6 0 12 12 1 4 8 7 9 0 1 0 3 1 0 0 1 0.42 1.06 10 I 0 1 -1 1 -4 2 0 -1 2 -3 -3 1 -2 -4 -4 4 0 -1 0 -4 8 6 2 8 0 11 5 4 5 1 1 7 1 0 0 31 6 1 3 0 0.39 1.06 11 I -3 -5 -5 -6 -3 -5 -5 -6 -6 5 -1 -5 -1 -3 -5 -4 -2 -5 -4 6 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41 2 0 0 0 0 0 2 0 0 56 1.30 1.06 12 V -4 -5 -6 -6 -4 -5 -5 -6 -6 7 0 -5 3 -3 -5 -5 -2 -5 -4 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 82 1 0 6 0 0 0 2 0 0 9 1.50 1.07 13 E -1 -2 3 5 -5 1 4 -2 -3 -5 -5 -1 -4 -6 -4 -2 -2 -6 -5 -4 4 1 12 33 0 5 34 3 0 0 1 3 0 0 0 2 1 0 0 1 0.91 1.07 14 S -3 -3 0 7 -6 -1 3 -2 -3 -6 -6 -1 -5 -6 -4 -1 -2 -6 -5 -5 1 1 3 63 0 2 22 2 0 0 0 4 0 0 0 2 1 0 0 0 1.35 1.07 15 V -2 -5 -5 -6 -3 -5 -5 -6 -6 1 -1 -5 -2 -3 -5 -4 -1 -5 -4 7 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0 0 2 0 0 97 1.61 1.07 16 V -3 -5 -5 -6 3 -5 -5 -6 -5 6 0 -5 3 -3 -5 -3 -2 -5 -4 3 1 0 0 0 7 0 0 0 0 64 3 0 7 0 0 1 1 0 0 16 1.20 1.07 17 N 1 1 4 2 -5 1 3 -2 -1 -5 -5 0 -3 -5 -4 1 0 -5 -4 -3 12 6 24 10 0 5 18 1 1 0 0 4 0 0 0 10 5 0 0 1 0.53 1.07 18 E 1 -2 3 0 -2 0 0 2 0 -5 -4 2 -4 -5 -4 3 -1 -2 -4 -3 14 1 15 5 1 3 6 13 2 0 1 15 0 0 0 22 2 1 0 1 0.43 1.07 19 V -2 -4 -2 -4 1 -4 -4 -4 -4 2 -1 -4 2 -3 -4 3 -1 -5 -4 5 1 0 1 0 3 0 0 0 0 12 3 0 5 0 0 30 3 0 0 41 0.73 1.07 20 R -3 7 -2 -3 -5 2 -1 -4 -1 -4 -5 3 -4 -5 -4 -2 0 -5 -4 -3 0 62 1 0 0 8 3 0 1 1 0 17 0 0 0 2 5 0 0 1 1.24 1.07 21 E -1 -3 1 3 -1 2 4 -2 0 -1 -4 -1 -4 -5 0 -1 -1 -5 -2 1 4 0 8 16 1 8 26 3 2 4 0 3 0 0 5 4 3 0 1 12 0.40 1.07 22 D 0 -4 0 6 -3 -1 3 -4 -3 -2 0 -2 -4 -3 -2 -1 -2 -6 -3 -2 7 0 4 47 1 2 17 0 0 2 9 1 0 1 2 2 1 0 1 2 0.78 1.07 23 F -3 -5 -2 -6 -1 -5 -5 -5 -4 -2 -1 -5 -2 8 -6 -5 -4 0 1 -2 2 0 3 0 1 0 0 0 0 0 3 0 0 88 0 0 0 1 0 2 1.92 1.07 24 E -1 -3 -3 2 -4 1 4 -4 -3 1 2 -3 -1 -4 -4 -2 0 -5 -1 1 5 0 0 9 0 5 33 1 0 9 19 0 1 0 0 1 5 0 3 10 0.45 1.07 25 N -2 -1 3 4 -6 0 5 -2 -3 -5 -5 -2 -5 -3 -4 0 -2 -5 -2 -5 1 2 13 27 0 3 42 2 0 0 0 0 0 1 0 5 1 0 2 0 0.94 1.09 26 A 0 -3 3 0 -3 -1 4 -1 -3 -2 -2 -3 1 0 -4 1 -1 -4 2 -3 8 1 14 5 1 1 32 5 0 2 3 0 4 4 0 9 2 0 8 1 0.42 1.08 27 G -2 -4 0 -4 -5 -1 -4 7 -4 -6 -6 -4 -5 -5 -4 -1 -4 -5 -1 -5 1 0 3 0 0 2 0 87 0 0 0 0 0 0 0 3 0 0 2 0 1.73 1.09 28 I -1 -5 -5 -6 -1 -5 -5 -4 -5 4 1 -5 1 0 -1 -3 -3 -4 0 5 3 0 0 0 1 0 0 1 0 23 12 0 3 4 4 1 0 0 3 45 0.79 1.09 29 D -3 -4 0 6 -6 -1 3 1 -3 -5 -6 -3 -2 -6 -2 -1 -2 -6 -5 -5 0 0 2 57 0 1 20 13 0 0 0 0 1 0 1 3 2 0 0 0 1.19 1.09 30 E -2 -3 -2 3 -5 1 6 -3 -2 -2 -2 0 -4 -5 -3 0 -2 -5 -4 -2 2 0 1 14 0 5 53 1 1 3 5 4 0 0 1 6 2 0 0 3 0.81 1.09 31 Q 1 0 2 3 -4 4 1 -2 0 -5 -5 -2 -2 -5 -3 3 -1 -5 -4 -3 12 5 8 15 0 19 6 2 2 0 0 1 1 0 1 25 3 0 0 1 0.52 1.07 32 T -1 -5 -4 -5 -3 -4 -3 -5 -5 1 -1 -4 -2 -3 -4 -2 3 -5 -4 6 2 0 0 0 0 0 2 0 0 4 4 0 0 0 0 2 19 0 0 67 1.06 1.09 33 L -4 -5 -6 -6 -4 -5 -5 -6 -5 1 6 -5 1 -1 -5 -5 -4 -4 -3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7 86 0 2 2 0 0 0 0 0 3 1.36 1.09 34 Q 1 0 2 2 -3 4 3 -3 1 -3 -3 0 0 -5 -4 0 -1 -5 -3 -3 10 4 9 10 1 21 18 1 4 1 3 6 2 0 0 6 2 0 1 1 0.43 1.09 35 D -3 -3 -1 4 -6 2 6 -4 1 -5 -3 -1 -2 -5 -4 -2 -2 -5 -1 -5 1 0 1 22 0 8 56 0 4 0 2 1 1 0 0 2 1 0 2 0 1.10 1.09 36 L -4 -5 -6 -6 -4 -5 -5 -6 -5 1 6 -5 1 0 -5 -5 -4 -4 -3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 88 0 2 2 0 0 0 0 0 4 1.37 1.09 37 K -2 3 -2 -3 -2 5 -1 -4 0 -4 -5 5 -3 -5 -4 -2 -3 -5 -4 -3 2 18 1 0 1 33 1 0 2 1 0 38 0 0 0 1 0 0 0 1 1.06 1.09 38 N 0 2 1 -2 -5 4 0 -1 2 -5 -4 3 -3 -5 -4 2 1 -5 -4 -4 6 11 5 1 0 21 3 4 6 0 1 19 0 0 0 13 8 0 0 1 0.52 1.10 39 I -3 0 -3 -3 -2 -2 0 0 -4 2 3 0 1 -3 -5 -1 0 -5 -4 2 0 5 1 1 1 1 6 7 0 12 31 7 4 0 0 5 7 0 0 12 0.32 1.13 40 W -5 -1 -6 -7 -5 -4 -5 -5 -5 -5 -4 -5 -4 -1 -6 -5 -5 12 0 -5 0 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 97 0 0 3.82 1.05 41 Q -3 0 -1 -2 0 5 5 -3 -1 -3 -3 1 -3 -5 -4 -2 0 -5 -4 -4 0 4 1 0 3 25 48 1 1 2 2 5 0 0 0 2 5 0 0 1 0.92 1.06 42 K 1 0 2 0 -4 2 1 -3 1 -3 -2 2 0 -5 -4 2 3 -5 -3 -3 10 4 8 5 0 8 11 0 3 1 4 11 3 0 0 14 17 0 1 1 0.32 1.06 43 K -3 2 -1 -3 -6 -1 -2 -4 -3 -5 -5 7 -4 -6 -3 -2 -3 -5 -4 -5 0 9 2 0 0 0 0 0 0 0 0 87 0 0 0 1 0 0 0 0 1.59 1.06 44 L -3 -5 -6 -6 0 -4 -5 -6 -5 2 5 -5 4 -2 -5 -4 -3 -4 -3 2 0 0 0 0 2 0 0 0 0 12 58 0 12 0 0 0 0 0 0 16 1.03 1.02 45 T 2 -2 -2 -4 1 -2 -3 -2 -4 0 1 -3 5 -3 -4 3 1 -4 -1 -1 16 1 2 0 2 1 1 2 0 6 12 1 19 0 0 24 8 0 2 3 0.43 0.99 46 E -3 -1 -2 0 -5 7 4 -4 -2 -5 -4 0 -3 -5 -3 -2 -3 -4 -4 -4 0 0 0 3 0 66 30 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1.41 0.85 K Lambda Standard Ungapped 0.1272 0.3080 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1991 0.3195 PSI Gapped 0.0609 0.2670