Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 D -3 -2 2 6 -5 0 4 -3 -2 -5 -5 -1 -4 -5 -3 -1 -2 -5 -4 -4 0 0 7 53 0 0 39 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.14 0.51 2 Y -3 -3 -3 3 -4 -2 2 -4 -3 0 -1 -1 1 6 2 -3 -3 -2 0 -2 0 0 0 16 0 1 14 0 0 5 3 4 4 39 12 0 0 0 1 1 0.64 0.69 3 L -1 -1 4 5 -1 0 3 -2 1 -4 -4 -2 -1 -5 -3 -2 -2 -5 -4 -2 4 2 26 32 1 3 21 1 3 0 1 1 2 0 0 0 1 0 0 3 0.73 0.71 4 I -1 -3 -2 -2 2 -3 -3 -4 -1 3 -2 -3 1 0 -4 1 5 -4 -1 1 2 0 1 2 4 0 0 0 2 18 1 0 3 4 0 10 43 0 2 8 0.53 0.73 5 E 0 -2 0 4 -5 2 3 1 -1 -4 -5 0 -4 -5 1 -1 -3 -5 -4 -3 7 0 3 28 0 12 22 9 1 1 0 4 0 0 7 4 0 0 0 2 0.56 0.75 6 N -3 -2 7 2 -5 1 -1 -3 5 -5 -5 -2 -4 -5 -4 -1 -2 -5 -3 -5 1 1 62 12 0 5 1 0 17 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1.26 0.78 7 L -3 -4 -3 -5 0 -3 -4 -5 0 2 3 -1 1 3 -5 -2 -1 -3 2 3 0 0 1 0 2 1 0 0 3 14 25 5 3 16 0 2 3 0 7 19 0.47 0.80 8 M -2 -4 -5 -5 0 -4 -5 -5 -5 5 1 -4 4 -1 -5 -4 -1 -4 -3 4 2 0 0 0 2 0 0 0 0 33 7 0 14 1 0 0 2 0 0 39 0.86 0.79 9 L -1 -4 -5 -5 -3 -4 -5 -5 -4 2 4 -4 4 1 -5 -4 -3 -3 1 3 6 0 0 0 0 0 0 0 0 8 38 0 11 5 0 0 0 0 5 27 0.69 0.79 10 C 1 -5 -4 -5 10 -4 -5 -1 -5 -3 -3 -4 -3 -4 -4 0 -2 -4 -4 -3 14 0 0 0 76 0 0 4 0 0 0 0 0 0 0 7 0 0 0 0 1.99 0.79 11 L -3 -1 -3 -3 -4 6 -1 -4 -2 -1 2 -2 3 -1 -4 -2 0 -4 -3 -1 0 1 0 0 0 54 0 0 0 3 19 0 9 3 0 2 6 0 0 3 0.81 0.79 12 Y -3 -4 -4 -5 -4 -4 -4 -5 2 -3 -2 -4 -2 5 -5 -3 -2 0 8 -1 1 0 0 0 0 0 0 0 4 0 2 0 0 27 0 1 1 0 60 3 1.48 0.79 13 D -3 -3 0 6 -5 -1 4 -4 -3 -2 -3 -2 -4 -5 -3 -2 1 -6 -4 0 0 0 2 51 0 0 27 0 0 3 2 0 0 0 0 0 8 0 0 7 0.99 0.79 14 K -3 3 0 -3 -5 1 -1 -4 -2 -5 -5 7 -3 -5 -3 -2 -3 -5 -1 -4 0 17 3 0 0 3 0 0 0 0 0 75 0 0 0 0 0 0 2 0 1.26 0.84 15 V -2 -5 -5 -5 -3 -5 -5 -6 -5 4 -1 -5 -1 0 -5 -4 -2 -5 -3 6 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22 0 0 0 3 0 0 0 0 0 75 1.24 0.87 16 T -2 -1 3 -2 -4 3 -1 -3 4 -3 -3 0 -3 -3 -1 1 3 -4 0 -1 2 3 14 1 0 17 1 1 10 1 1 6 0 1 3 11 21 0 3 5 0.41 0.87 17 R -3 7 -2 -4 -5 -1 -2 -4 2 -5 -4 3 -1 -4 -4 -3 -2 -4 0 -4 0 72 0 0 0 0 0 0 5 0 0 16 2 0 0 0 2 0 3 0 1.37 0.87 18 T 0 0 2 -3 1 -3 -3 -3 -1 0 -3 0 -3 0 -2 3 2 -5 -3 2 8 6 11 0 4 0 0 0 1 5 0 5 0 5 2 21 16 0 0 17 0.32 0.87 19 K -3 3 0 -3 -5 1 -1 -4 -3 -5 -5 6 -3 -5 -1 -1 -3 -5 -4 -4 0 17 3 0 0 5 0 0 0 0 0 68 0 0 3 3 0 0 0 0 1.17 0.87 20 A -1 -3 6 -1 1 0 -2 1 -2 -5 -5 0 -4 0 -4 2 0 -5 -2 -4 3 0 47 1 3 5 0 8 0 0 0 5 0 4 0 18 5 0 1 0 0.78 0.87 21 R -2 4 -1 -3 -5 0 1 -4 -3 -1 -4 6 -3 -5 -3 -2 -3 -5 -4 -3 2 22 1 0 0 1 7 0 0 5 0 60 0 0 0 0 0 0 0 2 1.03 0.87 22 W -5 0 -5 -6 -5 -4 -5 -5 -4 -5 -4 -4 -3 -1 -6 -5 -4 12 3 -5 0 6 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 87 7 0 3.22 0.84 23 K -3 4 -2 -1 -5 -1 1 -4 -3 -2 -2 6 -3 -5 -3 -2 -3 -5 -4 -4 0 20 0 3 0 0 6 0 0 3 3 64 0 0 0 0 0 0 0 0 1.06 0.84 24 C -1 -5 -4 -5 8 -4 -5 -5 -4 0 0 -5 1 4 -5 -1 -1 -3 -1 1 6 0 0 0 41 0 0 0 0 5 5 0 3 19 0 4 3 0 2 12 1.05 0.84 25 S -1 -1 2 -3 -1 0 0 -4 1 1 -2 1 -3 -1 -1 0 2 4 3 1 4 3 9 0 1 3 7 0 3 7 1 8 0 2 3 5 15 6 10 12 0.23 0.84 26 L -4 -4 -5 -6 -4 -4 -5 -6 -4 -1 5 -5 2 5 -5 -5 -3 -3 -1 -1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 71 0 5 23 0 0 0 0 0 0 1.16 0.84 27 K -3 3 1 -3 -5 -1 -1 -4 0 -4 -2 6 0 -5 -3 -2 -3 -5 -4 -2 0 12 6 0 0 0 0 0 2 0 3 70 3 0 0 0 0 0 0 3 1.06 0.84 28 D 1 -3 1 6 0 1 0 -2 2 -4 -3 -2 -4 0 -4 0 -3 -5 -2 -3 13 0 6 47 2 6 4 2 6 0 2 1 0 4 0 4 0 0 1 1 0.70 0.84 29 G 0 -2 -2 -3 2 -4 -4 7 -4 -6 -5 -3 -5 -5 -4 -2 -3 -5 -5 -5 4 3 0 0 5 0 0 88 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.61 0.79 30 V -3 -5 -5 -5 -3 -4 -5 -6 -5 6 0 -4 2 2 -5 -4 -2 -4 -3 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 48 3 0 6 7 0 0 0 0 0 35 1.00 0.79 31 V 1 -4 -4 -5 -3 -3 -4 -5 -4 2 2 -4 7 -1 -4 -3 -2 -4 -3 2 11 0 0 0 0 0 0 0 0 14 18 0 44 2 0 0 1 0 0 11 0.89 0.79 32 T -2 0 4 -2 2 1 -2 -2 7 -4 -3 0 -3 -4 -3 1 2 -4 -2 -4 1 3 21 0 6 7 0 2 29 0 2 5 0 0 0 10 15 0 0 0 0.70 0.76 33 I -2 -5 -5 -5 -3 -4 -5 -5 -5 5 2 -4 1 1 -5 -3 -1 -4 -1 3 3 0 0 0 0 0 0 0 0 45 20 0 3 4 0 1 2 0 1 21 0.79 0.79 34 N -3 0 6 2 -5 -1 0 2 0 -5 -3 -1 -4 -5 -1 -1 -2 -5 -4 -5 1 5 49 13 0 1 4 16 1 0 3 2 0 0 2 2 0 0 0 0 0.85 0.82 35 R -2 0 2 0 -5 -2 -2 6 -1 -6 -6 -1 -5 -5 -2 -2 -3 -5 -5 -5 0 6 9 4 0 1 2 70 2 0 0 2 0 0 1 1 1 0 0 0 1.18 0.85 36 N -2 4 -1 -3 -5 0 -1 -4 1 -2 -3 6 -1 -5 -3 -2 -1 -5 -3 -2 1 22 1 0 0 3 2 0 3 2 1 54 1 0 0 1 4 0 1 3 0.88 0.85 37 D -3 -3 2 7 -6 -2 3 -3 -3 -5 -6 -2 -5 -6 -3 -1 -3 -6 -5 -5 0 0 7 70 0 0 20 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 0 0 0 1.46 0.85 38 Y -4 -2 -4 -5 -4 -2 -2 -5 2 1 -1 -3 -1 3 -5 -2 -3 1 8 -1 0 2 0 0 0 1 3 0 3 10 3 1 1 13 0 3 1 1 55 5 1.13 0.89 39 T 1 -4 -5 -5 0 -4 -4 -3 -5 1 3 -4 -1 -1 -2 -3 -1 -4 -3 4 12 0 0 0 2 0 0 2 0 4 34 0 0 2 2 1 3 0 0 38 0.62 0.89 40 F -4 -5 -5 -6 -4 -5 -5 -5 -3 -2 -1 -5 -2 9 -6 -5 -4 3 1 -1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 0 91 0 0 0 3 0 3 1.93 0.88 41 Q 0 0 3 -1 -4 3 -2 0 5 -5 -4 0 0 -3 -4 2 -1 -1 -3 -4 8 3 15 2 0 17 0 8 17 0 0 4 3 1 0 18 2 1 0 0 0.52 0.88 42 K -2 3 0 -3 -5 2 -1 -4 -3 -5 -4 6 -3 -3 -3 0 -1 -5 -4 -3 1 12 4 0 0 8 2 0 0 0 1 62 0 1 0 4 4 0 0 1 0.95 0.88 43 A 5 -4 -4 -4 5 -3 -4 0 -4 0 -1 -3 0 -2 -4 -1 -2 -2 -4 -1 58 0 0 0 14 0 0 7 0 5 6 0 3 2 0 2 1 1 0 2 0.79 0.89 44 Q -1 -2 4 -2 -4 3 -1 -3 -1 0 -2 0 -1 -2 -4 1 4 -5 -4 -1 3 0 20 0 0 17 1 0 1 5 3 4 1 2 0 12 26 0 0 4 0.49 0.91 45 V 0 -4 -3 -4 3 -4 -4 6 -4 -4 -3 -4 -4 -5 -4 -2 -3 -5 -5 -1 7 0 0 0 6 0 0 78 0 0 2 0 0 0 0 1 0 0 0 6 1.38 0.89 46 E -3 -1 -1 4 -6 0 6 -4 -2 -5 -5 -2 -4 -5 -3 -2 -2 -5 -3 -5 0 2 2 28 0 2 64 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 1.30 0.88 47 A 2 -4 -4 -5 -1 -4 -4 -4 -3 0 2 -4 1 5 -4 0 -1 -2 2 0 20 0 0 0 1 0 0 0 0 3 20 0 3 32 0 8 3 0 6 4 0.61 0.88 48 E -3 -1 0 3 -5 1 5 -4 -2 -2 -2 1 -3 -1 -4 -2 -2 -5 -4 -3 1 2 4 13 0 4 52 0 1 3 4 7 0 3 0 2 1 0 0 2 0.77 0.90 49 W -5 -5 -6 -6 -4 -4 -5 -5 -4 -4 -3 -5 -3 4 -6 -5 -5 12 2 -4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19 0 0 0 77 4 0 2.99 0.87 50 V -2 -3 -4 -4 -2 -3 -4 -4 -4 3 3 -3 3 -1 -4 -3 -1 -3 -2 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14 27 0 9 0 0 0 0 0 0 51 0.56 0.27 K Lambda Standard Ungapped 0.1342 0.3221 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1968 0.3196 PSI Gapped 0.0602 0.2670