Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 G -2 -5 -3 -4 -5 -4 -4 7 -4 -6 -6 -4 -5 -6 -4 -3 -4 -5 -5 -6 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.09 1.02 2 H -2 1 -2 -2 -5 -1 4 -3 6 -4 -5 -1 -4 -4 -1 3 -2 -5 2 -3 2 6 1 1 0 1 27 1 21 1 0 2 0 0 2 27 1 0 6 1 0.83 1.40 3 M -3 0 2 4 -5 3 1 -2 0 -4 -3 1 3 -5 -2 2 -1 -6 -4 -4 1 4 11 20 0 12 9 2 3 1 2 8 7 0 2 14 3 0 0 1 0.50 1.51 4 N 0 -1 4 2 -5 2 1 -2 0 -2 -5 0 -2 -4 3 1 -1 -6 -3 -3 9 2 18 10 0 8 7 3 2 3 1 5 1 0 15 9 4 0 1 2 0.42 1.52 5 V -1 1 2 3 -3 0 3 -3 -2 0 -3 -1 -3 -4 -3 -1 -1 -6 -5 2 4 8 10 18 0 3 18 2 1 5 2 3 1 0 1 3 4 0 0 14 0.38 1.55 6 K -4 5 0 -2 -6 1 -2 -4 -3 -5 -5 6 -3 -6 -3 -2 -3 -6 -5 -5 0 35 4 1 0 4 1 1 0 0 0 47 1 0 1 1 1 0 0 0 1.28 1.61 7 R -4 8 -3 -4 -6 -1 -3 -5 -2 -6 -5 3 -3 -6 -4 -3 -4 2 -5 -6 1 76 0 0 0 1 1 0 1 0 0 14 0 0 0 1 0 3 0 0 1.82 1.65 8 R 2 1 -1 -1 -3 0 1 -4 -1 -1 0 1 1 -4 -3 1 1 -3 -4 0 17 8 3 3 0 5 10 0 1 3 8 8 4 1 1 11 10 0 0 7 0.20 1.67 9 T 2 -1 3 -2 -2 0 -1 -3 3 -1 -2 -1 -1 -2 -2 1 3 -5 -2 -1 17 2 14 2 1 5 3 1 7 4 4 4 2 1 2 10 17 0 1 5 0.31 1.64 10 H 1 -1 -2 -4 -3 -2 -3 -4 10 -5 -5 -3 -3 -4 -4 -2 -2 -5 -1 -4 11 2 1 0 0 1 0 1 76 0 1 0 0 0 1 3 2 0 0 1 2.18 1.63 11 N -4 -2 7 -2 -3 -3 -4 -3 -2 2 -3 0 -3 -3 -4 -1 0 -6 -4 -1 1 1 61 0 0 0 0 1 0 11 1 7 1 1 0 4 6 0 0 3 1.23 1.61 12 V 3 0 -2 -1 -2 0 1 -4 -2 0 0 0 3 -1 -4 -1 -2 -1 -2 1 26 5 2 3 1 4 11 1 1 5 10 6 7 2 1 4 1 1 1 9 0.25 1.56 13 L 1 3 -2 -5 -3 -3 -4 -4 -3 2 2 0 2 -3 -5 1 -1 -2 -3 1 13 15 2 0 0 1 0 1 1 13 21 5 5 1 0 10 3 0 1 9 0.36 1.53 14 E -4 -3 -3 0 -6 -1 7 -5 -3 -6 -6 -1 -5 -6 -4 -3 -4 -6 -5 -5 0 0 0 3 0 0 92 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 1.98 1.53 15 R -4 7 -2 -4 -6 4 -3 -4 0 -6 -5 3 -4 -6 -5 -4 -4 -1 -3 -4 0 61 1 0 0 17 0 1 2 0 0 16 0 0 0 0 0 1 1 1 1.53 1.66 16 Q -2 5 1 -2 -3 3 0 -4 -1 -4 -3 5 -2 -4 -5 -2 -3 -2 -4 -5 2 32 6 2 1 12 5 1 1 1 2 31 1 1 0 1 1 1 0 0 0.92 1.72 17 R -2 8 -4 -5 -2 -2 -3 -4 2 -6 -5 -1 -5 -5 -5 -2 -4 0 2 -6 3 77 0 0 1 0 0 1 5 0 0 1 0 0 0 2 0 1 9 0 1.76 1.70 18 R -4 8 -3 -5 -6 0 -3 -4 -4 -3 -3 0 2 -6 -2 -3 -2 -6 -5 -2 1 74 1 0 0 3 1 1 0 1 2 2 6 0 3 1 3 0 0 3 1.59 1.78 19 N -1 0 2 3 -1 0 2 -1 0 -2 -3 2 -2 -2 -3 1 -1 -5 -2 -2 5 6 11 17 2 5 13 4 2 2 2 12 1 2 1 8 4 0 1 2 0.31 1.73 20 E -2 1 2 1 -1 1 1 -1 3 -2 -3 3 -2 -3 -3 1 -2 -5 -2 -2 3 7 10 9 2 6 9 4 6 2 3 21 1 1 1 9 2 0 1 3 0.32 1.69 21 L -3 -4 -5 -5 -4 -2 -5 -5 -1 5 3 -4 5 -1 -5 -1 -2 -4 -4 0 2 0 0 0 0 2 0 1 1 33 30 0 15 2 0 4 2 0 0 4 0.87 1.60 22 K -3 2 6 -2 -1 -1 -2 -3 -1 -3 -3 4 -4 -5 -4 -1 -2 -5 -4 -5 2 9 43 2 1 2 2 2 1 2 3 25 0 0 0 3 2 0 0 0 1.00 1.70 23 R -1 -1 2 3 -1 1 3 -2 0 -3 -2 -1 0 -3 -4 0 0 -1 -2 -3 5 3 11 18 1 6 20 3 2 2 3 3 3 1 0 8 5 1 1 2 0.38 1.79 24 S 1 2 -2 -1 3 -1 -2 1 0 -3 -1 2 1 -2 -4 1 -2 3 1 -3 12 12 1 3 6 3 3 11 2 2 6 11 3 1 0 11 2 4 4 1 0.25 1.79 25 F -4 -1 -5 -5 1 -5 -5 -5 -4 3 0 -5 2 7 -5 -2 -1 -3 2 -1 0 3 0 0 3 0 0 0 0 16 8 0 5 43 0 3 3 0 7 4 1.03 1.64 26 F 0 0 0 2 0 1 2 -2 1 -1 -1 0 0 0 -4 0 1 -4 1 -1 8 5 4 10 2 6 13 3 3 4 6 6 3 5 0 8 7 0 6 4 0.13 1.64 27 A -1 0 0 0 3 1 0 -1 2 0 -1 0 2 1 -5 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0 5 5 5 5 5 0.13 2.01 28 L -4 -5 -6 -2 0 -5 -5 -6 0 0 6 -5 1 -3 -5 -5 -4 -5 -4 -1 0 0 0 3 2 0 0 0 3 3 82 0 2 0 0 0 0 0 0 2 1.42 1.67 29 R -1 6 -2 -4 -1 2 -2 -2 0 -1 -4 3 -2 -3 -5 -1 -2 -1 -3 -2 4 40 1 0 1 7 2 4 3 4 1 21 1 1 0 3 2 1 1 3 0.78 1.67 30 D -1 1 1 4 -2 1 1 -2 -1 -3 -4 2 1 -3 -2 1 -1 -6 -3 -3 5 7 6 23 1 7 10 3 1 1 1 11 3 1 2 10 4 0 1 1 0.38 1.67 31 Q -1 -1 -3 -3 4 0 0 -4 1 1 3 -3 1 -3 -5 0 0 -1 -3 1 5 3 1 1 8 4 8 1 4 8 27 1 4 1 0 8 7 1 1 8 0.32 1.69 32 I -4 -5 -3 -5 -1 -3 -5 -6 -2 4 3 -5 1 -2 -1 -2 0 -5 -4 4 0 0 1 0 1 1 0 0 1 26 24 0 3 1 3 2 6 0 0 27 0.77 1.67 33 P -3 -4 -3 -3 -5 -2 -3 -3 0 -3 -2 -3 -2 -5 8 -2 -2 -6 -5 -2 2 0 1 1 0 1 1 2 3 1 5 1 1 0 71 3 2 0 0 3 1.81 1.63 34 E 1 -2 1 1 -1 1 1 1 2 -3 -3 -1 -2 -1 -1 2 1 -1 -2 -2 12 1 7 7 1 5 9 12 4 1 3 4 1 3 3 15 9 1 2 2 0.19 1.65 35 L -2 -3 -2 -2 3 -2 -2 -2 -2 1 4 -3 2 -1 -2 0 -1 -1 -2 1 2 1 2 2 7 2 2 3 1 7 37 1 4 3 2 7 4 1 2 11 0.41 1.63 36 E 1 1 1 0 -2 2 1 -1 0 -3 -3 0 -2 -3 1 1 0 -5 -2 -1 12 8 8 6 1 10 9 6 2 1 2 5 1 1 7 9 6 0 1 5 0.18 1.72 37 N -1 1 2 2 -3 0 0 0 2 -3 -4 1 -2 -2 1 2 -1 -1 -1 -4 5 8 11 11 1 4 6 8 4 2 2 8 1 2 8 13 4 1 2 1 0.23 1.76 38 N -1 0 0 0 2 0 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 -5 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0 5 5 0.02 2.12 39 E -1 2 0 1 1 1 1 -2 1 -2 -3 2 1 -1 1 0 0 -5 0 -2 4 9 4 9 3 5 9 4 3 3 3 11 3 3 8 7 6 0 3 3 0.15 2.08 40 K -1 0 1 0 -5 1 0 -1 2 0 -1 0 2 -4 0 0 0 -5 1 0 6 6 6 6 0 6 6 6 6 6 6 6 6 0 6 6 6 0 6 6 0.10 1.78 41 A 2 -1 -1 -1 1 3 -2 -2 0 -1 0 -1 2 0 1 -1 0 2 0 0 15 4 4 4 3 11 3 3 3 4 8 3 4 3 8 4 5 3 3 6 0.12 1.92 42 P -1 -2 2 1 0 -1 -1 -2 2 -2 -3 -1 -4 -5 0 5 1 -5 -4 -4 4 2 8 7 2 2 3 3 4 2 3 3 0 0 5 43 7 0 0 0 0.60 1.82 43 K -2 2 -1 -2 -5 0 -1 -5 0 -2 -3 7 -1 -5 -4 -3 0 1 -4 -3 2 8 3 2 0 3 3 0 2 2 2 63 2 0 0 0 5 2 0 2 1.14 1.76 44 V 2 -2 -2 -5 0 -2 -2 1 -2 0 1 -3 0 -2 -1 1 -2 1 -1 2 19 2 2 0 2 1 3 11 1 6 13 1 2 1 3 13 1 2 2 13 0.24 1.85 45 V 1 -2 0 1 -1 1 2 0 -1 -2 -3 -1 0 -3 -3 2 2 -5 -2 0 14 1 5 7 1 6 11 6 1 2 2 3 3 1 1 14 11 0 1 7 0.21 1.85 46 I -3 -3 -5 -3 -4 -5 -5 -6 0 6 1 -3 1 -1 -5 -4 2 -5 -4 3 1 1 0 1 0 0 0 0 2 46 10 2 4 2 0 0 13 0 0 16 0.96 1.78 47 L -3 -5 -6 -6 -4 -3 -6 -6 -6 1 6 -5 1 -1 -6 -5 -2 0 -4 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 6 74 0 3 1 0 0 2 1 0 6 1.27 1.75 48 K -1 2 2 1 -3 3 0 -1 -1 -3 -3 2 -1 -3 -5 1 2 -2 -3 -4 6 10 10 6 1 13 5 5 1 2 3 12 1 1 0 9 11 1 1 1 0.28 1.75 49 K -1 2 -1 0 -1 1 2 -2 0 -3 -1 4 1 -4 -5 -1 -2 -6 -3 -4 6 12 2 5 2 5 12 4 2 1 6 29 4 1 0 5 2 0 1 1 0.42 1.80 50 A 6 -4 -4 -2 -1 -4 -4 -1 -5 -3 -4 -3 -4 -5 -3 1 2 -6 -5 0 60 0 0 3 1 0 0 3 0 1 0 1 0 0 1 10 10 0 0 7 0.96 1.74 51 T 0 0 -2 -5 3 -1 -5 -4 -1 4 0 -2 -1 -2 -3 -2 1 -3 -1 3 9 5 2 0 6 2 0 1 2 27 7 2 1 1 1 3 9 0 2 17 0.43 1.77 52 A -1 0 2 4 -2 0 4 -3 -2 -4 -4 1 -3 -6 -5 -1 -1 -6 -4 -4 4 4 9 21 1 3 32 2 1 1 1 7 1 0 0 4 4 0 0 1 0.65 1.79 53 Y -4 -3 -5 -5 0 -3 -1 -4 4 -4 -3 -3 -3 2 -6 -4 -3 2 8 -4 0 1 0 0 2 1 4 1 8 0 2 1 0 7 0 1 1 3 63 1 1.68 1.81 54 I -4 -5 -6 -6 0 -5 -5 -5 -1 7 1 -5 1 -2 -6 -4 -3 -5 -4 2 1 1 0 0 2 0 1 1 2 63 13 0 2 1 0 1 1 0 0 9 1.27 1.77 55 L -2 3 0 -2 -1 3 0 -2 3 -3 -2 3 -1 -3 -1 -1 0 0 -2 -2 3 14 4 2 1 13 5 3 8 1 3 17 1 1 4 4 5 2 1 3 0.31 1.78 56 S -1 0 0 -1 -3 3 2 -1 3 -3 -2 0 -2 1 -5 1 0 -2 3 -2 6 4 3 4 1 11 13 4 6 1 4 5 1 5 0 9 5 0 11 3 0.20 1.79 57 V -3 -4 -4 -6 -1 -3 -5 -5 -4 -1 6 -4 3 -2 -5 -3 -3 -5 -3 -2 1 1 1 0 1 1 0 1 0 2 72 1 7 0 0 2 1 0 1 2 1.16 1.79 58 Q -3 1 -2 -2 -3 5 2 -4 1 -3 -3 2 -1 -4 -2 -2 0 -5 -2 -2 1 7 2 2 1 31 14 1 3 1 3 14 2 0 1 2 6 0 1 3 0.60 1.81 59 A 0 1 0 2 -5 3 2 -1 0 -4 -3 1 -2 -4 -2 0 0 -3 -3 -2 9 7 4 9 0 13 13 5 3 1 3 10 1 0 2 7 6 0 1 2 0.24 1.82 60 E -1 2 -1 1 0 3 3 -2 -1 -4 -2 2 0 -4 -3 -1 0 -5 -3 -2 5 12 2 8 2 11 17 3 1 1 4 12 3 1 1 3 6 0 1 3 0.29 1.82 61 E -2 -1 3 0 -1 0 3 -3 2 1 1 -1 -1 -3 -4 -2 -2 -5 -3 1 4 3 16 4 2 5 17 1 4 7 11 4 2 1 0 3 2 0 1 10 0.24 1.78 62 Q -1 2 0 1 -1 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