Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 E -3 -3 -1 6 -6 2 6 -4 -2 -5 -5 -2 -4 -6 -3 -2 -3 -6 -5 -5 0 0 0 42 0 6 52 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.35 0.87 2 S -1 -3 -2 -3 -3 -2 -3 -3 -3 -5 -5 -3 -4 -5 -3 7 1 -5 -4 -4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 94 6 0 0 0 1.52 1.09 3 C -3 -6 -5 -6 11 -6 -6 -5 -6 -4 -4 -6 -4 -5 -5 -3 -3 -5 -5 -3 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3.20 1.12 4 K 1 3 -2 -3 -5 2 1 -4 -2 -2 -3 5 0 -5 -4 -2 -2 -5 -3 1 13 15 1 0 0 8 10 0 0 2 2 34 2 0 0 2 1 0 1 11 0.57 1.12 5 G -2 -3 2 0 -5 -2 -3 6 -4 -6 -6 -3 -5 -6 -5 1 -3 -5 -3 -6 0 1 10 4 0 2 1 72 0 0 0 1 0 0 0 8 0 0 1 0 1.36 1.14 6 R -4 8 -3 -4 -6 -1 -3 -5 1 -5 -3 0 -4 -5 -5 -3 -3 -5 -4 -5 0 92 0 0 0 1 0 0 3 0 2 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1.91 1.15 7 C -3 -6 -5 -6 12 -6 -6 -5 -6 -4 -4 -6 -4 -5 -6 -3 -3 -5 -5 -3 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3.23 1.15 8 T -2 -2 2 0 -5 -3 0 4 1 -4 -2 -3 -3 4 -4 -1 0 -4 1 -4 2 2 10 6 0 1 6 32 4 1 3 1 0 18 0 3 6 0 5 0 0.53 1.12 9 E -1 -2 0 1 -5 0 7 -3 -1 -5 -5 -1 -4 -3 -3 -1 -2 -5 -2 -4 3 1 5 7 0 2 68 2 1 0 0 2 0 1 0 4 1 0 1 1 1.13 1.11 10 G 1 -2 0 -2 -4 -1 -2 3 -1 -3 -1 1 -3 -4 1 2 0 -5 -2 -2 12 2 4 2 0 2 2 22 1 1 8 11 0 0 8 17 6 0 1 2 0.30 1.14 11 F -3 -4 -5 -4 -5 -1 -3 -5 -1 -2 -1 -4 -1 7 -3 -3 -3 0 6 -1 1 0 0 1 0 3 2 0 1 2 4 1 1 54 2 1 1 1 23 3 1.30 1.15 12 N -1 1 5 5 -5 -1 1 -4 -1 -4 -5 -1 -3 -4 -3 1 -1 -6 -5 -1 5 8 27 28 0 2 8 0 1 1 0 4 1 1 1 8 2 0 0 4 0.70 1.18 13 V 2 5 -1 -4 -5 -1 0 -1 -1 -3 -4 1 -4 -5 -1 2 0 -5 -3 -3 16 30 2 0 0 2 5 5 2 2 1 9 0 0 3 16 5 0 1 2 0.50 1.18 14 D -2 -1 0 3 -5 2 1 3 3 -5 -4 -1 -1 -2 -4 1 1 -5 -3 -5 2 3 4 18 0 9 10 20 6 0 2 3 2 2 0 10 8 0 1 0 0.42 1.15 15 K 1 4 2 1 -5 0 -2 -2 4 -5 -3 2 -2 -1 2 -1 -2 -5 -2 -3 13 22 8 8 0 3 1 2 10 0 2 13 1 2 9 3 1 0 1 1 0.44 1.15 16 K 0 -2 0 -1 -5 0 2 0 -4 -3 -2 3 -2 -5 4 0 0 -5 -4 -3 8 1 4 2 0 4 11 6 0 1 3 23 1 0 20 8 6 0 0 2 0.46 1.15 17 C -3 -1 -5 -6 11 -5 -6 -5 -5 -4 -4 -5 -4 -5 -5 -3 -3 -5 -5 -3 0 5 0 0 95 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.87 1.01 18 Q -3 2 0 2 -5 6 0 -3 7 -5 -4 -1 -3 -3 -4 -1 -2 -5 -2 -5 0 13 3 10 0 37 3 1 25 0 1 1 0 1 0 4 1 0 1 0 0.98 1.01 19 C -3 -6 -5 -6 11 -5 -6 -5 -6 -4 -4 -6 -4 -5 -5 -3 -3 -5 -5 -3 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3.09 1.01 20 D -4 -3 4 7 -6 -2 -1 -3 1 -5 -6 -3 -5 -6 -4 -2 -3 -6 -5 -5 0 0 23 71 0 0 0 0 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.63 1.00 21 E 1 1 2 1 -4 -2 1 -2 0 -2 -2 -2 -3 -2 2 3 0 -5 -1 -2 14 7 10 6 0 0 9 2 3 2 3 1 0 1 9 24 4 0 2 2 0.28 1.01 22 L -1 1 1 2 -4 2 0 -2 1 -2 2 1 2 -4 -4 -1 -2 -5 -2 -3 6 9 6 11 0 9 7 3 3 1 26 8 5 0 0 3 2 0 1 1 0.25 1.01 23 C -3 -6 -5 -6 11 -5 -6 -5 -5 -4 -4 -6 -4 -4 -5 -3 -3 -4 -1 -3 0 0 0 0 97 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 2.97 1.01 24 S -1 0 -1 -1 -4 1 1 -4 -1 -1 -2 3 0 -2 3 1 0 -2 -4 1 3 3 2 2 0 7 8 1 2 3 4 17 2 2 14 12 5 1 0 12 0.26 1.01 25 Y -2 1 -1 -1 -5 3 2 -3 1 -2 -2 2 0 -2 -3 0 1 0 4 -2 2 7 2 4 0 12 12 2 3 2 3 11 2 1 1 8 9 1 17 2 0.32 1.01 26 Y -3 -1 -3 -5 -5 -3 -2 -5 4 -3 -1 -3 -3 5 -5 -3 -3 -1 8 -3 1 4 1 0 0 0 2 0 9 0 5 1 0 20 0 1 1 0 54 1 1.34 1.01 27 Q -2 -1 4 -1 -5 3 -2 5 1 -6 -5 1 -2 -5 -4 -1 -3 -1 -2 -5 1 3 21 2 0 14 1 39 4 0 1 7 1 0 0 3 1 1 1 0 0.76 1.01 28 S -2 -3 4 4 -5 1 -1 -3 -3 -5 -5 1 -3 -5 -4 3 0 -6 -2 -5 1 0 22 26 0 5 2 1 0 0 0 9 1 0 0 29 3 0 1 0 0.78 1.01 29 C -3 -6 -5 -6 11 -5 -6 -5 -6 -4 -4 -6 -4 -5 -5 -3 -3 -5 -5 -3 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3.09 1.01 30 C -3 -6 -5 -6 11 -5 -6 -5 -6 -4 -4 -6 -4 -5 -5 -3 -3 -5 -5 -3 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3.09 1.01 31 T 0 -2 0 0 -4 0 2 -3 1 -1 -2 -2 -2 -1 3 3 -1 1 -1 -2 6 1 3 6 0 3 15 1 3 3 3 1 1 2 17 26 2 2 2 2 0.38 1.01 32 D -4 -4 1 8 -6 -3 -1 -4 -3 -6 -6 -3 -6 -6 -4 -2 -3 -7 -6 -6 0 0 5 95 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.05 1.01 33 Y -4 -4 -5 -6 -5 -4 -5 -6 2 -2 -3 -3 -1 5 -6 -4 -4 0 8 -3 0 0 0 0 0 0 0 0 4 2 0 1 2 27 0 0 0 0 64 0 1.78 1.01 34 T -1 -2 2 2 -5 2 4 -2 2 -2 -3 0 1 -3 -1 0 -2 -2 -1 -1 5 1 9 11 0 7 26 2 5 2 2 6 4 1 2 6 1 0 2 4 0.34 1.01 35 A 1 0 -1 2 -4 1 2 -3 1 -3 -3 -1 -2 -2 -2 2 2 -5 -3 -3 12 4 3 11 0 7 16 1 4 1 2 3 1 2 1 16 14 0 1 1 0.32 1.01 36 E -1 -4 -3 -4 -4 -1 0 -5 5 1 3 -3 0 2 -5 -3 0 -2 -1 1 4 0 1 0 0 3 8 0 14 9 32 1 1 10 0 1 6 1 2 9 0.45 1.01 37 C -3 -6 -5 -6 11 -5 -6 -5 -6 -4 -4 -6 -4 -5 -5 -3 -3 -5 -5 -3 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3.09 1.01 K Lambda Standard Ungapped 0.1345 0.3226 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1853 0.3170 PSI Gapped 0.0567 0.2670