Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 M -3 -4 -5 -6 -4 -3 -5 -5 -4 2 2 -4 9 -2 -5 -4 -3 -4 -3 -1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9 13 0 78 0 0 0 0 0 0 0 1.75 0.99 2 Q -3 1 -2 -3 -5 6 0 -1 2 -4 -3 2 5 -5 -4 -1 -1 -5 -4 -4 1 7 1 0 0 41 4 5 6 0 2 11 16 0 0 3 2 0 0 0 0.92 1.31 3 K -3 5 3 -3 -6 3 -2 -4 -1 -5 -4 5 -4 -6 -3 -3 -2 -6 -5 -4 1 27 14 0 0 15 1 1 1 0 2 34 0 0 1 0 1 0 0 1 1.01 1.45 4 E -3 -2 -2 0 -6 2 7 -5 -2 -6 -6 -2 -5 -6 -4 -2 -3 -6 -5 -5 1 1 1 4 0 8 83 0 0 0 0 0 0 0 0 2 1 0 0 0 1.76 1.54 5 Q -2 2 1 -3 -2 4 -1 -5 0 -5 -1 3 -2 -4 -3 2 0 3 -2 -3 2 11 6 1 1 23 2 0 2 0 6 17 1 0 1 16 6 4 1 1 0.54 1.58 6 L -4 -5 -6 -7 -4 -5 -4 -7 -6 4 5 -6 1 -2 -6 -5 -2 0 -4 2 0 0 0 0 0 0 1 0 0 19 62 0 3 1 0 0 1 1 0 12 1.21 1.59 7 S -2 -4 -2 -3 -4 -3 -3 -3 -4 -5 -6 -3 -5 -2 -4 7 -2 -6 -5 -5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 98 0 0 0 0 1.89 1.62 8 A 6 -3 -4 -3 -4 -1 -1 -3 -5 -3 -4 -4 -3 -5 -4 0 -2 -6 -5 -2 84 1 0 1 0 2 3 0 0 1 0 0 0 0 0 4 1 0 0 2 1.44 1.62 9 L -2 -5 -6 -7 -1 -5 -6 -4 -5 -1 5 -6 2 3 -6 -4 -4 4 1 -1 4 0 0 0 1 0 0 2 0 2 61 0 4 11 0 1 0 6 5 4 1.09 1.71 10 M 1 -4 -6 -6 -1 -3 -5 -6 -5 2 1 -3 8 1 -6 -4 -3 -2 -3 3 13 0 0 0 1 1 0 0 0 10 12 1 36 5 0 1 1 0 1 19 1.03 1.74 11 D -5 -5 -2 8 -7 -4 -2 -5 -4 -6 -7 -4 -6 -7 -5 -3 -2 -8 -6 -6 0 0 0 97 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 0 0 2.49 1.75 12 G -2 -5 3 0 -2 -4 -3 6 -5 -7 -7 -4 -6 -6 -5 0 -4 -6 -6 -6 2 0 15 5 1 0 1 70 0 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 0 1.58 1.74 13 E -3 -2 -2 0 -3 2 7 -4 0 -6 -6 -2 -5 -6 -4 -3 -4 -6 -5 -4 1 1 1 4 1 8 80 1 2 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 1.70 1.72 14 T 2 -3 -3 -2 -2 -1 -1 -2 0 0 4 -3 0 -1 -3 -1 1 -3 -3 -1 18 1 1 2 1 3 5 3 2 5 35 1 2 2 1 4 8 0 0 4 0.34 1.67 15 L -1 -3 -2 4 -3 1 -1 -2 -1 0 1 -3 -1 -1 -1 2 -1 -5 -4 1 5 1 2 21 1 6 4 3 1 4 13 1 1 3 4 15 4 0 0 11 0.27 1.67 16 D -1 -2 0 6 -5 -1 3 0 -4 -6 -5 -2 -3 -6 0 0 -1 -6 -4 -5 5 2 3 40 0 1 18 8 0 0 1 1 1 0 4 7 3 0 1 0 0.80 1.69 17 S 1 -2 1 3 -5 2 2 -2 1 -3 0 -1 -2 0 -1 0 -1 -5 -3 -3 14 2 6 14 0 8 11 4 3 1 12 4 1 4 3 7 3 0 0 1 0.19 1.71 18 E 1 -1 -2 0 -5 2 6 -3 3 -3 -4 -2 -3 -5 -4 0 -3 -5 -3 -3 14 2 1 4 0 9 47 1 6 2 1 1 1 0 0 5 1 0 1 1 0.84 1.70 19 L -1 -4 -6 -4 -2 -3 -3 -6 -5 1 4 -5 0 3 -6 -4 -1 -1 -3 2 4 1 0 1 1 1 2 0 0 8 45 0 2 12 0 1 4 1 0 13 0.72 1.86 20 L -1 1 -4 -2 -3 -3 -2 -3 -3 3 4 -4 2 0 -1 -3 -1 -2 -2 0 5 8 1 2 1 1 2 3 1 15 35 1 4 3 3 2 3 0 1 6 0.40 1.86 21 N 1 3 1 3 -5 1 0 -1 0 -3 -3 1 -2 -4 -2 0 -1 -6 -5 -3 14 14 7 19 0 5 6 4 2 1 2 7 1 1 2 8 3 0 0 1 0.34 1.86 22 E 3 1 -1 -1 -2 0 3 -1 -2 -2 -1 -2 -1 -3 -5 1 0 -1 -5 0 23 7 2 4 1 4 20 4 1 2 6 2 1 1 0 9 6 1 0 6 0.29 1.86 23 L -1 -5 -6 -4 0 -3 -4 -5 -5 1 5 -3 2 0 -4 -4 -3 -5 -4 1 4 0 0 1 2 1 1 1 0 7 61 2 5 4 1 1 1 0 0 7 0.92 1.84 24 A 2 0 -3 1 2 0 1 -1 -1 -2 0 1 -2 -5 -3 2 -1 -6 -3 -2 18 6 1 7 4 4 10 4 1 3 9 8 1 0 1 15 3 0 1 3 0.20 1.83 25 H 1 2 1 0 -1 2 1 -2 3 -3 -3 1 0 -4 -4 1 -1 -5 -3 -2 13 9 6 6 1 10 9 3 8 2 2 10 2 1 0 12 3 0 1 2 0.29 1.82 26 N -2 -3 1 7 -5 0 0 -2 0 -5 -6 -2 -3 -6 -4 1 0 -6 -5 -4 2 1 6 55 0 4 5 3 2 0 0 1 1 0 0 10 6 0 0 1 1.14 1.81 27 P 2 -1 -1 2 -5 1 2 -1 -1 -4 -4 0 -5 -6 4 0 0 -6 -5 -2 14 3 3 10 0 7 14 4 1 1 1 6 0 0 21 6 5 0 0 4 0.47 1.86 28 E 1 -2 -2 3 -6 1 5 -2 1 -4 -4 -1 -5 -5 -3 1 -2 -6 -1 -3 10 1 1 14 0 5 42 3 3 1 2 2 0 0 1 8 2 0 2 2 0.74 1.85 29 M 1 -3 -3 1 0 -1 -1 2 -2 -2 4 -3 1 -4 -4 0 -2 -2 -3 0 11 2 1 8 2 3 3 13 1 1 34 1 4 0 1 7 2 1 1 5 0.35 1.84 30 Q 1 3 -1 -1 1 3 0 -2 2 -1 -1 0 1 -1 -4 -1 -1 -5 0 -2 12 17 3 3 3 13 5 3 4 3 7 5 3 3 0 4 3 0 3 3 0.25 1.75 31 K 2 0 0 2 -5 3 1 -1 1 -1 -2 0 1 -5 -1 0 -1 -6 -5 -2 19 4 3 10 0 13 9 5 3 3 4 5 3 0 3 6 4 0 0 3 0.25 1.83 32 T 1 1 -1 0 3 2 1 -3 1 -4 -3 1 -4 -5 -4 1 3 -5 -2 -2 12 8 2 6 6 8 9 1 3 1 3 10 0 0 0 10 19 0 1 3 0.34 1.44 33 W -4 -5 -4 -6 -2 -2 -5 -5 -1 -4 -1 -5 0 2 -6 -5 -5 12 1 -4 1 0 1 0 1 2 0 0 2 0 6 0 2 7 0 0 0 74 2 1 2.88 1.34 34 E 2 1 -2 -1 0 2 2 1 2 -4 -2 0 -1 -3 -4 1 -2 -5 0 -4 18 8 1 3 2 11 14 9 4 1 3 5 1 1 0 13 1 0 4 0 0.30 1.32 35 S -1 6 1 1 -3 -1 -1 -3 -1 -3 -2 -1 -2 -5 -3 1 -1 -5 -3 -3 6 51 6 7 1 1 4 1 1 1 4 0 1 0 1 10 3 0 1 1 0.81 1.32 36 Y -4 -4 -5 -6 -1 -1 -4 -5 0 -2 -1 -4 0 2 -5 -4 -4 7 8 -4 0 0 0 0 1 3 0 0 2 2 4 0 2 5 0 0 0 13 65 0 1.80 1.32 37 H -1 -2 -1 -3 0 5 -1 -3 9 -5 -4 -3 -1 -3 -4 -1 -3 -1 -1 -3 5 1 2 0 3 27 1 1 47 0 1 0 2 1 0 4 1 1 1 1 1.36 1.32 38 L -1 0 -5 -4 -4 1 -3 -6 -2 0 5 -3 2 -2 -5 -3 -1 0 -4 1 5 6 0 1 0 7 1 0 1 3 54 1 5 1 0 1 4 1 0 10 0.70 1.36 39 I 2 -4 -3 -5 1 -5 -5 -3 -5 6 0 -5 1 -3 -5 -3 0 -5 -1 1 16 1 2 0 3 0 0 1 0 51 6 0 3 0 0 1 5 0 3 7 0.86 1.36 40 R -2 5 -3 -4 -5 0 -3 5 -1 -6 -6 -1 -5 -6 -5 1 -4 -5 -5 -5 2 34 0 0 0 4 0 46 2 0 0 2 0 0 0 11 0 0 0 0 1.17 1.36 41 D 1 -4 -1 7 -5 1 0 -2 0 -6 -6 -3 -5 -3 -4 1 -1 -6 -5 -5 12 0 1 61 0 5 4 2 2 0 0 0 0 1 0 9 2 0 0 0 1.21 1.36 42 S 4 -5 -5 -5 1 -2 -3 -1 -2 0 1 -4 -1 -4 -4 -1 0 -1 -4 4 32 0 0 0 2 1 1 4 1 3 10 0 1 0 0 4 5 1 0 33 0.62 1.36 43 M -2 -5 -5 -6 1 -4 -5 -6 -5 2 4 -5 7 -2 -5 -4 -3 -4 -4 0 3 0 0 0 3 0 0 0 0 10 45 0 35 0 0 0 0 0 0 3 1.23 1.27 44 R -3 7 0 0 -2 1 -1 -5 4 -5 -4 1 -4 -5 -4 -2 -4 -5 -4 -5 2 61 3 4 1 6 1 0 10 0 1 8 0 0 0 1 0 0 0 0 1.26 1.27 45 G -1 1 1 0 -2 0 -2 5 0 -6 -5 0 -5 -5 -1 1 -2 -5 -2 -5 5 8 6 5 1 3 2 44 2 0 0 5 0 0 3 11 2 0 1 0 0.69 1.27 46 D -2 0 0 4 -5 2 5 0 -1 -5 -5 0 -4 -5 -3 -2 -2 -5 -1 -3 2 4 3 22 0 8 36 8 1 0 0 6 0 0 1 2 2 0 2 2 0.71 1.27 47 T 2 -1 -3 0 -2 0 0 -1 2 0 1 -1 2 -2 -1 0 0 -1 -2 0 15 3 1 4 1 5 7 4 5 5 16 3 5 1 4 6 7 1 1 7 0.12 1.32 48 P 1 -1 0 0 0 1 -1 1 -2 -1 -1 -2 -2 -2 4 2 -1 -4 -1 -1 9 3 5 5 2 7 3 10 1 5 6 2 1 2 19 13 2 0 2 4 0.25 1.34 49 E 1 1 -1 0 -1 1 1 0 -1 0 -2 -1 0 -3 0 0 0 -2 -2 1 13 9 2 5 1 7 9 7 1 5 4 2 3 1 5 7 5 1 2 11 0.10 1.37 50 V 1 0 -1 -1 -1 0 -3 0 2 0 0 -1 0 1 1 0 0 1 -1 1 13 4 3 4 1 4 1 6 4 6 8 4 2 6 8 6 5 2 2 11 0.08 1.49 51 L 2 -1 -3 -3 -2 -3 -2 -3 -1 1 2 -1 1 -1 2 0 -2 -5 -3 1 19 3 1 2 1 1 2 1 2 7 23 4 3 3 12 6 2 0 1 9 0.28 1.51 52 H -2 0 1 2 -1 1 0 2 3 -5 -5 -2 -3 -4 3 3 -1 -5 -2 -4 2 4 5 10 1 7 5 13 7 1 1 2 0 1 13 22 3 0 1 1 0.43 1.52 53 F 2 0 -3 -2 -2 -2 -2 -3 -2 2 1 -3 0 1 1 0 -1 4 -2 1 18 5 1 2 1 1 2 1 1 10 15 1 3 7 7 6 4 5 1 8 0.24 1.54 54 D -2 -2 1 7 -1 -2 -1 1 -2 -6 -6 -3 -4 -6 -4 -1 -3 -6 -6 -5 4 2 6 66 1 1 2 9 1 0 0 0 1 0 1 4 1 0 0 1 1.39 1.56 55 I -4 -6 -6 -6 -5 -6 -6 -6 -5 4 2 -6 -1 6 -6 -4 -3 -3 -1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 28 18 0 1 40 0 1 1 0 1 9 1.20 1.54 56 S 3 -2 -1 -3 1 -2 -4 -3 -3 -4 -1 -3 1 -4 -4 4 2 -5 -3 0 28 2 2 1 3 2 0 1 1 0 5 1 4 0 0 30 13 0 1 5 0.60 1.57 57 S 4 -2 -2 3 -4 1 1 -1 -2 -5 -3 -1 -3 -6 -2 2 -2 -6 -5 -2 33 2 1 19 0 6 7 5 1 0 2 2 0 0 1 16 2 0 0 2 0.57 1.56 58 R 0 6 0 -3 -3 0 -3 2 -3 -5 -4 2 -4 -4 -5 1 -3 -6 -5 -4 8 44 4 1 0 4 0 13 0 0 1 11 0 1 0 10 1 0 0 1 0.85 1.58 59 V -2 -6 -6 -6 -4 -5 -6 -6 -6 4 1 -5 3 1 -6 -5 -3 -5 -4 6 2 0 0 0 0 0 0 0 0 21 10 0 7 5 0 0 0 0 0 55 1.22 1.54 60 M 3 3 -2 -4 -4 0 -1 -3 -1 -3 -3 -3 6 -3 -4 2 -2 -1 -4 -4 30 15 2 0 0 3 3 1 2 1 1 0 23 1 0 18 1 1 0 0 0.75 1.54 61 A 5 0 -2 0 -2 2 0 -3 -3 -4 -1 -1 -1 -4 -4 1 -2 -6 -5 -3 48 4 1 5 1 8 7 1 0 0 8 3 2 0 0 9 1 0 0 1 0.62 1.54 62 A 5 3 -3 -4 -4 1 0 -2 -3 -4 -1 -1 -1 -5 -4 -1 -2 -6 -5 -2 51 18 0 0 0 7 5 2 0 0 7 2 1 0 0 4 1 0 0 1 0.77 1.52 63 I -4 -5 -6 -7 -4 -5 -6 -7 -6 5 5 -6 0 -1 -6 -5 -4 -5 -4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30 63 0 1 2 0 0 0 0 0 5 1.34 1.49 64 E 3 -2 -3 4 -5 0 5 -4 -1 -4 -5 -1 -2 -6 -4 -1 -3 -6 -4 -3 27 1 0 20 0 3 37 0 2 0 0 3 1 0 0 2 1 0 0 1 0.88 1.48 65 E 3 0 3 3 -5 2 2 -3 0 -5 -3 0 -3 -6 -4 1 -2 -6 -5 -3 22 4 12 19 0 8 12 1 2 0 2 5 0 0 0 9 1 0 0 2 0.50 1.47 66 E -4 -3 -3 0 -7 1 7 -5 -3 -6 -6 -2 -5 -6 -4 -3 -4 -6 -5 -5 0 0 0 3 0 3 94 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.99 1.41 K Lambda Standard Ungapped 0.1268 0.3117 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1825 0.3184 PSI Gapped 0.0559 0.2670