Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 P -4 -6 -6 -5 -7 -5 -5 -6 -6 -7 -7 -5 -6 -7 9 -4 -5 -8 -7 -6 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 3.20 1.89 2 C -4 -7 -5 -6 12 -6 -8 -6 -5 -2 -4 -7 -4 -4 -6 -4 -4 -6 -5 -4 0 0 0 0 93 0 0 0 0 2 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 3.47 2.14 3 P -2 -5 -4 -3 -6 -3 -4 -5 -3 -5 -4 -4 -5 -4 9 -2 -4 -6 -6 -5 2 0 1 1 0 1 1 1 1 1 2 0 0 1 85 3 0 0 0 0 2.48 2.15 4 G 1 0 -1 -1 -4 1 0 0 0 -5 -4 0 -3 -2 2 3 1 -1 -3 -3 12 6 2 4 0 6 7 7 2 1 2 5 1 2 9 24 7 1 1 2 0.31 2.17 5 A 0 2 2 -2 -4 2 0 2 0 -3 -1 -1 -1 -4 1 0 -2 -5 -4 0 7 11 8 2 0 10 6 13 2 2 5 3 1 1 7 8 2 0 1 8 0.20 2.16 6 C -3 -7 -6 -6 12 -6 -7 -5 -6 -2 -3 -6 -4 -5 -5 -4 -4 -4 -5 -3 1 0 0 0 88 0 0 1 0 2 2 0 0 0 1 1 0 0 0 2 3.21 2.16 7 V -1 1 -1 0 -4 1 -2 -4 1 1 -1 -2 -2 -1 -4 3 3 -2 -2 0 4 7 3 6 0 5 3 1 4 7 6 3 1 3 0 23 16 1 1 7 0.30 2.17 8 C -3 -5 -3 -6 11 -3 -5 -4 -4 -4 -3 -5 -4 -5 -4 -2 -3 -4 -5 -3 2 1 1 0 81 1 1 1 1 1 2 1 0 0 1 3 1 0 0 1 2.85 2.17 9 Y -1 -1 1 0 -2 1 0 -3 1 -3 -1 -2 -3 0 0 3 0 2 3 -2 4 4 6 6 1 6 5 2 3 2 7 2 1 4 4 21 6 3 8 3 0.22 2.04 10 N -2 -1 4 1 -2 -1 -1 2 1 -2 -1 -1 -2 -2 0 2 -1 1 -2 -1 3 3 16 7 1 3 3 14 4 3 7 3 1 2 4 13 4 2 1 4 0.22 2.07 11 E -1 1 2 2 -3 1 2 0 1 -4 -2 0 -3 -3 -1 2 -1 0 -3 -3 5 7 9 12 1 6 14 7 3 1 5 5 1 1 3 13 4 1 1 2 0.24 1.94 12 P -1 0 2 0 -3 0 0 1 0 -2 -1 -1 -2 -1 2 2 0 -2 -2 -2 5 6 8 6 1 5 5 10 2 2 7 4 1 3 10 15 7 1 2 2 0.15 1.88 13 K -1 1 0 -2 -3 1 -1 0 0 -1 1 2 -1 -2 0 1 -1 1 -2 0 5 6 5 2 0 5 5 7 2 4 14 11 2 2 6 9 3 2 2 8 0.08 1.86 14 V -2 0 -1 -3 -2 0 -1 -3 -1 1 2 0 0 0 -3 -1 4 1 -2 1 3 5 4 1 1 4 3 2 2 6 16 5 2 4 1 4 22 2 2 11 0.25 1.95 15 T -1 -1 -1 -2 -1 -2 1 -3 1 0 -1 -2 -2 -1 -5 2 4 -2 -1 1 5 3 3 2 1 2 8 2 3 5 6 2 1 3 0 15 24 1 2 11 0.31 2.12 16 T -1 -5 -5 -5 0 -5 -6 -5 -5 2 3 -5 0 -2 -5 -4 -1 -4 -2 5 5 0 0 0 2 0 0 1 0 10 30 0 2 2 0 1 4 0 1 40 0.90 2.19 17 S -4 -2 4 5 -4 -1 -1 -4 2 -4 -2 -2 -4 -2 -4 1 -1 -3 1 -3 1 3 18 34 0 3 4 1 5 1 4 2 0 2 1 11 3 0 5 2 0.74 2.18 18 C -3 -5 -4 -6 10 -5 -6 -5 -5 0 3 -6 -1 -2 -6 -4 -4 -4 -4 -2 1 0 1 0 57 0 0 1 0 4 27 0 1 1 0 1 1 0 0 3 2.04 2.19 19 P -1 0 2 0 -3 1 -1 -1 1 -3 -4 -2 -1 -4 -1 5 1 -3 -2 -3 4 4 8 5 0 6 4 4 4 1 1 2 1 1 3 39 7 0 2 2 0.51 2.19 20 Q -2 0 4 1 -3 -1 0 2 2 -4 -3 -1 -3 1 -5 2 -3 2 0 -5 3 6 19 8 1 3 6 14 5 1 3 3 1 5 0 15 1 3 4 1 0.39 2.19 21 Q -2 3 5 -3 -1 1 -2 -2 -1 -3 0 2 -1 -4 -3 -1 -1 -4 -4 -3 4 16 29 0 1 6 2 2 1 1 10 13 1 1 1 4 3 0 1 2 0.60 2.19 22 G -2 1 4 0 -4 1 -1 4 1 -5 -3 1 -2 -2 -4 1 -3 -4 -2 -5 3 9 16 4 0 6 3 27 3 1 3 8 1 2 1 11 1 0 1 0 0.51 2.19 23 L -4 -5 -5 -6 -4 -5 -5 -5 -3 2 6 -4 1 2 -4 -4 -4 -2 -3 -1 1 1 1 0 0 0 1 1 1 8 70 1 2 8 1 1 1 0 1 2 1.23 2.17 24 Q 0 1 -1 -1 -4 1 0 -2 1 -1 -2 0 -3 -4 -1 2 4 -4 -3 -3 6 7 3 3 0 5 5 3 3 4 4 7 1 1 3 14 28 0 1 2 0.38 2.16 25 A 1 -1 0 -1 -1 0 2 -1 0 -3 -4 -1 -3 -2 -1 4 2 -4 -2 -2 12 4 4 3 2 4 13 4 2 1 1 4 1 2 3 26 10 0 2 3 0.34 2.19 26 V -3 -5 -5 -5 -3 -5 -5 -6 -5 6 2 -5 0 0 -3 -4 -3 -4 -3 4 1 0 1 1 0 0 1 1 0 39 17 0 2 4 2 1 1 0 1 29 1.05 2.19 27 P -3 -5 -3 -4 -4 -3 -3 -4 -3 -4 -5 -3 -4 -5 9 -1 -3 -4 -5 -5 1 0 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 0 1 81 4 1 0 0 1 2.30 2.17 28 V 1 0 -2 0 -3 0 1 -2 -1 0 -1 0 -1 -2 2 2 0 -3 -3 -1 12 5 2 6 1 5 7 3 1 7 6 5 1 2 9 15 6 0 1 5 0.13 2.17 29 G -1 -2 3 2 0 -1 1 4 0 -4 -3 -2 -3 -3 -2 1 -1 0 -3 -4 5 2 14 10 2 2 9 27 2 1 3 2 1 2 2 12 3 1 1 1 0.46 2.12 30 I -3 -4 -1 -4 -2 -3 -4 -5 -4 6 4 -4 0 1 -4 -2 -3 -1 -3 0 2 1 4 1 1 1 1 1 0 37 30 1 2 6 1 3 2 1 1 6 0.82 2.16 31 P -3 -4 -2 -2 0 -3 -3 0 -3 -4 2 -4 -2 1 6 2 -2 -2 -3 -4 2 1 2 2 2 1 2 8 1 1 18 1 1 5 37 13 2 1 1 1 0.79 2.16 32 A 1 1 2 -2 -3 0 -1 -3 -1 -3 -3 1 -2 -4 3 2 2 -3 -3 -1 10 6 9 2 1 4 4 2 2 1 3 7 1 1 14 15 13 0 1 4 0.30 2.16 33 A -2 -1 4 2 -2 -1 -1 -1 1 -3 0 -1 -2 -2 -4 3 0 -3 -2 -4 4 3 21 12 1 3 4 5 3 1 9 4 1 2 1 18 6 0 2 1 0.37 2.16 34 S -1 -3 -4 -5 -3 -4 -4 -5 -4 1 5 -4 -1 -3 -4 -2 4 -3 -4 1 4 1 1 0 1 0 1 1 0 6 45 1 1 1 1 3 24 0 0 8 0.82 2.17 35 Q -2 2 -1 -2 -4 4 2 -4 -1 -2 -3 2 -2 -4 -3 -1 2 -2 -3 -1 3 12 2 2 0 20 15 1 2 2 3 11 1 1 1 4 14 1 1 5 0.48 2.15 36 R -2 2 0 -2 -3 0 1 -3 2 0 0 1 0 -1 -5 0 1 1 2 1 3 9 4 2 1 3 9 2 4 6 8 7 2 3 0 8 10 2 7 10 0.17 2.14 37 I -4 -4 -5 -5 -3 -4 -5 -6 -4 2 6 -5 0 -1 -5 -5 -4 -3 -3 0 1 1 1 1 0 1 1 1 0 8 75 1 2 2 1 1 1 0 1 4 1.34 2.14 38 F -3 0 2 5 -3 -1 -1 -4 1 -1 -2 -2 -2 0 -4 0 -2 1 3 -2 2 5 10 29 1 2 4 1 4 4 5 2 1 4 1 8 3 2 10 3 0.48 2.14 39 L -4 -4 -6 -6 -2 -4 -5 -5 -6 1 6 -6 2 0 -5 -5 -4 -2 -3 0 1 1 0 0 1 1 1 1 0 5 74 0 4 3 1 1 1 1 1 4 1.32 2.13 40 H -1 0 1 0 -3 2 -1 0 2 -4 -4 -1 -2 -2 -3 4 0 -1 0 -4 5 5 6 6 1 10 4 7 4 1 1 3 1 2 1 32 5 1 3 1 0.41 2.18 41 G -2 0 4 1 -2 0 -1 2 4 -4 -4 -1 -2 0 -4 1 -3 -1 2 -4 3 6 19 8 1 3 4 14 8 1 2 4 1 4 1 9 2 1 8 1 0.39 2.17 42 N -4 -3 8 -2 0 -3 -3 -3 -2 -4 -5 -3 -3 -4 -4 -1 -1 -2 -4 -5 1 1 77 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3 3 1 1 1 1.86 2.17 43 R -2 2 3 -1 -2 3 -1 -1 2 -4 -2 2 -1 -1 -2 1 -2 -1 -1 -3 3 11 14 3 1 14 4 4 5 1 5 11 2 3 2 10 2 1 3 2 0.32 2.16 44 I -4 -4 -4 -5 -2 -4 -6 -5 -2 5 4 -4 0 3 -4 -4 -3 -1 -2 -1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 35 36 1 2 11 1 1 1 1 1 3 0.97 2.15 45 S -1 0 0 -2 -2 1 0 -1 1 -3 -3 0 -2 -2 -2 3 3 -1 -1 -2 4 5 4 2 1 5 6 6 3 2 2 6 1 2 2 23 20 1 2 4 0.32 2.15 46 H -1 -1 -1 0 -1 -1 0 4 1 -2 -3 0 -1 -1 -3 1 0 0 -1 -2 4 4 3 5 1 3 7 31 3 3 2 5 2 3 1 9 7 1 2 4 0.33 2.16 47 V -3 -2 -2 -3 1 -1 -1 -3 -1 3 3 -2 0 0 -1 -1 -1 0 -2 1 2 2 2 2 2 2 5 2 2 17 28 3 2 3 3 5 4 1 2 9 0.33 2.16 48 P -2 -1 -1 -1 1 -1 -1 -2 0 4 0 -2 0 0 4 0 -1 0 -1 -1 2 3 3 4 2 3 4 3 3 21 9 3 2 3 17 6 4 1 2 4 0.30 2.15 49 A -1 0 0 0 1 0 0 -2 1 -2 -3 -1 0 -1 5 0 -1 2 0 -2 6 4 4 5 3 3 5 4 3 3 3 4 3 3 27 6 4 3 3 3 0.38 2.18 50 A -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 51 S 2 -3 -1 0 0 -1 0 -2 -1 0 0 -3 -1 0 -2 2 0 3 -2 0 14 1 3 6 2 3 7 3 2 6 8 1 2 4 3 17 7 4 1 7 0.15 2.16 52 F -4 -4 -3 -4 -1 -3 -4 -3 -2 2 2 -4 0 7 -3 -4 -2 2 0 -1 1 1 1 1 1 1 1 3 1 12 21 1 2 38 2 2 2 2 2 3 0.88 2.11 53 R 0 0 0 0 0 1 -1 3 2 -2 -3 0 -1 -2 -2 1 -1 1 -1 -2 8 6 4 6 2 6 4 18 5 3 3 6 2 2 2 11 4 2 2 3 0.14 2.11 54 A -2 0 5 -1 -1 0 -1 2 2 -3 -3 1 -1 -1 -2 1 0 -1 -1 -3 3 6 22 3 1 4 4 13 5 2 3 7 1 3 3 9 5 1 2 2 0.31 2.06 55 C -2 -2 -2 -3 3 -2 -3 -3 -1 0 5 -3 2 0 -2 -2 -2 0 1 -1 4 3 2 1 6 2 2 2 1 4 48 1 4 4 2 3 2 1 4 3 0.61 2.04 56 R -1 1 -1 -2 1 0 -1 -2 0 -2 -2 1 -1 -2 3 2 3 0 -2 -2 4 6 3 2 2 4 3 4 2 2 4 9 1 2 15 13 15 1 2 3 0.24 2.04 57 N -1 0 4 -1 -1 1 1 -1 2 -3 -2 1 0 -2 -2 1 0 1 -1 -3 5 6 19 3 2 6 8 4 4 2 4 8 3 2 2 10 6 2 3 2 0.23 2.04 58 L -3 -2 -5 -3 0 -5 -5 -3 0 0 6 -2 1 -1 -2 -3 -2 -5 -4 -1 2 2 0 2 2 0 0 2 2 4 62 2 3 2 2 2 2 0 0 4 0.87 2.05 59 T -2 1 -1 -2 -1 2 2 -2 1 -1 -1 1 -1 -2 -2 -1 2 1 -1 0 4 8 2 3 2 10 13 3 3 3 7 9 2 2 2 4 12 2 2 6 0.16 2.06 60 I -1 -1 -1 -2 -1 -1 1 -3 3 1 -1 0 0 1 -3 -1 0 2 3 1 5 3 3 3 1 3 9 2 7 9 6 6 2 7 1 5 7 3 8 9 0.14 1.96 61 L -3 -5 -3 -6 -1 -5 -6 -6 -6 1 6 -6 1 0 -3 -3 -2 0 -1 -1 2 0 2 0 2 0 0 0 0 7 67 0 3 3 2 2 3 2 2 4 1.11 1.97 62 W -2 0 1 4 1 -1 0 -2 1 0 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