Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 P -3 -4 -4 -4 -5 -3 -3 -4 -4 -5 -5 -3 -5 -6 9 -3 -3 -6 -5 -5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 2.83 0.93 2 E -3 -2 -1 0 -2 1 7 -4 1 -5 -5 -1 -4 -2 -3 -2 -3 -4 0 -5 1 0 2 1 1 3 83 0 3 0 0 1 0 2 0 0 0 0 4 0 1.42 0.98 3 H -1 -3 -3 -4 -4 0 -3 -3 8 -2 0 -3 6 2 -5 -3 -2 -4 1 -3 5 0 0 0 0 3 0 1 47 1 6 0 23 9 0 1 1 0 2 0 1.21 0.99 4 D -4 -4 0 8 -6 -2 2 -4 -3 -5 -6 -3 -5 -6 -4 -2 -2 -6 -5 -5 0 0 2 85 0 0 12 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1.81 0.98 5 H -2 -2 -2 4 -5 3 5 -3 3 -2 -3 -1 -4 -5 -3 -1 0 0 -3 -2 1 1 0 20 0 12 38 1 6 2 2 2 0 0 1 2 7 1 1 2 0.70 0.98 6 R -4 8 -3 -4 -6 -1 -2 -2 -2 -5 -4 0 -1 -5 -4 -3 -3 0 -4 -5 0 92 0 0 0 1 0 4 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 1.79 0.98 7 K -3 1 0 -3 -5 0 -1 -4 -1 -5 -5 7 -4 -5 -3 -2 -3 -5 -4 -5 0 5 4 0 0 2 0 0 1 0 0 88 0 0 0 0 0 0 0 0 1.53 1.00 8 R -3 5 -3 -3 1 2 -2 -5 -3 -2 2 4 -2 -4 -4 -2 -3 -5 -4 -3 0 31 0 1 3 8 0 0 0 2 21 32 0 0 0 2 0 0 0 1 0.77 1.03 9 M -2 -4 -4 -3 -4 -2 -4 -4 -4 1 1 -4 8 0 -5 -2 -1 5 0 -1 3 0 0 2 0 2 0 0 0 7 11 0 54 3 0 2 4 8 3 2 1.14 1.03 10 G 0 -4 -3 -4 -4 -4 -4 6 -4 -3 -1 -4 -4 1 -4 -2 -1 -4 -4 -3 8 0 0 0 0 0 0 69 0 1 8 0 0 6 0 1 4 0 0 2 1.16 1.01 11 L -1 -4 -5 -5 -4 -4 -5 -5 -4 3 3 -4 5 4 -5 -3 -3 2 -2 0 6 0 0 0 0 0 0 0 0 21 32 0 15 16 0 2 0 3 0 5 0.76 1.01 12 K -3 1 -1 -2 -5 2 -1 -4 -3 -5 -5 7 -4 -5 -3 -2 -2 -5 -4 -4 0 5 1 1 0 9 1 0 0 0 0 80 0 0 0 0 2 0 0 0 1.40 1.02 13 M 3 -4 -4 -5 0 -4 -4 -2 -4 0 -1 -4 2 -1 -4 -1 0 7 -1 3 29 0 0 0 2 0 0 2 0 3 4 0 7 2 0 4 6 15 2 24 0.67 1.02 14 L -2 -5 -5 -6 1 -4 -5 -6 -5 4 3 -5 5 1 -5 -4 0 -4 -3 2 3 0 0 0 3 0 0 0 0 26 30 0 15 5 0 0 5 0 0 14 0.78 1.04 15 L 1 -5 -4 -5 0 -4 -5 1 -5 3 2 -4 4 3 -3 -2 -1 -4 -3 2 10 0 0 0 2 0 0 13 0 18 16 0 11 13 1 2 3 0 0 12 0.45 1.04 16 M 0 -4 -4 -5 -2 -4 -4 0 -5 5 1 -4 3 1 -4 -2 -2 -4 -3 3 7 0 0 0 1 0 0 7 0 33 12 0 8 5 0 2 2 0 0 22 0.61 0.99 17 M 0 -4 -4 -5 1 -4 -4 -1 -4 1 4 -4 3 2 -4 0 1 -4 -3 -1 7 0 0 0 3 0 0 4 0 6 42 0 6 10 0 9 8 0 0 3 0.49 1.01 18 G 1 -4 -3 -3 -2 -3 -3 1 -4 1 -1 -3 -2 -1 0 4 2 -5 -4 -1 12 0 0 0 1 0 0 12 0 8 5 0 1 2 5 39 10 0 0 5 0.48 1.04 19 L 0 -4 -5 -5 -2 -4 -5 -3 -5 3 3 -4 3 2 -1 0 0 0 -3 2 7 0 0 0 1 0 0 2 0 18 27 0 7 9 3 6 6 1 0 12 0.45 1.04 20 L 1 -4 -5 -6 -1 -4 -5 -3 -5 1 5 -4 3 0 -5 -4 -1 -4 -3 1 11 0 0 0 1 0 0 2 0 6 59 0 6 4 0 0 3 0 0 8 0.80 1.04 21 L 1 -4 -3 -5 -1 -4 -4 -2 -4 2 2 -4 1 4 -5 -2 3 2 1 0 11 0 1 0 1 0 0 3 0 10 23 0 3 16 0 1 19 2 5 5 0.45 1.04 22 P 3 -4 -4 -5 -1 -4 -4 0 -4 0 2 -4 0 0 3 -1 -2 -5 -3 1 31 0 0 0 1 0 0 7 0 3 21 0 2 5 14 4 1 0 0 11 0.46 1.04 23 L -1 -4 -4 -5 -1 2 -4 -2 -4 2 3 -4 2 1 0 0 -2 -4 -3 1 4 0 0 0 1 11 0 4 0 13 35 0 4 6 4 7 2 0 0 10 0.42 1.04 24 V 2 -4 -2 -4 0 -3 -3 -3 -4 0 0 -3 1 -1 -4 3 2 -5 -3 2 17 0 1 0 2 0 0 1 0 5 8 0 4 3 0 30 13 0 0 17 0.46 1.04 25 Y 0 -5 -5 -5 -4 -4 -5 1 -3 1 0 -4 0 2 -5 -4 -2 5 5 2 7 0 0 0 0 0 0 12 0 10 9 0 2 6 0 0 2 8 25 18 0.65 1.04 26 A -1 -4 -3 -5 0 -4 -4 -4 1 -2 -3 -4 -3 1 -5 -4 -3 8 8 -1 6 0 1 0 2 0 0 1 3 2 0 0 0 3 0 0 1 21 58 4 1.67 1.04 27 M -3 -4 -4 -5 -4 -2 -4 -3 0 1 0 -3 4 0 -5 -2 -1 4 6 3 1 0 0 0 0 2 0 2 2 8 9 1 12 3 0 2 3 5 28 22 0.69 1.02 28 K -2 2 0 -3 -5 -1 -2 -4 0 -5 -5 7 0 -5 -3 -2 -2 -5 -2 -4 1 8 4 0 0 0 0 0 2 0 0 79 3 0 0 1 1 0 2 0 1.32 1.04 29 R -4 8 -3 -4 -6 0 -2 -5 -3 -5 -5 2 -4 -5 -4 -3 -3 -5 -4 -5 0 87 0 0 0 3 0 0 0 0 0 10 0 0 0 0 0 0 0 0 1.82 1.04 30 H -4 -1 -3 -4 -5 0 -3 -5 6 -3 1 -1 0 4 -5 -1 -4 4 4 -2 0 4 1 0 0 4 0 0 26 1 12 4 2 22 0 4 0 6 15 2 0.86 1.04 31 K -3 3 0 -3 -5 -1 -2 -4 -1 -1 -2 6 -1 -4 -4 -3 -1 -5 -1 -1 1 16 3 0 0 1 0 0 1 4 3 60 1 0 0 0 3 0 2 5 0.94 1.04 32 W -5 -5 -6 -7 -5 -4 -5 -2 -5 -5 -4 -5 -4 2 -6 -5 -5 12 0 -5 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0 6 0 0 0 92 0 0 3.59 1.04 33 S 3 -3 -2 -3 -3 -1 -3 -2 -3 -4 -4 -3 -1 -5 -2 5 2 -5 -4 -2 25 0 1 0 0 2 0 1 0 0 1 0 2 0 1 58 10 0 0 1 0.92 1.04 34 V -1 -4 -2 -3 -4 -3 -4 -2 2 0 -1 -4 -1 -1 4 0 1 2 -1 3 4 0 2 1 0 1 0 3 6 4 4 0 1 3 20 8 10 3 2 27 0.46 1.05 35 L -2 -5 -5 -6 -4 -4 -5 -6 -5 4 4 -5 2 0 -5 -4 -2 -4 0 1 3 0 0 0 0 0 0 0 0 29 48 0 5 3 0 0 2 0 4 7 0.90 1.05 36 K -3 2 -2 -3 -5 -1 -2 -4 -3 -4 -2 7 -2 -5 -3 -2 -3 -5 -4 -3 0 6 0 0 0 0 0 0 0 0 4 87 1 0 0 0 0 0 0 2 1.47 1.00 37 S -1 -3 2 -3 -3 -2 -3 -3 -1 -4 -4 -3 -3 -4 -3 5 4 -5 -1 -3 3 0 9 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 54 31 0 2 0 0.99 1.00 38 R -3 8 -3 -4 -6 1 -2 -3 -2 -5 -4 1 -4 -5 -4 -3 -1 -5 -4 -4 1 86 0 0 0 4 0 1 0 0 0 4 0 0 0 0 3 0 0 1 1.67 1.00 39 K -3 3 -2 -3 -5 2 -1 -4 -3 -5 -5 7 -3 -5 -3 -2 -2 -5 -4 -3 0 12 0 0 0 7 0 0 0 0 0 77 0 0 0 1 1 0 0 1 1.36 0.98 40 L -3 -5 -5 -6 -4 -5 -5 -6 -3 6 2 -5 3 2 -5 -4 -3 -4 -1 2 0 0 0 0 0 0 0 0 1 52 21 0 6 8 0 0 1 0 2 9 0.99 0.97 41 A 3 -2 -4 -3 -3 -1 -1 -4 -2 1 -1 -2 0 1 -4 0 0 -4 -2 4 24 1 0 1 0 3 3 0 1 7 5 1 2 6 0 5 5 0 0 34 0.43 0.99 42 Y -4 -4 -5 -5 -5 -3 -5 -5 -1 -1 -1 -4 -3 5 -5 -4 -3 3 8 -2 0 0 0 0 0 1 0 0 0 3 3 0 0 28 0 0 1 3 60 1 1.62 0.96 43 R -2 2 4 1 -5 1 -2 -4 2 -1 -4 3 -2 -4 -1 -1 1 -5 -2 -1 1 14 21 9 0 6 1 0 6 5 0 17 0 0 3 3 8 0 1 5 0.43 0.95 44 P -2 -2 -4 -2 -5 -3 -1 -4 -4 -5 -5 -3 -4 -6 8 -1 -3 -6 -5 -4 2 2 0 1 0 0 4 0 0 0 0 0 0 0 88 4 0 0 0 0 2.28 0.83 45 P -2 -1 -3 -3 -5 -1 -2 -4 -4 -5 -5 3 -4 -5 7 -2 -3 -5 -5 -4 2 2 0 0 0 1 0 0 0 0 0 26 0 0 69 0 0 0 0 0 1.80 0.79 46 K -3 3 -2 1 -5 2 -1 -3 -2 -5 -4 6 -3 -5 -3 -2 -2 -5 -4 -4 0 14 0 7 0 8 0 0 0 0 0 72 0 0 0 0 0 0 0 0 1.11 0.68 K Lambda Standard Ungapped 0.1399 0.3275 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1992 0.3174 PSI Gapped 0.0610 0.2670