Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 P -2 -3 -3 -3 -4 -2 -2 -3 -3 -4 -4 -2 -4 -5 8 -2 -2 -5 -4 -3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 2.45 0.37 2 D -2 -3 1 4 -4 -2 -2 5 2 -5 -5 -3 -4 -5 -3 2 -2 -5 -4 -5 0 0 6 28 0 0 0 43 5 0 0 0 0 0 0 18 1 0 0 0 0.87 0.68 3 W -2 -5 -6 -6 -4 -4 -5 -4 -4 -4 -3 -5 -3 -1 -5 -4 -4 12 1 -5 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 97 0 0 3.54 0.75 4 R -1 4 0 -3 2 -1 1 -4 2 -2 -3 1 -3 -4 -1 1 1 -5 -3 0 5 26 4 0 5 1 10 0 5 3 1 7 0 0 2 12 11 0 0 7 0.36 0.78 5 Q -3 -1 -2 3 -5 3 6 -3 0 -5 -5 -1 -4 -5 -3 -2 -3 -5 -4 -4 0 1 0 16 0 11 69 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.24 0.78 6 F -4 -5 -5 -5 -4 -5 -5 -5 -3 0 -1 -5 -2 8 -6 -4 -4 -1 1 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 2 0 0 95 0 0 0 0 0 0 1.91 0.78 7 C -2 -5 -4 -5 11 -5 -5 -4 -5 -3 -3 -5 -3 -4 -4 -3 -3 -4 -4 -3 0 0 0 0 97 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.69 0.76 8 E -2 -2 0 1 -5 0 7 -4 -2 -5 -5 -1 -4 -5 -3 -1 -3 -5 -4 -4 1 0 4 5 0 0 86 0 0 0 0 1 0 0 0 3 0 0 0 0 1.41 0.78 9 L -2 3 -1 -4 -4 -1 -1 -4 -1 -1 4 1 -1 -3 -4 0 -1 -4 -3 -1 2 20 4 0 0 2 3 0 2 1 46 9 0 0 0 8 3 0 0 2 0.47 0.78 10 H -2 -2 -1 -3 1 2 0 -4 10 -5 -5 -2 -3 -3 -2 -3 -3 -4 0 -5 3 0 0 0 3 8 3 0 80 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0 1.82 0.78 11 A 6 -3 -3 -4 -2 -3 -3 -2 -3 -3 -3 -3 -3 -4 -1 0 -2 -4 -4 -2 95 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 3 0 0 0 0 1.26 0.78 12 Q -2 5 0 -3 -4 3 -2 -4 3 2 -3 0 -2 -3 -4 0 -2 -4 -3 0 3 40 3 0 0 16 0 0 9 14 0 3 0 1 0 6 0 0 0 6 0.64 0.78 13 A 5 -1 -1 -4 -3 -3 -3 -2 -3 -2 -3 -1 -2 -1 -3 0 1 -4 0 2 53 4 4 0 0 0 0 0 0 1 0 3 0 3 0 5 8 0 3 16 0.55 0.78 14 A 5 -3 -3 -1 -2 -3 -3 -2 -3 -2 -3 -2 -3 -4 -3 2 2 -5 -4 -2 70 0 0 3 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 12 14 0 0 0 0.90 0.78 15 A 6 -3 -3 -3 -2 -3 -3 -2 -3 -3 -3 -3 -3 -4 -3 1 -2 -4 -4 -2 91 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9 0 0 0 0 1.22 0.78 16 V 3 2 -3 -3 -3 0 -1 -1 -3 -2 -1 0 -1 -3 -3 1 -2 -4 0 3 25 15 0 0 0 4 4 3 0 0 5 6 1 0 0 11 0 0 3 23 0.32 0.78 17 D -3 -2 1 6 -5 3 4 -2 -2 -2 -5 -2 -4 -5 -3 -2 -3 -5 -4 -4 0 0 6 47 0 12 31 1 0 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.06 0.78 18 F -4 -5 -5 -6 -4 -5 -5 -5 -3 -1 3 -5 -1 8 -5 -4 -4 -1 1 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27 0 0 73 0 0 0 0 0 0 1.51 0.78 19 A 6 -3 -3 -4 -2 -3 -3 -2 -4 -3 -3 -3 -3 -4 -3 -1 -2 -4 -4 0 93 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7 1.22 0.78 20 H -1 5 -1 -1 -5 2 -2 -2 5 -5 -3 3 -3 -4 -2 -2 -3 -4 -2 -4 4 40 1 2 0 9 0 3 19 0 1 18 0 0 1 0 0 0 1 0 0.87 0.78 21 K 1 1 2 -2 -1 3 0 -3 4 -4 -4 4 -3 -4 -3 1 -2 -5 -3 -4 14 8 10 0 1 13 4 0 13 0 0 26 0 0 0 12 0 0 0 0 0.56 0.78 22 F -3 -4 -4 -5 5 -4 -5 -5 -2 -2 -1 -4 -2 6 -5 -2 -3 3 6 -3 0 0 0 0 12 0 0 0 0 0 5 0 0 48 0 3 0 3 29 0 1.30 0.78 23 C -3 4 -4 -4 6 1 -3 -5 -3 1 1 -2 -2 -3 -4 -3 -3 6 -3 0 0 32 0 0 22 6 0 0 0 9 13 0 0 0 0 0 0 11 0 9 0.81 0.78 24 R 1 4 2 -1 0 1 -2 -3 2 -1 1 -1 -2 -4 -4 0 0 -4 -3 -3 12 28 10 4 2 7 0 0 7 4 16 0 0 0 0 6 6 0 0 0 0.35 0.78 25 F -4 -4 -5 -5 -4 -4 -5 -5 -2 -2 -2 -5 -2 8 -5 -4 -4 0 6 -3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 70 0 0 0 0 30 0 1.75 0.78 26 L 2 -4 -4 -1 -3 -1 -4 -4 -4 2 3 -4 1 -2 -2 -3 -2 -4 -3 3 17 0 0 4 0 4 0 0 0 13 33 0 3 0 2 0 0 0 0 26 0.51 0.78 27 R 1 5 2 -3 -4 -1 -2 -2 -1 -4 -2 0 -3 -4 -1 1 2 -4 -3 -3 16 35 11 0 0 2 0 1 1 0 3 1 0 0 2 12 16 0 0 0 0.55 0.76 28 D -1 -2 2 4 -4 1 4 -1 -2 -4 0 -2 -3 -4 -3 1 -1 -5 -4 -4 2 0 9 23 0 4 31 5 0 0 10 0 0 0 0 11 2 0 0 0 0.55 0.75 29 N -3 2 7 -1 -4 -1 -2 -3 6 -5 -4 -2 -3 -4 -4 -1 -1 -4 -1 -4 0 11 59 0 0 0 0 0 23 0 0 0 0 0 0 0 2 0 1 0 1.22 0.74 30 P -2 -2 -2 -3 -4 -2 -3 -2 -3 -4 -2 -2 -4 -5 8 -2 -3 -5 -4 -4 1 2 2 0 0 2 0 3 0 0 4 0 0 0 83 0 0 0 0 0 2.01 0.73 31 A 2 -1 -2 -1 2 5 2 -3 4 -1 -4 -2 -3 -4 1 0 -1 -4 -3 -2 18 2 1 2 4 30 12 0 12 3 0 0 0 0 7 4 3 0 0 1 0.53 0.75 32 Y -3 -3 -1 -4 -4 -1 1 -5 6 0 -1 -3 2 0 -4 -2 -1 -2 6 0 0 0 3 0 0 2 10 0 19 5 5 0 5 3 0 3 4 0 32 7 0.80 1.17 33 D 3 -3 1 4 -4 -3 0 0 -3 -1 -4 -3 -4 -4 -3 1 0 -5 -4 -2 32 0 7 28 0 0 4 5 0 4 1 0 0 0 0 11 4 0 0 2 0.60 1.12 34 T 0 3 1 0 -4 -2 0 -1 2 -2 0 0 -3 -2 -1 1 2 -4 -3 0 9 16 6 4 0 0 5 4 5 2 9 4 0 2 3 10 13 0 0 7 0.17 1.11 35 P 0 1 1 -4 -4 -3 -4 -1 -4 -4 0 -3 -3 -2 6 -1 1 4 -4 -1 8 7 7 0 0 0 0 5 0 0 9 0 0 2 36 4 10 5 0 4 0.71 1.16 36 D 1 0 -3 2 -4 2 -1 2 -4 1 -1 -3 1 -4 2 -3 -3 -5 -4 0 14 5 0 13 0 11 4 14 0 10 7 0 4 0 9 0 0 0 0 8 0.28 1.13 37 A 3 0 -3 1 -4 0 0 -3 -3 -5 -5 0 -4 0 3 3 -2 -5 -1 -4 27 6 0 8 0 3 4 0 0 0 0 5 0 5 15 23 0 0 2 0 0.54 1.19 38 G 2 -3 -3 0 2 -2 4 0 5 -5 -4 -1 -4 2 2 -3 -3 -4 0 -4 18 0 0 4 5 0 27 6 13 0 0 4 0 11 9 0 0 0 2 0 0.59 1.19 39 A 1 4 2 0 -4 1 1 -4 -3 -3 -2 -2 -3 -4 -1 -1 1 -4 1 0 15 25 11 4 0 5 9 0 0 0 4 0 0 0 2 4 10 0 5 7 0.36 1.06 40 S 1 -1 0 2 -3 -2 1 -3 -1 -2 1 1 1 -4 -3 3 -1 -4 -4 -3 13 4 3 12 0 0 10 1 1 2 15 7 3 0 0 24 3 0 0 0 0.30 1.02 41 F 0 -5 -5 -6 -4 -5 -5 -5 -3 -2 0 -5 -2 8 -5 -4 -4 -2 3 0 10 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 0 0 69 0 0 0 0 8 7 1.49 1.10 42 S 2 -1 -3 -4 2 -3 -3 1 -4 -4 0 -3 2 -4 1 4 -2 -5 -4 -3 21 3 0 0 5 0 0 9 0 0 12 0 5 0 6 39 0 0 0 0 0.58 1.10 43 R -1 5 -3 -4 -5 3 -2 -3 1 -3 1 2 -2 -4 -4 -2 -1 -5 -3 -1 4 39 0 0 0 15 0 1 4 0 14 14 0 0 0 2 2 0 0 5 0.68 0.93 44 H -3 5 -2 -3 -1 4 -1 -4 5 -5 -5 4 -3 -5 -4 -3 -3 -5 -3 -5 0 31 0 0 2 18 0 0 19 0 0 30 0 0 0 0 0 0 0 0 1.09 0.93 45 F -1 -5 -5 -6 -4 -5 -5 -5 -3 -2 -2 -5 -2 8 -6 -4 -4 -1 2 -3 6 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 90 0 0 0 0 4 0 1.93 0.93 46 A 3 -4 -3 -4 0 -3 -4 -3 -4 1 -1 -3 -2 -4 -4 0 4 -5 -4 3 33 0 0 0 2 0 0 0 0 8 2 0 0 0 0 4 26 0 0 26 0.66 0.93 47 A 1 -1 -2 5 -5 2 4 -3 1 -5 -5 -2 -4 -5 -3 -2 -1 -5 -4 -4 15 2 0 37 0 8 33 0 3 0 0 0 0 0 0 0 3 0 0 0 0.92 0.93 48 N 0 -1 1 -4 2 -3 -3 -4 4 -2 3 -3 -2 0 -4 1 0 -4 0 0 7 4 8 0 5 0 0 0 13 0 29 0 0 4 0 15 6 0 4 5 0.36 0.89 49 F -4 -5 -5 -6 -4 -5 -5 -5 -3 -2 -2 -5 -2 9 -6 -4 -4 -1 1 -3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 2.17 0.89 50 L -2 -1 -3 -4 2 4 -1 -1 -3 -2 3 -2 0 -1 -4 -1 -3 -4 1 1 2 2 0 0 4 28 3 4 0 0 35 0 1 2 0 5 0 0 5 9 0.48 0.89 51 D -2 3 -2 3 -5 4 4 -4 0 -4 -3 -1 -3 -5 -3 0 -2 -5 -4 -1 2 16 0 17 0 21 26 0 2 0 1 2 0 0 0 6 1 0 0 6 0.67 0.89 52 V -2 -1 -2 -4 2 -1 -3 -4 8 -3 -4 0 -3 -1 -3 -2 -3 -2 5 0 2 2 0 0 6 1 0 0 48 1 0 5 0 1 1 1 0 0 25 7 1.25 0.91 53 F -4 -5 -5 -6 -4 -5 -5 -5 -3 -2 -2 -5 -2 8 -6 -4 -4 -1 4 -3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 90 0 0 0 0 10 0 1.99 0.87 54 G 0 0 -2 2 5 1 5 0 -3 -2 -4 -2 -4 -5 -3 1 -2 -5 -4 -4 6 5 0 10 14 4 41 6 0 2 0 0 0 0 0 9 1 0 0 0 0.69 0.89 55 E 2 0 2 -1 2 -2 1 -3 3 -2 -2 -1 -2 -2 -4 1 1 -4 0 -1 22 6 13 2 4 0 12 0 9 2 3 2 1 1 0 9 7 0 3 5 0.28 0.89 56 E -1 -1 -2 1 -5 1 7 -3 -2 -5 -5 0 -4 -5 -3 -2 -2 -5 -4 -4 4 2 0 4 0 3 83 1 0 0 0 2 0 0 0 0 1 0 0 0 1.39 0.89 57 V 0 -4 -5 -5 -3 -1 -4 -5 -4 1 3 -4 -1 3 -4 -2 -3 -3 1 4 8 0 0 0 0 3 0 0 0 4 25 0 0 11 0 3 0 0 5 40 0.62 0.88 58 R 0 4 -1 0 -4 1 0 -3 1 -4 -1 2 -3 1 -4 1 -1 -4 -1 -4 10 30 3 5 0 6 4 1 4 0 5 12 0 6 0 11 3 0 2 0 0.41 0.89 59 R -3 7 -2 -2 -5 1 1 0 -2 -5 -4 2 -3 -5 -4 -3 -3 -5 -4 -5 0 68 0 2 0 4 9 7 0 0 0 11 0 0 0 0 0 0 0 0 1.22 0.86 60 V 3 -1 -3 -3 -3 1 -3 2 -3 1 -3 -3 0 -4 -3 1 1 -4 -4 1 32 4 0 0 0 6 0 16 0 11 0 0 2 0 0 9 8 0 0 11 0.38 0.75 61 L -2 0 -3 -4 -1 -1 -3 -4 -2 -1 3 -3 -1 4 -4 2 -2 -2 2 -2 0 6 0 0 2 3 0 0 0 0 36 0 0 24 0 20 0 0 9 0 0.49 0.56 62 V 4 -3 0 -3 -2 -3 -3 1 -3 0 -2 -3 0 -3 -3 -1 -1 -4 -3 3 45 0 6 0 0 0 0 12 0 3 0 0 2 0 0 0 2 0 0 31 0.50 0.53 63 A 4 -2 -1 -2 -2 -2 -2 3 -3 -3 -3 -2 -2 -4 -2 3 1 -4 -3 -2 41 0 0 0 0 0 0 19 0 0 0 0 0 0 0 32 7 0 0 0 0.57 0.37 K Lambda Standard Ungapped 0.1396 0.3303 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1804 0.3174 PSI Gapped 0.0552 0.2670