Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 A 6 -4 -4 -5 -4 -4 -4 -3 -5 -5 -5 -4 -4 -6 -4 3 -3 -6 -5 -4 75 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25 0 0 0 0 1.48 1.56 2 S -3 -4 1 -4 -5 -3 -4 -5 -4 -3 -5 1 -4 -6 -5 1 7 -6 -4 -4 1 0 5 0 0 0 0 0 0 1 0 7 0 0 0 9 74 0 0 0 1.58 1.99 3 V -1 -5 -5 -6 -2 -5 -6 3 -6 2 -2 -5 0 -3 -4 -4 -1 -3 -3 6 6 0 0 0 1 0 0 19 0 8 3 0 2 1 1 1 4 0 1 52 0.98 2.02 4 H 5 -1 -3 -4 -3 -4 -3 3 0 -5 -5 -4 -4 -5 -4 3 -3 -1 -1 -3 47 4 1 0 0 0 1 19 2 1 1 0 0 0 0 17 1 1 2 1 0.89 2.07 5 G -2 -1 -2 4 -5 5 4 -2 1 -5 -5 -2 -4 -4 -5 -1 -2 -5 -4 -6 4 2 1 24 0 22 27 4 4 0 1 2 0 1 0 5 2 0 0 0 0.88 2.08 6 T 4 -2 -4 -5 -3 -2 -4 -4 0 2 1 -5 -1 -1 -5 -1 -1 -3 4 1 33 2 1 0 0 2 0 1 2 11 13 0 2 3 0 4 3 0 12 10 0.55 2.07 7 T -3 -6 -7 -7 -3 -6 -6 -6 -7 5 4 -6 1 1 -6 -5 -1 -3 -4 3 2 0 0 0 0 0 0 0 0 26 38 0 3 5 0 0 4 0 0 20 1.02 2.10 8 Y 3 -5 -5 -7 -3 -5 -5 -4 -2 2 1 -5 0 2 -5 -3 -2 -2 -2 5 22 0 0 0 0 0 0 1 1 12 13 0 2 7 0 1 2 1 1 35 0.75 2.12 9 E -1 3 -1 4 -5 2 4 -4 0 -6 -5 2 -4 -6 -5 -2 -2 -4 -3 -5 6 16 2 19 0 9 24 1 3 0 1 12 0 0 0 3 3 0 1 0 0.71 2.12 10 L 2 2 -4 -5 3 0 0 -4 -2 0 0 -3 1 2 -6 0 2 -1 0 0 17 12 1 0 5 3 5 1 1 5 9 1 3 8 0 8 10 1 4 7 0.26 2.12 11 L -4 -6 -7 -7 0 -6 -7 -7 -7 0 7 -6 1 0 -7 -5 -4 -3 -4 -2 1 0 0 0 2 0 0 0 0 3 85 0 3 3 0 0 1 0 0 1 1.65 2.12 12 R 2 2 -3 -2 -2 1 2 -4 1 0 -2 3 -2 -4 -5 -1 -2 -2 -1 1 14 11 1 2 1 5 14 1 4 5 5 18 1 1 0 4 3 1 2 10 0.32 2.16 13 R 3 3 1 1 -4 3 3 -2 0 -4 -3 1 -2 -5 -4 -1 -2 -7 -5 -4 20 16 7 8 0 10 15 3 2 1 3 6 1 0 0 4 2 0 0 1 0.46 2.16 14 Q 0 -1 1 -3 0 3 2 -4 5 -1 1 -1 -2 -2 -5 -2 -3 4 1 -2 8 3 6 1 2 13 15 1 12 3 15 3 1 2 0 2 1 6 4 2 0.41 2.17 15 G -3 -4 0 -1 -5 -3 -3 7 -2 -7 -6 -3 -5 -5 -5 -3 -4 -4 -3 -6 1 1 5 4 0 1 2 79 1 0 1 2 0 0 0 1 1 0 1 0 1.72 2.15 16 I -1 -6 -5 -5 -1 -5 -6 -6 -5 4 -1 -6 -1 -3 -5 -4 -1 -6 -4 6 5 0 0 1 1 0 0 0 0 24 4 0 1 1 0 1 3 0 0 57 1.28 2.15 17 D -3 3 -1 4 -4 0 3 -3 0 -5 -5 2 -4 -3 -3 -1 2 -1 -3 -5 1 14 3 19 0 3 19 2 2 0 1 11 0 1 1 5 15 1 1 0 0.59 2.17 18 T -2 1 -1 1 -1 -1 -1 -4 7 -2 -4 -1 -3 0 -5 -2 3 -1 4 0 4 8 2 7 1 3 4 1 21 2 2 3 1 3 0 3 15 1 11 7 0.57 2.17 19 V 0 -5 -5 -7 2 -5 -6 -5 -3 5 0 -5 2 0 -5 -4 -3 -3 -3 5 8 1 0 0 4 0 0 1 1 29 8 0 4 4 0 1 1 0 1 37 0.97 2.17 20 F -3 -6 -5 -6 1 -5 -7 -6 0 -2 -3 -7 -3 8 -5 -4 -4 0 4 0 2 0 0 0 3 0 0 0 2 2 1 0 0 66 1 1 1 1 10 8 1.79 2.17 21 G 0 -5 -4 -5 0 -4 -5 6 -3 -1 -2 -5 -1 -2 -6 -2 -1 -6 -3 -1 6 0 1 0 2 1 1 62 1 5 5 0 2 2 0 2 4 0 1 5 1.14 2.19 22 N -2 -6 1 -6 2 -2 -5 -5 2 4 1 -5 2 0 -5 -1 -4 -5 4 3 3 0 7 0 4 2 0 1 4 19 12 0 5 3 0 5 1 0 11 22 0.59 2.20 23 P -2 -5 -4 -3 0 -4 -4 -3 -2 -2 -3 -5 -1 -1 8 -1 -2 -2 -4 0 2 1 1 1 2 1 1 2 1 3 3 0 2 3 62 5 3 1 1 8 1.50 2.19 24 G -2 -4 -2 -3 -3 -4 -5 7 -3 -4 -5 -4 -6 -6 -4 -2 -4 -6 -4 -4 2 1 1 2 1 1 1 82 1 1 1 1 0 0 1 2 1 0 1 1 1.81 2.19 25 S 0 -4 -1 4 -6 -2 0 3 1 -1 -4 -3 -3 -4 -2 2 0 -7 -4 -2 6 1 3 20 0 1 5 24 3 5 1 1 1 1 2 17 5 0 1 4 0.49 2.26 26 N 2 2 0 -1 -3 -1 -1 0 2 -4 -3 -2 -2 1 0 2 0 -3 2 -3 16 10 4 4 1 3 4 8 5 1 2 2 1 5 5 14 6 0 6 1 0.22 2.30 27 A 0 -4 4 -4 -2 -4 -1 -4 -1 3 0 -4 0 0 -4 1 -1 -2 0 2 6 1 17 1 1 1 5 1 2 17 8 1 2 4 1 9 4 1 3 12 0.31 2.30 28 L 0 -4 1 -1 -1 -2 -3 -4 -3 0 3 -4 4 0 -2 -2 1 -2 -2 0 9 1 6 3 1 2 2 2 1 5 29 1 10 4 3 3 8 1 1 5 0.30 2.30 29 P 0 -2 -1 1 -2 -1 1 0 3 -4 -4 -3 -3 -3 5 -1 -1 -2 -2 -4 9 2 3 7 1 2 9 9 7 1 2 1 1 1 30 4 4 1 1 1 0.54 2.27 30 F -1 -4 -3 -5 -2 -4 -5 -5 -3 3 4 -4 1 4 -4 -4 -2 -1 -2 1 6 1 1 1 1 1 1 1 1 17 32 1 3 13 1 1 2 1 1 10 0.57 2.27 31 L 0 -3 -2 -3 -1 -3 -4 -3 0 0 3 -5 1 1 -4 -2 0 0 4 1 9 1 2 1 1 1 1 3 2 5 27 0 3 5 1 3 5 1 15 8 0.36 2.25 32 K 0 0 -1 5 -2 0 2 -2 1 -2 -3 -1 -1 -2 -4 -2 -3 -1 -1 -1 9 5 3 34 1 4 10 3 3 2 3 3 2 2 1 2 2 1 2 4 0.45 2.25 33 D 5 -2 -1 -1 -1 -1 1 -1 1 -3 -3 -2 0 -3 -1 0 -1 0 -1 -3 41 2 3 4 2 2 8 5 3 2 3 2 2 1 3 6 3 1 2 2 0.42 2.29 34 F -1 -2 -2 -2 1 0 -2 -4 0 1 3 -3 2 2 -1 -3 -2 1 0 1 4 2 2 2 3 4 3 2 2 8 31 2 4 7 3 2 2 2 3 8 0.27 2.27 35 P 1 1 -1 0 1 1 0 -1 3 -2 -3 -1 0 -1 1 0 -1 2 1 -2 10 7 3 6 2 7 7 5 6 3 3 4 3 3 6 7 3 2 5 3 0.06 2.24 36 E -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 37 D -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 38 F -2 -2 -2 -2 1 -1 -2 -2 0 4 1 -2 2 1 0 -2 -2 2 -1 0 3 3 3 3 2 3 3 4 2 21 14 3 5 6 5 3 3 2 2 6 0.19 2.23 39 R -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 40 Y -2 -3 -2 -3 3 -1 -3 -3 4 0 1 -3 0 3 -2 -3 0 6 2 1 4 2 2 1 5 3 2 2 8 5 11 2 2 11 3 2 7 9 7 9 0.33 2.24 41 I -3 -2 -2 -3 0 -2 -3 -3 3 4 -1 -3 0 0 -2 -3 -1 3 3 3 2 2 2 2 2 2 2 2 7 20 5 2 2 4 2 2 4 3 8 19 0.37 2.23 42 L -1 -1 -1 -1 1 0 -1 1 1 0 1 -2 1 -1 -1 0 0 2 1 1 4 4 3 3 3 4 4 9 3 5 12 3 3 3 4 7 5 2 5 11 0.02 2.23 43 A -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 44 L -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 45 Q -1 0 0 0 3 1 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 -5 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0 5 5 0.07 2.01 46 E -1 -4 0 0 -5 0 6 -2 1 -5 -2 -3 -4 -5 0 -1 -1 -5 -5 -1 4 0 4 4 0 4 49 4 4 0 4 0 0 0 4 4 4 0 0 4 0.71 1.74 47 A -1 0 0 0 3 0 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 -5 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0 5 5 0.02 2.12 48 C 2 -2 0 -2 1 -1 -2 3 2 -1 -3 -2 1 -1 -2 1 -1 2 -1 -1 14 3 5 3 3 3 3 18 5 3 3 3 3 2 3 10 4 2 2 5 0.13 1.95 49 V 0 0 1 -4 3 1 0 0 3 0 -1 -3 2 -5 1 0 0 -5 -4 0 6 6 6 0 6 6 6 6 6 6 6 0 6 0 6 6 6 0 0 6 0.11 1.67 50 V 0 -4 -4 -4 4 -3 0 0 -4 1 0 -4 3 2 1 0 1 -4 -3 0 8 0 0 0 7 0 8 8 0 8 8 0 7 7 8 8 8 0 0 8 0.16 1.34 51 G -1 0 0 0 3 0 -1 -1 2 0 -1 -4 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0 5 5 5 5 5 5 5 5 0.07 2.12 52 I -1 0 0 -4 3 1 0 -1 2 0 -1 -4 2 1 -5 -1 0 4 1 0 6 6 5 0 5 5 6 6 5 6 6 0 5 5 0 6 6 5 5 6 0.14 1.89 53 A 0 -4 1 -4 3 1 0 0 3 1 -1 -4 3 -4 1 0 0 -5 -4 0 7 0 7 0 6 7 7 7 6 7 7 0 6 0 7 7 7 0 0 7 0.14 1.56 54 D -1 -4 0 0 3 0 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 0 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.07 2.12 55 G 3 -2 -2 -3 0 -5 -2 5 -5 -2 -3 -2 0 -2 -5 -2 -2 -6 -1 -2 26 2 2 2 2 0 3 38 0 3 2 2 3 2 0 2 2 0 2 3 0.64 2.07 56 Y -2 -1 -2 -1 0 -1 0 -3 2 -1 0 -3 1 1 -6 -3 -2 2 6 -1 4 3 2 4 2 3 7 2 5 4 9 2 4 5 0 2 3 2 28 4 0.46 2.16 57 A 4 -1 -1 -2 1 -1 -2 1 1 -2 -3 -2 0 -1 -5 0 -1 2 0 -2 33 3 3 3 3 3 3 10 3 3 3 3 2 3 0 7 3 3 4 3 0.31 2.16 58 Q -1 0 0 0 3 0 0 -1 2 0 -1 0 2 1 -5 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0 5 5 5 5 5 0.07 2.12 59 A -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 60 S -1 1 0 -1 1 -1 -2 -1 1 -1 -2 0 0 -1 -2 2 4 2 -1 -2 4 7 4 3 3 3 3 5 3 3 4 5 3 2 2 13 21 2 2 3 0.18 2.26 61 R -1 0 0 0 3 0 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 -5 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0 5 5 0.02 2.12 62 K -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 63 P -1 0 0 -5 3 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 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