Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 E -4 -3 1 2 -7 4 7 -5 -3 -6 -6 1 -5 -7 -4 -3 -4 -6 -5 -6 0 0 5 10 0 15 63 0 0 0 0 7 0 0 0 0 0 0 0 0 1.40 1.48 2 T -3 -1 -2 -4 3 2 -2 -1 -2 -2 -3 2 5 -5 -1 1 4 -3 -4 -3 1 4 2 0 5 9 2 4 1 2 1 15 14 0 3 9 25 0 0 1 0.53 1.61 3 P -1 3 -3 -2 -4 -1 -1 -3 -3 -4 1 5 -2 -4 3 -2 -3 -6 -4 -2 4 15 1 2 0 1 3 2 0 1 13 36 1 0 14 2 1 0 0 2 0.67 1.66 4 R -4 7 0 -2 -4 -1 -3 -4 1 -6 -5 3 -5 -6 -4 -1 0 -6 -5 -4 1 58 4 2 0 2 0 1 3 0 0 15 0 0 0 5 6 0 0 1 1.28 1.75 5 L 0 -6 -6 -7 -2 -6 -6 -6 -4 4 3 -5 0 -2 -5 -4 -3 -1 -4 5 7 0 0 0 1 0 0 0 0 24 22 0 2 1 0 1 1 1 0 38 0.98 1.80 6 L -4 -6 -7 -7 -1 -5 -6 -6 -6 1 6 -6 5 -3 -5 -5 -4 -3 -5 2 1 0 0 0 1 0 0 0 0 5 65 0 11 0 0 0 1 0 0 13 1.28 1.82 7 F 2 -6 -5 -5 1 -5 -6 -3 -1 2 1 -6 0 2 -6 -3 -2 -3 1 5 16 0 0 0 3 0 0 2 1 10 10 0 2 9 0 2 2 0 5 35 0.66 1.85 8 V -4 -6 -7 -7 -2 -6 -5 -7 -6 5 1 -6 -1 3 -6 -5 -3 -5 -3 5 1 0 0 0 1 0 1 0 0 30 13 0 1 12 0 0 1 0 0 40 1.16 1.85 9 H 3 -4 -3 -5 -2 -3 -4 2 4 -1 -3 -3 -2 1 -5 2 0 -1 -2 1 27 0 1 0 1 1 1 13 10 4 2 1 1 7 0 15 5 1 1 9 0.49 1.87 10 A 6 -5 -5 -5 -2 -5 -5 -2 -5 -5 -5 -4 -5 -6 5 -2 -2 -7 -6 -3 65 0 0 0 1 0 0 2 0 0 1 0 0 0 28 1 1 0 0 2 1.52 1.89 11 H -4 -2 -3 -5 -7 -2 -2 -6 11 -7 -7 -4 -5 -5 -6 -4 -5 -6 -1 -7 1 1 0 0 0 1 1 0 95 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 3.20 1.94 12 P -1 -4 -5 -4 -3 -1 -3 -5 -4 -4 -3 -5 -4 -3 8 -2 -4 -7 -4 -4 5 1 0 1 1 2 1 1 0 1 3 0 0 1 78 3 1 0 1 1 2.15 2.01 13 D -3 -5 -2 8 -7 -3 -1 -2 -3 -7 -6 -4 -7 -5 -5 -4 -5 -8 -7 -5 2 0 1 90 0 1 1 3 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 2.27 2.02 14 D -6 -5 -2 9 -8 -4 0 -5 -5 -7 -8 -4 -7 -8 -5 -4 -5 -8 -7 -7 0 0 0 97 0 0 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.63 2.08 15 E 0 -4 -3 1 -1 -2 7 -4 -3 -2 -4 -4 -1 -2 -2 -3 -4 -3 -4 -1 8 0 0 6 1 0 66 1 0 3 2 0 1 2 2 0 1 0 0 4 1.25 2.19 16 S 1 -3 1 -1 2 -2 2 -4 -3 0 -2 -4 -3 -4 -3 2 3 -6 -5 2 12 1 5 3 4 1 16 1 1 5 3 1 1 0 1 15 14 0 0 14 0.35 2.15 17 L -4 -5 -4 -5 -3 -4 -5 -4 -3 3 3 -5 4 3 -5 0 0 2 1 -2 1 0 1 1 1 1 1 1 1 14 31 1 10 12 0 7 6 2 4 2 0.59 2.16 18 S 0 0 -2 -4 -1 -2 -4 4 -3 -2 -2 -1 -1 4 -4 1 -1 2 -3 -3 9 5 2 1 1 2 1 29 1 3 4 4 2 14 1 10 4 2 1 2 0.40 2.16 19 N 2 -5 -2 -5 7 -4 -4 0 -3 -2 -1 -4 4 3 -2 -1 1 -5 -3 0 14 0 2 0 19 1 1 6 1 2 6 1 8 14 2 5 8 0 1 5 0.57 2.12 20 G 3 -5 -2 -5 -3 -5 -4 6 -3 -2 -3 -5 -3 -1 -3 1 -2 -2 -2 -4 20 0 2 0 1 0 1 47 1 2 3 0 1 3 1 9 2 1 1 1 0.85 2.14 21 A 2 -4 -3 -4 -3 -2 -4 5 -3 -4 -4 -4 -2 -4 3 -2 -3 -2 -4 -2 17 1 1 1 1 2 1 44 1 1 2 1 1 1 14 3 1 1 1 2 0.81 2.17 22 T 0 -4 -4 -4 -2 -3 -5 -4 -2 -1 2 -4 0 -1 -4 0 5 1 0 0 8 1 1 1 1 1 0 1 1 3 18 1 2 2 1 6 37 2 3 6 0.56 2.19 23 I -2 -6 -4 -6 -2 -4 -5 -4 -3 5 4 -4 4 0 -6 -4 -3 -5 -1 1 3 0 1 0 1 1 1 2 1 30 32 1 9 3 0 1 2 0 2 8 0.79 2.21 24 A 4 -1 -2 -2 -2 1 -3 -3 0 -1 1 -2 -1 -3 -2 0 -1 -2 -1 -2 38 4 2 2 1 6 1 2 2 4 13 2 1 1 2 7 3 1 2 2 0.38 2.19 25 H 0 3 -1 -2 -2 1 0 -2 2 -3 0 3 -1 -3 -3 -1 -1 2 0 -3 8 17 3 2 1 7 5 4 4 1 9 15 1 1 1 5 3 3 4 1 0.23 2.22 26 Y 0 -3 -2 -4 0 -2 -3 -4 4 -2 3 -3 1 1 -5 -3 -2 4 4 -2 9 1 2 1 2 2 2 1 9 2 30 2 3 5 0 2 2 5 13 3 0.48 2.17 27 T 3 1 -2 -3 0 -1 -3 -2 0 1 -1 0 -1 -3 -3 0 1 -1 -1 1 22 8 2 1 2 3 2 3 3 7 6 5 1 1 2 8 8 1 2 11 0.15 2.18 28 S 1 2 1 1 -1 1 1 -1 1 -3 -3 1 -1 -2 -1 0 -1 1 -1 -3 12 9 7 9 2 5 9 4 3 2 3 8 2 2 3 6 3 2 2 2 0.12 2.22 29 R 0 1 1 0 -1 2 2 -2 3 -2 0 0 0 -2 0 -1 -2 1 -1 -3 8 8 5 4 2 9 12 3 6 2 8 6 3 2 5 5 2 2 2 2 0.10 2.20 30 G -2 -1 0 -1 0 -2 -2 6 0 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -2 -2 -5 -2 -3 3 3 5 4 2 2 3 47 2 2 2 3 2 2 2 3 2 0 2 2 0.65 2.16 31 A 2 0 -1 0 1 -1 -2 -2 5 -1 -2 0 -2 -2 -3 -1 -1 2 1 1 15 4 3 6 3 3 2 4 12 4 3 7 1 2 1 4 3 3 5 10 0.19 2.13 32 Q -1 3 0 1 -1 1 2 -3 2 -2 -3 1 -2 -3 1 -1 0 -1 -2 -3 5 15 4 7 1 6 15 2 5 2 2 9 1 1 6 4 6 1 1 2 0.24 2.05 33 V -1 -3 -3 -5 0 -2 -5 -3 -5 2 -1 -5 0 -1 -2 -3 1 0 -2 6 4 1 1 0 2 2 0 2 0 10 6 0 2 3 2 2 8 1 1 46 0.68 2.06 34 H -1 0 -2 -2 -1 -1 -2 0 4 -1 0 -1 0 0 -5 -1 2 1 2 1 6 6 2 3 1 3 2 6 11 3 8 4 2 4 0 4 11 2 6 12 0.15 2.09 35 V -2 -5 -3 -4 0 -3 -4 -4 -2 3 2 -4 0 0 -3 -3 -1 1 3 4 3 0 1 1 2 1 1 2 1 13 18 1 2 3 1 2 3 2 10 27 0.47 2.10 36 V -1 0 -4 0 3 0 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 0 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.07 2.12 37 T -2 -1 -1 -1 5 -1 -3 -3 0 2 -1 -3 0 1 -5 -1 3 3 3 0 3 3 3 4 10 3 2 2 2 10 6 2 2 5 0 5 15 4 9 6 0.28 2.06 38 C 0 -2 -1 -5 4 0 -2 -2 -5 0 2 -2 3 0 -2 -2 -2 -5 -1 2 9 2 3 0 9 4 3 3 0 5 22 2 6 4 2 3 3 0 2 14 0.26 2.01 39 T -1 -4 0 -2 1 -4 -4 -3 -1 -2 -3 -4 -1 -1 -2 1 6 -5 -4 -2 4 0 4 2 2 0 0 2 1 2 2 0 1 2 2 11 56 0 0 3 0.95 1.96 40 L -1 2 1 3 -2 -1 -1 0 0 -3 -1 -2 -2 -2 -1 1 0 0 -2 -2 5 12 6 18 1 2 3 7 2 2 8 2 1 2 4 11 6 1 2 3 0.19 1.93 41 G -1 -2 -1 -2 -1 -2 -3 6 -4 -5 -4 -2 -2 -5 -1 -1 -2 -5 -2 -3 5 2 2 2 1 2 2 64 0 1 2 2 1 0 3 5 2 0 2 2 1.16 1.83 42 E 0 -1 0 3 -1 0 5 -2 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -1 0 -2 0 -2 -3 7 4 4 13 2 3 35 4 1 2 2 3 1 2 3 7 3 2 1 2 0.50 1.77 43 E 2 2 0 -1 1 0 0 1 -1 -2 -1 1 3 -2 0 -1 -1 -4 0 -1 15 12 5 3 2 3 6 9 2 2 7 7 7 2 4 3 4 0 3 4 0.13 1.72 44 G 1 -2 0 -2 -2 -2 -2 5 -2 -3 -3 -2 -2 -1 -2 1 -2 -4 -1 -3 10 3 3 3 1 2 3 44 1 2 3 3 1 2 2 11 2 0 2 2 0.63 1.67 45 E -1 2 -1 1 -2 1 2 -2 3 -3 -3 0 -1 -1 0 1 1 -1 -1 -1 5 10 3 8 1 5 14 4 6 2 3 5 1 3 4 11 8 1 2 4 0.19 1.63 46 V 0 0 3 -2 -1 -1 -1 -1 0 1 -1 -1 -1 0 1 1 0 1 -2 1 8 5 11 3 1 3 4 5 2 8 5 3 2 4 7 9 5 2 1 11 0.10 1.71 47 I 0 0 -1 1 -2 -1 -1 1 0 1 2 -2 1 0 0 -1 -1 0 -1 -1 6 6 3 7 1 2 4 10 3 9 16 3 3 4 6 5 4 1 2 4 0.07 1.62 48 G 0 -1 2 1 -2 -1 -1 2 -1 -2 -2 -1 -1 -2 1 1 1 -1 0 -1 7 4 10 8 1 3 4 15 2 2 4 3 2 2 8 10 9 1 3 4 0.15 1.60 49 D 0 0 0 2 -1 0 1 0 -2 -2 -2 0 -2 -1 3 -1 -1 0 -1 -2 8 4 5 12 1 4 8 7 1 3 4 5 1 3 15 5 4 1 3 3 0.18 1.57 50 R 1 2 -1 0 -2 1 1 0 1 -2 -1 1 -1 -1 1 0 -1 2 0 -1 10 9 3 4 1 6 8 6 3 2 6 7 1 3 7 7 4 3 3 5 0.07 1.56 51 W -1 0 -2 0 -1 -1 -1 -2 1 0 2 0 0 0 -1 -1 -1 5 2 -1 6 5 2 6 1 2 4 4 4 4 17 6 3 4 4 6 5 6 6 4 0.11 1.52 52 A 2 0 -1 0 -1 0 0 0 0 -2 -1 0 -1 -1 2 0 -1 1 -2 -1 16 6 3 5 1 4 5 7 2 3 8 6 1 2 11 6 3 2 2 4 0.10 1.52 53 Q 0 1 0 1 0 1 2 1 3 -2 -2 0 1 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -2 6 8 4 6 2 6 11 10 7 2 5 6 4 2 4 5 4 1 2 3 0.10 1.57 54 L -1 1 -1 2 -1 -1 0 -2 -1 2 1 -1 0 0 0 0 -1 -1 -1 -1 4 7 2 12 1 2 6 4 2 11 14 4 2 4 5 7 3 1 2 4 0.08 1.83 55 T 0 1 -2 1 -1 -1 0 1 0 -2 -2 -1 -1 -2 2 0 1 0 -2 -1 8 8 2 9 1 2 7 9 2 2 5 4 2 2 11 8 7 2 1 5 0.09 1.94 56 A 1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 1 0 -1 -1 -1 -1 0 3 0 0 0 -1 -1 13 3 3 3 1 2 5 11 2 3 5 4 2 4 12 7 6 1 2 5 0.07 1.97 57 D 1 -1 -1 2 -1 0 2 0 1 -1 -1 -1 2 -1 -1 -1 -1 2 -1 -2 10 4 3 11 2 3 13 7 3 4 7 4 5 2 3 3 4 3 2 3 0.07 2.02 58 H 0 1 1 1 -1 0 0 -1 1 -1 -2 -1 -2 -2 1 0 2 -1 -1 0 7 6 8 8 1 3 6 5 4 4 5 3 1 2 6 7 11 1 2 6 0.04 2.11 59 A 1 3 -2 -1 -2 -1 -1 1 -1 -2 -2 -1 -2 -1 3 -1 -2 0 0 -1 11 16 2 4 1 3 5 9 2 2 4 4 1 2 13 4 3 1 4 4 0.16 2.15 60 D 0 0 -1 3 -5 0 4 -1 -1 -3 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -1 0 -2 9 5 2 17 0 4 25 4 1 2 3 3 1 1 3 3 2 1 4 3 0.34 2.17 61 Q 0 2 1 1 -2 2 3 0 0 -2 -2 0 -2 -3 -3 -1 0 -2 -2 -3 8 10 6 6 1 9 17 7 2 2 4 5 1 1 1 5 5 1 1 2 0.17 2.17 62 L -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 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