Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 T 3 -3 -2 -3 -3 -3 -3 -3 -4 -3 -3 -3 -3 -4 -3 2 6 -5 -4 0 22 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18 55 0 0 5 0.87 0.77 2 P -2 -3 -4 -4 -5 -3 -3 -4 -4 -5 -5 -3 -5 -6 8 -1 -1 -6 -5 -5 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 92 3 3 0 0 0 2.53 1.01 3 C -3 -6 -5 -6 11 -5 -6 -5 -5 -4 -4 -6 -4 -5 -5 -3 -3 -5 -5 -3 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3.09 1.01 4 G 3 -2 -3 -1 -4 -1 1 4 -4 -5 -5 -2 -4 -5 -4 2 -2 -5 -5 -3 28 2 0 2 0 2 11 36 0 0 0 1 0 0 0 17 1 0 0 1 0.74 1.01 5 D -1 -2 0 6 -5 0 0 -3 -2 -5 -2 -1 0 -5 -4 3 -2 -6 -4 -4 4 1 2 48 0 5 3 0 1 0 4 2 3 0 0 27 0 0 0 0 0.89 1.01 6 C -3 -6 -5 -6 11 -5 -6 -5 -5 -4 -4 -5 -4 -5 -5 -1 -3 -5 -5 -3 0 0 0 0 96 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 0 0 0 0 2.91 1.01 7 P -2 -3 -2 -4 -5 -1 -3 -3 -2 -5 -3 -1 -2 -6 8 -2 -3 -1 -5 -4 1 1 1 0 0 2 0 1 1 0 2 4 1 0 80 2 1 1 0 1 2.02 1.01 8 S -3 -3 4 5 -5 -1 0 1 1 -5 -6 1 -5 -5 -2 1 -2 -6 -2 -5 1 0 21 31 0 2 3 12 4 0 0 10 0 0 1 12 2 0 1 0 0.72 1.01 9 D 3 -1 4 2 -4 -1 -2 -3 6 -5 -5 -2 -4 -4 -4 1 -3 -5 -1 -4 28 2 19 13 0 2 0 0 23 0 0 1 0 0 0 11 0 0 2 0 0.80 1.06 10 C -3 -6 -5 -6 11 -5 -6 -5 -6 -4 -4 -6 -4 -5 -5 -3 -3 -5 -5 -3 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3.14 1.06 11 D -3 -1 -1 5 -6 -1 5 -4 -1 -4 -4 -1 -4 -5 -4 -1 -2 -6 -5 -1 1 3 1 40 0 1 38 0 1 0 1 2 0 0 0 3 1 0 0 7 1.02 1.06 12 N -3 -1 6 5 -5 -1 0 -3 -1 -5 -4 1 -5 -6 -4 -1 -2 -6 -5 -5 1 2 43 34 0 2 4 1 1 0 1 7 0 0 0 3 1 0 0 0 1.13 1.06 13 G -3 0 1 -2 -5 -1 -2 6 -4 -6 -6 3 -5 -6 -4 -2 -3 -5 -5 -4 0 5 7 1 0 1 1 59 0 0 0 23 0 0 0 2 1 0 0 1 1.12 1.06 14 L -4 -5 -6 -6 -4 -5 -5 -6 -5 0 6 -5 1 -2 -5 -5 -4 -4 -3 -1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 95 0 1 0 0 0 0 0 0 2 1.49 1.06 15 C -3 -6 -5 -6 11 -5 -6 -5 -5 -4 -4 -6 -4 -4 -5 -3 -3 -4 -1 -3 0 0 0 0 97 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 3.02 1.06 16 T -3 -4 1 -2 -4 -3 -3 -4 -4 -2 -3 -1 -3 -3 -4 2 7 -5 -4 -2 0 0 6 1 0 0 0 0 0 2 2 3 0 1 0 13 70 0 0 2 1.21 1.26 17 N -3 -3 8 0 -4 -1 -2 -3 0 -5 -5 -1 -4 -5 -4 1 -2 -5 -4 -4 1 0 75 2 0 2 2 1 2 0 1 3 0 0 0 8 1 0 0 1 1.54 1.18 18 P 0 -3 -2 -3 -4 -3 -3 -2 -3 -3 -4 -1 -4 -3 7 2 0 -4 0 -3 5 1 2 0 0 0 1 3 0 1 1 3 0 1 49 20 5 0 4 1 1.10 1.18 19 C -3 -5 -4 -5 11 -4 -5 -4 -5 -3 -3 -5 -3 -4 -4 -3 -3 -4 -4 0 1 0 0 0 85 0 1 1 0 0 1 1 0 0 0 1 1 0 0 7 2.64 1.18 20 T -2 -1 -2 0 -4 1 3 -2 -1 0 -1 2 0 -4 4 -1 0 -4 -1 -3 2 3 2 4 0 5 18 2 1 5 8 13 3 0 21 4 5 0 2 1 0.38 1.18 21 R -3 1 -3 -4 -4 -1 -2 -3 4 -3 -3 0 -3 2 -4 -3 -2 0 8 -1 1 8 0 0 0 2 2 2 8 1 1 6 0 6 0 2 2 1 52 4 1.13 1.18 22 E -1 0 1 -1 -4 1 3 -2 0 -1 -3 2 2 -2 -2 -1 -1 -4 3 1 6 4 8 2 0 6 23 3 2 3 1 11 5 1 2 3 3 0 9 9 0.28 1.18 23 N -4 -3 3 7 -5 -2 0 -3 -3 0 -4 -3 -4 -4 -4 -2 -3 -5 -2 -4 1 0 14 66 0 0 5 1 0 6 1 1 0 0 0 1 1 0 2 1 1.38 1.18 24 K -1 -1 0 0 -5 -1 2 -3 0 -3 1 4 1 -3 -3 0 2 -5 -2 -1 5 2 4 5 0 1 12 1 2 1 12 25 4 1 1 6 13 0 1 5 0.30 1.30 25 F -3 -2 -3 -5 -5 -3 -3 -4 0 -1 0 -4 -1 5 -5 -2 -4 5 7 -2 2 2 1 0 0 1 1 1 2 3 7 0 1 28 0 3 0 7 38 1 1.16 1.24 26 T 1 -3 -1 -1 -4 -2 -1 -1 -3 -1 -3 -1 -2 0 -2 4 2 -4 3 -2 12 1 3 3 0 1 4 4 0 3 1 3 1 4 2 33 15 0 10 2 0.43 1.30 27 N -4 -2 7 1 -5 0 -2 -1 -1 -4 -5 -2 -5 -5 -5 -1 1 1 -3 -5 0 1 67 5 0 4 1 3 1 1 1 1 0 0 0 3 9 2 1 0 1.34 1.30 28 C -3 -6 -5 -6 11 -6 -6 -5 -5 -4 -1 -6 -4 3 -6 -2 -4 -4 -3 -3 0 0 0 0 80 0 0 0 0 0 4 0 0 13 0 3 0 0 0 0 2.56 1.30 29 N 0 1 0 3 -5 1 1 -2 -1 -4 -4 3 -4 -4 3 1 -1 -1 -5 -4 8 7 3 15 0 6 7 2 1 1 2 17 0 0 15 12 3 1 0 1 0.43 1.38 30 T -1 1 0 2 -5 1 3 -4 0 -1 0 -1 -4 -5 -2 2 1 -6 -2 -3 5 7 4 12 0 6 17 1 2 5 9 3 0 0 2 17 9 0 1 1 0.30 1.38 31 M -3 -2 -5 -4 -4 1 -4 -6 -1 0 5 -3 4 1 -5 -5 -4 -4 0 -2 1 2 0 1 0 6 1 0 1 4 65 1 9 5 0 0 0 0 3 1 0.99 1.37 32 V -1 0 -2 -4 -5 -2 -2 -1 0 0 -1 6 -1 -3 -4 -3 0 -5 -2 2 5 4 1 0 0 1 1 4 3 5 6 47 2 1 0 0 5 0 2 13 0.64 1.34 33 Q 0 2 1 0 -4 2 0 -3 -1 -2 -3 4 0 -4 0 -1 0 -5 -4 -2 9 12 6 4 0 9 5 2 1 2 2 26 2 0 5 5 6 0 0 2 0.38 1.31 34 Q -1 0 0 -2 -4 3 0 -2 0 -1 0 2 2 -2 -4 1 1 -1 0 -1 5 4 4 2 0 16 5 3 2 3 8 12 5 2 0 10 10 1 3 5 0.21 1.34 35 S 1 -2 -2 -4 -1 -3 -4 -4 0 1 1 0 -2 3 -1 0 -2 5 3 0 10 1 2 1 1 1 1 1 3 8 14 6 1 13 3 7 3 7 10 7 0.31 1.46 36 S -1 -3 -1 -1 -5 -3 -3 5 -1 -3 -3 -1 -5 -5 0 1 1 -6 -5 -3 4 1 3 3 0 1 1 51 2 1 3 4 0 0 4 10 9 0 0 2 0.81 1.46 37 C -2 -6 -5 -6 11 -6 -6 -5 -6 -4 -4 -6 -4 -5 -5 -2 -4 -5 -5 -4 2 0 0 0 94 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 3.21 1.45 38 Q -2 -1 3 3 -5 3 2 -1 -1 -6 -5 2 -3 -6 -4 3 0 -6 -5 -5 2 2 13 13 0 12 14 5 1 0 1 12 1 0 0 20 4 0 0 0 0.57 1.47 39 D -2 -2 4 2 -5 -1 -2 -1 8 -3 -5 -3 -4 -1 -4 -1 1 -5 1 -4 2 1 17 11 0 3 1 5 36 2 0 0 0 3 0 3 10 0 5 1 0.96 1.46 40 N -2 -2 1 1 -5 0 2 -4 -2 -3 0 0 -2 -5 5 0 0 -6 -4 0 3 2 7 7 0 4 12 1 1 1 9 7 1 0 25 7 5 0 1 7 0.44 1.45 41 Y -2 -3 -3 -2 -4 1 -1 -3 -4 0 2 -4 4 2 -3 1 1 4 2 0 3 1 1 2 0 5 5 2 0 4 19 0 11 7 1 11 9 6 6 6 0.32 1.45 42 M -2 -1 -3 -4 -4 -4 -4 -6 -5 3 1 -2 4 -1 -1 -3 0 -5 -2 5 2 4 1 1 0 0 1 0 0 16 11 2 10 2 3 1 7 0 1 39 0.69 1.45 43 K -2 3 -2 -4 -6 4 0 -5 -2 -4 -3 6 0 -2 -2 -2 -2 -5 -2 -3 2 13 1 0 0 16 3 0 0 1 3 47 3 2 1 2 2 0 1 1 0.87 1.38 44 T -1 0 1 1 -5 3 2 -2 -3 -4 0 2 -2 -5 -3 2 1 -5 -3 -4 3 4 7 8 0 11 15 3 0 0 10 11 1 0 1 15 10 0 1 1 0.33 1.36 45 N -4 -1 4 0 -5 -1 -2 0 2 -4 -1 2 0 2 -5 0 -3 3 2 -2 0 2 24 6 0 2 2 7 4 1 5 15 2 9 0 6 0 4 8 2 0.45 1.36 46 C -3 -6 -6 -7 11 -6 -7 -6 -6 -2 -4 -6 -4 -5 -6 -4 -4 -5 -1 -4 0 0 0 0 96 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 3.23 1.39 47 P 0 1 -1 -1 -5 1 -2 -2 -1 -3 -2 5 -3 -2 4 -1 -3 -6 -5 -3 7 5 2 2 0 6 1 3 1 1 4 37 0 2 21 5 0 0 0 2 0.69 1.39 48 A 7 -4 -4 -5 -3 -4 -4 0 -5 -4 -4 -2 -4 -5 -4 -1 -2 -6 -5 -2 90 0 0 0 0 0 0 4 0 0 0 2 0 0 0 1 1 0 0 1 1.53 1.39 49 S -1 -4 -3 -3 -4 -3 -2 -4 -2 -3 -4 -3 -4 -3 -4 5 6 -5 -4 -3 3 0 0 0 0 0 2 0 1 1 1 0 0 1 0 43 49 0 0 0 1.23 1.39 50 C -3 -6 -6 -7 12 -6 -7 -5 -6 -4 -4 -6 -4 -5 -6 -4 -4 -5 -5 -4 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3.44 1.39 51 F -4 0 3 -4 0 2 -2 -3 -1 -2 2 2 -1 3 -5 -2 -1 -4 -1 -3 0 5 14 0 2 11 2 1 1 1 24 16 1 14 0 2 3 0 2 1 0.44 1.39 52 C -3 -3 -6 -6 11 -6 -7 -5 -6 -4 -4 -6 -4 -5 -6 -4 -4 -5 -5 -4 0 2 0 0 98 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3.31 1.34 53 Q -3 -1 0 1 -5 2 3 -2 2 -3 -3 1 -4 -5 1 0 4 -6 -4 -3 1 2 4 8 0 9 17 4 5 1 2 10 0 0 6 6 24 0 0 1 0.46 1.33 54 N -3 -3 5 2 -5 -3 -3 1 -2 -2 -5 -1 -4 -5 -3 0 5 -6 -5 -4 0 1 27 12 0 0 0 13 0 3 0 3 0 0 1 6 34 0 0 0 0.84 1.32 55 K -3 -1 -2 -1 -6 2 5 -3 -3 -6 -5 5 -4 -6 -4 -2 -3 -6 -5 -5 1 1 1 1 0 7 45 2 0 0 0 41 0 0 0 1 0 0 0 0 1.24 1.30 56 I -4 -6 -6 -6 -4 -5 -4 -7 -6 8 -1 -3 0 -3 -6 -5 -3 -5 -4 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 94 0 1 2 0 0 0 0 0 0 2 1.82 1.27 57 I -4 -5 -5 -5 -4 -4 -5 -6 -2 6 -1 -5 0 1 -5 -4 -3 -2 7 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49 0 0 2 3 0 0 0 0 43 4 1.31 0.93 K Lambda Standard Ungapped 0.1320 0.3212 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1861 0.3163 PSI Gapped 0.0569 0.2670