JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_6LKStYw.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet |||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|||||||E|E|E||||E|E|E|E|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|E|||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 9|8|3|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|5|1|6|7|8|8|8|7|6|4|0|7|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|6|2|3|6|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|6|4|2|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|5|2|6|7|8|8|8|7|6|6|2|7|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|6|2|3|6|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|6|5|6|6|5|5|1|5|6|6|6|7|6|6|5|3|1|2|2|7|8|8|6|3|6|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|5|2|5|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|6|5|0|1|2|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|7|4|4|8|7|5|8|9|9|9|9|9|9|9|8|7|1|3|4|1|1|2|4|6|7|7|6|3|4|4|3|4|6|4|5|8|8|2|3|4|1|3|4|7|7|7|1|2|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|5|1|6|7|8|8|8|7|7|1|1|3|8|9|9|9|9|9|9|8|7|4|2|1|1|5|5|1|0|5|5|1|2|3|3|5|6|6|7|7|7|7|7|7|7|7|6|5|2|0|1|3|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|7|4|4|8|8|6|6|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|6|2|3|6|7|7|7|7|7|7|7|7|6|4|0|8|9|9|9|9|9|8|8|5|2|5|7|8|8|8|8|8|9|9 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off -|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|B|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|-|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|B|-|-|B|-|B|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|-|B|B|B|-|-|B|B|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|B|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|B|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|B|-|B|B|B|-|B|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|B|B|-|-|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|B|B|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|B|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|-|B|B|-|-|-|B|B|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|-|B|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles |||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|||||||E|E|E||||E|E|E||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||H|H|E|E||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles ||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|E|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||E|E|E||||E|E|E|E||||E||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*| | 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