JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_oJDHxXD.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet |||||||||||||H|H||||||H|H|H|H|H|H||||E|E|E|||||E|E|E|E|E||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|E||||||||||||||E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||E|E|E|E|E|E|E|||H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E||||E|E||||||E|E|E|E|||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|E||||H|H|H|H|H|H|H|H|||||||E|E|E|H|||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||H|H|H|H|H|H||||H|H|H|H||||||||||H|H|H|| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 6|1|0|4|4|6|7|7|6|4|5|5|0|1|0|2|2|1|2|2|2|3|1|3|2|1|4|6|3|4|7|5|2|7|7|6|1|4|3|1|1|6|7|0|0|3|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|5|2|7|8|8|5|5|8|8|8|6|3|8|8|8|5|5|8|9|9|8|5|0|8|8|0|5|8|9|9|8|8|6|1|5|7|7|7|6|6|4|5|7|7|6|2|6|8|9|9|9|8|0|4|7|7|1|5|6|2|4|6|7|7|7|7|7|7|7|7|7|6|5|2|7|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|7|0|4|8|8|8|5|4|8|8|8|8|7|3|5|7|4|7|8|9|9|8|8|7|0|3|5|7|8|5|1|1|0|1|1|3|2|3|6|7|7|4|2|3|3|0|1|1|7|9|9|9|9|9|9|9|9|8|8|6|3|6|6|2|7|7|7|4|5|7|7|1|6|8|8|8|8|8|6|0|3|7|8|8|3|1|1|0|1|3|2|8|9|9|9|9|9|8|7|4|2|1|1|3|3|3|2|1|1|7|8|7|8|7|4|1|4|2|1|0|2|1|3|5|7|7|6|6|6|5|0|2|2|1|1|8 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off -|B|-|B|B|B|-|-|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|-|-|B|-|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|B|B|B|B|-|-|B|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|B|B|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|B|-|B|-|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|-|B|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|B|-|B|B|B|B|-|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|B|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|B|B|B|B|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|B|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles ||E||||||||||H|H|H||||||H|H|H|H|H|H||||E|E|E|||||E|E|E|E|E|||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E|E|||E|E|E|E|E|E|E|E||||||||||||||E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||E|E|E|E|E|E|E|||H|H|H|H|H|H|H|H|||||||E|E||||E|E||||||E|E|E|E|||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|E||||H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E|||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||H|H|H|H|||||||||H|H|H|H|| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles ||||||||||||||||||||||H|||||||E|E|E|||||E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|E|E||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E|E|E|||H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|||E|E|E||||||E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||E|E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||H|H|H|H|H|||H|H|H|H|H|H||||H|H|H|H|||||||||||E|E|| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree | |*| | | | | | | | | |*|*|*| | | | | |*|*| |*|*|*| | | | | | | | | | | | | | |*| | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | |*| | | | | | | |*| | | | | | | | | | | |*| | | | | | |*| | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | |*| | | | | | | | | |*|*| | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | |*| | | | | | | |*| | | | |*|*|*|*|*|*|*| | | | | | | | | |*|*| | | | | |*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*|*|*| |