Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 T 2 -4 -3 -4 -4 -3 -4 -4 -4 -4 -5 -3 -4 -5 4 3 5 -6 -5 -4 17 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21 23 39 0 0 0 1.05 1.31 2 L -3 -6 -6 -7 -1 -6 -6 -7 -6 4 2 -5 0 -3 -6 -5 -3 -6 -4 6 1 0 0 0 1 0 0 0 0 23 14 1 2 0 0 0 1 0 0 58 1.30 1.65 3 T -1 -1 1 3 -4 -1 3 -5 -2 -4 -5 0 -4 -5 -3 1 4 -6 -5 -2 4 3 6 14 0 1 19 0 1 0 0 6 0 0 1 11 29 0 0 3 0.62 1.69 4 V -3 -6 -6 -7 -4 -6 -6 -7 -7 5 1 -5 -1 -2 -6 -5 -3 -6 -4 6 1 0 0 0 0 0 0 0 0 28 10 1 0 1 0 0 1 0 0 59 1.42 1.70 5 Q -3 2 2 1 -6 3 2 -4 1 -4 -4 1 -3 -5 -4 1 3 -6 -3 -3 1 10 8 6 0 11 14 1 3 1 1 9 0 0 0 12 20 0 1 2 0.49 1.72 6 I -5 -6 -7 -7 -5 -6 -7 -7 -7 8 2 -6 -1 -2 -6 -6 -4 -6 -5 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 77 15 0 1 1 0 0 0 0 0 6 1.76 1.72 7 L 0 -4 2 -2 -2 -3 -5 -1 -2 -2 4 -5 4 3 -6 -3 -4 -4 4 -3 7 1 11 3 1 1 0 4 1 2 35 0 10 11 0 1 0 0 12 0 0.64 1.75 8 D -3 -4 1 2 -5 -3 -2 7 -3 -7 -7 -4 -6 -7 -5 -3 -4 -6 -6 -7 0 0 5 13 0 1 2 75 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1.66 1.75 9 K -4 5 -1 -2 -4 5 1 -5 1 -4 -5 4 -3 -6 -5 -2 -3 -6 -2 -3 1 33 3 2 0 22 7 0 2 1 0 20 1 0 0 2 1 0 2 2 0.97 1.76 10 E -1 -2 0 2 -6 2 4 -4 0 -3 -3 -1 -3 -5 -1 2 2 -6 -2 -1 4 2 4 9 0 8 24 1 2 2 2 4 0 0 4 14 14 0 1 5 0.43 1.76 11 Y -5 -5 -6 -7 -4 -3 -6 -7 0 -2 0 -5 -1 4 -7 -5 -3 -1 9 -4 0 0 0 0 0 1 0 0 2 2 8 0 1 14 0 0 2 0 70 0 2.01 1.76 12 C -2 4 0 -3 -2 1 -2 -4 0 -3 -2 1 -1 -5 1 1 3 -4 -4 -2 2 26 4 1 1 6 2 1 2 1 4 9 1 0 6 12 19 0 0 3 0.50 1.76 13 I -4 -6 -7 -7 -5 -6 -6 -7 -6 5 3 -6 4 1 -6 -6 -4 -5 -4 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31 28 0 8 6 0 0 0 0 0 27 1.15 1.76 14 N 4 1 2 -4 -4 -2 -3 0 -2 -1 -3 2 -1 -3 -2 1 0 -5 -2 -2 31 8 9 0 0 1 1 8 1 3 2 14 1 1 2 8 5 0 1 2 0.41 1.62 15 C -1 -5 -5 -5 10 -5 -5 1 -5 -2 -3 -5 -4 -5 -5 -1 1 -5 -4 2 5 1 0 0 54 0 0 9 0 1 1 0 0 0 0 4 7 0 1 14 1.66 1.66 16 P -1 -1 -1 1 -6 0 1 1 -3 -5 -6 -1 -5 -6 6 1 0 -6 -5 -5 5 4 2 9 0 4 9 12 1 0 0 3 0 0 35 9 6 0 0 0 0.77 1.74 17 D 1 -3 -1 4 -6 -1 3 -4 -3 -3 -4 -1 -3 -5 4 -1 -1 -6 -3 -1 14 1 2 20 0 2 22 0 0 2 1 4 1 0 17 5 4 0 1 4 0.59 1.81 18 D -2 -4 -1 2 -6 -2 4 5 0 -6 -6 -2 -4 -6 -1 0 -3 -6 -6 -5 3 0 3 12 0 1 30 37 2 0 0 2 0 0 3 6 1 0 0 0 0.91 1.80 19 E -3 -2 0 1 -6 5 6 -3 0 -6 -6 -1 -5 -6 -3 1 -2 -6 -5 -6 2 1 4 7 0 24 43 2 2 0 0 2 0 0 1 9 2 0 0 0 1.03 1.78 20 R -2 2 -3 -2 -4 2 5 -4 -1 -3 -4 1 -4 -5 1 -2 -3 -6 -3 -2 4 10 0 1 0 7 42 1 1 2 2 8 0 0 7 3 1 0 1 3 0.69 1.76 21 A 2 -1 -1 3 -5 2 4 -2 0 -4 -4 -1 -2 -5 0 0 -2 -5 -4 -3 17 3 3 14 0 7 24 3 2 1 1 3 1 0 4 6 2 0 0 2 0.40 1.74 22 N 1 2 0 -1 -5 -1 -1 -2 6 -4 -3 0 -3 -2 -4 0 0 -3 4 -3 13 10 5 4 0 2 4 3 18 1 3 5 1 1 0 5 6 0 12 1 0.41 1.81 23 L -4 -5 -6 -7 -5 -5 -6 -7 -6 3 5 -5 3 -3 -4 -5 -3 -5 -3 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 13 62 1 6 0 1 0 1 0 1 10 1.12 1.79 24 E -3 4 -2 -4 -4 2 1 -5 1 1 2 1 1 -3 -5 -2 -1 -6 -2 -2 2 18 2 1 0 10 8 0 4 9 21 7 3 1 0 2 3 0 1 3 0.34 1.80 25 S 1 2 0 1 -3 3 3 -2 1 -4 -3 1 -1 -5 -5 1 -3 -6 -3 -4 14 9 3 6 0 11 17 3 4 1 3 9 2 0 0 9 1 0 1 1 0.30 1.82 26 A 4 -5 -5 -6 -1 -5 -5 -4 -6 0 2 -5 -1 -4 -5 0 -2 -6 -3 3 40 0 0 0 1 0 0 1 0 5 20 0 1 0 0 7 1 0 1 18 0.70 1.82 27 A 6 -5 -5 -5 -1 -4 -3 -1 -5 -2 -4 -4 -3 -5 -5 -2 -2 -6 -5 2 65 0 0 0 1 0 1 5 0 1 0 0 0 0 0 2 1 0 0 15 1.07 1.82 28 R 2 3 0 1 -5 2 2 -2 0 -4 -3 1 -3 -5 -5 1 -2 -6 -4 -4 16 15 5 7 0 9 11 3 2 1 2 9 0 0 0 10 3 0 0 1 0.31 1.87 29 Y -4 1 -2 -1 -1 1 -1 -5 2 -1 2 -1 4 1 -6 -2 -3 -1 5 -2 1 7 2 3 1 7 5 1 4 4 16 3 11 6 0 3 1 1 19 2 0.39 1.86 30 L -3 -6 -7 -7 -5 -6 -6 -7 -6 1 4 -6 -1 1 -6 -6 -4 -5 -3 5 1 0 0 0 0 0 0 0 0 6 42 0 1 6 0 0 0 0 1 36 1.04 1.88 31 D -4 -3 4 7 -7 -1 1 -3 -1 -6 -4 -2 -6 -7 -5 -2 -3 -7 -6 -6 1 1 19 54 0 2 8 1 1 0 2 2 0 0 0 2 1 0 0 0 1.28 1.92 32 G 1 2 0 2 -6 3 3 0 0 -4 -4 1 -3 -6 -5 -1 -1 -3 -5 -4 10 9 3 11 0 11 20 6 2 1 1 8 1 0 0 5 4 0 0 1 0.36 1.92 33 K -1 4 -2 -3 -4 2 0 -5 1 -4 -3 5 -2 -4 -5 -2 -3 -2 0 -4 6 21 1 1 0 7 6 0 3 1 3 34 1 1 0 2 1 1 4 1 0.66 1.89 34 M -1 -5 -6 -6 -1 -5 -6 -6 -3 3 2 -5 8 -1 -6 -4 -2 -1 -2 1 4 0 0 0 1 0 0 0 1 16 18 0 38 2 0 1 2 1 1 9 1.06 1.89 35 R 0 4 0 1 0 2 0 -2 0 -3 -3 2 -2 -5 -4 -1 0 -6 -4 -3 8 24 4 7 2 8 5 3 2 1 3 11 1 0 0 4 6 0 0 2 0.31 1.90 36 E 0 1 -1 2 -6 2 5 -1 1 -4 -4 0 -2 -6 -5 0 -2 -6 -5 -3 8 6 2 9 0 7 33 5 3 1 1 6 1 0 0 6 2 0 0 2 0.48 1.89 37 I -2 -6 -3 -6 -5 -4 -6 -6 -6 5 3 -5 3 0 -3 -4 0 -5 -1 2 3 0 1 0 0 1 0 0 0 36 21 0 7 3 2 1 5 0 2 11 0.75 1.89 38 R 1 5 -2 -3 -6 1 -2 -2 1 -4 -3 4 -2 -6 -4 1 -2 -6 -4 -3 11 28 1 1 0 5 2 3 3 1 3 21 1 0 1 10 2 0 0 2 0.55 1.89 39 S 1 1 -1 2 -4 3 2 0 -1 -4 -4 2 -3 -3 -5 1 -2 -6 -4 -3 10 8 3 11 0 11 14 8 1 1 2 10 0 1 0 9 2 0 1 2 0.26 1.89 40 S 1 2 1 -2 -5 2 -2 0 0 -4 -4 3 -1 -5 -4 2 -1 -6 -3 -3 12 9 6 2 0 8 2 8 2 1 2 18 1 0 1 16 4 0 1 2 0.29 1.89 41 G 0 -3 3 -3 -5 -3 -5 3 -1 -3 -3 -2 -1 1 -2 1 2 -5 1 -2 8 1 15 1 0 1 0 20 2 2 3 2 2 7 2 9 13 0 4 3 0.33 2.02 42 K -2 2 1 -3 -6 -2 -2 2 0 -4 -4 4 -2 -4 4 0 -1 -6 -5 -3 3 11 6 1 0 2 1 15 2 1 1 21 1 1 17 5 3 0 0 2 0.48 2.01 43 V 0 1 1 -3 -2 -1 -1 -2 -1 1 -1 -1 0 -3 -3 0 1 -6 -1 3 7 8 6 2 1 3 4 3 2 9 5 4 2 1 1 8 9 0 2 20 0.14 2.02 44 I -1 0 -1 -4 -5 0 -5 -3 1 2 3 -1 1 -1 -2 -1 0 -5 0 1 5 4 3 1 0 4 0 3 4 10 25 5 4 2 2 5 6 0 3 8 0.19 2.01 45 G -1 -3 2 2 -5 -1 -1 3 -1 -2 -4 -2 -1 -6 0 3 0 -6 -6 -4 5 1 8 12 0 3 3 23 1 3 1 2 2 0 5 19 5 0 0 1 0.40 2.01 46 A -1 1 1 1 -5 -2 1 -2 -1 -1 -1 -1 0 -1 1 0 3 -6 -2 0 5 7 7 7 0 2 9 3 2 3 6 4 2 3 7 6 15 0 1 6 0.09 1.98 47 D -1 -2 0 3 -6 2 4 -2 -1 -4 -2 -3 -2 -3 -3 0 1 -6 -2 -2 5 2 4 16 0 8 28 3 2 1 4 1 1 1 1 8 7 0 1 4 0.42 1.90 48 R -3 6 -1 0 -2 3 0 -4 -1 -6 -4 3 0 -6 -5 -1 -2 -1 -5 -4 2 37 3 6 1 13 6 1 2 0 1 17 3 0 0 4 3 1 0 1 0.81 1.89 49 V 0 -5 -6 -6 -1 -3 -5 -6 -2 5 4 -4 2 -2 -6 -3 -1 -5 -2 3 7 0 0 0 1 2 0 0 1 27 32 1 5 1 0 2 4 0 1 15 0.77 1.89 50 A 5 -5 -5 -5 -4 -3 -3 -3 -2 0 2 -4 0 -2 -5 -1 -1 -5 -5 -1 53 0 0 0 0 1 1 1 1 5 22 0 3 2 0 3 4 0 0 4 0.85 1.83 51 V -2 -6 -6 -6 -4 -5 -6 -6 -6 4 1 -5 1 -1 -4 -3 -1 -6 -2 6 3 0 0 0 0 0 0 0 0 20 13 0 2 3 1 2 4 0 1 50 1.02 1.71 52 M -3 -5 -3 -7 -5 -5 -6 -7 -6 2 4 -5 8 0 -6 -5 -2 0 -4 -1 1 0 1 0 0 0 0 0 0 10 38 0 40 3 0 0 2 1 0 2 1.38 1.74 53 A 5 -5 -5 -5 1 -4 -4 -2 -5 -1 -3 -4 -1 -5 -4 -1 3 -6 -5 2 56 0 0 0 3 0 0 2 0 3 1 0 1 0 0 3 17 0 0 14 1.00 1.68 54 A 6 -5 -4 -5 2 -4 -3 1 -5 -4 -3 -4 -4 -5 -4 0 -2 -6 -5 -2 73 0 0 0 5 0 1 10 0 0 2 0 0 0 0 6 1 0 0 2 1.23 1.53 55 L -4 -5 -6 -7 -4 -5 -6 -7 -6 2 6 -5 1 -1 -6 -5 -4 -5 -2 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10 75 0 3 2 0 0 0 0 1 8 1.33 1.53 56 N -3 -3 7 0 -5 2 -1 -3 0 -4 -3 -2 2 -3 -5 -1 0 -6 -4 -3 1 1 58 4 0 8 3 1 2 1 3 2 6 1 0 4 5 0 0 1 1.14 1.55 57 I -2 -5 -6 -6 -1 -4 -6 -6 -5 5 4 -5 3 1 -6 -4 -1 -5 -1 2 3 0 0 0 1 1 0 0 0 35 33 0 6 5 0 1 3 0 2 9 0.89 1.52 58 T 5 -4 -3 -5 5 -3 -4 -1 -5 -1 -3 -4 2 -4 -4 1 1 -5 -3 0 47 1 1 0 13 1 0 4 0 3 2 0 5 0 0 9 8 0 1 5 0.79 1.55 59 H -2 -3 1 5 -6 -1 0 -3 6 -5 -3 -3 -5 0 -5 0 -2 -2 3 -3 4 1 6 31 0 2 4 1 21 0 3 0 0 4 0 6 2 0 11 2 0.84 1.58 60 D -3 -2 -1 4 -7 1 7 -4 -2 -6 -5 -1 -5 -7 -4 -3 -3 -6 -5 -6 2 2 3 20 0 4 62 1 0 0 1 3 0 0 0 1 0 0 0 0 1.34 1.58 61 L -3 -3 -3 -6 -3 -1 -5 -5 -1 -1 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