Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 S 1 -4 1 -3 -4 -3 -3 -4 -4 -6 -6 -3 -5 -6 -4 7 0 -6 -5 -5 8 0 6 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 83 3 0 0 0 1.58 1.68 2 G 3 -5 1 1 -3 -3 -3 4 -3 -5 -1 -4 -2 -6 -4 3 -3 -6 -5 -2 24 0 7 9 0 0 2 27 0 0 6 0 1 0 1 18 1 0 0 3 0.63 1.85 3 G 1 -4 -1 -2 5 -3 -4 5 1 -6 -6 -3 -4 -6 0 2 -3 -6 -6 -5 9 1 3 2 12 1 1 46 3 0 0 1 0 0 5 15 1 0 0 1 0.99 1.91 4 G -2 -1 1 4 -4 -1 0 5 -2 -7 -6 -2 -6 -4 -2 1 -3 -4 -6 -4 3 3 6 22 0 2 7 37 1 0 0 2 0 1 2 11 1 0 0 2 0.79 1.97 5 G 1 -3 0 -1 0 -1 0 3 -4 -4 -4 -3 -2 3 -2 1 0 -5 1 -3 11 1 5 4 2 3 6 25 0 0 2 1 1 14 2 11 6 0 4 2 0.38 1.99 6 G -1 -3 -1 3 -2 -1 -1 5 -1 -5 -4 -2 -3 -5 -2 1 -2 -4 -4 -4 4 1 2 18 1 3 5 43 1 1 2 3 1 1 2 10 2 0 1 1 0.76 1.98 7 I -1 1 3 -1 -2 0 0 -3 3 0 -1 0 -1 -2 0 1 -1 -6 0 1 5 7 12 4 1 3 7 2 7 6 5 6 2 2 4 10 3 0 3 12 0.17 1.95 8 L 0 -3 -2 -1 -3 -1 -2 -2 0 1 1 -2 1 -1 3 -1 1 -3 -2 3 7 1 2 3 1 3 2 3 2 7 15 2 3 3 14 5 9 0 1 17 0.25 1.96 9 E -2 -1 0 3 -3 2 5 -2 0 -5 -5 1 -4 -4 -1 1 -2 -6 -3 -3 3 3 5 14 1 9 34 3 2 1 1 9 0 1 3 8 2 0 1 2 0.64 2.02 10 K -1 2 0 -1 -3 2 2 -3 0 -1 -3 3 -2 -4 -1 -1 -1 -2 -3 3 4 9 5 3 1 7 11 2 2 3 1 18 1 1 4 4 4 1 1 18 0.31 2.04 11 L -3 4 -4 -6 3 1 -4 -3 -3 0 3 -1 3 1 -4 -2 0 -2 0 0 1 19 0 0 6 6 1 2 0 4 26 3 6 5 1 3 6 1 3 6 0.45 2.07 12 G -2 -5 -3 -4 -4 -4 -4 7 -4 -7 -6 -4 -5 -5 -3 -2 -4 -6 -4 -6 3 1 0 1 0 1 1 86 0 0 0 1 0 0 1 3 0 0 1 0 1.95 2.12 13 D -2 3 -1 2 -2 2 5 -5 -2 -4 -5 1 -1 -5 -5 0 0 -3 -4 -4 3 14 2 9 1 9 33 0 1 1 1 8 2 1 0 8 6 0 1 1 0.67 2.13 14 I -4 -5 -5 -5 -3 -6 -6 -5 -5 6 4 -5 0 -3 -5 -4 -4 -6 -5 3 1 0 1 1 0 0 0 1 0 40 30 1 2 0 1 1 0 0 0 21 1.18 2.13 15 C -3 0 -1 -3 3 4 1 -5 4 -2 2 1 0 -2 -4 -2 0 1 -1 -3 1 4 3 1 5 19 8 1 9 2 17 9 2 2 1 3 5 2 2 2 0.42 2.13 16 F -4 -4 -4 -6 -3 -4 -5 -5 -4 3 4 -5 1 5 -5 -3 -3 -5 -1 3 1 1 1 0 1 1 1 1 0 14 36 1 2 19 0 2 1 0 2 17 0.87 2.12 17 S 1 0 -2 -2 0 -1 -1 0 -1 -4 -4 1 -4 -4 -3 5 2 -4 -2 -4 9 5 1 2 2 3 3 8 1 1 2 7 0 1 1 41 10 0 2 1 0.57 2.14 18 L 0 -5 -5 -5 -1 -5 -5 -5 -4 3 5 -5 2 -1 -4 -4 -1 -3 -4 2 9 0 0 0 2 0 1 1 1 14 48 1 4 3 1 1 3 0 0 11 0.81 2.11 19 R -2 3 -1 0 4 2 2 -3 0 -4 -3 1 -2 -3 -4 2 -1 3 -1 -4 3 16 3 4 8 8 12 2 2 1 3 9 1 1 1 15 4 3 2 1 0.38 2.08 20 Y -3 -4 -2 -3 1 -3 1 -5 2 -2 -2 -3 -3 2 -5 -3 -4 0 8 -2 2 1 2 1 3 1 9 1 5 2 3 1 1 8 1 2 1 1 54 2 1.35 2.05 21 V -2 -2 2 2 0 1 0 -4 0 0 2 -2 0 -3 -3 0 -2 -3 -2 1 3 2 10 12 2 6 5 1 2 4 20 2 2 1 1 9 2 0 2 11 0.23 2.04 22 P 0 -1 -2 0 -1 0 0 -3 -1 -2 -3 0 -2 0 6 1 -1 -5 -1 -2 7 3 2 4 1 4 6 2 2 3 2 5 1 4 33 11 3 0 2 3 0.54 2.03 23 T -1 -1 2 1 -2 2 1 -1 -1 -2 -2 1 -3 -4 1 1 2 -3 -3 -1 5 4 8 6 1 10 7 4 2 2 4 8 1 1 7 9 14 0 1 5 0.20 2.09 24 A 2 2 1 -1 2 0 0 -2 -2 -1 -1 0 0 -4 -3 1 2 -3 -4 -2 16 10 7 3 4 5 7 3 1 3 5 5 2 1 1 11 11 0 0 3 0.21 2.10 25 G -1 2 2 -2 1 2 0 4 1 -5 -5 0 -3 -4 -4 -1 -3 -1 -1 -4 4 9 10 2 3 10 7 33 3 0 1 5 1 1 1 5 2 1 2 1 0.55 2.10 26 K -2 4 -2 -1 -1 1 1 -3 0 0 -1 3 -2 -2 -4 -1 1 -2 -1 0 3 21 2 4 2 7 8 2 2 7 6 14 1 2 1 4 7 1 2 7 0.32 2.09 27 L -3 -5 -5 -5 -3 -6 -4 -6 -4 2 6 -6 1 0 -5 -4 -4 -3 -3 1 2 0 1 1 0 0 1 0 0 8 68 0 2 4 1 1 1 0 1 9 1.19 2.11 28 T -2 3 0 -3 -1 0 1 -4 2 1 -1 0 -1 0 -5 0 3 -2 -1 1 2 13 4 1 1 4 8 1 5 7 7 5 1 4 0 8 16 1 2 9 0.24 2.12 29 V -2 -5 -6 -5 0 -3 -4 -5 -6 4 0 -5 -1 -2 -6 -4 -3 -6 -3 6 2 1 0 1 2 2 1 1 0 19 8 1 1 1 0 1 1 0 1 58 1.20 2.12 30 V -3 2 0 -2 0 0 1 -1 3 -1 -2 1 2 -1 -4 -1 3 -2 1 1 1 10 4 2 2 3 8 5 6 3 5 8 5 3 1 4 15 1 4 10 0.20 2.16 31 I -3 -5 -4 -5 -3 -3 -5 -7 -6 5 1 -5 0 -3 -4 -4 -3 -6 -3 6 2 1 1 1 1 1 1 0 0 27 11 1 1 1 1 1 1 0 1 50 1.18 2.15 32 L -3 -2 -2 -4 -1 -2 -2 -4 3 4 3 0 3 -1 -4 -2 -3 -3 -1 3 1 3 2 1 1 2 3 1 6 22 22 6 6 2 1 3 1 0 2 16 0.49 2.17 33 E -1 3 -2 -2 0 2 3 -1 3 -4 -5 3 -3 -5 -5 1 -3 -3 -3 -5 6 16 2 2 2 8 16 5 6 1 1 19 1 1 0 11 1 1 1 1 0.52 2.17 34 A 6 -4 -5 -4 5 -5 -5 2 -3 -1 -3 -5 -1 -3 -4 -3 -3 -2 -2 -1 53 1 0 1 10 0 0 16 1 4 3 0 2 1 1 1 1 1 1 3 1.00 2.17 35 K -2 5 -1 -2 -2 2 0 -4 0 -1 -3 4 -2 -3 -5 0 0 -2 -3 -2 3 29 3 2 1 8 6 1 3 4 3 21 1 1 0 6 5 1 1 3 0.61 2.21 36 N -3 -2 5 3 -2 1 -1 3 2 -2 -4 -2 -3 -4 -4 -1 -2 -7 -3 -4 2 2 29 16 1 5 3 20 4 2 2 3 1 1 1 3 2 0 1 1 0.66 2.23 37 L -4 -4 -4 -7 -1 -6 -6 -4 -2 0 6 -4 0 0 -4 -4 -3 0 -2 -1 1 1 1 0 1 0 0 1 1 4 74 1 2 3 1 1 1 1 1 3 1.26 2.22 38 K 1 1 -2 -2 -1 1 -2 -3 1 0 -1 2 0 -2 4 -1 -1 -1 -2 -1 11 8 2 2 1 6 2 2 3 5 5 10 3 2 19 4 3 1 2 5 0.24 2.25 39 K 1 -1 0 -1 0 -1 -2 -1 -1 -1 -2 1 -1 -2 3 0 -1 2 0 -1 14 3 5 3 2 2 2 5 2 3 5 9 1 2 16 8 3 2 3 4 0.16 2.24 40 M 0 2 -1 -2 2 0 -2 -2 0 -1 0 2 3 0 0 0 0 1 -1 -1 8 9 3 2 4 5 3 3 2 4 8 10 8 3 4 6 5 2 2 5 0.08 2.21 41 D -2 -1 1 5 1 0 1 -1 1 -2 -3 -1 0 -1 -1 0 -1 -6 -1 -2 4 3 5 31 3 4 7 4 3 3 3 4 3 3 3 6 4 0 3 3 0.37 2.17 42 V -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 43 G -1 -1 1 -1 1 -1 -1 0 1 -1 -1 2 1 0 1 0 0 2 0 -2 4 4 7 4 3 3 3 9 3 3 6 10 3 4 8 8 5 3 3 3 0.05 2.22 44 G -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 45 L -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 46 S -1 0 0 -2 3 0 0 -1 1 -1 -2 -1 1 0 1 1 -1 3 0 -1 6 5 5 3 6 4 6 4 4 4 4 3 4 4 7 10 4 3 3 5 0.05 2.07 47 D -1 0 1 0 3 1 0 -1 2 -4 -4 0 2 1 0 0 0 -5 1 -1 6 6 5 6 5 5 6 6 5 0 0 6 5 5 6 6 6 0 5 6 0.10 1.89 48 P -1 -3 -3 -3 2 -3 -3 -3 -1 -2 -3 -3 0 -2 7 -1 -1 -1 -3 0 5 1 1 1 5 1 2 3 2 3 3 2 3 2 45 5 4 1 1 7 0.89 1.97 49 Y -2 -3 -3 -3 1 -2 -3 -6 0 -2 -2 -2 -1 4 -6 -2 -3 1 8 -3 3 2 2 1 3 2 1 0 1 2 4 3 2 15 0 3 1 1 46 2 1.11 1.89 50 V -1 -2 -5 -6 5 -2 -5 -3 -5 1 -1 -5 0 0 -2 -2 -1 -5 -1 5 6 2 0 0 12 2 0 3 0 6 5 0 2 4 2 2 3 0 2 42 0.67 1.83 51 K -2 2 -1 -2 0 0 -1 -2 0 -1 -3 5 0 -1 0 -2 -1 2 -1 0 3 9 3 3 2 3 4 3 2 4 3 32 2 2 4 3 3 2 2 6 0.33 1.91 52 I 0 -4 -4 -5 3 -4 -4 0 -4 1 -1 0 3 1 1 0 0 5 2 0 7 0 0 0 6 0 0 7 0 7 7 7 6 6 7 7 7 6 6 7 0.20 1.56 53 H -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 54 L -1 0 -4 0 3 1 0 -1 2 0 -1 0 2 1 -5 -1 0 4 1 -1 5 5 0 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0 5 5 5 5 5 0.10 2.01 55 M -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 56 Q -2 -1 1 -1 1 0 -1 1 2 -2 -2 0 0 -1 3 -1 -1 2 0 -2 3 4 6 4 3 5 5 11 4 3 4 7 3 3 14 5 5 2 4 3 0.12 2.19 57 N -1 -1 3 2 1 0 0 1 2 -2 -2 -1 0 -1 -1 0 -1 2 0 -1 6 3 12 10 3 4 6 9 4 3 4 4 3 3 3 6 4 2 3 4 0.08 2.12 58 G -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 59 K -2 2 0 0 0 1 0 0 1 -2 -3 3 -1 -2 -1 1 -1 1 0 -2 4 10 4 5 2 6 5 8 3 2 3 14 2 2 4 9 4 2 3 3 0.10 2.20 60 R -2 1 0 2 1 1 0 -1 1 -2 -2 3 0 0 -1 -1 -1 2 0 -2 3 7 4 10 3 5 6 5 4 3 4 14 2 4 3 5 4 3 3 3 0.10 2.22 61 L -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 62 K -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 63 K -2 2 -1 -1 1 -1 -1 -2 0 -3 -3 5 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