Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 K -4 2 -3 -3 -7 2 5 -5 -3 -6 -6 6 -5 -6 -4 -3 -4 -6 -5 -6 0 11 0 0 0 8 34 0 0 0 0 47 0 0 0 0 0 0 0 0 1.34 1.55 2 D -3 -4 2 7 -6 -2 1 -4 -1 -6 -7 -3 -6 -7 -4 3 -3 -7 -6 -6 1 0 7 56 0 1 7 0 2 0 0 1 0 0 0 25 1 0 0 0 1.40 1.74 3 E 0 -1 -1 2 -4 1 4 -4 -1 -5 -5 2 -4 -5 4 0 -3 -6 -4 -4 6 4 2 13 0 4 26 0 2 0 1 10 0 0 20 7 1 0 0 1 0.67 1.76 4 E -1 -1 -2 4 -5 0 6 -4 -2 -1 -4 -1 -2 -5 -3 -1 -3 -6 -4 -4 4 4 1 22 0 2 49 1 1 4 1 2 1 0 1 3 1 0 0 1 0.98 1.76 5 G 2 -1 -2 -4 -4 -3 -3 6 -3 -5 -5 -3 -4 -3 -2 -1 -3 -3 -1 -4 17 4 1 1 0 1 1 60 0 0 1 1 0 1 2 3 1 0 2 1 1.13 1.76 6 L -2 3 0 -4 -4 0 -2 -5 0 0 3 3 2 -2 -4 -3 -3 1 -1 -1 3 14 4 0 0 4 2 1 2 4 31 16 6 1 0 2 1 2 3 4 0.46 1.74 7 E 0 3 0 1 -6 2 3 -3 0 -4 -4 2 -1 -4 -3 0 -1 -1 -2 -4 9 16 4 8 0 7 21 1 2 1 2 13 2 1 1 6 3 1 1 1 0.45 1.72 8 I 2 -3 -4 -5 -1 -4 -5 -5 -4 4 0 -3 0 -3 -4 -2 2 -6 -4 4 15 2 1 0 1 0 0 0 0 23 6 2 2 1 0 2 12 0 0 33 0.71 1.71 9 I -2 -3 -4 -6 -3 -4 -6 -6 -2 2 2 -4 2 5 -5 -4 -4 -1 6 -2 4 1 1 0 0 1 0 0 1 13 19 1 5 19 0 0 1 0 32 2 1.01 1.68 10 R -4 6 1 -5 -2 1 -1 -5 0 -4 -4 -1 -1 -2 -6 -3 -2 8 -2 -3 1 42 7 0 1 6 4 1 2 1 1 2 1 1 0 1 3 23 0 3 1.26 1.69 11 H -3 4 -1 -4 -4 0 -2 -5 9 -6 -5 -1 -5 -5 -5 -3 -3 -6 -1 -6 2 26 3 1 0 3 1 1 57 0 1 3 0 0 0 1 1 0 2 0 1.84 1.72 12 S -2 -2 -2 -1 -4 -4 -4 -1 -3 -5 -4 -4 -3 -6 -4 6 4 -6 -5 -4 1 2 1 3 0 0 0 3 1 0 1 0 1 0 0 59 28 0 0 1 1.24 1.74 13 C 4 -5 -5 -5 5 -4 -5 -2 -5 -2 2 -5 1 -3 -5 2 1 -6 -3 0 34 0 0 0 10 0 0 2 0 2 17 0 3 1 0 17 8 0 1 5 0.68 1.78 14 A 5 -2 -3 -4 1 -2 -3 -3 -3 -1 -3 -3 -2 -1 -4 2 4 -3 -3 -2 43 2 1 1 3 1 1 2 0 3 2 1 1 2 0 12 22 0 0 3 0.73 1.79 15 H -4 -3 -3 -5 -2 -2 -3 -6 10 -3 -1 -4 1 4 -6 -4 -5 -5 0 -4 1 1 1 0 1 2 1 0 61 1 7 0 4 16 0 1 0 0 2 1 1.84 1.77 16 L -3 -6 -6 -6 -1 -5 -6 -6 -6 4 4 -6 2 -2 -6 -4 -3 -5 -3 4 1 0 0 0 1 0 0 0 0 22 39 0 4 1 0 1 1 0 1 27 1.02 1.79 17 L -3 -5 -6 -7 -2 -5 -6 -7 -6 -1 6 -6 6 0 -6 -4 -2 -5 -2 -1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 2 64 0 21 4 0 1 2 0 1 2 1.36 1.85 18 G 3 -3 -1 -2 0 0 -2 3 5 -1 -1 -3 -2 -3 -5 -1 -3 -6 -1 -1 27 1 3 2 2 5 2 23 12 4 6 1 1 1 0 4 1 0 2 4 0.53 1.92 19 H 2 -1 -2 -3 0 4 3 -3 2 -3 -3 2 2 -3 -5 -2 -2 -1 0 -3 17 3 1 1 2 20 16 1 4 1 3 14 5 1 0 2 2 1 4 2 0.50 1.89 20 A 7 -5 -5 -5 -1 -3 -3 -2 -5 -3 -3 -4 -1 -5 -4 -1 -2 -6 -5 0 80 0 0 0 1 1 1 1 0 1 1 0 1 0 0 3 2 0 0 5 1.42 1.88 21 I 0 -4 -6 -6 3 -3 -6 -4 -6 2 3 -4 3 0 -6 -3 -2 -5 -2 4 7 1 0 0 5 1 0 1 0 12 28 1 7 3 0 1 2 0 1 29 0.72 1.96 22 K -3 3 -1 -2 -2 3 4 -3 2 -3 -2 4 -1 -3 -5 -2 -3 -1 1 -3 2 13 2 1 1 13 22 2 4 1 4 21 2 1 0 2 1 1 5 2 0.57 2.04 23 Q -2 3 1 2 -1 3 3 -3 1 -3 -4 1 -1 -3 -5 -1 -1 -5 -2 -3 4 17 6 12 2 12 16 2 4 1 2 8 2 1 0 4 4 0 2 2 0.44 1.96 24 L -3 -2 -3 -4 0 -2 -2 -4 1 2 5 -2 1 -1 -6 -3 -2 -5 -1 1 2 3 1 1 2 2 3 1 3 10 48 2 3 2 0 2 2 0 2 10 0.64 2.01 25 W -3 -2 -1 -3 -1 -3 -3 2 0 -3 -2 -3 -1 6 -4 -3 -3 3 6 -2 2 2 3 2 1 1 2 18 2 2 3 2 1 27 1 1 1 4 24 2 0.86 2.01 26 P -1 -1 -1 0 1 0 -1 0 1 -2 -3 0 0 -1 5 -1 0 2 0 -2 5 3 3 5 3 4 4 6 3 3 3 5 2 3 31 4 6 3 3 3 0.48 2.00 27 H -2 -1 1 1 1 0 0 2 7 -2 -3 -1 0 -5 -1 -1 -1 -5 0 -5 4 3 5 8 3 3 6 17 24 3 3 4 3 0 3 4 3 0 3 0 0.55 1.97 28 T -1 0 0 0 2 0 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.09 2.12 29 K -2 2 -1 -2 -1 2 0 -3 4 0 -1 4 -1 -2 -2 -2 -1 0 -1 0 3 8 3 2 1 10 5 2 9 4 7 24 2 2 2 3 3 1 3 8 0.34 2.09 30 M -1 -2 -2 -5 0 2 -3 -6 0 1 3 -2 1 3 -1 -1 -2 1 -1 2 5 2 2 0 2 9 2 0 2 6 29 2 3 10 3 4 2 2 2 11 0.37 2.05 31 A 1 -1 -1 -2 5 2 -2 1 0 -2 -2 -1 -1 0 0 -1 1 1 -1 0 13 3 3 2 12 9 2 11 3 2 4 4 2 5 4 4 8 2 2 6 0.23 2.02 32 I -2 -2 -2 -2 0 -2 0 1 0 4 -1 0 2 -1 -2 -2 -2 -5 1 2 3 2 2 2 2 2 6 11 2 25 5 5 4 3 2 3 3 0 4 13 0.29 2.02 33 G -2 -1 -1 -1 -1 -1 0 5 1 -1 -3 -2 -1 -2 -3 1 -2 0 -2 -1 2 3 3 3 2 2 6 42 3 4 2 2 2 2 2 11 2 2 2 4 0.57 2.06 34 P -3 -3 0 -3 -2 -1 -2 -3 5 -2 -1 -2 -1 1 6 0 -3 -1 2 -3 2 2 4 2 1 3 2 3 12 2 6 2 1 6 37 6 2 1 6 2 0.79 2.09 35 V 0 -2 0 -3 0 -1 -3 -2 -1 1 -2 -1 -1 -1 1 0 -1 1 -1 5 6 2 4 2 2 3 2 3 2 6 2 5 2 2 7 8 3 2 2 35 0.37 2.10 36 I 0 -1 0 1 1 -1 0 -1 0 3 -1 -2 1 -1 -1 0 1 -5 0 0 6 3 4 8 3 3 7 4 3 16 6 3 3 3 3 6 10 0 3 6 0.12 2.06 37 D -1 0 0 0 2 0 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.09 2.12 38 N -1 0 0 0 3 1 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 -5 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0 5 5 0.07 2.01 39 G -1 2 -2 0 -1 -2 -1 5 0 -3 -4 0 -2 -3 -3 0 -1 0 -1 -3 4 9 1 5 2 2 5 40 3 2 2 6 1 1 1 8 3 1 2 2 0.55 2.04 40 F -2 -2 -1 -2 1 -1 -2 -2 0 1 0 -2 1 6 -5 0 -1 2 2 -2 3 3 3 3 3 3 3 3 3 7 10 3 4 29 0 7 3 3 6 3 0.46 1.95 41 Y -2 3 -1 -5 1 -1 0 -5 1 -2 -2 -1 0 2 -1 -2 -2 2 6 -2 3 18 3 0 3 3 5 0 3 3 4 3 3 9 3 3 3 3 26 3 0.60 1.96 42 Y 0 -4 -4 0 3 1 -4 0 3 1 -1 -4 3 1 -5 0 0 4 2 0 7 0 0 7 6 7 0 7 6 7 7 0 6 6 0 7 7 6 6 7 0.28 1.56 43 D -2 -1 0 5 1 0 2 -2 1 -2 -3 -1 -4 -1 -1 -1 0 -5 0 -1 3 4 4 29 3 3 14 4 3 3 3 4 0 3 3 4 6 0 3 5 0.38 1.74 44 V -1 -4 0 0 3 -4 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 0 5 5 5 0 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.09 2.01 45 D -1 0 0 2 2 -1 -1 -2 2 -2 -2 0 1 2 -1 -1 -1 2 2 -1 4 5 5 10 3 3 5 4 5 3 5 6 3 8 3 5 4 2 7 5 0.07 2.14 46 L -2 1 0 -1 1 -1 -2 -1 6 -1 -1 -1 1 0 -1 -1 -1 2 1 -1 3 7 5 3 3 3 3 6 18 4 6 4 4 4 3 4 4 2 5 5 0.25 2.26 47 D -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 48 R -1 2 -1 1 -1 1 2 -1 2 -2 -3 2 -1 -2 -2 -1 -1 1 -1 -1 4 9 3 8 2 7 13 6 5 2 2 11 2 2 2 5 4 2 2 4 0.13 2.24 49 T 1 -1 -1 -2 -1 0 -1 -1 0 -2 -3 1 -1 -2 4 1 0 -6 -2 -2 12 4 3 3 2 4 5 5 2 2 2 7 2 2 22 9 5 0 2 3 0.28 2.25 50 L -1 0 0 0 3 1 -4 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 -4 -1 5 5 5 5 5 5 0 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0 5 0.08 2.01 51 T -2 -1 -1 -1 1 -1 -2 -2 0 -1 -1 0 1 0 -1 1 3 3 -1 0 3 3 3 4 3 3 3 4 3 4 5 6 3 3 3 10 20 4 2 6 0.13 2.14 52 Q -1 0 0 0 2 0 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 -5 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0 5 5 0.02 2.12 53 E -1 0 0 0 -5 1 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 -5 1 -1 5 5 5 5 0 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0 5 5 0.02 2.01 54 D -1 0 0 0 2 0 0 -1 2 0 -1 0 2 1 -5 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0 5 5 5 5 5 0.07 2.12 55 V -2 -2 -2 -2 1 -1 -2 -3 1 2 3 -2 1 1 -2 -2 -2 2 0 1 4 3 3 3 3 2 3 3 3 9 26 3 3 6 2 3 3 2 3 10 0.17 2.19 56 E 1 1 -1 0 0 0 2 -1 0 -2 -2 2 -1 -1 2 -1 -2 0 -1 -2 10 7 2 5 2 4 11 6 2 2 3 12 2 3 9 3 3 2 2 3 0.09 1.93 57 A 0 0 -1 -1 1 1 1 -2 0 0 -1 1 0 -1 0 1 -1 2 -1 0 6 6 3 3 2 5 8 3 3 6 5 8 2 3 5 10 3 2 2 7 0.00 1.78 58 L 0 -3 -4 -4 -4 -3 0 -4 -4 1 0 1 3 2 -4 0 1 5 2 0 8 0 0 0 0 0 8 1 0 8 8 8 7 7 0 8 8 7 7 8 0.22 1.34 59 E -2 -1 -1 -1 -1 0 6 -2 -1 -2 -4 0 -1 -3 -3 -1 -1 0 -1 -3 2 4 2 3 1 4 46 3 1 2 2 5 2 1 1 5 4 1 3 2 0.62 2.06 60 K 1 1 1 1 0 1 1 -2 0 -2 -3 3 -1 -3 -5 -1 0 0 -2 -3 11 8 6 8 2 7 7 3 2 2 2 18 1 1 0 5 5 2 1 2 0.20 2.06 61 R -1 1 -1 -1 0 0 1 -2 0 1 1 1 2 -1 -2 -2 -1 2 -1 0 6 8 3 3 2 4 8 3 3 7 11 8 5 3 3 3 3 3 3 8 0.02 1.95 62 M 0 -4 1 -4 3 1 -4 0 -4 0 -1 0 2 1 1 0 0 -4 2 0 6 0 6 0 6 6 0 6 0 6 6 6 6 6 6 6 6 0 6 6 0.11 1.67 63 H -1 1 4 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