Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 P -4 -5 -5 -4 -6 -4 -4 -5 -5 -6 -6 -4 -6 -7 9 -4 -4 -7 -6 -5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 3.05 1.41 2 T -4 1 -6 -5 -5 -3 -6 -4 -3 7 3 -3 -1 -2 -6 -5 -4 -6 -5 0 0 8 0 1 0 1 0 2 1 57 23 2 1 1 0 0 0 0 0 3 1.22 1.82 3 L 0 3 -5 -5 1 1 -3 -5 -3 1 2 -1 2 -2 -5 0 0 -3 -3 2 7 15 0 0 2 7 1 0 1 7 22 3 5 1 0 9 5 0 1 14 0.37 1.85 4 A 3 -2 0 -1 -3 0 1 1 -3 -5 -3 -2 -1 -3 -5 3 2 -6 -4 -3 24 1 4 3 0 3 9 11 0 0 3 2 2 1 0 20 14 0 0 1 0.45 1.91 5 E -5 -4 2 8 -7 -3 0 -4 -3 -7 -7 -4 -7 -7 -5 -2 -4 -8 -7 -7 0 0 8 84 0 0 4 0 1 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 2.16 2.00 6 P -4 -5 -6 -7 -5 -6 -6 -6 -4 4 4 -6 1 1 0 -5 -5 0 5 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 19 38 0 3 5 5 0 0 1 22 5 1.03 2.04 7 E -1 -2 -1 3 -5 0 4 0 -2 -3 -3 -1 -2 1 -1 -1 0 -3 -1 -1 6 2 2 18 0 4 24 8 1 2 2 4 1 7 3 4 6 0 2 5 0.36 2.05 8 R 1 5 -2 -3 -1 -2 -3 -2 -2 -3 1 4 -1 -5 -5 -1 -1 -6 -4 -3 11 26 1 1 1 1 1 3 1 2 14 27 1 0 0 4 3 0 0 1 0.65 2.05 9 Y -1 -5 1 -5 -5 -3 -4 -5 -2 0 3 -5 3 2 -5 -1 2 0 5 -2 6 0 7 0 0 1 1 0 1 5 25 0 6 7 0 5 12 1 20 2 0.60 2.04 10 A 4 -3 -3 -4 2 -4 -3 -1 -4 -2 -2 -3 -1 -2 -4 2 3 -2 2 -2 34 1 1 0 4 0 1 5 0 2 3 1 1 2 1 14 19 0 7 2 0.59 2.05 11 F 3 -3 -5 -6 1 -4 -5 -4 0 -1 1 -4 0 0 -5 -2 -1 0 7 -1 24 1 0 0 3 1 0 1 2 3 11 1 2 3 0 2 4 1 37 3 0.94 2.05 12 A 6 -5 -5 -5 -1 -4 -5 3 -5 -4 -2 -4 -2 -4 -5 0 -3 -4 -4 -2 64 0 0 0 1 0 0 19 0 0 3 0 1 0 0 5 1 0 0 2 1.21 2.06 13 H 1 -5 -1 -4 4 1 -3 -2 -1 -3 -1 -4 1 0 -5 4 2 -3 1 -2 12 0 3 0 7 7 1 3 1 1 5 0 3 4 0 33 12 0 5 2 0.55 2.07 14 L 1 -3 -2 -6 -3 -3 -4 -5 0 -2 -1 -5 -2 2 -3 -3 -3 -1 8 0 14 1 2 0 1 1 1 1 2 1 6 0 1 8 1 1 1 0 52 6 1.30 2.07 15 M 0 -6 -6 -7 1 -6 -6 -6 -6 4 2 -6 5 4 -5 -5 -4 0 -3 2 7 0 0 0 3 0 0 0 0 23 21 0 14 15 0 1 1 1 0 13 0.90 2.08 16 A 3 -4 1 -5 5 -4 -5 -3 -6 0 3 -5 0 -2 -6 -1 0 -6 -5 1 25 1 7 0 10 0 0 1 0 4 26 0 3 2 0 5 5 0 0 10 0.60 2.10 17 E -2 -2 -2 1 -7 0 7 -3 -2 -7 -7 -1 -5 -7 -5 -2 -4 -4 -5 -6 3 2 2 6 0 2 76 2 1 0 0 3 0 0 0 2 0 0 0 0 1.66 2.11 18 F -2 -5 -6 -6 -2 -5 -6 -6 -6 2 5 -5 1 1 -6 -4 2 -3 -2 1 3 0 0 0 1 0 0 0 0 10 53 0 3 5 0 1 13 0 1 8 0.94 2.13 19 A 4 -6 -6 -6 0 -5 -5 -5 -6 3 2 -5 0 -3 -6 -3 1 -6 -3 3 31 0 0 0 2 0 0 0 0 14 20 0 2 1 0 1 8 0 1 20 0.76 2.14 20 D -2 0 0 5 -2 -1 3 -3 -2 -2 0 -3 0 -3 -5 -1 -2 -4 -1 -2 2 4 4 35 1 3 18 2 1 2 9 1 2 1 0 5 2 0 3 2 0.62 2.14 21 A 1 5 -1 -2 -1 1 0 -3 0 -1 -2 3 -3 -2 -5 -1 -3 -3 3 -3 11 28 3 2 1 5 5 2 2 3 3 15 1 2 0 3 1 0 9 2 0.51 2.15 22 L 1 -6 -4 -6 0 -2 -5 -4 -3 0 4 -5 1 3 -6 0 -1 -1 1 1 12 0 1 0 2 2 0 1 1 4 36 0 2 12 0 6 4 1 5 9 0.57 2.14 23 F 1 -4 -4 -5 2 -4 -4 -1 -4 1 2 -4 1 2 -5 0 4 -2 -1 1 12 0 0 0 4 1 1 4 0 7 16 0 3 7 0 6 25 0 2 9 0.42 2.16 24 Q 0 1 -2 1 -2 2 3 -2 0 -2 -1 -1 -2 -2 3 -2 -2 -6 -2 -1 8 7 1 8 1 7 18 4 2 3 5 3 1 2 16 3 2 0 1 5 0.28 2.15 25 E -1 -1 -2 3 -4 0 6 -3 -2 -5 -5 -2 -3 -3 0 -1 -3 -6 -4 -4 5 4 2 17 0 3 47 2 1 0 1 1 1 1 5 5 1 0 1 1 0.90 2.14 26 G -1 2 3 1 -4 0 3 3 2 -5 -5 -1 -4 -4 -4 -1 -3 -6 -1 -4 4 11 12 9 0 4 16 21 6 0 1 4 0 1 1 4 1 0 2 1 0.48 2.14 27 E -1 -3 -1 3 -5 3 4 -3 0 -2 -2 -1 -2 -4 -4 -2 -1 -4 -3 -1 6 1 3 17 0 15 28 2 2 3 4 2 1 1 1 3 4 0 1 6 0.55 2.16 28 F 0 -2 -2 1 -4 -2 1 -2 -2 -3 -5 -1 -5 -3 6 0 -1 -4 -1 -2 9 3 2 7 0 2 8 3 1 2 1 4 0 1 41 6 3 0 2 3 0.82 2.15 29 S 1 -4 4 3 -2 2 0 -2 5 -2 -2 -3 -2 -3 -4 1 -2 -6 -2 -2 12 0 17 14 1 7 7 3 11 2 4 1 1 1 1 9 2 0 2 3 0.44 2.14 30 E -1 1 -1 0 -4 0 2 -2 -1 -3 -2 -1 -3 -4 5 -1 -1 -4 -2 -2 5 7 3 5 0 4 12 4 2 2 5 3 1 1 32 5 4 0 2 3 0.54 2.14 31 Q 1 2 -1 0 -4 2 3 -1 0 -3 -3 0 -3 1 0 -2 -2 -3 1 -3 12 11 3 6 0 9 20 5 2 1 2 5 1 5 5 3 2 0 5 1 0.29 2.12 32 A -1 -5 -4 -6 -3 1 -3 -5 -1 2 5 -5 2 0 -5 -4 -2 3 -1 1 5 0 1 0 0 7 2 1 2 10 45 0 4 3 0 1 2 4 2 9 0.71 2.13 33 F -5 -4 -6 -7 -6 -5 -6 -7 0 -3 0 -6 -2 7 -7 -5 -5 1 7 -3 0 1 0 0 0 0 0 0 2 1 10 0 1 49 0 1 0 2 31 1 1.77 2.12 34 D -1 3 1 3 -6 1 2 -3 1 -2 -1 0 -2 -2 -1 -1 -1 -3 -2 -3 6 13 6 16 0 7 13 2 3 3 8 6 1 2 3 5 3 0 1 1 0.26 2.15 35 L -1 -2 -4 -2 -3 0 -3 -5 0 0 5 -3 0 1 -5 -3 -3 0 -1 -2 5 2 1 2 0 4 2 1 2 4 56 1 2 5 0 1 2 1 2 2 0.74 2.15 36 F -1 -6 -6 -7 -1 -6 -6 -6 -6 1 5 -6 0 2 -6 -4 1 -2 2 0 4 0 0 0 1 0 0 0 0 6 51 0 1 9 0 1 9 1 7 7 0.86 2.14 37 A 0 -1 0 -2 0 -1 0 -3 1 0 2 -1 0 -1 -6 -1 -1 -1 3 2 8 4 4 2 2 3 6 2 3 4 19 4 2 2 0 4 4 1 9 14 0.15 2.15 38 A 1 0 1 0 -3 3 1 2 1 -3 -2 1 -3 -1 -5 0 0 -1 -2 -2 11 4 8 4 1 11 9 13 3 1 4 8 1 3 0 6 5 1 1 3 0.17 2.14 39 S 4 -5 -4 -4 2 -4 -4 -1 2 -1 -2 -4 -2 0 -5 1 3 -3 -1 0 30 0 1 1 5 0 0 4 4 3 5 0 1 4 0 11 19 0 2 6 0.51 2.18 40 L -4 -4 -5 -7 -3 -5 -5 -6 -3 0 6 -6 2 2 -7 -5 -4 -2 -2 -2 1 1 0 0 0 0 0 0 1 4 73 0 5 7 0 0 0 0 1 2 1.33 2.18 41 R 0 3 1 2 -3 1 1 -3 3 -4 -3 1 -2 -1 -4 0 -1 -3 2 -4 7 18 5 11 1 6 10 2 6 1 3 7 1 2 1 6 4 0 6 1 0.32 2.18 42 G 3 2 -1 -2 -2 -1 -1 -2 1 -2 1 0 0 -1 -5 0 -1 1 1 -2 24 10 2 2 1 3 4 4 3 2 13 4 2 2 0 7 4 2 5 2 0.21 2.19 43 V -3 -6 -5 -7 -2 -6 -5 -6 -6 3 5 -6 3 0 -5 -5 -3 -2 -3 0 2 0 1 0 1 0 1 1 0 17 58 0 7 4 1 1 1 1 1 4 1.13 2.17 44 A 3 -2 2 3 1 1 3 -2 -2 -4 -3 -2 -3 -5 -3 1 -1 -3 -3 -2 20 2 10 15 3 5 17 3 1 1 2 2 1 1 1 10 3 1 1 2 0.42 2.19 45 H 0 2 1 2 -3 1 3 -2 2 -4 -4 2 -2 -4 -3 -1 0 -6 -2 -2 7 10 7 9 1 7 21 3 4 1 1 10 1 1 1 5 6 0 1 3 0.36 2.20 46 Q 0 0 0 1 -2 1 1 4 1 -4 -3 0 -3 -3 -2 0 0 -2 -3 -3 8 4 3 6 1 7 8 29 4 1 3 5 1 2 2 6 5 1 1 2 0.33 2.17 47 P -1 1 0 0 -3 -1 1 -1 4 -3 -2 2 -2 0 1 -1 -1 -5 1 -1 6 7 5 6 1 2 11 5 9 2 4 11 1 3 8 5 4 0 5 4 0.19 2.17 48 D 0 0 2 5 -3 0 0 -2 1 -2 -3 -1 -2 -3 0 0 -2 -1 -2 -3 9 6 9 29 1 4 6 3 3 3 3 4 1 1 5 7 2 1 1 2 0.43 2.16 49 P 1 -2 0 -3 -2 -2 -2 -3 0 -2 -1 -1 -2 -2 6 -1 -1 -1 -1 -1 12 3 4 1 1 1 2 2 2 2 7 3 1 2 40 5 3 1 2 4 0.74 2.16 50 E 0 1 -1 1 -6 2 4 -2 1 -2 -1 -1 -1 -2 0 -1 -1 2 -1 -3 9 7 3 8 0 9 24 3 3 2 6 3 1 2 4 5 4 3 2 2 0.29 2.17 51 W 0 -1 -1 -2 -2 -2 -3 -3 -2 3 2 -2 1 0 0 -1 -1 2 -2 1 9 3 3 2 1 2 2 3 1 13 22 2 3 5 4 5 4 3 1 9 0.16 2.22 52 V 0 -3 -3 -4 0 -3 -4 -4 -1 4 2 -4 1 1 -2 -3 -1 -1 -1 3 7 1 1 1 2 1 1 1 2 19 19 1 3 5 3 2 3 1 2 21 0.40 2.22 53 A 1 0 -3 -3 2 -2 -3 -2 0 0 2 0 0 -1 -1 0 1 0 -1 0 13 5 1 1 4 2 2 3 2 4 19 5 2 3 3 7 9 1 2 7 0.10 2.15 54 L 1 3 1 0 1 -1 -2 -3 2 -1 2 -3 0 -1 -1 -2 -2 0 0 -1 10 13 7 6 3 2 2 2 4 4 18 1 2 2 3 3 2 1 3 5 0.13 2.16 55 V 2 -1 -1 -2 1 -1 -2 -2 1 2 1 -2 1 1 -5 -1 -2 3 0 0 15 4 3 3 3 3 3 3 3 10 13 3 3 6 0 5 3 4 3 7 0.10 2.02 56 M -1 -4 0 -4 3 1 0 -1 2 0 -1 -4 2 1 0 -1 0 4 1 0 6 0 5 0 5 5 6 6 5 6 6 0 5 5 6 6 6 5 5 6 0.14 1.89 57 S -1 -1 -1 -1 -1 1 5 -3 2 -1 1 -2 0 -2 -5 -1 -2 -5 0 -2 5 3 2 2 2 6 34 2 4 3 13 2 2 2 0 4 2 0 3 3 0.37 1.93 58 Y -1 -1 -5 -6 0 -2 -5 -3 -1 1 4 -3 2 2 -6 -3 -2 5 1 0 6 4 0 0 2 2 0 2 2 6 33 2 4 9 0 2 3 7 5 6 0.47 1.96 59 K -2 3 -2 -2 -6 3 -2 -3 5 -3 -3 4 -1 0 -5 -2 -2 2 -1 -3 3 17 2 2 0 11 2 2 12 2 2 24 1 3 0 2 2 3 2 2 0.57 1.97 60 L 1 -3 -3 -5 1 -2 -5 -3 -1 0 3 -3 5 1 -5 -2 -1 1 0 0 10 2 2 0 2 2 0 2 1 5 31 2 12 5 0 4 4 2 3 6 0.41 1.99 61 L -1 -5 -2 -5 1 -2 -5 -3 -5 0 4 -5 5 0 -5 -2 -1 2 0 -1 5 0 3 0 3 2 0 3 0 4 41 0 14 3 0 3 3 2 3 4 0.61 2.00 62 G 1 1 0 1 2 1 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