JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_mJR642D.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet |||E|E|E|E|E|E||||||E||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||H|H|H|H|H|H|H||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E|E|E|||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|||||||||||||||||||E|| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 9|9|2|4|7|8|8|6|0|5|7|7|4|1|2|1|4|6|7|7|7|6|6|6|7|7|7|7|7|4|1|8|8|8|8|8|1|3|6|7|7|7|7|6|6|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|6|0|1|6|6|8|9|9|4|1|0|1|1|6|7|8|7|7|0|2|1|1|0|4|2|1|0|5|6|7|7|7|7|7|7|6|6|2|3|0|7|9|9|9|9|9|9|9|9|8|2|0|1|2|9|8|8|8|6|2|3|6|7|8|8|7|7|7|7|5|2|7|8|9|9|9|9|9|8|8|6|1|6|9|7|1|7|8|9|9|8|8|6|3|7|8|8|8|4|6|8|8|8|8|8|8|9|8|6|3|7|7|7|7|6|4|2|2|5|6|6|7|7|7|7|7|4|0|0|2 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off -|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|B|B|-|B|-|-|-|-|B|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|B|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|B|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|-|B|B|-|B|B|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|B|-|B|-|B|B|-|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|B|B|-|B|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles ||E|E|E|E|E|E|E|||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||H|H|H|H|H|H||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E|E|E|||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E||||||||||||||||||||| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles |||E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||H|H|H|||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E|E|||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|||||||||||||||||||E|E| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree | |*| | | | | | | | | | |*|*|*| | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | |*|*|*|*| | | | | | |*|*| | | |*|*|*|*| | | | | | | | | | |*|*| | | | | | | | | | | |*|*|*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*|