Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 I -2 -4 -5 -5 -3 -4 -5 -5 -5 5 2 -4 -1 -2 -4 -4 -2 -4 -3 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35 13 0 0 0 0 0 0 0 0 52 0.98 0.71 2 G 2 6 -3 -4 -5 0 -3 0 3 -4 -4 1 -2 -3 -3 -1 -2 -5 -1 -2 17 45 0 0 0 2 0 8 7 0 0 9 1 1 1 3 1 0 2 4 0.75 1.02 3 K -2 5 -3 -4 -5 -2 -1 0 -3 -5 -5 6 -4 -6 -4 -2 0 -5 -4 -4 3 33 0 0 0 0 2 6 0 0 0 48 0 0 0 2 6 0 0 1 1.11 1.23 4 K -3 3 -4 -5 -2 -3 -2 -5 -5 4 0 2 1 -3 -5 -3 1 -5 -4 3 1 14 0 0 1 0 2 0 0 27 7 12 4 1 0 1 11 0 0 19 0.58 1.30 5 V 1 1 -3 -4 -5 0 2 -4 -4 1 -2 2 1 -3 3 -1 2 -5 -4 0 13 8 0 0 0 3 12 0 0 7 3 11 4 1 16 2 11 0 0 7 0.35 1.36 6 A 6 -3 -4 -5 -2 -4 -4 -1 -5 -4 -3 -3 -1 -4 -4 0 -2 -6 -5 -1 82 1 0 0 1 0 0 3 0 0 1 1 1 0 0 5 2 0 0 3 1.34 1.51 7 R -2 5 -2 -3 -5 0 -1 -2 0 0 -3 3 -2 -5 -3 0 1 -6 -3 1 3 36 1 1 0 3 4 3 2 5 1 16 1 0 1 5 9 0 1 10 0.63 1.55 8 L -2 -3 -4 -6 -2 -5 -5 -6 -5 1 5 -5 3 1 -5 -4 -3 -4 -4 1 3 1 1 0 1 0 0 0 0 5 66 0 7 6 0 1 1 0 0 8 1.06 1.54 9 K 3 0 -2 -1 -3 -1 -1 -1 -3 -4 -4 1 -1 -5 0 2 3 -3 -2 -2 25 6 2 3 0 3 2 4 0 0 1 8 1 0 4 18 18 0 2 2 0.41 1.55 10 H -2 6 -2 -2 -6 0 2 -3 4 -3 -3 1 -2 -1 -5 -2 -1 -3 1 -2 2 40 1 1 0 4 12 2 9 2 2 8 1 2 0 2 3 0 5 3 0.75 1.55 11 K -1 5 3 0 -6 -1 -2 -2 -2 -4 -5 4 -3 -6 0 -1 -2 -6 -5 -4 5 28 15 5 0 2 2 2 1 1 0 27 1 0 5 5 2 0 0 1 0.77 1.56 12 V -3 -4 -4 -4 -3 -4 -5 -6 -5 5 1 0 0 -1 -4 -2 -1 -5 1 4 1 1 1 1 0 0 0 0 0 34 12 7 2 2 0 4 3 0 4 28 0.75 1.53 13 F 2 0 -2 -3 -3 -2 -1 -3 2 -2 -3 0 -1 0 5 0 0 -5 -2 1 19 5 2 1 0 2 3 2 5 2 2 5 1 4 25 7 5 0 1 9 0.44 1.56 14 S 0 0 -1 -3 -4 -2 -1 0 -2 -4 -4 0 -4 -5 -1 6 -1 -6 -5 -3 6 4 2 1 0 1 4 5 1 1 1 6 0 0 3 64 1 0 0 1 0.95 1.55 15 V -2 0 -2 -2 -5 -3 0 6 -5 -3 -6 -3 -5 -6 -3 1 0 -6 -5 -1 2 6 2 2 0 0 5 60 0 2 0 1 0 0 1 9 5 0 0 4 1.06 1.58 16 R -3 7 -2 -3 -4 -1 -1 -5 -2 -4 -3 0 0 -3 -2 -2 -1 -1 0 -2 1 63 2 1 0 1 3 0 1 0 3 4 3 1 3 2 3 1 4 3 1.17 1.58 17 R -2 4 -2 0 -5 -1 4 -3 -1 -2 -1 -1 0 -5 -4 -2 2 -6 -2 0 3 26 1 4 0 1 24 1 1 2 6 2 3 0 1 2 16 0 1 6 0.57 1.60 18 Q -3 0 -1 4 -6 2 5 -2 1 -5 -4 -2 -4 -5 -4 -1 1 -1 -4 -3 1 5 1 22 0 9 39 3 3 0 1 1 0 0 0 4 8 1 0 2 0.82 1.58 19 F -5 -4 -6 -6 -5 -5 -6 -6 0 -1 1 -4 -1 7 -6 -5 -3 2 6 -3 0 1 0 0 0 0 0 0 2 2 12 1 1 50 0 0 1 2 28 1 1.57 1.58 20 L -1 -2 -4 -6 -2 0 -5 -5 -3 3 3 -5 1 -2 -5 -4 -2 -5 0 5 5 2 0 0 1 4 0 1 1 15 24 0 3 1 0 1 2 0 3 38 0.75 1.59 21 P -3 6 -3 -5 -3 -2 -2 -4 -4 -5 -2 -1 2 -2 5 -3 -3 -6 -4 -5 1 55 1 0 1 1 1 1 0 0 3 1 5 2 25 1 1 0 0 0 1.36 1.59 22 V 1 -5 -4 -6 -2 -5 -4 0 -6 0 -1 -5 1 -4 -4 -3 -2 -6 -4 6 11 0 1 0 1 0 0 9 0 3 3 0 3 0 0 1 1 0 0 67 1.14 1.60 23 K -1 4 0 -3 -4 -1 -2 0 -2 -1 -4 3 -1 -3 -5 2 0 -1 -1 0 5 23 4 1 0 2 1 6 1 3 1 20 2 1 0 14 6 1 2 6 0.43 1.61 24 L -4 -2 -6 -5 -3 -5 -5 -6 -3 3 5 -4 0 -1 -5 -4 -2 -2 1 2 1 3 0 1 1 0 0 0 1 14 53 1 1 2 0 1 1 0 5 16 0.91 1.61 25 E -2 -1 0 4 -6 0 4 0 -1 -3 -3 1 -5 -5 -4 -2 -1 -6 -3 -1 3 3 4 25 0 4 29 7 2 2 2 7 0 0 1 3 3 0 1 6 0.60 1.58 26 G -1 2 1 2 -6 -1 2 4 -1 -5 -5 2 -3 -4 -2 -2 -2 -6 -4 -5 3 11 7 11 0 2 14 30 1 0 0 12 0 1 1 1 3 0 0 0 0.58 1.56 27 D -4 -1 1 2 -4 -2 0 2 -2 0 1 -2 -1 0 -1 -2 -1 0 4 -2 0 3 6 11 0 2 7 18 1 5 14 2 1 3 4 2 4 1 14 2 0.27 1.55 28 L -1 0 -3 -3 -2 -2 -1 -1 -2 2 1 -1 1 0 -4 -1 1 3 1 3 5 6 1 2 1 2 3 5 1 12 10 4 3 4 1 5 7 3 6 20 0.20 1.49 29 A 5 -4 -3 -4 -2 -3 -2 -3 -3 0 -3 -3 -3 -2 -3 -2 -2 -5 -4 3 63 0 1 1 1 1 2 1 0 4 1 1 0 2 1 1 1 0 0 22 1.00 1.45 30 V -1 0 -1 -3 -4 -2 1 -4 1 0 -2 -2 -2 1 -2 0 3 -2 5 1 5 4 2 1 0 1 11 1 3 6 2 2 1 4 2 5 19 0 19 10 0.37 1.44 31 P -2 -3 -5 -4 -5 -2 -3 -4 -3 -4 -5 -2 -5 -5 8 -2 -3 -6 -4 -3 2 2 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 0 0 84 2 1 0 1 2 2.31 1.44 32 I -1 -2 -4 -5 -2 -3 -4 -4 -3 3 3 -4 0 -1 -4 -2 0 -5 -3 3 5 2 0 0 0 1 1 1 1 16 34 0 2 2 1 3 6 0 1 24 0.62 1.43 33 L 0 -2 -1 0 -5 -2 -2 1 -2 -1 1 -1 1 2 1 1 1 -2 1 -3 8 2 2 5 0 1 2 10 1 3 13 4 3 10 8 12 9 0 5 1 0.15 1.45 34 K -1 4 -2 -3 -5 1 -2 4 -1 -5 -5 2 -2 -3 -4 1 0 -5 -2 -4 4 22 1 1 0 6 1 31 1 0 0 15 1 1 0 10 5 0 1 0 0.66 1.44 35 G -1 -2 -2 -1 -5 -1 -1 5 0 -6 -5 3 -5 -3 -3 -1 -2 -5 -3 -5 2 1 1 3 0 2 3 54 2 0 1 22 0 1 1 4 2 0 1 0 0.97 1.27 36 S 3 -2 -2 -2 -3 -2 -2 -2 -4 -5 -4 -3 -4 -5 -3 6 -1 -5 -4 -4 22 1 0 1 0 1 2 1 0 0 1 0 0 0 0 70 1 0 0 0 1.19 1.28 37 G 0 -4 0 -1 -5 -4 -3 6 3 -6 -6 -4 -5 -5 -4 0 -3 -5 -2 -5 8 0 4 2 0 0 1 67 8 0 0 0 0 0 0 7 0 0 2 0 1.28 1.25 38 A 2 -2 -1 -3 -2 -3 -4 -4 -2 1 2 -3 3 -2 -4 1 -1 -4 0 2 17 3 4 1 1 1 0 0 1 8 22 1 7 1 0 12 2 0 4 15 0.34 1.26 39 V -2 -5 -5 -6 -4 -2 -5 -6 -5 5 3 -5 2 -2 -5 -3 1 -5 -4 2 2 0 0 0 0 2 0 0 0 41 25 0 5 1 0 1 9 0 0 14 0.89 1.28 40 T 0 1 -1 -2 -4 -3 -2 -2 -1 -4 -3 -1 3 -2 -2 4 3 -5 -2 -2 7 6 2 1 0 0 1 3 1 0 1 3 10 2 1 36 23 0 1 2 0.59 1.28 41 S 2 -2 -2 -3 -2 -3 -3 0 -2 -2 -1 -3 -1 -5 -2 5 3 -2 -4 -2 14 1 1 1 1 0 0 5 1 1 7 1 1 0 1 42 20 0 0 2 0.63 1.28 42 F -1 -5 -6 -6 -4 -4 -5 -6 -5 1 5 -5 5 2 -5 -4 -2 -1 0 1 5 0 0 0 0 0 0 0 0 5 52 0 16 7 0 1 2 1 3 9 0.91 1.28 43 I 3 -2 -2 -4 -2 -4 -4 -2 -4 0 -2 -2 -1 -3 -4 2 2 -5 -4 3 27 1 2 0 1 0 0 3 0 3 3 2 1 1 0 18 13 0 0 25 0.52 1.28 44 D -2 4 0 0 -5 1 1 -2 2 -4 -1 3 -2 -3 -4 -2 -3 1 0 -4 2 28 4 6 0 7 9 2 4 1 8 21 1 1 0 2 1 2 3 0 0.54 1.28 45 A 6 -4 -3 -4 -1 -2 -3 -1 -4 -4 -3 -3 -1 -5 -4 2 -1 -5 -4 -2 72 0 1 0 1 1 0 2 0 0 1 0 1 0 0 17 2 0 0 1 1.16 1.28 46 D -3 -3 3 7 -3 0 1 -4 1 -4 -6 -2 -5 -3 -4 -1 -2 -2 -3 -5 1 1 13 63 1 5 6 0 3 1 0 1 0 1 0 3 1 1 1 0 1.32 1.28 47 G 2 -5 -3 -4 1 -4 -5 7 -5 -5 -6 -4 -5 -2 -5 -2 -4 -5 -5 -3 14 0 0 0 4 0 0 77 0 0 0 0 0 2 0 2 0 0 0 2 1.56 1.28 48 F -4 -4 -5 -4 -4 -5 -5 -6 -3 2 3 -5 0 4 -6 -5 -2 4 6 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 11 24 0 2 18 0 0 2 6 27 7 0.96 1.28 49 V 0 -5 -5 -6 -1 -5 -5 -4 -5 5 2 -5 2 0 -5 -3 -2 -5 -4 4 8 0 0 0 1 0 0 1 0 34 16 0 4 3 0 1 2 0 0 29 0.85 1.29 50 E -1 2 -3 -1 0 -2 2 -5 1 2 -1 0 -2 -3 -3 -1 -1 -1 -1 3 5 13 0 2 2 1 14 0 3 11 4 7 1 1 1 4 2 1 2 24 0.32 1.29 51 I -2 -4 -6 -6 -1 -5 -4 -6 -6 6 1 -5 0 -2 -5 -5 -2 -5 -4 4 2 1 0 0 1 0 1 0 0 51 10 0 2 1 0 0 1 0 0 30 1.17 1.29 52 P -2 -3 -3 1 -6 -1 0 -1 -3 -5 -5 -2 -5 -3 7 -2 -3 -6 -3 -4 3 1 1 9 0 2 5 4 1 0 0 2 0 1 66 3 1 0 1 0 1.64 1.37 53 E 2 1 -3 -1 -5 1 5 -1 -3 -3 -2 1 -3 -4 1 -1 -2 -5 -3 -4 19 7 1 2 0 4 37 3 0 1 3 7 1 0 8 5 1 0 1 0 0.58 1.37 54 T -2 -2 4 4 -5 0 2 1 1 -5 -3 -2 -3 -2 -3 -1 -1 -6 -2 -5 3 1 24 23 0 4 15 11 3 0 3 1 0 2 1 4 3 0 1 0 0.64 1.36 55 V 0 3 -2 -3 1 -1 -1 -4 -2 0 -1 1 -2 -3 -4 1 2 -1 -3 3 8 15 2 1 3 2 5 0 1 4 7 7 1 0 0 13 11 1 1 19 0.29 1.40 56 E -1 0 -2 1 -6 -1 6 -3 -2 -4 -3 -2 -4 -6 -2 -1 0 -6 -5 -4 5 4 1 7 0 1 61 2 1 1 3 1 0 0 2 4 7 0 0 0 1.04 1.47 57 S -1 -2 -3 -2 -5 -2 -2 6 -1 -1 -3 -3 -2 -1 -5 -1 -1 -4 2 -2 4 2 1 2 0 1 2 57 1 5 3 1 1 3 0 4 3 0 7 3 0.87 1.46 58 L -2 -4 -6 -6 -2 -5 -4 -6 -2 4 3 -3 1 1 -4 -5 -3 -2 3 3 4 0 0 0 1 0 1 0 1 21 33 2 4 5 0 0 1 0 10 18 0.74 1.46 59 D 0 -1 0 2 -3 0 4 -2 1 -4 -3 1 -3 -3 2 -1 -2 -5 1 -3 8 3 5 10 0 2 31 3 3 1 3 7 1 1 9 4 1 0 5 2 0.44 1.45 60 E 4 0 -4 -2 -5 1 3 -3 -2 -3 -4 3 -2 -5 1 -1 -1 -6 -5 -3 34 3 0 1 0 6 23 1 1 1 1 16 1 0 6 2 3 0 0 1 0.64 1.47 61 G -2 -4 0 1 -5 -3 -3 7 -2 -7 -6 -3 -5 -6 -5 -3 -4 -6 -5 -6 1 0 4 7 0 1 1 82 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1.74 1.46 62 E 0 -2 -2 3 -3 0 5 -4 -3 -5 -5 -2 -2 -5 -4 1 1 -6 -5 -4 9 1 1 16 1 4 46 1 0 0 0 2 1 0 0 9 9 0 0 1 0.87 1.49 63 E -2 1 -2 -1 -5 0 4 -4 -3 -1 -1 1 1 -3 1 -1 2 -1 -2 -1 2 7 1 3 0 4 31 0 0 5 6 7 4 1 6 5 12 1 1 4 0.40 1.48 64 V -1 -4 -5 -6 0 -5 -5 -6 -4 2 -1 -5 -1 -2 -4 -4 -2 -6 -4 7 4 1 0 0 2 0 0 0 0 7 3 0 1 1 1 0 2 0 0 79 1.40 1.49 65 E -1 0 0 3 -6 1 4 -4 -2 -4 -4 0 -2 -3 0 -1 2 0 -3 -4 4 6 4 16 0 5 32 0 0 1 1 5 1 1 4 5 12 2 1 1 0.58 1.51 66 V 0 -5 -6 -6 -4 -5 -5 -6 -6 2 -1 -4 -2 0 -5 -4 -2 -5 -2 7 6 0 0 0 0 0 0 0 0 9 3 0 0 4 0 0 1 0 1 76 1.38 1.48 67 T -3 1 -1 -2 -4 1 3 -4 2 1 0 -1 0 0 -5 -2 1 4 3 0 0 7 2 1 0 6 17 1 6 7 7 4 2 4 0 2 11 6 9 6 0.31 1.47 68 L -4 -3 -4 -4 -2 -3 -5 -5 -4 0 6 -3 1 -1 1 -4 -4 -5 -3 -2 0 1 1 1 1 1 0 0 0 3 75 1 3 2 8 1 0 0 0 1 1.13 1.48 69 F -5 -4 -4 -6 -3 -5 -6 -6 -2 1 3 -5 0 6 -6 -5 -4 6 3 -2 0 0 1 0 0 0 0 0 1 6 32 0 2 38 0 0 0 9 9 1 1.24 1.43 70 K -2 5 0 1 -5 0 2 -1 1 -6 -5 2 -4 -6 -4 2 -2 -6 -4 -5 2 29 4 6 0 4 16 4 4 0 0 10 0 0 0 20 2 0 0 0 0.68 1.33 71 G 0 2 2 4 -5 -2 -1 2 -2 -5 -5 0 -5 -6 -4 3 -3 -6 -5 -5 8 10 9 26 0 1 2 18 1 0 0 4 0 0 0 21 0 0 0 0 0.66 1.19 72 W -4 -4 -5 -6 -4 -4 -5 -5 -3 -1 4 -5 -1 4 -5 -4 -3 5 4 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 55 0 0 20 0 0 0 8 17 0 1.06 0.82 K Lambda Standard Ungapped 0.1399 0.3182 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1946 0.3180 PSI Gapped 0.0595 0.2670