JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_lLYnWH_.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet ||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E||||||||E|E|E|E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E||||||E||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E||||||E|E|E||| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 9|9|8|3|7|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|6|2|3|6|7|7|7|7|7|7|7|6|6|5|3|3|4|4|6|7|7|6|1|6|8|8|8|7|6|1|3|5|7|8|8|7|3|1|7|3|6|1|0|0|0|1|5|3|1|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|2|1|6|7|8|7|7|6|5|4|2|2|3|4|5|2|5|8|9|9|9|8|4|4|7|7|3|0|1|2|6|7|7|7|5|5|6|5|5|5|5|6|7|4|4|8|9|9|8|5|2|1|8|4|1|1|3|5|3|3|6|7|7|7|7|7|7|7|5|2|7|8|9|9|9|9|9|9|9|8|5|1|5|7|7|7|7|7|7|7|7|7|3|1|8|9|9|9|8|8|8|8|9|9|9|8|6|4|7|8|7|4|1|4|0|2|8|9 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off -|-|B|-|-|-|-|B|-|B|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|B|B|-|B|B|B|-|B|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|B|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|-|B|-|-|-|B|B|B|B|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|B|B|B|-|-|-|B|B|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|-|B|-|B|B|-|B|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles ||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E||||||||||E||E|E|E|E|E|E||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E||||||E|E||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles ||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|||||||E|E|E|E|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|||||E|E||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E||||||E|E|E||| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*| | | | | | |*| |*| |*|*|*|*|*| |*|*| | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | |*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*| | |*|*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| |