Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 F -4 -5 -5 -6 -4 -4 -5 -6 -4 2 1 -5 7 6 -6 -5 -4 -2 3 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11 9 0 28 42 0 0 0 0 10 0 1.36 1.25 2 K -2 3 1 -3 -5 1 3 -2 -1 -4 -4 4 -2 -5 -4 2 -2 -6 -4 -2 3 15 6 0 0 4 23 2 1 0 1 24 1 0 0 14 2 0 0 2 0.62 1.43 3 I -3 -5 -4 -4 -4 -4 -5 -6 -4 3 5 -4 1 1 -2 -5 -3 -5 -2 -1 2 0 1 1 0 1 0 0 0 14 67 1 3 6 2 0 1 0 1 1 1.10 1.58 4 K -2 1 2 0 -5 -3 -2 -3 -4 -5 -4 0 -3 -6 0 4 4 -6 -5 -4 1 6 9 6 0 0 1 1 0 0 1 7 0 0 5 36 27 0 0 0 0.76 1.61 5 D 0 -1 -1 3 -5 1 2 -4 -2 -2 1 1 -4 -1 0 0 -1 -5 1 -3 7 4 2 16 0 6 15 1 1 3 13 10 0 2 4 5 4 0 5 2 0.26 1.62 6 E -1 -1 0 2 -6 2 5 -3 -1 -6 -5 0 -5 -6 -1 0 -1 -6 -3 -3 6 2 5 11 0 10 44 1 1 0 0 4 0 0 4 5 4 0 1 1 0.79 1.66 7 W 0 -1 0 4 -3 2 5 -5 2 -3 -2 -1 -4 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -4 8 2 3 22 1 8 36 0 4 1 5 2 0 1 0 1 1 1 2 1 0.74 1.65 8 G -2 2 -3 -1 -3 1 -1 5 -2 -6 -4 4 -4 -5 -4 -2 -2 -6 -3 -5 2 10 0 3 1 6 4 42 1 0 1 24 0 0 0 3 1 0 1 0 0.86 1.65 9 E 1 1 0 3 -4 2 2 -4 -2 -1 -4 3 -3 -5 -1 0 0 -6 -4 -2 11 8 4 14 0 10 12 1 1 3 1 16 1 0 3 5 6 0 0 3 0.36 1.68 10 F 1 1 -4 -3 -3 -1 0 -5 -2 1 0 -2 -1 3 -1 -2 0 2 3 0 13 9 0 1 0 3 6 0 1 10 10 2 2 14 3 2 6 3 9 5 0.28 1.69 11 L 0 -5 -6 -6 -2 -5 -5 -6 -5 0 5 -5 1 -1 -6 -3 -3 -2 4 -1 9 0 0 0 1 0 0 0 0 4 63 0 3 1 0 2 1 0 13 3 1.08 1.76 12 V -3 -2 -6 -6 1 -5 -6 -6 -4 2 4 -1 -1 -3 -2 -4 -2 -5 -4 5 1 2 0 0 3 0 0 0 0 8 39 4 0 1 2 1 2 0 0 36 0.90 1.79 13 R 0 3 -1 1 -2 2 1 -2 -1 -5 -5 4 -3 -5 -3 0 -1 -3 -3 -3 9 16 3 7 1 10 9 4 1 0 1 24 0 0 1 7 3 0 1 1 0.51 1.81 14 L -3 -3 -4 -3 -3 -4 -3 -7 0 4 5 -5 0 -1 -6 -4 -2 2 0 0 2 2 1 2 0 0 1 0 2 20 51 0 2 2 0 1 3 3 3 5 0.86 1.80 15 A 6 -5 -5 -5 2 -4 -4 -2 -5 -3 -3 -4 -4 -5 -4 -1 -3 -6 -3 0 83 0 0 0 4 0 0 1 0 1 1 0 0 0 0 2 1 0 1 6 1.53 1.80 16 R -3 8 -3 -3 -4 -2 -3 -5 -2 -4 -5 1 -3 0 -5 -3 -4 1 -2 -4 2 74 0 1 0 1 1 0 1 1 1 8 1 4 0 1 0 2 2 1 1.67 1.83 17 R 0 2 1 2 -4 2 3 -3 -2 -3 -2 2 -2 -3 -5 0 -1 -1 -2 -5 9 9 6 12 0 10 20 2 1 1 4 12 1 1 0 5 3 1 1 0 0.41 1.84 18 A 4 -4 -2 -4 0 -3 -3 -3 -3 -2 -4 -4 -2 -5 -3 4 3 -6 -4 0 34 0 2 0 2 1 1 1 1 2 1 0 1 0 1 31 17 0 0 6 0.82 1.84 19 I -3 -6 -6 -7 -4 -6 -6 -4 -6 6 3 -6 0 -3 -6 -5 -3 -6 -5 3 2 0 0 0 0 0 0 1 0 54 24 0 2 0 0 0 1 0 0 16 1.34 1.84 20 E 1 0 0 -1 -6 1 5 -2 0 -1 -1 0 -3 -5 -5 -2 -1 -3 -2 -2 14 6 4 3 0 4 39 2 2 3 6 6 0 0 0 2 4 0 1 3 0.56 1.87 21 E 1 0 2 0 -3 -1 2 -3 4 -4 -3 -1 -3 -3 -4 2 1 -3 2 -4 14 5 9 4 1 2 13 2 11 1 2 3 1 1 0 16 8 0 7 1 0.39 1.87 22 Y 1 1 -3 -4 -2 -1 -1 0 4 -3 -4 0 -3 2 -5 -3 -2 2 6 -1 11 7 1 0 1 3 5 7 9 1 1 6 0 8 0 2 2 3 28 5 0.65 1.86 23 L -3 -5 -5 -5 -2 -4 -4 -6 -4 1 5 -5 -1 3 -6 -5 -3 -1 -2 3 2 0 0 0 1 0 1 0 0 7 51 0 1 13 0 0 1 1 1 19 0.99 1.83 24 K -1 3 1 0 -3 1 2 0 1 -3 -2 3 -2 -3 -3 0 0 -2 -2 -3 4 18 5 5 1 7 13 8 3 2 4 15 1 1 1 5 5 1 1 2 0.33 1.73 25 T -1 0 3 -1 -3 0 1 2 4 -2 -2 0 -1 -3 -2 -1 2 -5 -1 -3 6 4 12 3 0 4 10 13 10 2 5 5 1 1 2 5 13 0 3 1 0.27 1.75 26 G -2 0 0 -1 -2 1 -1 5 1 -4 -4 2 -5 -6 -1 -1 -1 -5 -5 -4 3 5 4 4 1 6 4 43 3 1 2 11 0 0 3 4 3 0 0 1 0.66 1.77 27 K -1 3 0 -1 -2 2 2 -2 0 -3 -3 4 -3 -4 -1 -1 0 -2 -1 -2 6 14 4 3 1 8 11 2 2 1 2 25 1 0 3 5 7 1 2 3 0.40 1.79 28 E 0 1 -2 0 -5 1 0 -3 -2 0 -1 1 0 -2 3 0 0 -3 1 0 6 9 2 5 0 5 6 2 1 6 5 8 2 2 14 8 7 0 6 7 0.17 1.77 29 I 0 -2 -3 -2 -2 -2 -3 -4 -2 3 2 -2 1 0 3 -2 -1 -3 -1 0 8 2 1 2 1 2 2 1 1 20 23 2 3 3 16 3 4 0 2 5 0.42 1.74 30 E 0 1 0 3 -3 0 3 -3 -2 -1 -3 1 -3 -3 3 0 0 -6 -1 -2 6 7 3 15 0 4 17 2 1 4 2 8 0 1 14 6 5 0 2 3 0.33 1.76 31 P 0 -1 -3 0 -2 0 -1 -4 -2 1 0 0 -1 -2 5 -2 -2 -5 -2 2 8 3 1 5 1 4 4 1 1 8 9 6 1 1 28 2 2 0 2 13 0.44 1.71 32 P -2 -1 -2 1 -4 0 0 -3 -2 -1 -1 -1 -3 -4 6 0 0 0 -2 -2 3 3 2 8 0 3 6 2 1 3 6 3 0 1 41 7 5 1 1 2 0.77 1.71 33 K 1 -1 0 2 -2 -1 3 -1 -1 -2 -3 2 -2 -1 1 0 -1 -5 -1 -1 12 4 4 10 1 3 17 6 1 3 2 11 1 3 7 8 3 0 3 4 0.20 1.70 34 D -1 -1 1 3 -2 1 3 -1 -1 -2 -2 -1 -3 -2 2 1 -2 -1 -1 -3 5 3 6 17 1 5 16 5 2 2 4 3 0 2 9 12 2 1 3 2 0.28 1.69 35 T -1 -2 -1 -1 -2 -2 0 -3 1 1 2 -1 1 1 -1 -1 1 -2 2 0 5 2 3 3 1 1 5 1 4 7 22 4 4 6 3 5 10 1 6 7 0.17 1.63 36 P -1 -1 -1 1 -3 -2 0 -2 1 -3 -1 -2 -2 -2 6 0 1 -5 0 -2 4 4 3 8 1 1 5 4 3 1 7 2 1 2 34 8 8 0 3 3 0.57 1.62 37 P 0 0 -1 2 -2 -1 3 -1 0 -4 -4 0 -2 -3 4 0 -2 -3 -2 -2 8 4 2 10 1 2 18 5 2 1 2 6 1 1 23 7 2 0 1 2 0.46 1.60 38 E 0 -1 0 0 -2 -2 3 -2 1 1 0 1 -2 1 -2 0 -1 3 -2 -1 8 4 4 5 1 1 19 2 3 8 8 9 1 5 2 7 4 4 1 5 0.16 1.53 39 L -3 -3 -5 -3 -2 -2 -4 -4 -4 0 4 -2 3 4 0 -2 -1 1 -1 -2 2 1 0 2 1 1 1 1 0 4 41 2 7 19 5 3 4 2 1 2 0.64 1.48 40 W -1 1 3 0 -1 1 0 -1 -1 -2 0 1 -2 0 -1 0 0 -1 0 -2 4 8 14 4 1 7 6 5 1 2 9 9 1 4 2 8 7 1 4 2 0.14 1.51 41 E -1 2 0 2 -2 1 3 -2 1 -3 -2 1 -1 -1 -3 -1 0 -5 -3 -1 5 10 5 10 1 7 23 4 3 2 4 7 2 3 1 5 6 0 1 4 0.27 1.43 42 K -1 2 1 -2 -2 0 0 -3 2 -3 -4 4 -1 -4 3 1 -2 -2 -2 -3 5 13 5 2 1 3 5 1 5 2 1 24 2 1 16 12 1 1 1 1 0.48 1.37 43 M 1 3 -2 -3 3 0 -3 1 0 0 -1 -2 1 -2 -4 0 0 -4 3 -2 12 16 1 1 6 5 1 12 2 5 7 2 4 1 0 7 5 0 10 2 0.25 1.27 44 G 3 -4 -3 -2 -4 -3 -2 5 -4 -3 -3 -2 -1 -5 3 -1 -2 -5 -4 -3 23 0 0 1 0 0 3 42 0 1 3 2 2 0 17 2 1 0 0 2 0.80 1.13 45 V 1 -2 -4 -4 4 -4 -4 -4 -4 1 2 -4 0 -1 -2 0 2 -4 -3 3 13 2 0 0 10 0 0 0 0 8 16 0 2 2 2 6 16 0 0 21 0.44 1.12 46 F -2 -4 -4 -4 0 -2 -2 -4 2 -2 -1 -4 0 8 -4 -4 -2 2 2 -3 3 0 0 1 2 2 2 1 6 0 3 1 2 66 0 1 3 2 4 1 1.32 1.07 47 V -1 -4 -4 -5 2 -4 -4 -5 -5 3 -1 -4 -2 -3 -4 -3 1 -5 -3 6 3 0 0 0 4 0 0 0 0 13 3 0 0 0 0 0 10 0 0 63 1.01 1.11 48 T -2 0 -2 -3 0 -2 -3 -2 -3 -2 -3 -1 0 -3 -3 2 5 1 1 -1 1 5 1 1 2 1 1 3 0 2 1 3 2 0 1 16 48 2 6 5 0.69 1.04 49 L -3 -3 -4 -4 -3 -3 -4 -4 2 3 3 -1 1 0 -4 -4 -3 8 0 0 1 1 0 1 0 0 1 1 6 15 33 5 2 3 1 1 1 22 2 5 0.88 1.05 50 N 0 1 1 0 -5 1 0 -4 3 0 -1 0 2 1 -4 0 0 -4 2 0 6 6 6 6 0 6 6 0 6 6 6 6 6 6 0 6 6 0 6 6 0.16 1.67 51 R -2 1 -1 -1 -5 0 -1 -5 0 1 -2 4 0 -5 -4 -2 3 -5 -1 -1 3 7 3 3 0 3 4 0 2 9 5 29 2 0 0 3 16 0 2 4 0.43 1.97 52 Y 0 0 0 0 1 0 -1 -1 2 1 0 -1 1 0 -5 -1 -1 2 2 0 7 4 4 6 3 4 4 6 5 7 9 5 3 5 0 4 4 3 6 8 0.03 2.07 53 N -1 0 1 1 -4 -1 0 0 1 -1 -2 0 0 0 0 1 -1 2 0 -1 4 5 8 6 0 3 6 8 3 4 4 6 3 3 4 12 4 3 3 4 0.03 1.84 54 V 0 1 1 0 -1 -1 -1 0 2 0 -1 1 -1 -1 -1 0 1 -2 0 1 7 6 7 4 1 2 3 7 4 5 5 9 2 3 3 8 9 1 3 9 0.04 1.03 55 P -1 1 -1 1 -2 0 -1 1 -1 1 -2 0 -1 1 0 0 -1 1 1 -1 5 7 3 7 1 4 4 12 1 8 4 7 1 6 5 8 3 2 4 5 0.05 0.95 56 P -1 -1 0 0 -2 0 0 2 -1 2 -1 0 -1 -2 1 -1 -1 -1 -1 0 5 4 4 6 1 5 6 14 2 13 6 6 1 2 8 4 3 1 2 5 0.09 1.06 57 Q 0 2 2 3 -4 1 1 0 0 -3 -2 1 0 -4 -2 -1 -2 -4 -2 -3 9 10 11 17 0 6 8 6 2 1 4 8 3 1 2 5 2 0 1 2 0.26 1.14 58 T -1 2 -2 0 -4 -2 0 4 1 -4 -3 0 -2 -1 -1 1 -1 -1 0 -3 4 12 1 6 0 1 7 30 4 1 2 6 1 3 3 11 4 1 3 1 0.37 1.17 59 A 0 3 0 0 -2 3 3 -3 0 -3 -3 1 -2 -4 -3 1 -1 -1 -3 -3 7 17 3 6 1 13 20 1 2 1 1 6 1 0 1 13 4 1 1 2 0.40 1.22 60 L -1 -2 -4 -5 -3 -4 -4 -5 -4 1 5 -4 1 -2 0 -3 -3 5 -3 1 4 2 0 0 0 0 0 1 0 5 61 0 2 0 5 2 0 8 0 8 0.82 1.01 61 R -2 7 -1 -3 -1 0 -2 -4 0 -4 -2 1 0 -4 -4 -2 -3 -4 -4 -2 2 72 2 0 2 2 0 0 2 0 3 5 3 0 0 2 0 0 0 3 1.29 1.04 62 G 1 -4 -3 -3 -4 -3 -4 6 -4 -4 -4 -3 -4 -4 -4 0 -3 -4 -4 -1 8 0 0 0 0 0 0 75 0 0 1 0 0 0 0 6 0 0 0 5 1.37 1.02 63 C -2 -1 -3 -1 9 -3 -2 -4 -4 -1 -3 -4 -3 -1 -4 2 -1 -4 -4 -3 1 3 0 3 54 0 3 1 0 5 1 0 0 3 0 21 4 0 0 0 1.46 1.16 64 I 1 -2 -4 -5 3 -4 -4 -4 -4 5 1 -1 2 1 -4 -2 -1 2 1 0 14 3 0 0 7 0 0 0 0 34 10 4 5 5 0 3 3 2 5 4 0.52 1.28 65 G 0 0 -3 -3 -4 -3 -4 6 -4 -1 -5 -1 -4 -5 -4 0 0 -4 -4 -4 6 5 0 0 0 0 0 63 0 5 1 5 0 0 0 7 6 0 0 0 1.10 1.27 66 F -1 0 0 -1 0 -1 -2 -1 1 -2 -2 -3 0 0 -4 3 4 -4 -1 -1 4 6 4 2 2 2 2 4 3 2 4 0 2 4 0 27 26 0 3 3 0.40 1.31 67 P -3 -3 -5 -5 -2 1 -1 -5 -1 2 2 -2 1 4 1 -3 -2 0 3 0 2 1 0 0 1 6 4 0 2 14 17 3 4 19 9 2 2 1 8 5 0.45 1.56 68 T -1 0 1 0 -2 2 3 -2 0 -2 -2 -1 1 -1 -4 1 1 -1 0 -1 6 6 7 5 1 7 19 3 2 3 4 2 3 3 0 12 8 1 4 4 0.20 1.58 69 P 0 1 1 1 3 1 0 0 3 0 -1 0 -4 -5 1 0 0 -5 -4 -4 7 7 7 7 6 7 7 7 6 7 7 7 0 0 7 7 7 0 0 0 0.17 1.56 70 I -2 0 -1 1 -1 0 -1 -2 3 0 -1 -1 0 -1 -1 -1 2 0 0 2 3 5 2 9 1 3 5 4 6 6 6 4 2 3 3 5 13 1 3 15 0.13 1.71 71 Y -1 3 -2 1 0 3 0 -2 0 -2 -2 2 1 -1 -2 -1 0 1 0 -2 5 17 2 9 2 12 5 4 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