JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_GkE6ZJv.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet ||E|E|E|E|E||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|||||||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|||||||E|E|E|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E||||H|H|H|H|H|H||| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 8|3|6|8|9|8|5|4|7|7|8|7|7|7|6|3|3|7|8|9|9|9|9|9|9|8|7|4|2|6|6|2|0|4|2|1|1|1|0|3|7|6|5|1|4|4|1|2|1|7|8|7|8|7|5|3|2|2|1|2|2|3|1|1|1|5|6|7|7|7|7|7|7|7|7|6|5|0|1|8|8|8|8|7|4|1|5|7|8|7|0|2|1|3|0|6|7|8|7|7|6|5|4|7|8|8|9|9|9|9|8|6|0|4|7|8|6|2|2|1|0|1|2|4|2|8|8|9|9|9|9|9|8|8|4|2|7|7|6|1|6|7|7|6|1|4|7|7|7|7|2|1|1|2|2|7|7|5|3|1|1|2|3|6|7|7|7|7|7|0|1|2|1|3|3|4|2|1|5|7|7|1|4|7|6|3|1|7|7|4|6|8|9|9|9|9|8|7|5|3|8|9|7|3|6|6|1|4|5|5|8|7|7|6|4|0|8|9 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off -|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|B|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|B|B|-|B|-|-|B|-|B|-|-|B|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|B|-|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|B|-|-|B|B|-|B|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|-|B|-|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|B|-|B|B|-|B|-|B|-|-|B|-|-|-|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles ||E|E|E|E|E||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|E|E|E|E|E||||E|E|E|E|E|E|||||||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||E|E|E|E|E|||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E||||||H|H|H|H|H|||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|E|E||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E||||H|H|H|H|H|H|H|| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles ||E|E|E|E|E|||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|||||||||||E|E|E|E|||||||||E|E|E|H|H|H|H|||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|||||||E||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E||||||||||||||E|E|E|E|||||||||||H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|||H|H|H|H|H|H||| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | |*| |*|*|*|*|*|*|*| | | | | | | |*|*| | | | | | |*|*|*|*|*|*|*| | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | |*| | | | |*|*| |*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | |*|*|*|*|*| |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*|*|*|*| | | |*|*|*|*| | | | | | | |*|*|*| | | | | |*| | | |*| | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | |*| |