Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 M -3 -3 -4 -5 -3 -2 -4 -5 -3 -1 0 -3 10 -2 -4 -3 -2 -3 -3 -1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 1.91 0.76 2 F -4 -1 -1 -1 -4 -4 -2 -5 -3 1 3 -1 -1 6 -3 -4 -4 -2 1 -2 0 3 3 4 0 0 2 0 0 7 28 4 0 43 2 0 0 0 4 0 0.79 0.90 3 K -3 2 1 0 -5 6 -1 -4 0 -1 -3 4 -2 -5 -4 -1 -2 -5 -4 -4 1 10 5 5 0 39 2 0 2 5 2 23 1 0 0 3 2 0 0 0 0.84 1.22 4 G -2 -1 -4 -4 -6 -2 -3 -2 1 -6 -6 -1 -5 -5 8 -1 -2 -6 -5 -5 2 3 0 0 0 1 1 4 4 0 0 4 0 0 74 3 2 0 0 0 1.97 1.50 5 I 1 -6 -6 -6 -4 -5 -5 -6 -3 5 -1 -5 -1 -2 -5 -4 -2 -5 -1 5 13 0 0 0 0 0 0 0 1 37 2 0 1 1 0 1 1 0 2 42 1.13 1.54 6 I -3 -6 -6 -6 -4 -6 -6 -5 -6 8 0 -6 -1 -3 -6 -5 -4 -6 -4 2 1 0 0 0 0 0 0 1 0 81 7 0 1 0 0 0 0 0 0 10 1.74 1.58 7 A 5 3 -4 -5 -1 -3 -4 -2 -2 -5 -4 -1 -2 -5 5 -2 -2 -6 -3 -3 43 15 0 0 2 0 0 2 1 0 1 4 1 0 27 1 1 0 1 1 0.99 1.60 8 A 5 -2 -1 -2 -4 -1 -2 -2 -2 -5 -5 -1 -2 -5 -4 3 0 -6 -5 -3 56 2 3 2 0 2 1 2 1 0 0 2 1 0 0 22 5 0 0 1 0.93 1.61 9 L -1 -5 -6 -6 -4 -5 -5 -6 -6 4 1 -5 5 -3 -2 -4 -2 -2 -4 5 4 0 0 0 0 0 1 0 0 22 12 0 15 0 2 0 2 1 0 42 1.05 1.62 10 W -3 4 0 -3 -6 1 0 -5 -1 -6 -5 6 -2 -4 -4 -2 -2 1 -2 -4 1 24 3 1 0 4 4 0 1 0 0 52 1 1 0 2 2 2 1 1 1.15 1.63 11 D -4 -1 3 6 -5 2 2 -2 2 -6 -6 -2 -5 -6 -3 0 -2 -6 -2 -5 0 2 12 49 0 8 11 3 4 0 0 1 0 0 1 5 1 0 1 0 1.09 1.63 12 M -2 -3 -4 -2 -3 -4 -1 -5 -4 1 4 -5 3 4 -2 -5 -3 0 -1 -1 3 1 1 2 0 0 5 0 0 7 45 0 6 19 2 0 1 1 1 3 0.75 1.64 13 D -3 0 -1 3 -4 1 6 -4 -1 -6 -6 2 -5 -6 -4 -2 -2 -6 -4 -5 1 4 3 16 0 6 54 0 1 0 0 10 0 0 0 2 1 0 1 1 1.14 1.63 14 S 1 2 -1 2 -4 1 1 -1 -1 -3 -2 4 -3 -3 -4 -1 -1 -2 -2 -2 12 10 3 10 0 6 8 6 2 2 5 25 1 1 0 4 3 0 2 2 0.34 1.63 15 I 3 -4 -6 -6 2 -5 -5 -5 -5 1 3 -5 0 3 -4 -3 -3 -5 -3 1 30 1 0 0 4 0 0 0 0 9 31 0 2 14 1 1 1 0 0 8 0.74 1.62 16 G -1 -1 -3 -3 -1 -2 -1 -4 -2 2 5 -2 1 -2 -2 -4 -2 -5 -2 -1 5 3 1 1 2 2 4 1 1 12 51 2 3 1 3 1 2 0 1 3 0.63 1.62 17 E 0 0 1 2 -6 2 3 -2 1 -4 -4 3 -3 -6 -4 0 0 -6 -4 -4 9 5 7 10 0 8 19 2 3 1 2 19 1 0 0 7 6 0 0 1 0.47 1.62 18 I 0 -3 -2 -4 1 -3 -2 -2 -2 -3 -2 -2 -3 -4 -3 5 2 -6 -1 -2 8 1 1 0 3 1 1 3 1 1 5 2 1 1 1 54 13 0 2 3 0.80 1.62 19 E -2 0 2 4 -4 0 2 -3 0 -6 -4 1 -4 -6 3 0 -2 -6 -4 -4 2 5 10 25 0 3 15 2 2 0 1 9 0 0 14 7 2 0 0 1 0.61 1.62 20 P 2 -3 -2 -3 4 -3 -4 -4 2 1 -1 -4 -2 1 -1 1 -1 0 4 2 15 1 2 1 8 1 1 1 4 7 5 0 1 5 4 10 2 1 14 16 0.39 1.60 21 D -2 2 1 1 -1 3 4 -2 -1 -5 -4 2 -3 -6 1 0 -1 -6 -5 -3 2 9 6 8 1 11 26 3 1 0 1 13 0 0 6 7 4 0 0 2 0.50 1.60 22 V 1 -2 -3 -5 1 -4 -2 -5 -3 3 -2 -4 0 0 -5 -2 1 2 4 3 10 2 1 0 3 0 3 0 1 18 3 1 2 3 0 3 7 2 16 23 0.53 1.60 23 V -1 -6 -6 -6 4 -5 -6 1 -6 5 0 -5 0 -2 -6 -3 -3 -5 -3 4 4 0 0 0 8 0 0 11 0 32 7 0 2 1 0 1 1 0 1 31 0.89 1.57 24 F -4 -6 -3 -6 -5 -4 -4 -6 -5 3 0 -6 0 7 -6 -2 -4 -3 1 3 1 0 2 0 0 1 1 0 0 14 9 0 2 44 0 3 0 0 4 21 1.14 1.59 25 L -4 -5 -6 -7 -4 -5 -6 -7 -6 3 5 -6 2 2 -6 -5 -2 -5 -2 3 1 0 0 0 0 0 0 0 0 15 53 0 4 7 0 0 2 0 1 17 1.07 1.61 26 L 0 -4 -6 -6 -4 -3 -5 -5 -6 0 5 -4 4 -3 -4 0 -2 -5 -4 -1 7 0 0 0 0 1 0 1 0 3 68 1 9 0 0 7 2 0 0 2 1.09 1.65 27 K -3 -3 2 3 -2 -2 2 1 1 -2 -4 -2 -2 2 -5 -1 2 -2 3 -4 1 1 10 18 1 1 12 11 4 2 1 2 1 7 0 4 12 0 10 1 0.42 1.65 28 S 0 -5 -3 -4 -1 -5 -4 5 -5 -1 -2 -5 0 -2 -5 1 1 -6 -5 1 5 0 1 0 1 0 0 50 0 4 3 0 3 2 0 9 8 0 0 13 0.85 1.65 29 D -3 -1 4 4 -6 -1 -1 -4 7 -6 -6 -1 -5 -6 -2 0 0 -6 -2 -6 2 3 18 27 0 2 4 1 25 0 0 3 0 0 2 7 7 0 1 0 1.01 1.65 30 I -4 -6 -6 -7 -4 -6 -6 -7 -6 6 3 -6 2 -2 -4 -5 -4 -5 -2 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 55 24 0 4 1 1 0 0 0 1 14 1.33 1.65 31 L 1 -1 1 -3 4 -3 -4 2 -2 -1 1 -2 1 2 -4 1 -2 -5 -3 -2 11 4 7 1 10 1 0 18 1 4 12 2 4 9 0 12 2 0 1 2 0.32 1.65 32 N -3 0 4 0 -5 4 1 -3 3 -3 -2 0 0 -2 -4 0 1 -5 -2 -1 2 4 22 5 0 17 8 1 6 2 3 4 2 2 0 8 9 0 1 4 0.46 1.58 33 L -2 -5 -5 -6 -4 -5 -5 -6 -5 4 5 -5 1 -1 -5 -5 -2 -4 -4 1 4 0 0 0 0 0 0 0 0 24 53 0 3 2 0 0 2 0 0 9 1.04 1.62 34 K 0 1 -3 -2 -3 1 1 0 -1 -1 -2 4 0 -4 2 -1 -2 -5 -4 -2 7 6 1 2 1 7 8 6 1 4 3 30 2 1 12 4 2 0 0 2 0.43 1.62 35 F -1 1 1 2 -5 1 3 0 1 -4 -4 1 -2 -3 0 2 -2 -5 -2 -3 5 7 7 10 0 5 17 7 4 1 1 7 1 1 4 18 2 0 2 1 0.33 1.62 36 H -1 -3 -3 -4 -2 -3 -3 -5 -1 5 2 -3 2 -1 -4 -3 0 -4 3 2 4 2 1 1 1 1 2 0 2 29 20 1 4 2 1 2 5 0 9 12 0.55 1.62 37 L -1 -2 -3 -5 0 -3 -3 -4 -2 2 0 -2 2 0 -5 -1 -1 -5 -1 5 4 3 1 0 2 1 2 1 1 12 6 2 6 4 0 5 3 0 2 44 0.64 1.62 38 K 0 1 0 2 -3 2 2 -2 0 -4 -4 3 -3 -2 -2 0 -1 -5 -1 -4 8 7 5 13 1 9 13 3 2 1 2 19 1 2 2 7 3 0 2 1 0.36 1.62 39 I -1 3 -2 -3 -2 1 1 -4 0 -1 2 2 3 0 -4 -2 0 -4 1 -1 4 14 2 1 1 7 8 1 2 3 19 11 7 4 0 3 5 0 5 4 0.27 1.56 40 L 2 -4 -5 -5 3 -4 -3 -2 -5 3 3 -4 1 1 -4 -1 -2 -4 -1 2 20 0 0 0 5 0 1 3 0 16 26 0 3 5 0 4 2 0 2 11 0.49 1.56 41 K -2 3 0 -1 -5 1 -1 -2 4 -3 -3 5 -4 -3 -4 -2 -1 -5 -2 -3 3 13 4 3 0 5 2 2 10 1 3 42 0 1 0 3 4 0 1 2 0.74 1.58 42 D 1 2 -1 1 -5 3 2 -1 -1 -5 -4 3 -2 -5 -3 1 -2 -5 -1 -3 10 12 2 7 0 13 12 4 1 0 2 18 1 0 1 10 2 0 2 1 0.41 1.58 43 R 3 2 1 -3 0 -1 -1 -2 6 -5 -4 1 -1 -2 -2 0 -2 -5 1 -3 26 9 7 1 2 2 3 3 19 0 2 9 1 1 1 6 2 0 4 2 0.53 1.58 44 G -2 0 3 2 0 1 0 4 2 -5 -5 0 -4 -5 -1 -1 -3 -5 -4 -5 3 6 12 10 2 7 5 37 5 0 1 5 0 0 3 4 1 0 0 1 0.62 1.39 45 K -3 0 -3 -4 -5 -1 -3 -2 1 1 -2 6 1 -1 -1 -3 -3 1 -4 -1 0 4 0 0 0 2 0 2 3 10 4 56 4 2 3 0 0 2 0 5 0.88 1.44 46 T -1 -1 -1 -1 1 0 2 -2 1 1 0 2 1 1 -1 -1 0 -4 0 -1 5 4 3 3 3 4 12 3 3 8 10 13 4 5 4 4 5 0 3 4 0.09 1.61 47 V 2 -5 -4 -5 2 -4 -4 -1 -4 1 0 -4 2 1 0 -1 0 -4 1 4 16 0 0 0 5 0 0 5 0 8 8 0 6 5 5 4 5 0 4 26 0.41 1.61 48 F -3 -4 -4 -5 -2 -4 -4 -5 -3 3 2 -4 2 6 -4 -4 -3 -1 2 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 18 16 1 5 40 1 1 1 1 7 5 0.93 1.11 49 V -2 -4 -4 -5 -3 -4 -4 -5 -4 3 2 -4 0 -2 -4 -4 -2 -4 -1 5 2 1 0 1 0 0 1 1 0 17 19 1 2 1 1 1 1 0 2 51 0.90 1.11 50 D -3 -1 3 0 -4 -2 -2 -4 10 -5 -4 -3 -4 -3 -4 -3 -3 -4 0 -4 1 2 16 5 0 0 1 1 68 1 1 1 0 0 1 1 1 0 2 1 1.84 1.11 51 M 1 -4 -4 -4 -2 -2 -2 -4 1 4 1 -4 3 0 -2 -3 -1 -4 -2 3 10 0 0 1 1 2 2 1 4 22 14 1 8 5 2 1 3 0 1 23 0.49 1.15 52 D -4 -3 -1 7 -5 -2 2 -3 -3 -5 -5 -2 -4 -5 -3 -2 -3 -5 -4 -5 1 0 1 76 0 0 13 1 0 0 1 1 0 0 0 1 1 0 0 1 1.64 1.15 53 F -3 -2 -4 -4 -3 -3 -4 -4 -4 -1 5 -2 4 2 -4 0 -2 -3 -3 -2 2 2 0 1 0 0 1 1 0 2 56 3 12 8 0 9 2 0 0 1 0.79 1.17 54 V -2 -4 -4 -5 3 -4 -4 -5 -4 6 1 -4 1 -1 -4 -3 -1 -4 -3 3 2 0 0 1 5 0 1 1 0 46 11 1 3 2 0 2 3 0 0 20 0.87 1.17 55 N -2 -1 1 2 -4 2 3 2 1 -4 -4 2 -3 -5 0 0 -1 -4 -4 -3 3 3 6 10 0 9 21 15 3 0 1 10 0 0 4 7 4 0 0 1 0.40 1.17 56 G -2 -4 -3 -3 -4 -4 -4 7 -4 -5 -5 -4 -5 -5 -4 -3 -4 -4 -5 -5 1 0 0 0 0 0 0 93 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 1.95 1.19 57 L -3 -4 -5 -5 -3 -4 -5 -5 -4 3 5 -4 1 2 -4 -3 -2 -3 -1 0 2 0 0 0 0 0 0 1 0 17 57 0 3 10 0 1 2 0 1 3 0.91 1.19 58 G 2 0 0 -2 -4 -1 -2 3 -1 -4 -4 2 -4 -4 -3 4 -1 -5 -4 -3 15 4 4 1 0 2 1 20 1 0 1 13 0 0 0 34 3 0 0 1 0.58 1.19 59 E 0 1 3 -2 -3 2 -1 -1 2 -4 -3 1 -3 -3 1 2 1 -4 -1 -3 8 9 13 1 0 8 2 5 6 1 2 10 0 1 7 16 7 0 2 1 0.30 1.19 60 G -3 0 0 7 -5 -2 -1 -2 -1 -5 -5 2 -4 -5 -3 -1 -2 -5 -4 -5 1 4 3 65 0 1 1 2 1 0 1 11 0 0 0 4 2 0 0 1 1.27 1.19 61 E -1 3 0 0 -5 1 4 -3 0 -3 -4 3 -3 -4 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