JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_CGmQKYB.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet |||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|||||E|E|E|E|E|E||||H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||E|E|E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|||||||||||||E|||||E|E|E|E|E|E|||||||E|E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 9|9|9|8|7|2|4|6|8|8|8|8|7|4|0|7|8|5|4|7|6|2|7|8|7|0|7|8|8|7|4|0|7|5|4|7|8|8|7|6|8|7|5|2|4|6|7|8|7|7|7|7|7|5|2|6|7|7|6|5|1|5|8|8|8|6|0|3|6|6|6|6|4|3|1|8|8|7|3|5|8|8|7|4|4|7|7|4|6|8|9|9|9|9|9|9|9|8|7|1|1|6|8|8|5|2|4|1|6|5|2|1|7|8|8|8|8|8|5|3|7|7|1|2|3|1|2|1|2|0|6|7|7|7|7|7|7|6|2|2|0|0|1|4|7|8|0|5|8|9|8|2|3|7|8|8|7|3|6|8|8|6|2|5|7|7|2|2|7|8|9|9|9|8|6|1|1|1|7|2|2|3|1|9|9|9|9|9|9|9|9|8|7|5|3|0|4|0|2|1|4|5|5|6|7|7|5|4|3|2|3|6|7|7|6|6|4|5|6|5|5|6|7|7|7|7|6|4|2|8|9|9|9|9|9|9|8|5|1|8|9 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|B|B|-|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|-|B|-|B|-|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|B|B|B|-|-|B|-|B|B|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|B|B|-|-|B|B|B|-|B|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|B|B|-|B|-|-|B|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|B|-|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles |||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|E|||H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||E|E|E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|E||||H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||E|E|E|E|E||||||||E|E|E|E|E||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||H|H|H||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles ||||||H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|||||E|E|E|E|E|E||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||E|E|E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E|E|||||||E|E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|||||E|E|E|E|E|E|E|E|||||||H|H|H||||||||||||E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|||||||E|E|E|E||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||H|H|H||||||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree | | | | |*| | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | |*| | | |*| | | | | | | | | | |*|*|*| | | |*|*| | | | | | | | | |*|*|*|*| | | |*| | | | |*| | | | | | | | | | |*| | | |*| | | | | | | | | |*|*| | |*|*|*| | | | | | | | | | | |*|*| |*|*| | | | | | | | | |*|*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| |