JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_p9WjP1z.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet ||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E|E|E|E||E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E||||E|E|E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E||||E|E|E|E|E|E||||E|E|E|E|E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||E|E|E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||H|H|H|H|H|H||||||||||||||||||E|E|E|E|||||||||||||||||||||||E|E|E|E||||E|E|E|E|E|H|||H|H|H|H|H|H|H||||||||||||E|E|E|||||||H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E||||E|E|E|E|E|E||||E|E|E|E||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|||||E|E|E|E|E|E|E|||E|E|E|E|| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 9|7|5|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|8|5|3|8|8|6|5|8|9|9|9|9|8|7|0|3|5|8|9|9|9|7|3|5|7|1|1|1|4|3|0|3|4|0|2|7|8|9|9|9|8|5|5|6|1|8|9|9|8|6|2|6|8|7|4|6|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|6|2|1|6|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|6|5|2|7|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|8|5|1|6|8|8|8|1|3|5|6|6|5|3|4|2|1|1|1|0|1|2|3|4|4|1|6|4|2|3|4|4|4|2|0|2|6|1|8|9|9|8|8|8|7|1|2|1|7|7|7|4|0|3|0|1|1|0|0|1|7|7|7|7|7|6|5|2|1|1|1|2|5|5|8|9|9|9|9|9|9|9|9|8|6|0|4|7|8|8|8|8|7|5|1|6|8|8|7|4|4|7|7|5|2|5|8|9|9|9|9|8|6|2|5|7|6|1|7|8|9|9|8|2|2|1|3|1|1|2|2|3|0|1|0|0|6|7|7|7|6|1|2|3|3|2|5|6|7|6|7|6|7|7|7|7|7|7|7|7|6|6|5|4|6|7|5|2|1|0|2|1|1|3|1|1|2|1|0|1|3|2|7|9|9|8|8|7|5|1|5|7|6|7|7|7|7|5|0|2|2|3|2|1|3|3|3|2|1|5|4|6|6|5|1|5|8|8|5|5|7|7|5|1|6|7|7|7|7|7|5|4|5|6|5|5|1|2|4|6|7|8|8|8|8|7|0|1|8|5|0|9|9|9|5|0|8|8|5|5|8|7|4|4|1|6|7|7|7|7|5|4|6|1|3|5|7|7|4|1|1|5|7|6|0|1|9|9|9|9|8|5|4|4|6|8|7|3|4|8 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off -|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|-|-|-|B|-|-|B|-|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|-|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|-|-|-|B|-|B|B|-|-|B|B|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|B|B|B|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|-|B|-|B|B|B|-|-|B|-|B|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|B|B|B|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|-|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|B|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|-|B|-|-|B|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles ||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E|E|E|E||E|E|E|E|E|E||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E||||E|E|E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E||||E|E|E|E|E|E|E|||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|E|E|||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||E|E|E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||H|H|H|H|H||||||||||||E|E||||||E|E|E|E|||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|||E|E|E|E|E|E|||H|H|H|H|H|H|H||||||||||||E|E|E|||||||H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E|E||||E|E|E|E|E||||E|E|E|E||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||E|E||||||E|E|E|E|E|E|||E|E|E|E|| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles ||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E|E|E|E||E|E|E|E|E|E|E||||||E|E|E|||E|E|E|E|E|E|E|E|E|||E|E|E|E|E|E||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||E|E|E|E|E|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|||||||E|E|E||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||E|E|E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||H|H|H|H|H|H|H|H||H|H|H|H|H|H|||||||||||E|E|E||||||||||||||||||||||||E|E||||H|H|H|H|H|H|H|H||H|H|H|H|H|H|H|||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H||H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|E|E||||E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|||||E|E|E|E|E|E|E|||E|E|E|E|| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | |*|*|*| | | |*|*| | | | | | | | | | | |*| | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | 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