Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 M -5 -5 -6 -7 -5 -4 -6 -7 -5 0 2 -5 11 -3 -6 -5 -4 -5 -5 -3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 14 0 83 0 0 0 0 0 0 0 2.50 1.86 2 I -4 -4 -3 -2 -5 -3 -4 -6 -4 4 0 -2 8 -2 -6 -2 3 -3 -3 -1 0 1 1 2 0 1 1 0 0 18 7 3 36 1 0 3 21 0 1 3 1.03 1.89 3 T 0 -1 -2 -2 -5 0 0 -5 -3 1 -2 2 -3 -2 -1 3 4 -6 -4 -2 6 2 1 2 0 4 6 0 0 9 5 11 0 2 3 18 26 0 0 2 0.43 1.90 4 D -2 -3 1 6 -6 2 4 -4 -3 -3 -4 -1 -3 -5 -2 -2 -1 -3 -3 -4 3 1 5 40 0 8 23 1 1 1 2 4 1 0 2 2 3 0 1 1 0.90 1.86 5 E -1 -1 0 2 -6 4 5 -4 0 -3 -2 -1 -2 -3 -1 -1 0 -5 -3 -4 4 3 4 10 0 16 32 1 2 2 6 4 1 1 3 4 5 0 1 1 0.58 1.86 6 N 2 -4 2 0 -4 0 -2 -4 -2 0 3 -3 -2 1 -2 -2 0 -5 -2 -1 15 1 9 6 0 4 3 1 1 5 31 2 1 6 2 2 5 0 1 4 0.33 1.93 7 K -2 3 -1 -2 -6 4 3 -5 1 -3 -2 5 -3 -4 -3 -2 -3 -6 -4 -5 4 14 2 2 0 15 18 1 3 2 4 28 0 1 1 3 1 0 1 0 0.71 1.97 8 K 0 1 0 3 -6 3 4 -4 -2 -4 -4 2 -4 -5 -3 0 -1 -6 -4 -4 9 7 5 16 0 10 24 1 1 1 2 10 0 0 1 7 4 0 0 1 0.55 1.99 9 L -1 -2 -4 -4 -2 -3 -5 -6 -4 4 4 -2 1 0 -4 -4 0 -3 -3 1 6 3 1 1 1 1 1 0 1 23 39 2 3 4 1 1 6 0 1 7 0.67 2.01 10 A 4 -4 -4 -5 0 -3 -3 -3 -6 1 2 -3 2 -4 -4 -2 -1 -6 -4 3 33 1 1 0 2 1 1 2 0 7 20 1 4 1 1 3 3 0 0 18 0.59 2.02 11 Q 0 0 0 3 -5 4 5 -2 -1 -5 -5 0 -4 -5 -4 0 -1 -6 -4 -4 6 4 4 14 0 16 32 3 2 1 1 6 0 0 1 6 3 0 1 1 0.68 2.05 12 W -1 3 -1 2 -4 3 1 -4 -1 -2 -3 3 -3 0 -5 -1 -1 2 1 -3 6 15 3 10 0 11 8 1 1 3 3 19 1 4 0 4 3 2 4 1 0.40 2.06 13 A 3 -5 -5 -5 -1 -4 -5 -4 -6 3 3 -4 -1 -3 -5 -3 -1 -2 -4 3 27 0 0 0 1 1 0 1 0 14 26 1 1 1 0 1 4 1 0 20 0.71 2.05 14 M -3 -4 -5 -5 -4 -3 -4 -6 -5 3 5 -3 1 1 -6 -4 -4 -5 -4 2 2 1 1 0 0 1 1 0 0 17 52 1 3 4 0 1 1 0 0 13 0.96 2.05 15 D 1 0 1 3 -4 1 4 -1 -1 -5 -5 1 -4 -5 -4 1 -1 -6 -4 -4 11 5 6 17 0 5 22 6 1 1 1 7 0 1 0 11 3 0 1 1 0.49 2.01 16 Y 1 2 -3 -3 -3 0 1 -4 2 0 2 1 -1 0 -5 -2 0 -1 2 -2 12 10 1 1 1 5 9 1 4 5 19 8 2 4 0 3 6 1 8 2 0.23 1.99 17 A 6 -4 -4 -5 0 -4 -4 0 -5 -1 0 -4 -1 -4 -4 1 -2 -5 -4 -1 56 0 0 0 2 0 1 8 0 4 9 1 1 1 0 10 2 0 1 3 0.86 1.98 18 L -1 3 -3 -4 -3 0 0 -4 -1 -1 3 4 0 -4 -4 -2 -1 -4 -3 -2 4 16 1 1 1 3 5 1 1 3 27 24 2 1 1 2 4 0 1 3 0.50 2.02 19 K 2 3 0 -1 -3 1 1 -1 -2 -4 -4 4 -4 -4 -3 1 -1 -3 -4 -3 16 12 4 3 1 6 9 4 1 1 2 21 0 1 1 12 4 0 0 1 0.41 1.92 20 N 2 1 0 0 -2 1 -1 -2 2 -3 2 1 -1 -2 -3 1 -1 -4 0 -2 17 6 5 5 1 6 4 3 4 2 17 9 2 2 1 9 4 0 3 2 0.16 1.91 21 G -1 -2 -1 -1 -4 -1 -2 6 -2 -5 -5 0 -5 -4 -2 -2 -2 -5 -4 -4 4 2 3 4 0 2 3 63 1 1 1 5 0 1 2 3 2 0 1 1 1.12 1.85 22 C 5 -4 -3 -3 3 -4 -4 0 -5 1 -2 -4 -3 1 -4 -2 -2 -5 -1 0 50 1 1 1 6 0 1 7 0 8 3 1 1 6 1 3 2 0 2 7 0.75 2.01 23 Q -3 -2 -1 6 -4 0 3 -3 -3 -5 -4 -2 -4 -5 -3 1 1 -4 -3 -4 2 2 2 44 0 4 15 1 1 1 1 3 0 0 1 12 9 0 1 1 0.93 2.02 24 A 1 -3 -3 2 -4 1 2 -1 1 -4 -4 -1 -3 4 -4 -1 -3 0 5 -3 13 1 1 12 0 6 11 5 3 1 2 3 1 14 1 4 1 1 18 2 0.50 2.01 25 A 5 -5 -4 -4 4 -4 -4 0 -4 -1 -2 -4 -2 1 -5 -1 -1 2 0 2 43 0 1 1 7 0 1 7 0 4 5 0 1 5 0 3 4 3 3 13 0.65 2.07 26 K -1 -2 -3 5 -3 -1 6 -4 -3 -2 -5 -3 -2 -4 -5 -1 -2 -3 -4 -2 5 2 0 27 1 2 45 1 0 3 1 1 1 1 0 5 2 0 1 3 1.00 2.08 27 V 1 -6 -7 -7 -1 -5 -6 -6 -5 4 2 -5 -1 0 -6 -4 -2 -4 -3 5 13 0 0 0 1 0 0 0 0 22 20 0 1 3 0 0 2 0 0 35 0.91 2.09 28 L -2 4 -2 -2 -4 -3 -2 -3 -2 -1 -1 -3 -1 4 -6 0 -1 -2 5 0 3 21 2 2 0 1 3 2 1 4 5 1 1 16 0 6 3 1 19 7 0.58 2.11 29 L 0 -4 -5 -4 -1 -3 -2 -2 -2 3 2 -4 0 4 -5 -3 -3 0 2 3 9 1 0 1 1 2 3 4 1 14 18 1 2 13 0 2 1 1 7 20 0.48 2.11 30 Y -2 -3 0 -2 -2 2 4 -1 2 -1 -3 -3 -2 -4 -5 2 0 -3 1 1 3 1 4 2 1 10 25 4 5 4 2 1 1 1 0 16 6 0 5 10 0.41 2.11 31 S -1 4 0 2 -3 1 3 -3 2 -4 -5 2 -4 -4 -5 1 -1 -3 0 -2 5 19 4 10 1 6 18 2 5 1 1 10 0 1 0 10 3 0 3 3 0.44 2.11 32 S 0 1 0 -1 -3 -1 0 1 -1 -2 -4 -1 -3 -5 -5 4 2 -3 -1 0 7 8 3 3 0 3 6 11 1 3 1 3 0 0 0 27 14 0 3 6 0.37 2.10 33 S -1 3 0 0 -3 2 2 -2 0 -2 -2 1 -4 -2 -5 1 2 -2 -1 -2 4 16 4 5 1 7 13 3 2 2 5 8 0 2 0 11 11 1 2 3 0.27 2.10 34 N -1 0 3 0 -6 -1 1 2 1 -4 -4 -2 -3 -1 -4 3 0 -4 -1 -3 5 5 12 5 0 2 10 16 3 1 2 2 1 3 1 23 6 0 2 2 0.37 2.08 35 T 0 -1 0 -3 -3 0 1 -4 -2 2 2 -3 -1 0 -5 -1 2 -1 -2 2 6 4 4 2 0 5 9 1 1 12 19 1 1 4 0 4 14 1 1 11 0.25 2.08 36 S -1 3 1 -1 -4 -1 -1 -1 0 -4 -4 -2 -2 -1 -3 5 0 -3 -1 -2 3 13 5 3 0 3 5 5 2 1 2 2 1 3 1 39 6 0 2 2 0.53 2.08 37 F -1 -4 -5 -7 -1 -5 -5 -6 -3 3 2 -6 0 4 -6 -4 -3 5 1 4 4 1 1 0 1 1 0 0 1 17 17 0 2 16 0 1 2 7 4 24 0.79 2.08 38 E 1 4 1 1 -4 0 2 -2 -2 -3 -2 -1 -2 -2 -5 2 0 -4 -3 -1 10 18 7 7 0 4 13 3 1 2 4 3 1 2 0 14 5 0 1 5 0.30 2.10 39 L 0 0 2 -1 -1 -1 -3 -2 -1 0 2 -1 1 -1 -6 -3 -1 4 -2 3 7 5 9 4 1 3 1 3 1 5 20 3 4 3 0 1 5 5 1 18 0.28 2.14 40 R 0 5 3 0 -3 -1 1 3 -2 -5 -5 0 -3 -4 -4 -1 -2 -3 -4 -5 8 26 15 4 1 2 8 20 1 1 1 5 1 1 0 4 2 0 1 1 0.61 2.14 41 D -2 2 3 4 -4 1 4 -2 -2 -5 -6 2 -5 -5 -4 -2 -2 -1 -4 -4 4 10 13 18 0 5 21 4 1 1 1 13 0 1 0 3 2 1 1 2 0.61 2.13 42 M -2 -4 -2 -5 -3 -3 -4 -1 -6 4 2 -4 3 -2 -1 -3 -2 -6 -4 5 4 1 2 1 0 1 1 5 0 17 20 1 6 2 3 2 2 0 0 32 0.65 2.11 43 D -3 0 -1 2 -4 0 5 -1 -1 -4 -5 2 -3 -5 -4 0 2 -7 -4 -3 1 6 2 12 0 3 31 5 2 1 1 14 1 1 0 8 12 0 1 2 0.61 2.14 44 R -2 0 2 0 -3 3 0 -2 1 -3 -3 0 -1 -3 -2 1 4 -3 -3 -2 3 5 8 5 0 12 7 4 3 2 3 6 2 2 2 10 22 0 1 2 0.33 2.15 45 L 1 -4 2 -4 -2 -4 -4 -1 -3 3 1 -4 -1 0 -2 0 0 -6 1 2 12 1 10 1 1 1 1 5 1 14 12 1 1 3 2 8 6 0 5 15 0.29 2.13 46 Q -2 0 0 -1 -3 1 3 3 1 -3 -4 1 -2 -4 -5 2 1 -3 -3 -1 3 5 5 3 1 5 17 18 3 2 2 8 1 1 0 15 8 0 1 4 0.34 2.13 47 Q -1 2 0 -1 -1 1 0 -3 2 -1 -2 -2 -2 3 -3 1 1 1 2 -1 6 9 5 3 1 6 6 2 5 4 4 2 1 10 1 10 7 2 5 5 0.11 2.11 48 A 0 -1 2 0 -2 -2 -2 1 0 -2 -3 -1 -2 -4 -4 3 1 2 -2 0 9 3 10 6 1 2 3 10 3 2 3 4 1 1 1 19 9 3 1 7 0.19 2.09 49 S -1 2 2 0 -3 1 2 -3 1 1 -2 -1 -1 -1 -3 1 1 -2 -2 0 4 9 8 4 1 6 12 2 3 8 4 4 1 3 1 9 9 1 2 6 0.10 2.08 50 E -2 -1 0 4 -2 0 2 0 0 -3 -4 -2 -2 -3 -3 3 0 -2 -1 -2 3 3 4 20 1 3 11 6 2 2 2 2 1 1 1 21 6 1 2 3 0.32 2.04 51 G -1 3 -1 -1 -1 2 0 1 0 -1 -2 0 -1 -1 -4 0 0 -1 -1 0 5 14 3 3 2 8 7 10 2 4 4 6 2 3 1 7 7 1 2 6 0.07 2.01 52 G 0 -2 0 -1 -2 -2 -2 5 -1 -3 -4 -1 -1 -3 -2 1 0 0 -2 -2 7 2 4 4 1 2 3 37 2 1 1 5 1 1 2 10 6 1 2 4 0.42 1.97 53 L 0 -2 -3 -4 -1 -3 -3 -2 -1 2 2 -3 1 1 -6 -3 0 -1 0 3 7 2 1 1 1 1 2 3 2 12 20 1 3 6 0 2 6 1 3 19 0.27 1.95 54 S 0 -2 -2 -1 0 -2 -1 4 0 -3 -3 -2 1 -2 -5 2 2 2 -2 -1 6 2 2 4 2 2 4 25 2 2 2 2 4 2 0 15 12 2 2 4 0.28 1.91 55 L -2 -2 -5 -6 0 -5 -5 -3 0 4 2 -5 1 1 -5 -3 -2 1 0 4 3 2 0 0 2 0 0 2 2 18 20 0 3 6 0 2 2 2 2 25 0.50 1.78 56 S -2 6 -1 -1 1 0 -1 -2 1 -1 -3 0 0 -1 -5 -1 1 -5 0 -2 3 35 3 3 3 4 3 3 3 3 3 4 3 3 0 4 10 0 3 3 0.45 1.87 57 L 0 0 -4 -5 3 1 -4 0 -4 0 -1 0 3 1 -5 0 0 4 2 0 6 6 0 0 6 6 0 6 0 6 6 6 6 6 0 6 6 6 6 6 0.17 1.67 58 Y -2 -2 -4 -5 0 -3 -4 -3 -1 3 2 -4 0 4 -6 -3 -2 4 4 2 3 2 1 1 2 1 1 2 2 15 15 1 2 15 0 2 2 5 13 12 0.53 2.10 59 V 0 1 0 -1 0 -1 -2 -3 2 -1 -1 2 -1 1 -5 0 -2 -1 2 2 8 8 5 4 2 2 3 3 5 4 5 14 1 6 0 6 2 1 6 13 0.17 2.07 60 D -2 -2 3 3 -6 -1 -1 5 -1 -4 -5 -1 -2 -3 -2 -2 -3 -6 -3 -4 2 2 15 15 0 3 4 41 1 1 1 4 1 1 2 2 2 0 1 1 0.81 2.08 61 G -2 0 1 0 -1 1 1 4 0 -3 -2 2 -2 -2 -3 -2 -1 0 -2 -3 2 4 6 6 1 6 9 29 3 2 4 10 1 2 1 3 4 1 1 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