Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 T -2 -4 -3 -4 -3 -3 -3 -4 -4 -2 -3 -3 -3 -4 -4 3 6 -5 -4 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19 60 0 0 22 1.12 1.12 2 S -2 -2 1 -3 -4 -3 -3 -3 -3 -5 -6 0 -5 -6 -3 7 1 -6 -5 -4 1 2 6 1 0 0 0 0 0 0 0 4 0 0 0 79 6 0 0 0 1.40 1.59 3 K -4 5 -2 -4 -6 -1 -2 -5 -2 -5 -6 6 -4 -5 -5 -3 0 -6 -4 -3 0 26 2 0 0 2 0 0 1 0 0 60 0 0 0 1 6 0 0 1 1.44 1.77 4 K -3 1 -1 -4 -2 -1 -3 -4 2 -2 -5 5 -3 -4 -3 0 4 -6 -3 -3 1 8 3 0 1 2 0 0 6 3 0 40 0 1 1 7 26 0 1 2 0.87 1.81 5 K 0 5 1 -1 -4 0 0 -3 -2 -5 -4 3 -5 -5 -2 0 0 -2 -5 -4 8 33 8 3 0 4 4 2 1 1 1 18 0 0 2 8 5 1 0 1 0.66 1.83 6 R -2 5 -2 -3 -5 -1 -1 -3 -1 -5 -5 6 -5 -4 -2 -1 -3 -6 -2 -3 3 28 2 0 0 2 3 2 1 0 1 49 0 0 2 3 1 0 1 2 1.13 1.83 7 Q -4 0 -2 -4 -4 0 -3 -2 2 0 2 5 1 0 -4 -3 0 -4 1 -2 0 5 2 0 0 4 0 4 4 5 17 36 4 4 0 1 7 0 4 2 0.54 1.83 8 R -4 8 -4 -5 -7 -1 -3 -5 -2 -5 -5 -1 -3 -4 -5 -4 -4 2 -5 -5 0 89 0 0 0 2 0 1 0 1 1 1 0 1 0 1 0 3 0 1 2.13 1.82 9 G -3 0 -4 -3 -4 -5 -4 5 -6 1 0 0 -4 -5 -5 -4 -4 -4 -4 4 0 6 1 1 0 0 0 39 0 7 8 5 0 0 0 1 0 0 0 31 0.84 1.83 10 S -2 -2 -3 -3 -4 -3 -3 6 6 -6 -6 -3 -5 -6 -5 1 -1 -2 -2 -5 2 2 0 1 0 1 2 55 18 0 0 1 0 0 0 12 4 1 1 1 1.27 1.84 11 R -2 7 -3 -5 -4 -2 -3 -4 -2 -3 -4 -1 0 -5 -5 -3 -3 -6 -4 2 3 69 1 0 0 1 0 1 1 1 1 1 3 0 0 1 1 0 0 15 1.50 1.84 12 T -3 -3 -2 -4 -2 -2 -4 6 -1 -4 -5 -3 -5 -4 -4 3 2 -3 -2 -4 0 1 1 0 1 1 0 54 1 1 1 1 0 1 0 19 14 0 2 1 1.11 1.73 13 H 0 -1 -1 -3 2 1 -2 -4 7 2 -2 -2 2 -3 3 -2 -1 -1 -1 -2 7 4 3 1 5 6 2 1 24 13 3 2 6 1 13 2 3 1 1 3 0.61 1.72 14 G 0 -3 -3 -3 -5 -4 -5 7 -2 -5 -6 -4 -5 -6 -5 2 -4 -6 -6 -6 7 1 0 1 0 0 0 75 1 1 0 0 0 0 0 13 0 0 0 0 1.64 1.80 15 G -1 -1 -2 -4 -2 -2 0 0 5 -5 -5 -1 -3 -3 -4 5 -2 4 1 -5 5 3 1 0 1 1 5 8 15 0 0 3 0 1 0 42 1 6 5 0 0.83 1.82 16 G -2 -5 -2 -3 -5 -4 -4 7 -5 -6 -6 -3 -6 -6 -5 -1 -1 -2 -6 -5 2 0 2 1 0 0 0 85 0 0 0 1 0 0 0 3 3 1 0 1 1.88 1.83 17 S -2 3 0 -4 3 1 -3 -2 1 -3 0 3 0 -3 -3 1 1 0 -1 -3 3 18 5 1 5 6 1 2 3 1 8 17 2 1 1 12 8 2 2 1 0.36 1.77 18 H -3 -1 -2 -3 -3 -3 -4 5 4 2 -4 1 -2 -3 -5 -3 -1 -5 -3 0 1 3 1 1 1 1 0 44 11 14 1 8 1 1 0 1 3 0 0 8 0.82 1.80 19 K -2 1 -2 -2 -2 -3 -3 5 -3 -6 -5 6 -3 -3 -5 -2 -4 -6 -4 -5 2 6 1 2 1 0 0 38 0 0 1 44 0 1 0 2 1 0 0 0 1.18 1.88 20 N -3 -2 1 -3 -3 2 -3 1 -2 -4 -5 4 -3 -5 -4 -1 5 -6 -5 -4 1 1 7 1 1 9 0 9 1 1 1 29 1 0 0 3 35 0 0 0 0.87 1.87 21 R 1 1 -1 -3 1 -2 -3 0 7 -4 -4 -3 1 -3 -3 -1 2 -4 0 -3 14 9 3 1 3 1 1 7 29 1 1 1 3 1 1 5 14 0 3 2 0.73 1.70 22 R 1 5 -2 -3 1 -1 -3 -1 -1 -4 -3 2 -3 -4 -2 3 -1 -1 -3 -3 10 34 1 1 3 2 1 4 1 1 2 11 0 1 2 20 3 1 1 2 0.64 1.59 23 G -2 -1 -2 -2 -3 -2 -3 6 -5 -6 -6 3 -5 -6 -5 -3 -3 -5 -4 -5 2 3 1 2 1 1 1 66 0 0 0 18 0 0 0 1 2 0 0 1 1.41 1.87 24 A 1 6 -3 -3 -3 2 -2 -1 1 -4 -3 2 -2 -3 -3 0 -2 -2 -2 -4 13 40 1 1 1 9 2 4 3 1 2 9 1 1 1 6 2 1 2 1 0.72 1.71 25 G -2 -2 -1 -3 -4 -2 -2 7 -4 -4 -4 -1 -3 -4 -2 -2 -2 -2 -3 -4 2 2 3 1 0 1 2 71 0 1 2 4 1 1 2 2 3 1 1 1 1.34 1.67 26 H -1 -2 1 -3 -2 2 -2 -2 8 -3 -4 -2 1 -4 -5 1 1 -5 -2 -3 5 2 7 1 1 10 1 3 40 2 2 2 3 0 0 10 9 0 1 2 1.05 1.91 27 R -4 4 -1 -4 -6 -1 -2 -3 -2 -4 -5 6 -3 -6 3 -2 -4 -3 -5 -5 1 25 2 1 0 1 1 2 1 1 1 48 1 0 13 2 1 1 0 0 1.21 1.96 28 G -3 -3 -3 -5 -6 -3 -4 7 -2 -7 -7 -4 -6 -6 -3 0 -3 -6 -4 -5 1 1 1 0 0 1 1 83 1 0 0 1 0 0 1 6 1 0 1 1 1.84 1.97 29 G -2 -3 -2 -3 -4 6 -3 5 -2 -6 -5 -3 -3 -5 -5 -2 0 -6 -4 -6 3 1 2 1 0 36 1 43 1 0 1 1 1 0 0 2 7 0 1 0 1.22 2.01 30 R -3 5 0 -4 -4 -1 -3 -1 0 -4 -3 5 -3 -2 -3 -2 -2 1 -2 -3 1 28 4 1 0 2 0 5 2 1 2 40 0 2 1 2 2 2 1 2 0.94 2.01 31 G 4 -3 -3 -3 -3 -2 -4 5 -3 -4 -4 -3 -3 -4 -2 2 -3 -6 -4 -1 28 1 1 1 1 2 1 36 0 1 1 1 1 1 2 17 1 0 1 4 0.80 1.99 32 D -2 7 3 -3 -6 0 -3 -4 0 -4 -3 1 1 -3 -1 -3 -4 -6 -3 -4 4 55 12 1 0 4 1 1 2 1 2 6 4 1 3 1 1 0 1 1 1.15 2.02 33 A 4 -3 -3 -4 0 -3 -2 0 -1 -2 -3 -2 -2 -5 0 4 -1 -5 -2 -1 38 1 1 1 2 1 2 7 2 2 2 2 1 0 4 27 3 0 1 4 0.65 2.00 34 G -3 -3 -2 -3 -6 -3 -5 7 -3 -5 -5 -2 -3 -4 -5 -2 -2 0 -4 -4 1 1 1 1 0 1 0 80 1 1 1 2 1 1 0 3 2 1 1 1 1.71 2.02 35 R -1 1 -3 -3 -3 -2 -4 4 0 -2 -1 -2 1 4 -4 -1 -2 -1 2 -2 5 7 1 1 1 2 1 30 2 3 5 2 4 19 1 4 3 1 6 3 0.52 2.04 36 D -3 0 1 -1 0 1 3 1 3 -4 -1 1 1 -2 0 0 -2 -1 -4 -2 2 6 5 3 2 7 21 10 8 1 6 8 3 2 5 6 2 1 0 3 0.28 2.03 37 K -2 1 -2 -2 -6 -2 -4 4 4 -3 -3 5 -2 -3 -2 -3 -2 -1 -3 -2 3 8 1 2 0 1 0 26 11 2 2 31 1 1 2 1 2 1 1 3 0.72 2.01 38 H -3 0 -2 -3 -2 -2 -3 4 8 -3 -4 -1 0 -3 1 -3 -3 -6 -2 -4 1 5 2 1 1 1 2 33 33 1 1 3 3 1 8 1 1 0 1 1 1.13 2.03 39 E -3 0 0 -4 -6 6 0 -1 5 -4 -3 2 0 -1 -1 -3 -3 1 -2 -4 2 4 5 0 0 35 5 5 14 1 3 11 2 3 3 1 1 2 1 1 0.79 2.02 40 F -3 -2 -2 -3 -5 -1 -3 -4 -2 -1 -1 -2 6 5 -3 -3 2 6 1 -2 2 3 2 2 0 3 2 2 1 2 5 3 19 20 1 2 15 10 3 3 0.74 2.02 41 H -2 -2 -1 0 -5 -1 0 -3 3 -2 -3 -1 -1 0 6 -1 0 -5 1 -2 2 2 2 6 0 3 6 2 7 3 2 3 2 4 37 5 6 0 6 3 0.72 2.02 42 N -2 0 0 -1 -5 0 -1 0 0 1 3 1 1 0 -2 -2 -2 2 -1 -2 4 4 5 4 0 4 4 9 2 8 27 8 4 3 2 3 2 3 2 2 0.20 2.05 43 H -2 -1 -1 -2 1 2 -1 0 3 1 -2 0 1 1 1 -2 -2 3 4 -2 3 3 3 3 2 8 3 8 8 7 3 5 3 6 8 3 3 4 14 3 0.28 2.07 44 E -1 0 0 0 -5 1 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 0 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.10 2.01 45 P -3 6 -2 -3 -6 0 -2 -4 3 -3 -3 0 -2 -3 4 -3 0 1 0 -1 1 37 1 1 0 3 1 1 8 1 3 4 1 1 18 2 5 2 3 5 0.79 1.86 46 L -3 -2 -2 -5 -1 -3 -3 -6 0 2 3 -2 2 5 -3 -3 -2 3 2 0 2 2 3 0 1 1 2 0 2 10 26 2 4 22 1 2 2 3 6 7 0.58 1.81 47 G -2 -1 -4 -2 -5 -2 -4 5 -1 -6 -4 -2 -5 -6 6 -2 -3 -6 -2 -3 3 3 0 2 0 2 0 37 2 0 2 2 0 0 40 2 2 0 2 2 1.25 1.82 48 K -3 0 -1 -2 -6 -1 -1 -2 5 -2 -3 6 0 -1 -2 -2 -2 -5 -1 -2 2 4 2 2 0 2 2 3 12 2 2 52 2 3 2 2 2 0 2 2 0.92 1.93 49 S -2 2 -1 1 1 0 0 -2 1 0 -1 1 0 1 0 -2 -2 2 1 1 4 10 3 7 3 4 7 3 4 5 6 10 2 6 4 3 3 2 4 9 0.10 1.91 50 G 0 0 1 0 -5 1 -3 0 3 0 -1 0 2 -4 1 0 -4 4 2 0 6 6 6 6 0 6 0 6 6 6 6 6 6 0 6 6 0 6 6 6 0.19 1.67 51 F -3 -1 -2 -6 -5 -2 -3 -3 0 0 -2 -2 4 7 -1 -3 -2 1 2 -2 2 4 2 0 0 2 2 2 2 4 2 2 11 46 3 2 2 2 5 3 1.01 2.12 52 K -1 3 2 -2 0 0 -1 -1 2 -2 -3 2 0 -1 -2 -1 2 2 0 -2 4 14 10 3 2 3 3 4 5 3 3 10 2 3 3 5 13 2 3 3 0.20 2.17 53 R -1 0 0 0 2 0 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 -5 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0 5 5 0.02 2.12 54 P -2 1 -1 -2 0 -1 -4 -1 3 1 -1 0 0 1 4 -2 -2 1 2 -1 4 7 3 2 2 3 1 5 6 9 6 5 2 7 20 3 3 2 6 4 0.31 1.96 55 Q -1 -1 2 -1 1 1 -1 -2 4 -1 -1 0 0 2 0 -1 -1 2 1 -1 5 4 10 4 3 6 4 3 11 3 5 7 3 9 5 4 4 3 4 4 0.19 2.09 56 K -1 0 0 0 2 0 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 -5 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0 5 5 0.02 2.12 57 V -1 0 0 0 2 0 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.09 2.12 58 Q 0 1 -1 -1 1 2 1 -1 1 -1 -1 1 0 0 0 -1 0 -5 0 0 8 9 4 4 3 8 8 4 4 4 5 9 3 4 5 4 5 0 4 6 0.08 2.02 59 E -1 0 0 0 2 0 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.09 2.12 60 E -1 0 2 1 0 2 2 -3 1 -1 -2 1 -1 1 -1 -1 0 3 0 -1 5 4 9 7 2 8 14 2 3 3 3 9 2 5 3 3 5 3 3 5 0.17 2.11 61 A -1 -1 -1 -2 3 -1 -1 -2 0 0 -1 -1 0 3 -1 -2 -1 1 5 1 5 3 3 2 6 3 4 3 2 5 5 4 3 10 3 3 4 2 17 11 0.30 2.15 62 A 2 -1 0 -2 0 0 -1 -2 0 1 -1 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