Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 K -1 2 0 -1 -3 1 1 -2 -1 -3 -3 5 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0.57 0.04 2 E -2 -1 2 5 -4 2 4 -2 -1 -4 -4 0 -3 -4 -2 -1 -1 -4 -3 -3 0 0 7 44 0 11 37 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.76 0.18 3 L -2 -3 -4 -4 -2 -3 -3 -4 -3 1 5 -3 1 0 1 -3 -2 -2 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 92 0 0 0 8 0 0 0 0 0 0.67 0.21 4 T 0 -2 0 -1 -2 -1 -1 -2 -2 -2 -3 -1 -2 -3 -2 4 4 -4 -3 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 54 46 0 0 0 0.68 0.28 5 L -2 -3 -3 -3 -3 -1 -3 -4 -3 -1 2 -2 -1 -3 7 -2 -2 -4 -3 -1 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 31 0 0 0 64 0 0 0 0 3 1.35 0.37 6 A 0 -2 0 4 -3 1 -1 -2 -2 -2 0 -2 -2 -1 -3 -1 2 -4 -3 0 6 0 2 35 0 10 0 2 0 0 12 0 0 4 0 2 18 0 0 9 0.34 0.37 7 Q -2 -1 -2 -2 -4 6 0 -3 -1 -4 -4 1 -2 -5 6 -1 -2 -4 -3 -3 0 0 0 0 0 54 0 0 0 0 0 7 0 0 39 0 0 0 0 0 1.16 0.37 8 T -2 -3 -4 -5 -2 -3 -4 -5 -4 1 5 -3 2 -1 -4 -3 -1 -3 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 90 0 3 0 0 0 5 0 0 2 0.83 0.37 9 E -2 -1 -1 1 -5 1 7 -3 -1 -4 -4 0 -3 -4 -2 -1 -2 -4 -3 -4 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.27 0.37 10 S 1 -2 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -2 -3 -2 -1 -3 -4 4 4 0 -4 -3 -3 8 0 1 0 0 2 0 2 0 0 3 0 0 0 26 57 0 0 0 0 0.74 0.37 11 L -2 0 -2 -3 -3 0 -2 -4 1 -1 4 3 0 -2 -1 -2 0 -3 -2 -1 0 2 0 0 0 4 0 0 4 0 53 28 0 0 2 0 6 0 0 0 0.40 0.37 12 R -2 7 -1 -3 -4 0 -1 -3 -1 -4 -3 2 0 -4 -3 0 -1 -4 -3 -3 0 81 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7 4 0 0 6 2 0 0 0 1.03 0.37 13 E -2 -1 -1 1 -5 1 7 -3 -1 -4 -4 0 -3 -4 -2 -1 -2 -4 -3 -4 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.26 0.37 14 V -1 -3 -4 -4 -2 -1 -3 -4 -4 2 0 -3 1 -2 -3 -3 -1 -4 -2 6 0 0 0 0 0 4 0 0 0 4 0 0 3 0 0 0 0 0 0 89 0.79 0.37 15 C -1 -5 -4 -5 10 -4 -5 -4 -4 -2 -2 -4 -2 -3 -4 -2 -2 -3 -4 -2 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.14 0.37 16 E -2 -1 -1 1 -5 1 7 -3 -1 -4 -4 0 -3 -4 -2 -1 -2 -4 -3 -4 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.26 0.37 17 T 1 -3 -4 -4 -2 -3 -3 -4 -4 0 4 -3 1 0 -3 -2 0 -3 -2 1 13 0 0 0 0 0 0 0 0 0 67 0 0 2 0 0 8 0 0 11 0.55 0.37 18 N -2 -1 7 1 -4 -1 -1 -1 1 -4 -4 -1 -3 -4 -3 1 -1 -5 -3 -4 0 0 84 4 0 0 0 0 3 0 0 0 0 0 0 9 0 0 0 0 1.14 0.37 19 M -1 -3 -3 -1 -3 -3 -2 -4 -3 0 1 -3 1 -2 6 -2 -1 -4 -1 1 3 0 0 5 0 0 0 0 0 3 21 0 5 0 42 0 4 0 3 15 0.74 0.37 20 A 4 -2 1 4 -2 -2 -1 0 0 -3 -3 -2 -3 -4 -2 0 -1 2 -3 -2 51 0 5 31 0 0 0 5 2 0 0 0 0 0 0 4 0 3 0 0 0.55 0.37 21 C -1 -5 -4 -5 10 -4 -5 -4 -4 -2 -2 -4 -3 -4 -4 -2 -2 -3 -4 -2 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.16 0.38 22 D -2 -2 1 6 -5 0 4 -3 -2 -4 -5 -1 -4 -5 -2 -1 -2 -5 -4 -4 0 0 4 60 0 0 35 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.10 0.38 23 E -2 -1 0 3 -5 0 5 -3 5 -4 -4 -1 -3 -4 -2 -1 -2 -4 -2 -4 0 0 2 14 0 0 62 0 19 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0.90 0.38 24 M -2 -3 -4 -4 -2 -2 -3 -4 -3 0 4 -3 7 -1 -4 -3 -1 -3 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49 0 47 0 0 0 4 0 0 0 0.83 0.38 25 A 4 -2 -3 -3 -2 -2 -2 -2 -3 -1 -1 -2 5 -2 -2 1 -1 -3 -3 -1 61 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30 0 0 9 0 0 0 0 0.63 0.38 26 D -3 -2 0 7 -5 -1 2 -2 -2 -4 -5 -1 -4 -5 -3 -1 -2 -5 -4 -4 0 0 0 88 0 0 12 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.36 0.38 27 A -1 -1 -1 -2 -3 3 -1 -3 6 -1 -3 -1 -2 -3 -2 0 4 -3 -1 -1 4 0 0 0 0 18 0 0 26 2 0 0 0 0 0 0 47 0 0 2 0.64 0.38 28 Q 1 -2 0 -1 -2 1 0 -3 0 4 -1 -2 0 -2 -3 0 -1 -3 0 1 16 0 5 2 0 7 7 0 2 33 0 0 2 0 0 8 2 0 4 9 0.20 0.38 29 G -1 -3 -1 -2 -4 -3 -3 7 -3 -5 -5 -3 -4 -4 -3 -1 -3 -4 -4 -4 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.56 0.38 30 I -3 -4 -4 -4 -3 -4 -4 -5 -4 5 1 -4 0 5 -4 -4 -2 -2 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 56 10 0 0 33 0 0 0 0 0 0 0.78 0.38 31 V -1 -1 -2 -3 -3 4 -1 -4 1 4 -1 0 -1 -2 -3 -2 -2 -4 -2 3 2 2 0 0 0 30 2 0 3 31 0 4 0 0 0 2 0 0 0 24 0.42 0.38 32 A 4 -2 0 2 -2 -1 2 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -4 -2 0 0 -4 -3 -1 52 0 4 13 0 0 20 0 0 0 0 2 0 0 0 0 6 0 0 2 0.48 0.38 33 A 6 -2 -3 -3 -1 -2 -2 -1 -3 -2 -3 -2 -2 -3 -2 0 -1 -4 -3 -1 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.93 0.38 34 Y -3 -3 -3 -4 -4 -3 -3 -4 1 -2 -2 -3 -2 2 -4 -3 -3 1 8 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 1.64 0.38 35 Q -2 3 0 -2 -3 3 -1 -3 -2 -2 -3 1 -2 -4 -2 0 4 -4 -3 -1 0 22 2 0 0 19 0 0 0 2 0 9 0 0 0 4 39 0 0 4 0.50 0.38 36 A 3 5 -2 -2 -3 0 0 -2 -2 -3 -3 1 -2 -4 -2 -1 0 -4 -3 -2 37 42 0 0 0 2 3 0 0 0 0 8 0 0 0 0 7 0 0 0 0.58 0.37 37 F -3 -3 -3 -4 -3 -3 -3 -4 4 0 -1 -3 -1 5 -4 -3 -3 0 6 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 11 6 0 0 0 38 0 0 0 0 44 0 1.04 0.37 38 Y -3 -3 -3 -4 -4 -3 -3 -4 1 -2 -2 -3 -2 3 -4 -3 -3 1 8 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8 0 0 0 0 92 0 1.53 0.37 39 G -1 -3 -1 -2 -4 -3 -3 7 -3 -5 -5 -3 -4 -4 -3 -1 -3 -4 -4 -4 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.53 0.35 40 P -1 -1 -3 -2 -3 -1 -2 -3 -3 -3 -2 -1 -1 -4 7 -1 1 -4 -3 -3 5 2 0 0 0 2 0 0 0 0 3 2 3 0 72 0 12 0 0 0 1.50 0.33 41 I -2 -4 -4 -4 -2 -3 -4 -4 -4 5 1 -3 0 -1 -1 -3 0 -4 -2 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50 4 0 0 0 4 0 6 0 0 37 0.63 0.33 42 P -2 -3 -3 -2 -4 0 -2 -3 -3 -4 -4 -2 -3 -5 8 -2 -2 -5 -4 -3 0 0 0 0 0 5 0 0 0 0 0 0 0 0 95 0 0 0 0 0 2.21 0.28 43 F -3 -3 -3 -4 -3 -3 -3 -4 0 -1 -1 -3 -1 6 -4 -3 -3 1 6 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 63 0 0 0 0 37 0 0.99 0.17 K Lambda Standard Ungapped 0.1308 0.3190 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1770 0.3153 PSI Gapped 0.0542 0.2670