Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 M -3 -3 -4 -5 -3 -3 -4 -5 -4 4 1 -3 8 -2 -4 -3 -2 -3 -3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28 5 0 67 0 0 0 0 0 0 0 1.23 0.61 2 W -4 -2 -5 -5 -4 -4 -5 -5 -4 -1 3 -4 4 4 -5 0 -2 7 2 -1 0 2 0 0 0 0 0 0 0 2 29 0 13 17 0 8 2 18 7 2 0.90 1.01 3 M -3 -2 -5 -6 -4 -3 -5 -5 -3 -1 0 -2 10 -3 -2 -2 -3 -5 -4 -1 1 1 0 0 0 0 0 1 1 1 2 2 84 0 3 3 1 0 0 2 2.12 1.49 4 P -2 -4 -2 -3 -6 -4 -1 -4 -5 -5 -5 -3 -4 -6 8 0 -2 -2 -6 -4 2 0 2 1 0 0 4 1 0 0 1 1 0 0 77 7 2 1 0 1 2.05 1.52 5 P -2 -1 -4 -5 -5 -3 -4 -6 -3 1 0 3 8 -3 1 -3 -2 -2 -3 -1 2 2 1 0 0 1 0 0 1 8 5 16 49 0 6 2 1 1 1 4 1.22 1.75 6 R -3 1 1 -1 -5 -1 -3 -4 -3 -3 0 5 -3 -3 -3 0 3 -6 -5 -3 1 8 6 3 0 2 0 0 0 1 11 39 0 1 1 7 17 0 0 2 0.68 1.75 7 P 2 0 -4 -4 -1 -2 -4 0 -2 -2 -5 -3 -4 -1 4 2 -2 0 3 0 16 5 0 1 1 2 0 6 1 2 0 0 0 3 23 18 2 2 12 6 0.56 1.76 8 E -1 5 0 0 -4 0 0 -3 -2 -5 -5 5 -5 -5 -5 1 -3 -6 -5 -4 4 31 3 4 0 4 5 1 1 0 1 31 0 0 0 12 1 0 0 1 0.90 1.81 9 E -3 0 -2 3 -6 3 6 -5 -3 -4 -5 2 -3 -5 -4 -3 -2 -6 -4 -4 2 4 1 15 0 10 51 0 0 1 1 10 0 0 0 1 2 0 0 1 1.10 1.82 10 V -1 -5 -6 -6 0 -4 -5 -6 -4 3 4 -5 3 1 -6 -4 -3 -5 -4 4 5 0 0 0 2 0 0 0 0 17 33 0 8 6 0 0 1 0 0 26 0.89 1.82 11 A -1 -1 -4 -4 1 -3 -1 -6 -3 6 0 -2 -1 -3 -6 -4 -2 -6 -3 3 5 3 1 1 3 1 5 0 1 43 9 2 1 0 0 1 1 0 1 21 0.84 1.85 12 R -1 5 -2 -3 -4 0 -1 -4 -2 -5 -5 6 -4 -6 -5 -2 -2 -6 -3 -5 5 28 1 1 0 3 2 1 1 1 0 50 0 0 0 3 2 0 1 0 1.21 1.86 13 K 2 1 -3 -4 -3 -2 -2 -4 -2 3 2 1 1 0 -4 -3 -2 2 -1 1 18 7 1 1 0 1 3 1 1 15 18 9 3 3 0 1 2 3 2 10 0.33 1.86 14 L -2 -4 -7 -5 -5 -6 -6 -7 -6 1 6 -6 0 1 -5 -5 -4 -5 -3 -1 3 1 0 0 0 0 0 0 0 7 79 0 1 6 1 0 0 0 0 2 1.44 1.85 15 R -2 2 -1 -2 -3 1 4 -3 -1 -3 -1 4 -2 -4 -5 -1 -2 -2 -3 -2 3 10 2 1 0 6 29 2 2 2 6 26 1 1 0 3 2 0 1 3 0.63 1.88 16 R 1 3 0 -1 -4 2 0 -3 -1 -4 -4 5 -1 -5 -4 0 -2 -3 -2 -4 12 16 4 4 0 8 5 1 1 1 1 36 1 0 0 6 2 0 1 1 0.68 1.88 17 L 2 -2 3 3 -4 0 -1 -3 2 0 2 -2 -1 0 -5 -2 -3 -3 -1 -2 15 2 13 17 0 3 3 2 5 5 18 2 1 4 0 2 1 0 2 3 0.34 1.84 18 G -2 -4 -1 -3 -3 -4 -4 7 -3 -7 -7 -4 -6 -6 -5 -3 -5 0 -6 -6 1 1 2 1 1 1 1 88 1 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 2.01 1.83 19 F -4 -5 -6 -7 2 -6 -6 -4 -5 -3 -2 -5 -2 7 -5 -5 -4 10 3 -3 1 1 0 0 4 0 0 1 0 1 2 1 1 43 0 0 1 34 9 2 2.05 1.87 20 V -3 0 -2 -2 -3 1 3 -5 1 1 -3 1 -2 0 -5 -1 0 -1 4 2 2 5 2 2 1 7 17 1 3 7 2 8 1 4 0 4 6 1 12 18 0.36 1.88 21 E -3 -2 -2 -4 -2 0 2 -1 0 2 3 0 -1 2 -1 -3 -3 -1 -1 1 1 2 2 1 1 4 13 5 2 10 25 7 1 8 4 1 1 1 2 11 0.28 1.88 22 R -1 1 -3 1 -3 -2 -2 -4 0 2 -1 2 -2 -3 0 -2 0 -6 -2 4 4 8 1 8 1 1 3 1 3 10 4 11 1 1 5 3 5 0 2 30 0.37 1.84 23 M -1 6 -1 -3 -3 -1 -2 -1 2 -4 -5 0 -2 -2 -1 0 -2 -2 0 -3 5 52 2 1 1 1 2 4 5 1 1 4 1 1 3 8 2 1 3 2 0.92 1.83 24 A -1 -1 -2 -3 -1 6 -1 1 0 1 -4 -2 -1 -5 -2 0 1 -2 -5 1 5 3 1 1 1 33 4 11 2 7 1 2 1 0 2 6 9 1 0 10 0.55 1.78 25 K -1 2 0 -2 -1 -1 -1 1 -1 -4 -5 5 -3 -6 -3 0 2 -6 -5 -3 5 12 5 1 1 2 4 10 2 1 0 34 1 0 1 8 11 0 0 2 0.59 1.77 26 G -2 -2 -3 -2 -1 -4 -3 7 -5 -6 -6 -2 -5 -6 -5 -1 -3 -1 -5 -4 2 3 0 2 1 0 1 79 0 0 0 3 0 0 0 3 1 1 0 1 1.62 1.73 27 G -1 -1 0 1 -5 -3 -2 -1 -1 -3 -4 -1 -5 -6 -3 6 -2 -6 -5 -4 3 3 4 8 0 0 2 4 2 1 1 4 0 0 1 66 1 0 0 1 1.08 1.85 28 H -5 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -5 10 -4 -6 -4 -5 -4 -5 -2 -3 -5 0 -4 0 2 1 2 1 1 1 0 83 1 0 0 0 0 0 3 1 0 2 1 2.59 1.85 29 R -1 2 -3 -2 0 0 -1 -4 6 2 -1 0 -1 -2 -3 -2 -3 -1 0 2 4 12 1 2 2 5 5 1 20 12 7 6 2 2 1 2 1 1 3 12 0.45 1.82 30 L -2 2 -3 -5 -2 3 -3 -6 1 4 -1 2 0 2 -4 -3 -1 -5 1 0 3 12 1 0 1 11 1 0 4 23 5 12 2 8 1 2 3 0 4 7 0.45 1.85 31 Y -3 -2 -3 -6 -1 -5 -3 -6 -1 -1 2 -1 4 4 -6 -3 -3 6 5 -2 2 2 2 0 2 0 2 0 2 3 22 3 12 16 0 2 2 11 17 2 0.86 1.96 32 T -1 3 -1 -3 0 1 0 -3 0 -1 -3 3 0 -1 -5 -1 1 1 1 0 6 18 3 1 2 7 5 2 2 4 3 18 2 3 0 3 7 2 5 6 0.32 1.94 33 H -3 2 3 -1 -5 0 -2 -2 7 -3 -3 2 -1 -2 -2 -1 -1 0 1 -3 2 11 12 3 0 3 2 3 24 2 2 14 2 2 2 4 3 1 5 2 0.64 1.86 34 P -1 -1 0 -1 -1 -1 1 0 -1 -2 -2 2 -4 -3 5 0 -1 -6 -2 -3 5 3 4 3 1 2 9 8 1 2 5 12 0 1 28 8 3 0 2 2 0.45 1.94 35 D -2 -2 2 4 0 0 2 1 -1 -2 -4 -2 -2 -3 -2 0 2 -6 -1 -2 3 2 11 24 2 4 12 9 2 3 2 2 1 1 2 6 11 0 2 3 0.39 1.94 36 G -2 -1 1 -1 -2 -2 -2 5 0 -3 -3 1 -2 -3 -2 -1 0 1 -2 -3 3 4 7 4 1 2 2 41 3 2 3 10 1 1 2 4 5 2 1 2 0.58 1.98 37 R -2 5 0 -3 -2 0 -1 -3 2 -1 -3 4 -2 -3 1 -2 0 -5 -2 -3 3 30 4 1 1 3 4 2 4 3 3 23 1 1 6 3 5 0 2 2 0.61 1.92 38 I -1 2 -1 -2 -1 0 -2 -1 -1 2 -1 0 1 -1 -2 -2 2 0 0 3 4 9 3 3 1 4 3 4 2 9 6 6 3 3 2 3 11 2 3 18 0.16 1.76 39 V -2 -1 -4 -2 0 -2 -2 -3 -1 1 -1 -2 0 0 -2 -2 4 1 -1 3 3 4 0 2 2 2 2 2 2 8 5 3 2 4 2 2 30 2 2 21 0.44 1.67 40 V -2 -2 -2 -2 0 -1 -2 -5 -5 3 -1 -2 0 -1 0 -1 3 -5 -4 4 2 2 2 2 2 3 2 0 0 15 4 2 2 2 4 5 17 0 0 31 0.49 1.67 41 V -2 -2 -1 -2 -4 -5 -5 -5 -5 4 0 -5 1 0 1 -2 -1 -5 -4 5 3 3 3 3 0 0 0 0 0 20 8 0 3 4 9 3 3 0 0 38 0.69 1.69 42 P 0 -2 1 -1 -1 -2 -3 1 -1 -1 -3 -2 -4 -3 6 -1 -1 0 -5 -2 6 2 7 3 2 2 2 11 2 3 3 2 0 2 44 4 3 2 0 3 0.88 1.74 43 F -2 0 1 -1 0 -1 -3 -3 5 0 -1 1 1 2 2 -3 -2 -1 1 0 2 5 6 4 2 3 1 2 12 5 6 11 4 8 10 2 3 1 5 8 0.28 1.82 44 H -3 -1 -1 -2 -2 -1 -2 0 9 -5 -2 -1 -1 -3 2 -2 -2 -1 -1 -5 1 2 2 2 1 3 1 6 51 0 4 4 1 1 12 3 2 1 1 0 1.37 1.85 45 S 0 1 1 -1 -1 0 -1 1 1 -3 -4 2 -4 -5 0 3 -1 -5 -1 -3 7 8 7 4 1 3 3 10 3 1 2 15 0 0 5 24 3 0 3 2 0.34 1.75 46 G -2 1 0 2 -2 0 -1 2 0 -3 -4 5 -2 -5 -3 -1 -2 -1 -3 -3 3 7 5 11 1 3 3 18 2 1 1 33 1 0 1 4 2 1 1 2 0.55 1.82 47 E -3 -3 -1 5 -6 -1 5 -3 -2 -4 -4 -1 -2 -6 0 -2 0 -6 -3 -3 1 1 2 36 0 2 36 1 1 1 1 2 1 0 5 2 5 0 1 2 1.02 1.84 48 L -3 -5 -6 -4 -2 -4 -6 -5 -3 5 4 -4 2 -1 -3 -5 -3 -5 -2 2 1 0 0 1 1 1 0 1 1 33 36 1 4 2 1 0 1 0 1 15 0.97 1.87 49 P 1 -1 -1 -1 -5 -3 -3 1 -1 -5 -4 3 -3 -6 5 1 -2 -2 -5 -2 11 3 3 4 0 1 1 10 1 0 1 19 1 0 29 9 2 1 0 2 0.69 1.85 50 K -2 1 -3 -3 -3 0 -2 -3 -1 3 -1 3 -1 -4 4 -1 0 -2 -3 0 3 8 1 1 1 4 2 2 1 15 5 19 2 1 17 4 6 1 1 5 0.40 1.89 51 G -2 -2 -2 -2 -6 -3 -3 6 0 -4 -4 1 -2 -1 -1 -1 -2 1 -1 -4 2 2 1 2 0 1 1 59 2 1 1 8 1 4 3 3 3 2 2 1 1.02 1.91 52 T -3 -3 -3 -3 -4 -4 -5 -6 -5 0 2 -4 0 -3 -4 -2 6 -2 -2 0 1 1 1 1 0 0 0 0 0 5 23 1 2 1 1 1 57 1 1 5 1.13 1.90 53 F -1 -2 -6 -5 -1 -2 1 -6 0 1 5 -4 1 0 -6 -4 -3 -1 0 1 5 2 0 0 1 2 8 0 2 5 50 0 2 4 0 1 1 1 3 11 0.70 1.90 54 K 0 4 3 -3 -3 1 -2 -3 1 -3 -2 4 -1 -3 -2 -1 -2 -6 -2 -3 7 23 15 1 0 6 2 2 3 1 5 22 1 1 2 4 2 0 1 1 0.56 1.90 55 R 2 1 1 -3 -3 1 0 0 -1 -4 -4 2 -3 -4 -4 4 -2 -6 -3 -4 14 6 7 1 0 5 4 6 1 1 1 14 0 1 0 35 2 0 1 1 0.58 1.90 56 I -2 -6 -4 -6 -4 -6 -6 -6 -3 8 0 -6 1 -2 -6 -5 -3 -6 -4 1 2 0 1 0 0 0 0 0 1 80 4 0 3 1 0 0 1 0 0 5 1.74 1.83 57 L -1 -1 -6 -5 0 -2 -1 -5 -4 2 5 -2 2 0 -5 -3 -4 2 -1 -1 7 4 0 0 2 2 4 0 0 12 48 3 4 4 0 1 0 3 2 3 0.68 1.86 58 R -3 4 0 -1 -6 0 0 -4 -2 -4 -5 6 -3 -5 -5 -2 -2 -6 -5 -5 1 23 4 3 0 2 4 1 1 1 1 56 1 0 0 2 2 0 0 0 1.26 1.85 59 D -2 -1 -2 3 -6 7 1 -3 -1 -3 -3 -1 -1 -5 -4 -2 -2 -6 -4 -3 3 2 1 16 0 58 5 1 1 1 2 2 1 0 0 2 3 0 0 1 1.28 1.87 60 A 6 -4 -5 -4 0 -4 -4 -3 -5 1 -1 -4 0 -3 -5 0 0 -6 -5 -1 63 0 0 0 2 0 0 1 0 7 7 0 2 1 0 7 7 0 0 4 1.00 1.83 61 G -3 -2 1 0 -6 0 -1 6 -3 -7 -6 -1 -3 -6 -5 -3 -5 -3 -5 -6 1 2 6 5 0 4 5 70 1 0 0 4 1 0 0 1 0 0 0 0 1.42 1.81 62 L -4 -4 -6 -6 -4 -5 -5 -6 -6 5 5 -5 2 -2 -5 -5 -3 5 -3 1 1 1 0 0 0 0 1 1 0 30 48 0 4 1 0 0 1 7 0 6 1.16 1.76 63 T -2 -2 -1 2 -4 -2 0 -2 -3 -2 -4 1 -4 -5 0 3 4 -6 -5 -3 2 2 3 10 0 1 6 3 1 2 1 9 0 0 5 26 30 0 0 1 0.62 1.63 64 E -1 3 -3 -1 -5 -2 3 -5 -3 0 -2 2 -3 -3 2 -3 -2 1 -3 1 5 16 1 4 0 1 19 0 0 6 5 14 0 1 10 1 2 2 1 12 0.42 1.67 65 E -2 -2 1 4 -6 0 6 -4 -3 -5 -5 1 -5 -6 -3 -1 -3 -6 -4 -6 3 1 5 25 0 3 49 1 0 0 0 7 0 0 0 4 1 0 1 0 1.12 1.63 66 E -3 -2 -2 5 -6 0 6 -4 -2 -5 -4 -2 -4 -6 -4 -2 -2 -4 -4 -4 1 1 0 30 0 3 55 0 0 0 1 1 0 0 0 1 2 0 0 1 1.33 1.63 67 F -4 -6 -6 -7 -5 -6 -6 -6 -4 0 2 -5 0 7 -6 -5 -4 6 2 -3 1 0 0 0 0 0 0 0 0 5 22 1 2 53 0 0 1 10 6 0 1.53 1.57 68 H -3 1 0 -3 -4 -1 3 -2 1 2 2 2 -1 0 -5 -2 -3 0 0 -2 1 7 5 1 0 2 17 3 3 13 23 11 1 4 0 2 1 1 3 2 0.31 1.53 69 N -2 2 4 2 -4 1 3 -2 -3 -4 -5 4 -3 -6 -4 -2 -1 -6 -5 -4 3 12 18 10 0 5 18 2 0 1 0 23 0 0 0 2 3 0 0 1 0.67 1.48 70 L -4 -5 -6 -6 -4 -5 -6 -6 -6 2 6 -5 1 -2 -6 -5 -4 -4 -4 -1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9 89 0 2 0 0 0 0 0 0 0 1.53 1.27 K Lambda Standard Ungapped 0.1438 0.3242 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1859 0.3179 PSI Gapped 0.0569 0.2670