Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 D -5 -5 -2 9 -7 -3 0 -5 -4 -7 -7 -4 -7 -7 -5 -3 -4 -8 -7 -7 0 0 0 97 0 0 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.42 1.60 2 P -3 -5 -3 -4 -1 -3 -4 -4 -4 -4 -2 -1 -4 -5 8 -3 3 -7 -2 -4 1 0 1 0 1 1 0 1 0 1 4 4 0 0 67 0 17 0 1 0 1.79 1.77 3 S 3 -4 -3 -4 -2 -3 -3 -3 -5 -5 -3 -4 -3 -5 -3 6 3 -6 -4 -3 24 0 0 0 1 0 1 1 0 0 3 0 0 0 1 50 18 0 0 1 1.04 1.81 4 V 1 -5 -6 -5 -1 -6 -5 -6 -6 6 0 -5 -1 -3 -6 -5 -3 -6 -2 5 11 0 0 0 1 0 1 0 0 41 6 0 1 0 0 0 1 0 1 36 1.16 1.90 5 Y -4 -3 -4 1 -4 -4 -2 -5 5 -1 -3 -4 -2 3 -6 -3 2 3 7 -1 1 1 0 8 0 0 3 1 11 3 3 0 1 9 0 1 14 3 37 5 1.01 1.93 6 V -1 -6 -6 -5 -3 -6 -6 -6 -6 4 0 -6 0 2 -5 -5 -3 -4 -1 6 6 0 0 0 0 0 0 0 0 17 6 0 2 7 0 0 0 0 2 58 1.19 1.98 7 R 2 4 -1 -1 -3 0 -1 -1 -3 -5 -4 5 -2 -5 -4 0 -1 -4 -4 -5 15 22 2 3 0 4 3 4 1 1 1 31 1 0 0 5 4 0 0 1 0.68 2.00 8 F -5 -6 -4 -7 -4 -5 -5 -6 -3 -3 -2 -6 -1 9 -7 -6 -5 0 6 -3 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 2 0 1 68 0 0 0 1 22 2 2.11 2.00 9 P -1 1 -2 -1 -4 0 0 -3 -2 -5 -4 3 -3 -4 6 -2 -1 -4 -4 -4 6 7 2 4 0 3 7 2 1 0 1 18 1 1 41 2 3 0 0 1 0.94 1.97 10 L -1 -5 -6 -5 -3 -5 -4 -6 -4 4 4 -5 1 1 -5 -3 -3 -3 -2 4 4 0 0 1 1 0 1 1 0 17 35 0 2 5 1 2 1 0 1 28 0.83 1.94 11 K 1 -1 -2 -1 -3 -1 1 -4 -2 1 -2 3 -2 -3 -1 0 1 -3 -4 2 12 3 2 4 1 2 10 1 1 6 4 18 1 1 3 6 10 0 0 16 0.26 1.88 12 E -2 -2 2 6 -4 -1 2 0 -2 -4 -3 0 -3 -4 -3 1 -1 -3 -1 -4 3 2 9 36 0 2 12 7 1 1 3 5 1 1 1 8 3 0 3 1 0.63 1.81 13 P 1 -2 0 2 -2 -1 0 2 -1 -3 -2 0 -2 -2 3 1 0 -3 -3 -3 10 2 4 11 1 2 7 17 2 2 4 5 1 2 13 10 5 0 1 2 0.26 1.75 14 K 0 -2 1 2 -3 0 2 -1 -1 -3 -2 3 -3 -2 2 1 -1 -2 -2 -1 6 2 6 9 1 4 14 5 1 1 4 15 1 2 10 9 3 1 2 4 0.22 1.69 15 K 0 0 1 1 -3 -1 2 2 0 -3 -2 3 -2 -3 -1 0 0 -2 -2 -2 8 4 6 7 1 2 12 16 2 2 4 15 1 1 3 7 5 1 1 3 0.20 1.68 16 L 0 -2 -2 -2 -2 -1 0 -2 -2 2 2 -1 -1 2 -1 -1 1 -2 0 1 7 3 2 3 1 2 6 3 1 11 16 4 2 9 3 4 8 1 3 9 0.12 1.57 17 G 0 -2 -1 2 -2 -1 0 2 -2 0 0 0 -2 0 -1 -1 -2 -1 -2 -2 9 3 3 13 1 3 7 16 1 5 8 6 1 4 4 4 3 1 2 3 0.08 1.56 18 L 0 -2 -1 2 -2 0 1 2 0 0 0 -1 -1 -1 -1 0 0 -1 0 -1 8 2 3 9 1 3 9 13 2 5 11 4 1 2 3 6 5 1 3 4 0.03 1.58 19 E 0 -1 0 2 -3 0 3 1 1 -1 -3 2 -2 -3 0 0 -1 -2 -3 -1 6 3 3 10 1 4 16 9 3 3 3 11 1 1 4 8 4 1 1 4 0.14 1.60 20 K -2 -1 3 5 -3 -1 1 1 -1 -3 -2 1 -3 -2 0 -1 -1 0 -3 -3 3 3 11 26 1 2 7 9 1 1 4 8 1 2 4 4 3 1 1 2 0.35 1.60 21 A 1 -2 -2 0 -1 -2 1 0 -2 0 -1 -1 -1 -1 -2 -1 2 0 -2 2 12 2 1 5 1 2 8 8 1 6 6 4 1 3 2 4 13 1 1 13 0.06 1.59 22 S -1 -2 -1 -2 -2 -2 0 -1 3 -3 -4 2 -3 1 -3 2 0 -1 4 -3 5 2 2 2 1 2 5 4 5 1 1 13 1 6 1 16 6 1 15 2 0.26 1.64 23 L 0 -2 -4 -4 -2 -5 -5 -4 -5 4 2 -5 0 4 -4 -4 -2 -2 -1 2 7 3 1 1 1 0 0 1 0 21 21 0 2 15 1 1 3 1 1 11 0.45 1.65 24 L -2 -2 -3 -3 1 -2 0 -4 -2 2 2 -1 -2 -3 0 -2 2 -2 -3 3 2 2 1 1 3 2 7 1 1 10 16 4 1 1 5 2 13 1 1 18 0.18 1.63 25 I 2 -5 -1 -5 0 -5 -5 -3 -5 4 -2 -5 -1 -2 -2 -3 -1 0 -4 5 16 0 3 0 2 0 0 1 0 21 2 0 1 1 2 2 3 1 0 35 0.59 1.59 26 W 2 -4 -5 -4 -2 -1 -3 -3 1 -3 -3 -3 -2 4 -2 -2 -3 9 2 -3 19 0 0 1 1 4 1 1 3 1 2 1 1 19 2 3 1 26 5 1 0.95 1.57 27 T -2 -4 -3 -1 -4 -1 -4 -4 -4 -1 -4 -4 1 -1 -4 0 7 -5 -4 -1 2 0 0 3 0 3 0 0 0 3 1 0 3 3 0 4 64 0 0 4 1.03 1.52 28 T -2 -4 -2 -1 -4 -1 -4 -3 -4 0 -2 -3 -1 -2 -2 -1 7 -5 -2 -1 2 0 1 3 0 3 0 2 0 6 4 1 1 1 1 3 58 0 1 4 0.85 1.63 29 T -2 5 -2 -3 0 -1 -1 -5 1 0 -3 1 0 -2 -2 -2 3 0 -2 -4 3 31 2 1 2 2 3 0 3 7 2 7 2 1 2 2 17 1 2 0 0.45 1.62 30 P -2 -4 -4 -4 0 -1 -4 -2 0 0 -1 -4 0 -4 7 -2 -2 4 -4 -1 3 0 0 0 2 3 0 3 2 5 8 0 3 0 47 3 3 5 0 4 0.96 1.44 31 W -4 -1 -4 0 -5 0 4 -4 2 -5 -2 -1 -4 0 -4 -1 -1 9 1 -4 1 4 0 6 0 4 23 1 4 0 4 4 0 4 0 4 4 25 4 0 0.85 1.45 32 T 0 1 1 -4 3 -3 0 -4 -4 0 -1 0 3 1 1 0 0 -4 2 -3 7 7 7 0 6 0 7 0 0 7 7 7 6 6 7 7 7 0 6 0 0.14 1.56 33 L -3 -5 -3 -6 -4 -5 -5 -6 -5 4 5 -3 4 -1 -5 -4 -3 0 -2 1 2 0 1 0 0 0 0 0 0 21 45 2 8 2 0 1 1 1 1 7 0.83 1.79 34 P -2 -3 -3 -3 -1 -2 -4 -4 -1 -1 -1 -3 1 5 6 -3 -3 -1 3 -1 3 1 1 1 1 2 1 2 1 3 7 1 3 21 31 1 2 1 8 4 0.75 1.87 35 G 2 -5 -2 -3 -1 -2 -3 5 -5 -3 -4 -4 -1 -3 -5 2 -1 0 -1 -3 15 0 1 2 1 1 2 40 0 2 2 0 1 1 0 17 3 1 3 2 0.65 1.82 36 N 1 -2 5 2 2 -2 -2 -3 0 -2 -3 -2 -1 -2 -4 -1 -1 -5 -2 1 13 2 27 12 4 2 2 2 2 2 2 2 2 2 0 3 3 0 2 12 0.43 1.75 37 V -2 -1 -2 -2 0 1 -2 -3 -1 -1 0 -1 2 -1 -2 0 4 -5 -1 1 4 3 2 2 2 6 3 2 2 4 9 3 4 2 2 6 27 0 3 9 0.21 1.68 38 A 3 -4 -1 -5 1 -4 -2 -1 1 -1 -2 -4 1 3 -5 -1 -1 3 5 -1 21 0 4 0 3 0 3 5 3 3 4 0 3 13 0 4 3 3 18 3 0.40 1.54 39 A 0 -4 1 -4 4 -4 -4 0 -4 1 0 -4 3 2 -4 0 1 -4 2 0 8 0 7 0 7 0 0 8 0 8 8 0 7 7 0 8 8 0 7 8 0.19 1.34 40 A -1 -5 0 0 3 1 -4 -1 2 0 -1 -4 2 1 0 -1 0 4 1 0 6 0 5 6 5 5 0 6 5 6 6 0 5 5 6 6 6 5 5 6 0.14 1.89 41 V -1 0 -4 0 3 1 0 -1 -4 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 0 5 5 5 5 5 0 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.07 2.01 42 H -1 0 0 0 3 0 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 -5 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0 5 5 0.02 2.12 43 P -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 44 E -2 -1 1 3 -1 0 4 -2 1 -2 -3 0 -1 -2 0 -1 -2 -6 -2 -3 4 3 6 16 1 3 27 3 3 2 4 6 1 2 6 4 3 0 2 2 0.37 2.20 45 Y -2 -2 -1 3 -1 -2 0 -3 6 1 0 -2 0 1 -2 -2 -2 1 3 -1 4 2 2 13 2 2 5 2 16 7 9 2 2 5 2 3 2 2 9 5 0.33 2.19 46 T -1 -1 -1 1 1 -1 2 -2 2 -1 -2 -1 0 -1 3 -1 0 -6 -1 0 6 3 3 7 3 3 11 3 4 4 3 4 3 3 15 4 5 0 3 8 0.13 2.20 47 Y -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 48 A 1 -2 -1 -1 1 -1 -2 -2 1 0 -1 -2 0 -1 -1 -1 -1 2 3 3 10 3 3 3 3 3 3 3 3 4 5 3 2 3 3 5 4 3 10 19 0.14 2.23 49 A -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 50 F -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 51 Q -1 0 -1 -1 1 0 0 -2 1 1 1 0 1 0 -1 -1 0 2 1 -1 6 5 3 4 3 4 7 3 3 8 12 6 3 4 3 4 6 3 4 5 0.01 2.18 52 V -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 53 G -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 54 D -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 55 E -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 56 A 0 0 0 -2 -1 1 -1 -1 1 -1 -2 1 -1 -1 0 -2 0 2 3 1 8 6 5 3 2 6 4 5 3 4 5 8 1 2 6 3 5 2 9 9 0.04 2.22 57 L -1 0 0 0 0 0 1 -2 0 0 -1 0 0 0 -1 -1 0 2 3 -1 6 6 5 5 2 5 8 3 2 5 7 7 2 4 4 4 6 3 8 4 0.02 2.23 58 I 0 -1 -1 0 1 0 0 -1 0 1 0 -1 0 0 -1 -1 -1 2 1 1 8 3 3 5 2 4 7 4 3 9 11 5 3 3 4 4 3 3 4 8 -0.00 2.24 59 L -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 60 E -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 61 E -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 62 G 0 0 0 0 2 0 0 -1 1 1 -1 0 1 0 -1 -1 0 2 2 -1 8 5 4 6 3 5 7 5 3 7 5 5 3 4 3 5 5 3 6 4 -0.00 2.22 63 L -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 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