JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_eH64AmL.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|C|C|C|C|C|C|C|C|C|C|C|C|C|C|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet |||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||E|E|E|E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|||||||E|E|E|E|||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 9|8|6|3|2|7|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|7|4|4|8|8|6|6|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|1|1|6|8|8|8|8|7|6|1|5|8|8|9|9|9|9|9|9|8|8|1|1|6|7|8|8|8|7|4|4|8|8|8|5|4|7|7|1|2|2|3|2|1|5|7|8|7|4|1|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|7|4|5|4|0|4|2|7|8|9|9|8|2|4|7|8|8|0|3|6|8|9|9|9|9|8|8|5|2|2|9|7|3|6|8|8|8|6|1|5|6|7|7|7|6|6|6|7|7|7|6|6|6|7|7|7|7|7|4|4|8|8|8|7|4|3|6|7|7|7|1|1|1|0|0|1|1|2|1|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|6|0|3|6|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|6|4|2|8|8|8|7|3|0|1|6|7|8|7|6|4|2|0|1|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|5|1|5|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|6|6|6|7|7|7|7|7|0|4|8|8|8|8|6|1|4|6|7|7|6|3|6|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|6|2|0|7|8|8|6|0|1|1|5|4|1|8|9|9|9|9|9|9|9|8|6|1|5|8|8|8|7|4|7|8|9|9|9|9|9|8|6|1|8 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off -|-|-|B|-|B|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|B|-|-|-|-|B|-|B|B|B|-|B|B|B|B|B|-|B|-|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|B|B|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|B|-|B|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|B|B|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|B|-|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|B|-|B|-|-|-|B|-|-|-|B|B|-|B|-|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|B NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|B|B|B|B|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles |||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||E|E|E|E|E|E||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|E||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|E||||||E|E|E|E|E|E||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles |||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||E|E|E|E|E|E|E|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E|E|||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|E||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||E||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | |*|*| | | | | | | | | |*|*| | |*| | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*|*|*|*|*| |*| | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | 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