Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 E -4 -5 -5 -4 -6 -2 0 -5 -5 -6 -6 -4 -5 -7 8 -4 -4 -7 -6 -5 0 0 0 0 0 1 8 0 0 0 0 0 0 0 91 0 0 0 0 0 2.71 1.47 2 N 0 1 5 -2 -5 3 -1 2 0 -6 -5 -1 -5 -6 -5 2 -3 -6 -3 -5 7 7 26 1 0 14 3 17 2 0 1 3 0 0 0 18 0 0 1 0 0.70 1.56 3 L -2 -6 -6 -6 -2 -5 -6 -6 -6 4 2 -5 -2 1 -6 -5 -2 -5 -4 5 3 0 0 0 1 0 0 0 0 26 19 0 0 6 0 0 1 0 0 45 1.13 1.62 4 E 2 0 -3 0 -3 -1 3 -3 1 0 -2 0 -1 -3 -1 -2 0 -6 -5 3 15 5 1 6 1 2 20 1 3 6 2 5 2 1 3 2 5 0 0 20 0.33 1.64 5 D 0 1 0 2 -6 2 4 -3 -1 -4 -4 1 -5 -5 -1 0 0 -6 -3 -4 7 8 4 11 0 9 31 1 1 1 2 10 0 0 2 7 5 0 1 1 0.56 1.64 6 T 4 -2 1 -3 -2 -3 -4 -2 4 -3 -4 -2 -4 -5 -4 2 3 -6 -4 -2 36 1 8 1 1 0 0 2 10 1 1 1 0 0 0 16 19 0 0 3 0.72 1.64 7 F -3 -5 -6 -7 -3 -5 -6 -7 -6 2 5 -6 1 1 -6 -4 -4 -5 -4 1 2 0 0 0 1 0 0 0 0 11 70 0 2 6 0 1 0 0 0 8 1.25 1.65 8 L 4 -3 2 -4 3 -2 -4 -1 -3 -3 0 -3 -2 -2 -5 0 -1 -1 -1 1 39 1 9 0 6 2 1 5 0 0 11 0 1 2 0 7 4 1 2 8 0.49 1.67 9 K -3 7 -1 -4 -6 4 -1 -4 2 -6 -5 0 -4 -6 -5 -2 -2 -6 -3 -4 2 60 2 0 0 20 2 0 5 0 0 4 0 0 0 2 1 0 0 1 1.44 1.66 10 M -2 -5 -3 -5 -2 -4 -4 -5 -5 -2 2 -4 4 0 -5 0 6 1 -2 -3 2 0 1 0 0 0 1 0 0 1 22 0 10 5 0 5 49 2 1 0 0.96 1.67 11 V 6 -3 -2 -5 0 -2 -4 -1 -5 -3 -3 -4 -2 -5 -4 2 -1 -6 -5 -2 66 1 1 0 2 1 0 4 0 1 3 0 1 0 0 16 2 0 0 2 1.10 1.67 12 K 0 1 -1 3 -3 0 5 -2 -1 -3 -4 -1 -3 -4 -4 0 1 -6 -5 -4 8 7 2 14 1 3 38 2 1 2 2 3 0 1 0 6 9 0 0 1 0.65 1.67 13 V -1 -4 -2 -3 -4 0 -4 -4 -3 5 3 -5 1 -1 -5 -2 -1 -1 -3 0 5 1 2 1 0 5 1 1 1 34 30 0 3 2 0 3 4 1 0 6 0.67 1.67 14 L 2 -5 -6 -6 1 -3 -5 -6 -6 1 5 -4 2 0 -5 -2 -3 -5 -4 1 15 0 0 0 3 1 0 0 0 7 56 1 4 3 0 2 1 0 0 7 0.89 1.68 15 R 1 6 -3 -3 -6 4 -1 -1 1 -6 -4 1 -4 -4 -5 0 -1 -2 -3 -5 12 42 1 1 0 17 2 5 3 0 1 6 0 1 0 6 3 1 0 0 0.87 1.70 16 A 3 -2 -3 4 -3 0 4 -2 -1 -4 -3 -3 -1 -4 -3 -1 -2 -3 -3 -3 26 2 1 20 1 3 29 2 1 0 3 0 1 1 0 4 2 0 1 2 0.67 1.70 17 E -3 -4 -2 6 -7 -2 5 -5 -4 -4 -5 -3 -5 -6 -4 -3 -3 -7 -4 -5 1 0 1 51 0 1 43 0 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 1 0 1.63 1.69 18 R 1 -1 3 4 -1 -1 2 -3 1 -3 -2 -3 -3 -4 -5 0 0 -6 -3 1 13 3 13 20 1 2 13 1 3 1 3 1 0 1 0 8 6 0 1 9 0.40 1.69 19 E 1 -2 -1 6 -3 0 4 -4 -1 -3 -4 -2 -3 -5 -4 -1 -1 -6 -4 -4 13 2 2 42 1 3 24 0 1 1 2 1 0 0 0 3 3 0 0 1 0.95 1.69 20 F 0 -5 -5 -6 0 -3 -4 -6 -1 -3 0 -5 -3 5 -6 -5 -3 2 7 -2 9 0 0 0 2 1 0 0 1 1 10 0 0 28 0 0 1 3 40 2 1.32 1.69 21 L -3 -5 -6 -7 -4 -5 -6 -7 -6 3 6 -6 4 -1 -6 -5 -3 1 -4 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 13 69 0 8 2 0 0 1 2 0 3 1.33 1.69 22 E -1 -1 0 5 -1 1 5 -3 -1 -6 -5 -2 -4 -6 -4 -2 -1 -6 -5 -4 6 2 4 29 1 5 41 1 1 0 1 1 0 0 0 2 4 0 0 1 0.99 1.69 23 E 1 0 -1 1 -3 3 3 -1 -1 -4 -4 1 -2 -6 -2 1 0 -6 -2 -3 14 6 2 7 1 15 20 5 1 1 1 8 1 0 1 9 5 0 1 1 0.39 1.69 24 E -2 -2 -3 -4 -3 3 3 -6 -1 1 3 -1 1 -2 -4 -2 -2 2 0 0 3 2 1 0 0 16 19 0 2 8 25 2 4 1 1 3 2 3 3 6 0.44 1.69 25 A 6 -5 -4 -5 0 -4 -4 -2 -5 -2 -2 -4 -2 -5 -4 1 2 -6 -5 0 64 0 0 0 1 0 0 1 0 2 3 0 1 0 0 8 13 0 0 6 1.08 1.69 26 Q 1 1 0 2 -5 2 3 -1 -1 -3 -1 0 -2 -4 -4 -1 0 -6 -4 -2 15 8 4 10 0 10 20 5 2 1 6 6 1 1 0 4 5 0 0 2 0.32 1.67 27 K 0 2 0 1 -6 3 3 -3 0 -2 -3 3 -2 -6 -4 -1 -1 -6 -3 -3 7 13 4 8 0 13 21 1 2 2 2 17 1 0 0 4 3 0 1 2 0.51 1.67 28 L 3 -3 -3 -5 -1 -2 -1 -4 -1 1 2 -2 0 0 -5 -2 -1 3 0 1 26 1 1 0 1 2 4 1 2 7 24 3 2 4 0 2 4 4 3 8 0.39 1.68 29 Y -1 -2 -5 -5 -1 -3 -4 -5 -1 -1 3 -4 0 4 -4 -5 -4 4 5 -1 6 3 0 1 1 1 1 1 1 2 29 0 2 18 1 0 0 6 23 4 0.85 1.67 30 K 1 2 0 1 -5 2 2 -1 -1 -3 -2 2 -3 -4 1 0 -1 -6 -5 -3 12 11 4 6 0 10 15 4 1 1 3 15 0 1 7 6 3 0 0 1 0.34 1.68 31 E -1 2 0 0 -1 3 3 -1 -1 -3 -2 2 -3 -6 -1 0 -1 -3 -2 -4 5 12 4 4 1 15 19 5 1 1 3 14 0 0 3 8 3 0 1 0 0.42 1.68 32 V 3 -4 -3 -5 4 -3 -3 -3 -4 2 1 -5 -1 -4 -5 -1 -2 -3 -2 4 23 1 1 0 9 1 1 1 0 13 14 0 1 0 0 5 2 0 1 26 0.61 1.66 33 K -1 2 -1 -2 -2 0 -1 -3 -1 1 0 2 -1 -1 -3 -1 1 -3 -2 3 5 13 3 3 1 4 4 2 1 9 8 11 1 2 1 4 8 0 1 19 0.21 1.65 34 K 0 2 2 1 1 2 1 0 1 -2 -3 0 -3 -3 -2 -1 2 -3 -3 -2 8 12 9 7 3 8 10 7 3 2 2 6 1 1 1 5 11 0 1 3 0.23 1.67 35 G -1 1 -1 2 -5 0 2 3 1 -2 -3 1 -5 -4 0 0 -2 -3 -2 -4 5 9 2 10 0 4 14 22 4 2 2 10 0 0 5 5 2 0 1 1 0.35 1.64 36 N -1 -1 2 4 -2 1 2 -1 0 -1 -1 -1 -3 -3 -1 -2 -2 -2 1 -1 5 3 10 20 1 6 13 6 2 4 5 4 0 1 3 3 3 1 5 5 0.25 1.62 37 C 0 1 -2 -2 2 0 -1 4 -2 -1 -4 0 -2 -5 -3 1 1 -3 -3 0 8 7 2 2 4 4 3 30 1 4 1 6 1 0 1 9 8 0 1 8 0.35 1.58 38 L -4 -5 -4 -4 0 -1 -4 -5 -5 2 5 -5 1 1 -4 -5 -3 -2 1 0 0 0 1 1 2 3 1 1 0 11 61 0 3 6 1 0 1 0 4 4 0.97 1.60 39 D -1 0 4 5 -2 -2 -1 -3 0 -3 -3 -2 -5 -4 0 2 -2 -6 -5 -3 6 4 17 34 1 1 3 1 2 1 3 2 0 1 6 15 1 0 0 1 0.70 1.56 40 V 0 4 -4 -4 3 -2 -3 -2 -2 2 0 -1 -2 -3 -4 -4 0 -5 -4 3 9 22 0 1 6 1 2 4 1 14 10 3 1 1 1 0 7 0 0 19 0.45 1.55 41 K 0 1 1 1 -3 0 3 -1 -1 -4 -3 1 -3 -4 0 1 -1 2 -3 -2 9 8 6 9 0 4 18 5 2 1 3 10 0 1 5 9 4 3 0 2 0.25 1.55 42 K 1 2 -2 -1 -2 -1 1 1 -1 0 -1 2 -1 -3 1 -1 -1 -2 -1 0 14 11 1 3 1 3 8 9 1 7 5 12 1 1 6 4 4 1 2 6 0.14 1.49 43 L -3 -5 -6 -6 -4 -5 -6 -6 -3 1 5 -5 2 4 -6 -5 -3 0 -1 0 2 0 0 0 0 0 0 0 1 5 64 0 4 15 0 0 1 1 2 5 1.13 1.49 44 K 2 3 -1 -2 -2 3 -1 -3 -2 -1 0 2 -1 -1 -4 0 -1 -1 -3 -1 15 18 3 2 1 12 3 2 1 3 8 14 1 3 0 7 4 1 0 3 0.31 1.48 45 E 2 1 1 1 -3 0 1 1 -1 -4 -4 2 -4 -5 -1 1 0 -6 -3 -2 19 7 7 7 0 4 9 10 2 1 1 11 0 0 3 9 7 0 1 2 0.29 1.48 46 K 2 -3 -4 -4 -1 1 -2 -4 -3 1 4 -4 1 -1 -5 -3 -1 -2 -2 0 15 1 0 1 1 6 3 1 1 5 48 1 3 1 0 1 4 1 1 6 0.59 1.49 47 P -2 -4 -2 1 -6 -2 -1 -3 6 -5 -3 -4 -3 -4 7 -2 -3 -6 -4 -5 3 0 1 7 0 1 3 2 23 0 3 0 1 1 52 3 1 0 0 0 1.55 1.49 48 L 0 1 -3 -1 -5 -2 -1 -3 -5 1 2 -1 -1 -2 4 -2 -1 -5 -3 1 8 7 1 3 0 2 4 2 0 8 23 4 1 1 20 3 3 0 1 9 0.34 1.49 49 A 6 -1 -3 -5 -2 -4 -4 -2 -4 -3 -4 -4 -4 -2 1 0 -2 -5 -2 -1 72 3 1 0 1 0 0 2 0 1 0 0 0 2 8 5 1 0 1 4 1.11 1.49 50 L -2 -4 -6 -6 -4 -5 -6 -6 -6 4 5 -5 1 -1 -3 -5 -3 -5 -4 2 3 1 0 0 0 0 0 0 0 21 54 0 3 2 1 0 1 0 0 14 1.04 1.49 51 Q 0 5 -3 -4 -1 6 -2 -3 -3 -4 -2 1 -3 -5 -4 -2 -4 -1 -4 -3 9 29 0 0 2 40 1 2 0 1 5 8 0 0 0 2 0 1 0 1 1.02 1.49 52 R -3 7 -2 -4 -6 0 -3 -3 -1 -4 -4 0 -2 -2 -1 -1 1 -2 -3 -4 1 69 1 0 0 3 0 2 1 1 1 3 1 2 3 4 8 1 1 1 1.35 1.49 53 R -3 8 -3 -4 -3 -1 -1 -4 -2 -5 -3 -1 -4 -5 -5 -3 -4 -6 -3 -3 1 86 0 0 1 1 2 1 1 0 3 0 0 0 0 1 0 0 1 1 1.87 1.49 54 V 1 -4 -6 -6 -1 -5 -5 -4 -6 3 2 -5 2 -2 -5 -3 -1 -5 -4 5 10 1 0 0 1 0 0 1 0 17 16 0 5 1 0 1 2 0 0 45 0.89 1.49 55 I -3 -5 -6 -6 -1 -3 -6 -6 -6 6 3 -5 2 -2 -6 -4 -3 0 -2 2 1 0 0 0 1 1 0 0 0 46 28 0 4 1 0 1 1 1 1 13 1.08 1.49 56 R -1 7 -3 -3 -6 1 -2 -5 0 -4 -3 3 0 -3 -3 -2 -2 -5 -1 -4 6 57 0 1 0 6 2 0 3 1 2 14 2 1 1 2 2 0 2 1 1.12 1.50 57 K -1 4 -1 -2 -1 2 -1 -3 -1 0 2 1 3 -2 -5 -3 -2 -5 -2 -2 6 20 3 2 1 11 3 2 2 4 24 7 7 1 0 1 2 0 2 2 0.38 1.52 58 F 2 -2 -5 -6 -4 -5 -5 -3 -5 3 1 -5 2 3 -5 -2 -1 7 -1 0 16 3 0 0 0 0 0 2 0 19 12 0 4 15 0 3 3 16 1 6 0.73 1.50 59 I 0 -4 -6 -5 2 -5 -4 -5 -5 2 5 -3 0 0 -6 -4 -2 3 -1 1 7 1 0 0 4 0 1 1 0 11 52 1 1 4 0 1 2 4 2 9 0.78 1.52 60 G 1 1 1 -1 -3 3 2 2 1 -5 -3 1 -2 -5 -2 0 -2 -3 -2 -2 12 7 7 2 0 15 11 16 3 0 2 8 1 0 2 6 2 0 1 2 0.33 1.51 61 E 0 0 -2 1 -2 4 4 -4 2 -3 -3 1 -2 -5 -3 -1 0 -5 -2 -1 7 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