Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 F -3 -4 -4 -5 -3 -4 -4 -5 -3 -1 3 -4 0 7 -5 -4 -3 -1 1 -1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30 0 0 70 0 0 0 0 0 0 1.08 0.40 2 Q -2 0 -1 1 -4 6 3 -3 4 -4 -4 0 -2 -4 -3 0 1 -4 -2 -3 0 2 0 5 0 49 18 0 12 0 0 0 0 0 0 6 9 0 0 0 0.73 0.42 3 R -3 7 -2 -3 -5 1 -1 -4 -1 -4 -4 2 -3 -4 -3 -2 -2 -4 -3 -4 0 89 0 0 0 2 0 0 0 0 0 9 0 0 0 0 0 0 0 0 1.30 0.43 4 E 1 -2 -2 2 -3 0 2 -3 -3 -2 -3 -2 -3 -4 5 1 1 -5 -4 -2 10 1 0 15 0 3 14 0 0 3 0 0 0 0 28 12 10 0 0 3 0.57 0.43 5 E 0 2 0 3 -4 3 4 -3 -1 -4 -3 0 -3 -1 -3 -1 -2 -4 -3 -4 7 11 3 22 0 18 34 0 0 0 1 0 0 4 0 0 0 0 0 0 0.60 0.43 6 L -3 -3 -5 -5 -2 -3 -4 -5 -4 1 6 -4 1 -1 -4 -4 -2 -3 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 98 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.98 0.42 7 M -1 -1 -3 -4 -3 2 -2 -4 -3 1 2 -2 8 -1 -4 -3 -2 -3 -2 0 3 2 0 0 0 12 0 0 0 6 13 0 61 0 0 0 0 0 0 3 0.76 0.42 8 K -1 4 -1 -2 -4 2 1 -1 1 -4 -4 5 -3 -4 -3 -1 -2 -4 0 -4 3 27 0 0 0 6 7 5 4 0 0 44 0 0 0 0 0 0 4 0 0.65 0.42 9 M -2 -3 -5 -5 -3 -3 -4 -5 -4 0 5 -4 4 -1 -4 -3 -2 5 -2 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 75 0 13 0 0 0 0 8 0 1 0.84 0.42 10 K -2 4 -1 -2 -5 0 0 -3 -2 -4 -4 6 -3 -4 -1 -1 -2 -4 -3 -4 0 24 0 0 0 0 0 0 0 0 0 74 0 0 2 0 0 0 0 0 1.00 0.42 11 V -2 -4 -4 -4 -2 -3 -4 -5 -4 3 0 -3 0 -2 0 -3 0 -4 -3 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18 0 0 0 0 6 0 3 0 0 73 0.76 0.42 12 K -2 3 -1 -2 -4 0 0 -3 -2 -4 -4 6 -3 -4 -2 -1 -2 -4 -3 -4 0 13 0 0 0 0 0 0 0 0 0 87 0 0 0 0 0 0 0 0 1.07 0.42 13 D -3 -3 0 7 -5 -1 2 -3 -2 -5 -5 -2 -4 -5 -3 -1 -2 -6 -4 -4 0 0 0 89 0 0 11 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.42 0.42 14 L -3 -3 -5 -5 -3 -3 -4 -5 -4 1 6 -4 3 -1 -4 -4 -2 -3 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 95 0 5 0 0 0 0 0 0 0 0.98 0.42 15 R -3 7 -2 -3 -4 2 -1 -4 -2 1 -3 2 -2 -4 -3 -2 -2 -4 -3 -2 0 74 0 0 0 7 0 0 0 12 0 7 0 0 0 0 0 0 0 0 0.98 0.42 16 D -3 -1 -1 4 3 4 0 -3 2 -3 -2 -1 -2 2 -3 -2 -2 4 -1 -3 0 1 0 31 8 32 2 0 5 0 3 0 0 12 0 0 0 7 0 0 0.59 0.42 17 Y -3 -3 -4 -5 -4 -3 -4 -4 0 -2 -2 -3 -2 4 -4 -3 -3 1 8 -1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 0 0 0 0 82 3 1.45 0.42 18 L -3 -3 -5 -5 -3 -3 -4 -5 -4 1 5 -4 3 -1 -4 -4 -2 -3 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 93 0 7 0 0 0 0 0 0 0 0.97 0.42 19 S 0 0 1 1 -3 2 -1 -2 4 -1 0 -1 -1 -3 -3 2 1 -4 -2 -2 7 4 8 7 0 13 2 1 13 3 13 1 1 0 0 19 7 0 0 0 0.23 0.42 20 L -2 -2 -1 -3 -3 -2 -3 -4 -3 0 4 1 0 -1 -3 0 0 -3 -2 0 0 0 4 0 0 0 0 0 0 0 64 10 0 0 0 12 5 0 0 5 0.47 0.42 21 H -3 5 -1 -2 -5 0 -1 -3 6 -4 -4 3 -3 -4 -3 -2 -2 -4 -1 -4 0 44 0 0 0 0 0 0 30 0 0 26 0 0 0 0 0 0 0 0 0.96 0.42 22 D -2 1 5 2 -4 0 2 0 4 -5 -4 -1 -3 -4 -3 0 -2 -5 -2 -4 0 7 40 9 0 2 15 5 14 0 0 0 0 0 0 7 0 0 0 0 0.65 0.42 23 I -2 -4 -4 -4 -2 -4 -4 -5 -5 6 0 -4 0 -1 -4 -3 -1 -4 -3 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 87 0 0 0 0 0 0 2 0 0 11 0.97 0.42 24 S 0 -3 0 -2 -3 -2 -2 -2 -3 -4 -4 -2 -3 -4 6 4 -1 -5 -4 -3 2 0 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45 49 0 0 0 0 1.12 0.42 25 T -1 -2 -2 -3 -2 -2 -2 -3 2 0 0 -2 2 -3 -3 0 5 -4 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7 6 9 0 7 0 0 3 63 0 0 4 0.60 0.42 26 E 0 1 -1 4 -4 2 3 -3 3 -4 -4 1 -3 -4 -3 2 -2 -4 -3 -4 5 7 0 28 0 8 23 0 9 0 0 5 0 0 0 16 0 0 0 0 0.54 0.42 27 M -2 -3 -2 2 -3 0 -2 1 -3 -2 0 -2 4 1 -3 0 4 -3 -2 -1 0 0 0 15 0 4 0 12 0 0 9 0 17 8 0 3 32 0 0 1 0.32 0.42 28 C -2 -5 -4 -5 10 -4 -5 -4 -4 -2 0 -4 -2 -3 -4 -2 -2 -4 -4 -2 0 0 0 0 91 0 0 0 0 0 9 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.95 0.42 29 R -2 6 -2 -3 -4 0 -1 -3 -2 -3 -2 2 -2 -4 -3 1 1 -4 -3 0 0 60 0 0 0 0 0 0 0 0 4 10 0 0 0 9 9 0 0 8 0.71 0.42 30 E -2 -1 -2 0 -5 1 7 -3 -1 -4 -3 0 2 -4 -2 -1 -2 -4 -3 -3 0 0 0 0 0 0 91 0 0 0 0 0 9 0 0 0 0 0 0 0 1.13 0.42 31 K -2 1 -1 -2 -4 0 0 -3 -2 -4 -4 6 -3 -5 2 -1 -2 -4 -3 -4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 91 0 0 9 0 0 0 0 0 1.06 0.42 32 E -1 1 -1 2 -4 0 6 -3 3 -4 -4 0 -3 -4 -2 0 -2 -4 -3 -4 3 7 0 9 0 0 65 0 8 0 0 0 0 0 0 7 0 0 0 0 0.83 0.42 33 E -3 -2 0 6 -5 0 5 -3 -2 -5 -5 -1 -4 -5 -3 -1 -2 -5 -4 -4 0 0 0 52 0 0 48 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.14 0.42 34 L -3 -4 -5 -5 -3 -4 -4 -5 -4 2 5 -4 1 -1 -4 -4 -2 -3 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9 91 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.94 0.42 35 V -2 -4 -4 -4 -2 -3 0 -5 -4 3 0 -3 0 -2 -4 -3 -1 -4 -3 5 0 0 0 0 0 0 9 0 0 18 0 0 0 0 0 0 0 0 0 73 0.73 0.42 36 L -2 -2 1 5 -1 0 3 1 -2 -4 -2 -2 -3 1 -3 -2 -2 -4 -3 -4 0 0 5 41 2 1 25 13 0 0 4 0 0 8 0 0 0 0 0 0 0.62 0.42 37 L -3 -3 -5 -5 -3 -3 -4 -5 -4 1 6 -4 1 -1 -4 -4 -2 -3 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.02 0.42 38 V -2 -4 -4 -4 -2 -3 -4 -4 -4 4 0 -3 0 -2 -4 -3 1 -4 -2 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26 4 0 0 0 0 0 10 0 0 60 0.71 0.41 39 L -3 -4 -5 -5 -2 -3 -4 -5 -4 3 5 -4 3 -1 -4 -4 -2 -3 -2 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14 71 0 8 0 0 0 0 0 0 7 0.78 0.41 40 G 1 4 -1 -1 5 0 -2 2 -2 -2 -3 -1 -3 -2 -3 0 -1 -4 -2 -3 12 33 1 4 17 3 0 19 0 2 0 0 0 2 0 4 2 0 1 0 0.46 0.41 41 Q -2 0 2 -2 -4 5 0 -3 8 -4 -4 -1 -2 -3 -3 -1 -2 -4 0 -4 0 2 9 0 0 37 0 0 51 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.07 0.39 42 Q -2 2 -1 -1 -4 6 1 -3 5 -4 -3 1 -2 -3 -2 -1 -2 -3 0 -3 0 13 0 0 0 59 0 0 22 0 0 4 0 0 0 0 0 0 2 0 0.74 0.22 43 P -1 -3 -2 -2 -3 -2 -2 4 -3 -4 -4 -2 -3 -4 6 -1 -2 -4 -4 -3 0 0 0 0 0 0 0 46 0 0 0 0 0 0 54 0 0 0 0 0 1.30 0.17 44 V -1 -3 -4 -4 -1 -3 -3 -4 -4 3 3 -3 1 -1 -3 -3 -1 -3 -2 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19 34 0 0 0 0 0 0 0 0 48 0.43 0.11 K Lambda Standard Ungapped 0.1378 0.3214 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1870 0.3160 PSI Gapped 0.0572 0.2670