Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 V -4 -5 -6 -6 -4 -4 -5 -6 -5 2 3 -5 8 -3 -5 -5 -3 -5 -4 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9 27 0 48 0 0 0 0 0 0 15 1.39 1.27 2 K -3 1 1 1 -6 3 3 -5 -2 -5 -6 5 -5 -5 -4 0 1 -6 -5 -5 1 6 7 7 0 11 19 0 0 0 0 36 0 0 0 5 7 0 0 0 0.82 1.52 3 T -2 -3 -1 -3 -4 -4 -4 -2 -5 3 -2 -4 -1 0 -4 1 5 -6 -4 3 3 1 3 1 0 0 1 3 0 18 1 0 1 3 0 9 34 0 0 22 0.71 1.64 4 F -5 -6 -7 -7 -3 -6 -6 -7 -6 2 6 -6 0 4 -5 -5 -5 -1 -2 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12 68 0 1 16 0 0 0 1 1 1 1.35 1.70 5 E 1 -1 0 3 -4 1 4 -2 1 -5 -5 0 -4 -4 -2 2 -1 -6 0 -5 11 3 4 18 0 5 22 3 3 0 1 5 0 1 1 14 4 0 3 0 0.49 1.72 6 D 0 3 -1 2 -4 2 4 -2 1 -5 -5 0 -4 -5 -5 1 0 -6 -1 -5 6 16 2 11 0 9 25 2 3 0 1 6 0 0 0 10 5 0 2 1 0.55 1.73 7 L -5 -4 -7 -5 -5 -5 -5 -7 -6 0 6 -6 0 -2 -6 -6 -4 -5 -4 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 4 86 0 1 1 0 0 0 0 0 5 1.58 1.72 8 F 1 -3 -3 0 -4 1 4 -3 0 -2 -4 -3 -1 4 -5 -3 -3 2 5 -2 10 1 1 5 0 6 27 1 2 2 1 0 2 15 0 1 1 2 21 2 0.72 1.75 9 A 3 2 1 2 -3 3 2 -2 1 -5 -5 1 -3 -5 -5 0 -1 -6 -4 -4 23 10 6 9 0 11 13 3 4 0 0 10 0 0 0 6 3 0 0 1 0.45 1.74 10 E -2 -3 -4 -4 -5 -2 2 -5 -4 3 1 -2 1 -2 -5 -2 4 -6 -3 3 2 1 0 0 0 2 12 0 0 13 11 2 3 1 0 2 26 0 1 23 0.57 1.74 11 L -3 -5 -7 -7 -2 -5 -6 -7 -6 6 4 -4 0 -3 -6 -6 -4 -6 -5 2 2 0 0 0 1 0 0 0 0 50 33 1 1 0 0 0 0 0 0 11 1.30 1.74 12 G 2 0 -1 0 1 2 2 -3 0 -2 -1 2 -3 -5 -5 1 0 -4 -4 -2 19 6 2 5 3 10 14 1 2 3 7 11 1 0 0 9 5 0 0 3 0.28 1.76 13 D 1 -1 -1 4 -6 2 3 -3 0 -5 -5 0 -4 -5 -5 2 -1 -6 -1 -4 12 4 3 21 0 10 20 2 2 0 1 6 0 0 0 13 3 0 2 1 0.54 1.75 14 R -3 8 -3 -5 -7 -2 -2 -5 -4 -4 -5 2 -5 -2 -5 -3 -3 -6 -4 -5 1 80 0 0 0 0 1 0 0 1 0 10 0 2 0 1 1 0 0 0 1.87 1.74 15 A 2 3 -3 -4 -5 -1 -1 -4 -1 -1 -1 5 -2 0 -5 -2 -3 -1 -2 -3 18 16 0 1 0 3 2 0 1 4 6 37 1 4 0 2 0 1 1 1 0.69 1.74 16 R 2 1 2 2 -4 2 2 0 -1 -3 -2 2 -3 -4 -2 0 -1 -6 -4 -2 16 7 9 9 0 8 14 6 2 1 4 10 0 1 2 5 3 0 0 3 0.28 1.75 17 T 2 -1 4 1 -3 -1 2 -2 1 -4 -4 -1 -3 -3 -4 1 1 -6 -3 -4 19 2 18 7 0 2 16 2 3 1 1 3 0 1 0 11 9 0 1 1 0.47 1.73 18 R 2 3 0 3 -4 -2 -3 0 -2 -4 -1 -1 0 -4 4 0 -3 -6 -3 -4 17 14 5 16 0 1 1 6 1 1 6 4 3 0 17 6 1 0 1 1 0.44 1.68 19 P -1 -1 -2 1 -4 -1 -1 -2 -4 -4 -4 -1 -4 -6 7 0 -1 -6 -4 -2 4 3 2 8 0 3 4 3 0 1 1 4 0 0 54 5 3 0 1 3 1.22 1.67 20 A 2 -3 -1 2 -6 1 5 -3 -3 -4 -5 0 -5 -5 2 0 -2 -6 -5 -3 14 1 2 11 0 5 39 2 0 1 1 5 0 0 8 5 3 0 0 2 0.69 1.66 21 D -2 0 1 1 -6 -2 0 5 -2 -4 -5 1 -4 -5 -4 0 0 -6 -5 -4 2 4 7 8 0 2 7 43 1 1 1 9 0 0 1 8 5 0 0 1 0.69 1.67 22 S -1 -4 -2 -3 -4 -3 -3 -3 -4 -3 -5 -3 -5 -3 -2 7 -1 -6 -3 -2 1 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 1 0 1 2 88 1 0 1 2 1.60 1.65 23 T -2 -1 -4 -4 -6 -4 -3 0 0 -3 -4 -3 -4 0 -6 -3 -4 5 9 -5 3 3 0 1 0 0 2 8 1 1 1 1 0 0 0 2 0 6 70 0 1.82 1.69 24 T -2 -5 -2 -5 -2 -4 -4 -5 -5 -1 -3 -3 -2 -4 -5 -1 7 -2 -3 2 2 0 2 0 1 0 0 0 0 2 1 1 1 1 0 2 72 1 1 15 1.41 1.70 25 V 4 0 1 -4 1 -2 -2 -3 -2 -3 -4 2 -3 -4 -4 0 1 -6 -2 1 38 6 7 1 2 1 1 1 1 1 1 13 0 1 1 6 8 0 2 11 0.53 1.73 26 A 0 5 -2 -3 -3 0 0 -4 1 -5 -3 3 -4 -4 -5 2 0 -5 2 -4 7 30 1 1 0 4 4 1 3 0 2 19 0 1 0 13 5 0 8 1 0.65 1.71 27 A -1 -3 -6 -6 -5 -3 -2 -7 -6 -1 6 -4 0 -3 -6 -4 -4 -5 -4 -2 4 1 0 0 0 1 3 0 0 2 85 1 1 0 0 1 0 0 0 1 1.44 1.71 28 L -4 -4 -3 -1 -3 -4 -5 -6 0 -1 3 -4 0 6 -6 -3 -3 -1 2 -1 1 1 1 4 1 1 0 0 3 3 30 1 2 34 0 2 1 1 7 5 0.84 1.76 29 D 2 -1 3 4 -2 1 1 -3 1 -4 -4 0 -1 -5 -4 0 0 -6 -3 -4 16 3 11 19 1 7 9 2 3 1 1 5 2 0 0 8 5 0 1 1 0.36 1.71 30 G 1 1 -1 1 -4 0 1 0 -1 -4 -4 4 -2 -5 -2 1 -2 -5 -4 -4 10 8 3 7 0 3 8 7 1 1 2 29 1 0 2 11 2 0 0 1 0.39 1.56 31 G -2 -1 -1 -1 -2 -2 -2 6 -4 -4 -3 -2 -2 -4 -1 -2 -3 -4 -4 -3 3 3 3 3 1 1 2 63 0 1 3 2 1 1 3 3 1 0 1 2 1.06 1.49 32 V -2 0 -3 2 -5 0 1 -4 0 1 1 -1 -1 -3 2 -2 1 -5 -3 2 3 4 1 10 0 5 8 1 2 8 15 3 1 1 9 2 7 0 1 14 0.16 1.67 33 H -2 0 3 5 -2 -1 2 -2 4 -4 -4 -1 -5 -5 0 -1 -2 -6 -2 -4 4 4 13 27 1 1 11 3 11 1 2 4 0 0 4 3 2 0 1 1 0.52 1.63 34 A 0 2 -1 -3 -5 -1 1 -2 0 -4 -1 5 1 -1 -4 -2 -1 -1 -2 -2 9 11 2 1 0 2 8 2 2 0 7 31 4 3 0 2 3 1 1 3 0.37 1.63 35 L -2 -2 -2 -5 1 -2 -4 -5 -1 5 2 -1 3 -1 -2 -1 -2 -4 -1 1 3 2 2 0 3 2 0 0 2 30 21 3 7 2 2 5 2 0 2 6 0.44 1.46 36 G 2 -2 -2 -3 2 -2 -3 0 -1 -1 4 -3 0 -2 -3 -2 -2 -4 -2 -1 17 3 2 2 4 2 2 6 1 2 41 2 1 1 2 2 2 0 1 3 0.36 1.47 37 K -1 1 -1 -1 -5 3 0 -2 -3 -4 -2 5 -4 -5 -4 0 1 -5 -4 -4 6 5 3 2 0 15 6 2 0 0 3 34 0 0 0 6 9 0 0 0 0.52 1.45 38 K -2 -1 3 -1 -3 3 2 -2 -2 -3 -3 2 -3 -4 -2 2 2 -3 -3 -3 1 1 13 1 0 13 13 1 0 1 1 13 0 0 1 13 13 0 0 1 0.28 0.68 39 L -1 -4 -4 -4 1 -4 -4 -4 -4 3 2 0 1 0 -4 -2 -1 -4 0 3 4 0 0 0 3 0 1 1 0 17 20 7 3 3 0 3 3 0 3 22 0.35 1.22 40 L -1 0 1 -4 3 1 0 -1 3 0 -1 0 2 -4 -5 0 0 -5 1 0 6 6 6 0 6 6 6 6 6 6 6 6 6 0 0 6 6 0 6 6 0.10 1.78 41 E 3 -2 1 -2 -3 -1 4 -3 3 -3 -1 1 -2 -3 -3 -2 -2 -3 -3 -3 24 1 7 1 0 1 28 1 7 1 7 8 0 0 1 1 1 0 0 1 0.30 0.73 42 E 0 -2 2 1 -4 -1 4 0 3 -4 -4 2 -3 -4 -3 -2 -2 -4 -3 -3 6 1 8 8 0 0 31 6 8 1 1 12 0 0 1 1 1 0 0 1 0.36 0.74 43 A 3 -3 -1 -3 3 -3 0 -1 0 0 -2 -3 1 0 -3 0 2 -4 -3 0 25 0 3 0 7 0 8 3 2 5 3 0 3 3 0 4 13 0 0 6 0.17 1.00 44 G 0 -3 -2 1 1 -2 0 1 -2 1 -2 -3 -2 -1 -4 0 3 -4 0 1 9 1 1 8 3 2 7 9 1 7 3 1 1 2 0 6 18 0 3 10 0.10 1.37 45 E -2 0 -1 -2 -6 0 7 -3 -3 -6 -5 -2 -5 -6 -4 -1 -4 -5 -5 -5 3 4 2 0 0 2 76 1 0 0 0 0 0 0 0 3 0 0 0 0 1.37 1.42 46 V 0 -4 -5 -5 0 -4 -3 -5 -5 0 3 -2 0 1 -5 -1 1 -4 -1 3 8 0 0 0 2 0 2 0 0 3 29 3 2 6 0 4 10 0 2 23 0.41 1.59 47 W 1 -4 -1 -4 6 -4 -2 -2 -4 3 0 -2 0 -1 -4 -1 0 3 -4 2 11 0 3 0 14 0 3 3 0 17 9 2 2 2 0 3 5 4 0 14 0.38 1.56 48 L -2 -1 -4 0 0 0 1 -5 0 3 2 -1 2 1 -4 -2 1 -4 -4 -1 3 3 0 5 2 4 8 1 2 18 19 3 6 5 0 3 9 0 0 4 0.23 1.61 49 A 5 -4 -1 -1 3 -3 1 -1 0 -4 -2 -4 -4 -4 -4 -1 1 -5 0 -2 44 0 3 4 5 0 8 4 3 0 4 0 0 0 0 4 8 0 3 3 0.52 1.63 50 A -1 0 1 0 3 1 0 -1 2 0 -1 0 -4 1 -5 0 0 -5 1 0 6 6 5 6 5 5 6 6 5 6 6 6 0 5 0 6 6 0 5 6 0.05 1.89 51 E -1 -1 -1 -1 1 1 3 -2 1 -1 -1 3 1 -1 -5 -2 0 -5 0 -1 5 3 3 3 3 6 16 4 3 3 6 18 4 3 0 3 5 0 3 5 0.18 1.97 52 H 0 -2 4 4 -1 -1 -1 -2 1 -3 -3 0 -1 -2 -2 0 -1 -6 0 -2 8 2 19 23 2 2 3 3 4 2 2 5 2 2 2 5 3 0 3 3 0.37 2.05 53 E -1 -1 1 1 0 2 3 3 1 -3 -3 0 0 -5 -1 -2 -2 -6 -2 -3 5 3 7 7 2 8 17 20 3 2 2 5 2 0 3 3 3 0 2 2 0.27 2.03 54 S -1 0 1 0 3 1 0 -1 2 0 -1 0 -4 -4 0 0 0 -5 1 0 6 6 5 6 5 5 6 6 5 6 6 6 0 0 6 6 6 0 5 6 0.05 1.89 55 N -2 3 1 3 -3 0 -1 -3 0 -4 -2 3 -3 -4 2 -2 -2 -6 -3 -4 4 15 6 18 1 3 3 1 2 1 4 21 1 1 10 3 2 0 1 1 0.45 1.65 56 D 0 -2 1 4 -6 0 4 -1 -1 -4 -4 1 -3 -4 -3 0 -2 -6 -3 -4 7 1 7 21 0 4 27 5 1 1 1 8 1 1 1 6 3 0 1 1 0.53 1.65 57 A 1 1 -1 2 -6 0 5 0 1 -5 -2 0 -3 -4 -3 -2 -3 -2 -5 -4 10 9 3 12 0 2 36 7 4 0 4 5 1 1 1 2 1 1 0 1 0.55 1.64 58 L -1 -5 -6 -6 -2 -2 -4 -5 -5 3 4 -4 0 1 -6 -4 0 -5 -2 2 4 0 0 0 1 2 1 1 0 15 41 1 2 7 0 1 7 0 1 15 0.66 1.65 59 A 3 -1 -5 -4 -1 -2 -4 -4 -3 4 0 0 -1 -4 -1 -2 -1 -6 -1 3 24 3 0 1 1 1 1 1 1 20 8 7 1 0 3 2 4 0 2 20 0.46 1.67 60 E 0 -2 3 -2 -1 -3 1 1 1 -4 -3 -2 -2 -1 -3 0 -3 5 5 -4 9 2 13 1 1 1 10 11 4 1 2 2 1 2 1 9 1 7 23 1 0.55 1.67 61 E -2 -3 -3 0 -6 -1 8 -5 -3 -6 -6 -2 -5 -6 -4 -3 -4 -6 -5 -5 3 0 0 3 0 0 90 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.93 1.60 62 I 4 -5 -4 -5 1 -4 -4 -3 -5 3 -2 -4 3 -1 -4 2 2 -1 -3 1 29 0 0 0 3 0 0 2 0 15 3 0 7 2 0 14 10 1 1 11 0.53 1.60 63 S 6 -4 -2 -3 2 -4 -4 -1 -4 -3 -4 -4 -4 -5 -4 3 -1 -5 -5 -2 64 0 1 1 4 0 0 4 0 1 0 0 0 0 0 18 3 0 0 2 1.09 1.60 64 Q -4 -4 1 8 -6 2 -1 -1 -3 -5 -6 -3 -5 -6 -4 -3 -4 -6 -5 -5 0 0 5 76 0 11 0 5 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.71 1.46 65 L -3 -5 -6 -7 -2 -5 -4 -7 -6 0 6 -5 0 0 -6 -4 -3 -5 -2 2 1 0 0 0 1 0 1 0 0 1 76 0 1 4 0 1 1 0 1 13 1.27 1.48 66 L -3 -5 -6 -7 -1 -5 -6 -6 -6 3 5 -6 1 3 -6 -4 -2 6 -2 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 15 48 0 3 10 0 1 2 12 1 5 1.03 1.48 67 Y -5 -5 -5 -6 0 -5 -5 -6 -2 -4 -3 -5 -4 6 -6 -5 -5 -1 9 -4 0 0 0 0 3 0 0 0 0 0 0 0 0 28 0 0 0 0 70 0 2.19 1.39 68 W -5 -2 -1 -3 -6 0 -3 -5 10 -6 -5 -1 -3 1 -5 -3 -4 3 0 -6 0 1 1 1 0 3 0 0 78 0 0 3 1 6 0 1 1 4 1 0 2.23 1.38 69 T 1 -5 -5 -6 2 -4 -5 -5 -3 1 4 -5 1 -1 -5 0 1 3 1 1 11 0 0 0 5 1 0 0 0 5 41 0 3 2 0 7 8 4 4 8 0.56 1.37 70 Q -2 -1 -4 -5 -3 2 -3 -5 -5 1 4 -4 6 0 -5 -3 0 -2 -3 -2 2 3 0 0 0 10 1 0 0 6 41 0 22 3 0 1 7 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0.1873 0.3188 PSI Gapped 0.0573 0.2670